Upgrade gcc4mbed project used by Smoothie.

Main updates:
* Now uses GCC ARM Embedded 4.6.2012-q1-update
* mbed SDK version upgraded from version 28 to 43.
* Now uses header dependencies to make incremental build more useful.  No
  longer do you need to run "make clean" before each build that contained
  header changes.
* Treats .c files as C code and not C++.  The mbed guys have finally made this
  change for the online compiler so I have switched to match it.  It does mean
  that some .c files now need to be renamed to .cpp if they #include a C++
  header such as mbed.h
* I have tried to trim out some of the fat in the build and produce smaller
  binaries than what were created previously by gcc4mbed based projects.  Still
  no where close to being as small as what the online compiler produces.

re-enabling serial

added -q ( quiet ) option to the play command

S is not a command, this is bad : https://github.com/arthurwolf/Smoothie/commit/de91760a051ab3231556131e0eaf65d58df5a3d5

laser was broken, lines missing at the end of files

Merge pull request #57 from gxurma/lasercontrol

Lasercontrol

Added laser control command. Forked from edge. Now command S can be also sent without G commands. For example S0.5 sets maximum laser output to 50%. It still uses the acceleration power ramp. Useful only with continuous laser output, because diode lasers behave differently when not reaching threshold current at the beginning...

those two were swapped

Merge pull request #51 from arthurwolf/streams

Streams

changed back from mbed for merging

kernel->serial is dead

changed to work with mbed

Merge pull request #49 from arthurwolf/switch

Switch

removing mbed stuff

Merge pull request #48 from arthurwolf/edge

Edge

version change

working Switch module

changed for testing on mbed

get_module_list was missing, adding, should make module pools work again

Merge pull request #46 from logxen/config

Config refactoring and Smoothification

made the local and sd configs addressable by those names

implemented config-load <filename> and did a little refactoring

fixed small bug in the new config-load implementation

implemented config-load command with new config system

removed M50x stubs

finished implementing basic config-get and config-set for both live settings and storage settings

implemented FileConfigSource::read() by copying the old version with a few changes

implemented FileConfigSource::write() by copying teh old implementation

extended ConfigSource to allow random read and writes as well as other features and refactoring

cleaning of Configurator for new Smoothified config system

moved config commands into Configurator module

several small bug squashes and some cleaning

Merge remote-tracking branch 'upstream/configrefactor' into config

forgot to remove the mbed hack thingie

tested on mbed, seems to work. commiting for Logxen to add configurator,
wheeee :)

First compiling version of the new Config abstraction, but untested atm,
and not fully functional

added include for Configurator to main.cpp

Merge branch 'config' of github.com:logxen/Smoothie into config

skeleton commit for Configurator

Merge pull request #44 from logxen/edge

Added 'pwd' command to SimpleShell and fixed the names of a few command_checksum defines

Merge branch 'ss' into edge

clarified the names of several command_checksums

skeleton commit for Configurator

Implemented pwd (present working directory) command in SimpleShell

Merge pull request #43 from logxen/reset

added a reset command to SimpleShell that triggers a watchdog reset

moved the system_reset function into libs/utils

added a reset command to SimpleShell that triggers a watchdog reset

Merge pull request #42 from logxen/config

Cached config settings - and also the answer to the ultimate question

cleaned system, removed obsolete comments, minor bugfixes

reworked config system to retain a compacted version of the cache to remove memory leaks and reduce sd reads even further

initial commit for caching config values during init

Merge pull request #40 from adamgreen/edge

Upgrade MRI to version 0.2-20120601.1

Upgrade MRI to version 0.2-20120601.1

This alpha build has been updated to work with the newer GNU ARM Embedded
toolchain and the mri.ar included in this update was actually compiled with
that toolchain.  It has however been tested to make sure that it will still
work with the Smoothie project which uses a slighly older version of the
Code Sourcery toolchain.  One good consequence of this change is that the
register context sent by MRI on debug events is 100 bytes smaller since it no
longer has to fake sending floating point registers which don't exist on the
Cortex-M3.

This update also includes changes that were made to allow MRI to work with
bare bone projects that don't link with the mbed SDK libraries.

Merge pull request #39 from briand/working

Console fix

Read in all you can from serial pipes (prevent lost commands)

Merge pull request #38 from logxen/wait4q

Wait4q - this code refactors the process of waiting for the block queue into a single function

Merge branch 'edge' into wait4q

Merge pull request #36 from briand/working

A clean cherry-pick of work so far. Each commit speaks for itself, I think.

Merge branch 'edge' into wait4q

implemented printf in USBCDCMSC. Works as a SimpleShell target now.

'cat' using full lines (to improve efficiency over USB)

Don't try to cat/play missing files

Convert incoming CR -> NL for cases where NL is not sent

Adding sense code from Steve Evans

OS X really hates it when MSC doesn't report sense info

Merge pull request #35 from logxen/edge

made Config read the last line of a file even if there is no line break

made Config read the last line of a file even if there is no line break

updated headers following merge of xhume into edge

Merge branch 'edge' into wait4q

Merge pull request #31 from logxen/xhume

Xhume

cleaning

mostly changes to headers files to further identify mbed dependencies, minor enhancements

it turns out, having currentcontrol enabled by default is bad if you
don't have the digipot chip, so ... disabling

Merge pull request #28 from adamgreen/edge

Update MRI to first alpha release, version 0.1-20120510.1

Update MRI to first alpha release, version 0.1-20120510.1

A pointer to source repository branch can be found in latest mri.h

Merge pull request #27 from logxen/xhume

Removed the need for mbed in Config.h

moved the define for error() directly into Config.h, removing the dependency on the mbed error.h

removed unnecessary include

slight change to reduce number of allocations

Merge branch 'edge' into wait4q

Merge pull request #26 from logxen/edge

replaced all occurrences of '_ckeckusm' with '_checksum'

replaced all occurrences of '_ckeckusm' with '_checksum'

defined constants for the checksums used in TemperatureControlPool

Merge pull request #25 from logxen/edge

defined constants for the checksums used in TemperatureControlPool

Merge pull request #24 from logxen/xhume

made mbed.h include more specific for several key files

made mbed.h include more specific for several key files

added a timer to Player::wait_for_queue so that time spent on idle events does not caused unexpected lag unless really extreme (> 500 us)

Merge branch 'edge' into wait4q

Merge pull request #23 from logxen/issue13

Issue13

replaced existing wait loops in code with calls to the new Player::wait_for_queue()

implemented Player::wait_for_queue(int free_blocks)

added ON_IDLE kernel event calls to the main loop and the planner wait loop

added Player.h include so SimpleShell can check the queue

made SimpleShell wait for the queue to have room so that a serial message can still be received while playing a file

Added ON_IDLE event to Kernel and Module, but it isn't called yet

Merge pull request #22 from logxen/edge

Removed 'S' as a key for beginning gcodes

removed 'S' as a key for beginning gcodes

Merge pull request #21 from logxen/edge

changed the name of the steps_per_mm_checksum to reflect the actual stri...

changed the name of the steps_per_mm_checksum to reflect the actual string used

Merge pull request #20 from adamgreen/edge

Update mri to latest pre-alpha bits.

Updated MRI notes.

* Hard faults aren't as likely to happen now that mri communicates a more
  complete memory map back to gdb.
* Stacking/Unstacking errors are now handled by mri.
* Updated notes asking Mac users to contact me if they want to dogfood my gdb
  updates to work with mbed on that platform.