scripts: Typo in args-fold*.

* guix/scripts.scm (args-fold*): Add missing 'args' parameter so that
the all parameter names match their value.

gnu: isc-bind: List included utilities in the description.

A frequent question was: "Which package contained the 'dig' utility?"  This
change should make the question answerable through 'guix search'.

* gnu/packages/dns.scm (isc-bind)[synopsis]: Remove leading article.
[description]: Add a table listing the utilities contained in the 'utils'
output and insert a missing space between two sentences.
[home-page]: Update.

gnu: emacs-debbugs: Update to 0.25.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-debbugs): Update to 0.25.

services: guix: Refer to 'berlin.guix.gnu.org.pub'.

Commit 6680880f9b8dceb4f2f3f91bd2b13c659b53835e pushes out a new guix
package with a new key location, so we need to update to the new key
in order for systems to build correctly.

* gnu/services/base.scm (%default-authorized-guix-keys): Refer to berlin.guix.gnu.org.pub.

gnu: guix: Update to 1.1.0-17.36a1925.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 1.1.0-17.36a1925.

gnu: Add 'pass-tomb'.

* gnu/packages/password-utils.scm (pass-tomb): New variable.

Signed-off-by: Julien Lepiller <julien@lepiller.eu>

gnu: Add kcov.

* gnu/packages/code.scm (kcov): New variable.

gnu: tomb: Add 'getent' to PATH.

* gnu/packages/crypto.scm (tomb)[arguments]: In 'wrap' phase add
'getent' to the PATH.

Signed-off-by: Julien Lepiller <julien@lepiller.eu>

tests: networking: Use 'net.ifnames=0' for the Open vSwitch test.

* gnu/tests/networking.scm (%openvswitch-os): Override KERNEL-ARGUMENTS.

Revert "vm: Use virtio network driver."

This allows users to specify network interface settings with 'guix system vm'
without having to create a new NIC.  Fixes <https://bugs.gnu.org/42252>.
Reported by Christopher Lemmer Webber <cwebber@dustycloud.org>.

This reverts commit 5379392731b52eef22b4936637eb592b93e04318.

gnu: php: Update to 7.4.8.

* gnu/packages/php.scm (php): Update to 7.4.8.

gnu: ntp: Update to 4.2.8p15 [security fixes].

* gnu/packages/ntp.scm (ntp): Update to 4.2.8p15.
[source]: Swap order of URIs.

gnu: wsjtx: Update to 2.2.2.

* gnu/packages/radio.scm (wsjtx-hamlib, wsjtx): Update to 2.2.2.

gnu: flrig: Update to 1.3.51.

* gnu/packages/radio.scm (flrig): Update to 1.3.51.

gnu: s6-linux-init: Update to 1.0.4.2.

* gnu/packages/skarnet.scm (s6-linux-init): Update to 1.0.4.2.

gnu: svt-av1: Update to 0.8.4.

* gnu/packages/video.scm (svt-av1): Update to 0.8.4.

gnu: xfce4-eyes-plugin: Update to 4.5.1.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-eyes-plugin): Update to 4.5.1.

gnu: bitcoin-abc: Update to 0.21.10.

* gnu/packages/finance.scm (bitcoin-abc): Update to 0.21.10.
[inputs]: Add jemalloc.

gnu: gperftools: Update to 2.8.

* gnu/packages/cpp.scm (gperftools): Update to 2.8.

gnu: hss: Patch less.

* gnu/packages/ssh.scm (hss)[arguments]: Set INSTALL_BIN make flag
instead of patching the Makefile.

gnu: hss: Return #t from phase.

* gnu/packages/ssh.scm (hss)[arguments]: End ‘patch-file-names’ with #t.

gnu: hss: Fix cross-compilation.

* gnu/packages/ssh.scm (hss)[arguments]: Move $CC to MAKE-FLAGS and use
CC-FOR-TARGET.  Rename ‘pre-env’ to the more accurate ‘patch-file-names’.

gnu: hss: Edit description.

* gnu/packages/ssh.scm (hss)[description]: Edit.

gnu: hss: Move to (gnu packages ssh).

* gnu/packages/admin.scm (hss): Move…
* gnu/packages/ssh.scm (hss): …here.

gnu: libglvnd: Update to 1.3.2.

* gnu/packages/gl.scm (libglvnd): Update to 1.3.2.

gnu: ruby-ruby-prof: Disable a flaky test.

A test was found to fail non-deterministically.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-ruby-prof)[phases]: Add the 'delete-flaky-test
phase.

gnu: Add ruby-yard-tomdoc.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-yard-tomdoc): New variable.

gnu: Add ruby-tomparse.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-tomparse): New variable.

gnu: Add ruby-spectroscope.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-spectroscope): New variable.

gnu: ruby-asciidoctor: Update to 2.0.10.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-asciidoctor): Update to 2.0.10.
[origin]: Use git-fetch.
[phases]: Remove 'remove-circular-tests.  Add 'strip-version-requirements.
[native-inputs]: Add ruby-erubis, ruby-cucumber, ruby-haml, ruby-rouge,
ruby-rspec-expectations, ruby-simplecov, ruby-slim and ruby-tilt.

gnu: ruby-asciidoctor: Re-indent.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-asciidoctor): Re-indent.

gnu: Add ruby-slim.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-slim): New variable.

gnu: ruby-temple: Update to 0.8.2.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-temple): Update to 0.8.2.

gnu: ruby-tilt: Add pandoc, sassc support.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-guard)[native-inputs]: Move ruby-sassc from
here...
[propagated-inputs]: ...to here.  Add ruby-pandoc-ruby.

gnu: ruby-tilt: Update to 2.0.10.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-tilt): Update to 2.0.10.

gnu: Add ruby-pandoc-ruby.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-pandoc-ruby): New variable.

gnu: ruby-cucumber: Enable more tests.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-cucumber)[test-target]: Use the default
test-target, which includes the cucumber tests target.
[phases]: Add the 'disable-rubocop and 'set-home phases.  Delete Gemfile as
part of the 'strip-version-requirements phase.

gnu: ruby-sinatra: Update to 2.0.8.1.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-sinatra): Update to 2.0.8.1.
[phases]{fix-slow-doc-generation}: Add phase.

gnu: ruby-yard: Update to 0.9.25.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-yard): Update to 0.9.25.

gnu: Add ruby-yard-with-tests.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-yard-with-tests): New variable.

gnu: ruby-yard: Disable tests.

YARD is a common dependency in the Ruby world; having it carry extra test
dependencies is prone to cause dependency cycles.  For example, YARD depends
on Asciidoctor, but the latest Asciidoctor requires ruby-cucumber for its test
suite, which pulls YARD through many of its dependencies.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-yard)[arguments]: Disable tests.
[native-inputs]: Remove.

gnu: ruby-asciimath: Update to 2.0.1.

* gnu/packages/maths.scm (ruby-asciimath): Update to 2.0.1.
[arguments]: Remove.
[native-inputs]: Remove bundler, add ruby-nokogiri.

gnu: rtl-sdr: Use HTTPS URL.

* gnu/packages/radio.scm (rtl-sdr)[source]: Use HTTPS URL.

gnu: Add hss.

* gnu/packages/admin.scm (hss): New variable.

gnu: qutebrowser: Update to 1.13.0.

* gnu/packages/web-browsers.scm (qutebrowser): Update to 1.13.0.

Signed-off-by: Julien Lepiller <julien@lepiller.eu>

news: Add ‘de’ translation.

* etc/news.scm: Add a ‘de’ translation.

image: Do not set journal_model=WAL for the Hurd.

This fixes <https://bugs.gnu.org/42151>.

* gnu/system/images/hurd.scm (hurd-initialize-root-partition): Use #:wal-mode #f
in call to ...
* gnu/build/image.scm (initialize-root-partition): ... this, add #:wal-mode?
parameter, pass it to ...
(register-closure): ... this, add #:wal-mode? parameter, pass it to ...
* guix/store/database.scm (with-database): ... this, add #:wal-mode?
parameter, pass it to ...
(call-with-database): ... this, add #:wal-mode? parameter; when
set to #f, do not set journal_model=WAL.

gnu: sqlite: Add locking-mode fix for the Hurd.

* gnu/packages/patches/sqlite-hurd.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/sqlite.scm (sqlite)[native-inputs]: Add it when building
for the Hurd.
[arguments]: Apply it when building for the Hurd.

gnu: monero-gui: Update to 0.16.0.2.

* gnu/packages/finance.scm (monero-gui): Update to 0.16.0.2.

gnu: maradns: Use CC-FOR-TARGET.

* gnu/packages/dns.scm (maradns)[arguments]: Use CC-FOR-TARGET.

gnu: maradns: Update to 3.5.0007.

* gnu/packages/dns.scm (maradns): Update to 3.5.0007.

gnu: chocolate-doom: Update to 3.0.1.

* gnu/packages/games.scm (chocolate-doom): Update to 3.0.1.

gnu: 7kaa: Update to 2.15.4.

* gnu/packages/games.scm (7kaa): Update to 2.15.4.

gnu: r-processx: Update to 3.4.3.

* gnu/packages/cran.scm (r-processx): Update to 3.4.3.

gnu: r-htmltable: Update to 2.0.1.

* gnu/packages/cran.scm (r-htmltable): Update to 2.0.1.

gnu: xwallpaper: Update to 0.6.5.

* gnu/packages/xdisorg.scm (xwallpaper): Update to 0.6.5.

news: Add entry for 'guix git authenticate'.

* etc/news.scm: Add entry.

maint: Remove 'build-aux/git-authenticate.scm'.

* Makefile.am (channel_intro_commit, channel_intro_signer): New
variables.
(authenticate): Use it.
(EXTRA_DIST): Remove 'build-aux/git-authenticate.scm'.
* build-aux/git-authenticate.scm: Remove.

Add 'guix git authenticate'.

* guix/scripts/git.scm, guix/scripts/git/authenticate.scm,
tests/guix-git-authenticate.sh: New files.
* Makefile.am (MODULES): Add the *.scm files.
(SH_TESTS): Add 'tests/guix-git-authenticate.sh'.
* doc/guix.texi (Channels)[Specifying Channel Authorizations]: Mention
'guix git authenticate'.
(Invoking guix git authenticate): New node.
* po/guix/POTFILES.in: Add 'guix/scripts/git.scm' and
'guix/scripts/git/authenticate.scm'.

git: Add 'with-git-error-handling'.

* guix/scripts/pull.scm (report-git-error, with-git-error-handling):
Move to...
* guix/git.scm: ... here.
* guix/scripts/time-machine.scm: Adjust accordingly.

Add 'etc/historical-authorizations'.

* etc/historical-authorizations: New file.  Data extracted from
'build-aux/git-authenticate.scm'.
* Makefile.am (EXTRA_DIST): Add it.

git-authenticate: Factorize 'authenticate-repository'.

* guix/git-authenticate.scm (repository-cache-key)
(verify-introductory-commit, authenticate-repository): New procedures.
* guix/channels.scm (verify-introductory-commit): Remove.
(authenticate-channel): Rewrite in terms of 'authenticate-repository'.

gnu: gnome-builder: Expound description.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-builder)[description]: Expound.

gnu: Add gnome-builder.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-builder): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add sysprof.

* gnu/packages/gnome.scm (sysprof): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: lcalc: Don't rename the include directory.

Sage no longer renames the directory, so we shouldn't either.

* gnu/packages/sagemath.scm (lcalc)[arguments]: Remove a substitution from
  the prepare-build phase.

gnu: Add ECL 16.1.3 for Sage.

* gnu/packages/sagemath.scm (ecl-16): New variable.
* gnu/packages/patches/ecl-16-format-directive-limit.patch,
  gnu/packages/patches/ecl-16-ignore-stderr-write-error.patch,
  gnu/packages/patches/ecl-16-libffi.patch: New files.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register the patches.

gnu: sagemath: Remove unnecessary old versions of packages

Sage has updated givaro, fflas-ffpack and linbox since the comment was
written.

* gnu/packages/sagemath.scm (givaro, fflas-ffpack, linbox): Remove
  variables.

gnu: linbox: Fix linking of dependant packages.

* gnu/packages/algebra.scm (linbox)[source]: Add a patch.
  [inputs]: Move fflas-ffpack to...
  [propagated-inputs]: ...here.
* gnu/packages/patches/linbox-fix-pkgconfig.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register it.

gnu: arb: Build with flint 2.6.

Backport an upstream patch to fix a compatibility issue with flint 2.6.

* gnu/packages/algebra.scm (arb): Add patch.
* gnu/packages/patches/arb-flint-2.6.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register new file.

gnu: flint: Build with ntl.

* gnu/packages/algebra.scm (flint)[inputs]: Add ntl.
  [arguments]: Pass --with-ntl to configure.

gnu: flint: Update to 2.6.0.

* gnu/packages/algebra.scm (flint): Update to 2.6.0.
* gnu/packages/patches/flint-ldconfig.patch: Remove the patch as it got
  applied upstream.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Deregister the removed file.

gnu: minetest: Update to 5.3.0.

* gnu/packages/games.scm
(minetest, minetest-data): Update to 5.3.0.
(minetest-data): Specify version with (package-version minetest)

gnu: webkitgtk: Update to 2.28.3 [security fixes].

Includes fixes for CVE-2020-9802, CVE-2020-9803, CVE-2020-9805,
CVE-2020-9806, CVE-2020-9807, CVE-2020-9843, CVE-2020-9850,
and CVE-2020-13753.

* gnu/packages/webkit.scm (webkitgtk): Update to 2.28.3.

services: guix: Refer to 'berlin.guixsd.org.pub'.

This partly reverts d283bb960f927dd5f7bb8b96bc697221e4e8ad39.

* gnu/services/base.scm (%default-authorized-guix-keys): Refer to berlin.guixsd.org.pub.

gnu: linux-libre: Fix regression with Atheros 9271.

* gnu/packages/patches/linux-libre-fix-atheros-9271.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-fix-atheros-9271-patch): New variable.
(linux-libre-4.4-source, linux-libre-4.9-source)
(linux-libre-4.14-source, linux-libre-4.19-source)
(linux-libre-5.4-source, linux-libre-5.7-source): Add the patch.

gnu: bats: Define TAP.

* gnu/packages/bash.scm (bats)[description]: Use @acronym{TAP, …}.

gnu: cryptsetup: Update to 2.3.3.

* gnu/packages/cryptsetup.scm (cryptsetup): Update to 2.3.3.
[inputs]: Use the default json-c version.

gnu: qbittorrent: Update to 4.2.5.

* gnu/packages/bittorrent.scm (qbittorrent): Update to 4.2.5.

gnu: u-boot: Update to 2020.07.

* gnu/packages/bootloaders (u-boot): Update to 2020.07.
  (u-boot-pinebook-pro-rk3399): Remove patches.
* gnu/packages/patches:
  u-boot-DT-for-Pinebook-Pro.patch, u-boot-add-boe-nv140fhmn49-display.patch,
  u-boot-gpio-keys-binding-cons.patch, u-boot-leds-common-binding-con.patch,
  u-boot-support-Pinebook-Pro-laptop.patch,
  u-boot-video-rockchip-fix-build.patch: Remove patches.
  u-boot-riscv64-fix-extlinux.patch: Refresh patch.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Update accordingly.

download-nar: Hide colliding 'dump-port*' binding.

* guix/build/download-nar.scm: Hide 'dump-port*' from (guix
serialization).

cve: Fix typos in <cve> accessor.

* guix/cve.scm (<cve>)[references]: Rename accessor to 'cve-references'
and fix adjust exported name accordingly.

git-download: Don't verify X.509 certificate of SWH.

Fixes <https://bugs.gnu.org/42286>.

Regression introduced with the switch to Guile 3.0 in commit
b6bee63bed4f013064c0d902e7c8b83ed7514ade.

* guix/git-download.scm (git-fetch): Parameterize %VERIFY-SWH-CERTIFICATE.

swh: Allow callers to disable X.509 certificate verification.

* guix/swh.scm (%verify-swh-certificate?): New parameter.
(http-get*, http-post*): New procedures.
(request-rate-limit-reached?): Use 'http-post*' instead of 'http-post'.
(update-rate-limit-reset-time!): Likewise.
(request-cooking): Likewise.
(call): Method defaults to 'http-get*' instead of 'http-get'.  Pass
 #:verify-certificate? to METHOD.
(vault-fetch): Likewise.

maint: Remove traces of "berlin.guixsd.org".

The guixsd.org domain is no longer advertised since before in 1.0.0
release in May 2019.

* etc/substitutes/berlin.guixsd.org.pub: Rename to...
* etc/substitutes/berlin.guix.gnu.org.pub: ... this.
* etc/substitutes/ci.guix.gnu.org.pub,
etc/substitutes/ci.guix.info.pub: Adjust accordingly.
* gnu/services/base.scm (%default-authorized-guix-keys): Likewise.
* guix/build/download-nar.scm (urls-for-item): Likewise.
* guix/self.scm (miscellaneous-files): Likewise.
* Makefile.am (dist_pkgdata_DATA): Likewise.

gnu: linux-libre: Update to 5.4.51.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.51.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.
(deblob-scripts-5.4): Update to 5.4.51.

gnu: linux-libre@5.7: Update to 5.7.8.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.7-version): Update to 5.7.8.
(linux-libre-5.7-pristine-source): Update hash.
(deblob-scripts-5.7): Update to 5.7.8.

gnu: linux-libre@4.19: Update to 4.19.132.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.132.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.
(deblob-scripts-4.19): Update to 4.19.132.

gnu: linux-libre@4.14: Update to 4.14.188.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.188.
(linux-libre-4.14-pristine-source): Update hash.
(deblob-scripts-4.14): Update to 4.14.188.

gnu: linux-libre@4.9: Update to 4.9.230.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9-version): Update to 4.9.230.
(linux-libre-4.9-pristine-source): Update hash.
(deblob-scripts-4.9): Update to 4.9.230.

gnu: linux-libre@4.4: Update to 4.4.230.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4-version): Update to 4.4.230.
(linux-libre-4.4-pristine-source): Update hash.
(deblob-scripts-4.4): Update to 4.4.230.

gnu: Add rust-itertools-0.9.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-itertools-0.9): New variable.
(rust-itertools-0.8): Inherit from rust-itertools-0.9.

gnu: rust-cargo-c: Update to 0.5.3.

* gnu/packages/rust-apps.scm (rust-cargo-c): Update to 0.5.3.
[arguments]: In cargo-inputs replace rust-cbindgen-0.12 with
rust-cbindgen, rust-pretty-env-logger-0.3 with 0.4.

gnu: rust-cbindgen: Update to 0.13.2.

* gnu/packages/rust-apps.scm (rust-cbindgen): Update to 0.13.2.

gnu: Add rust-pretty-env-logger-0.4.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-pretty-env-logger-0.4): New variable.
(rust-pretty-env-logger-0.3): Inherit from rust-pretty-env-logger-0.4.

gnu: zutils: Update to 1.9.

* gnu/packages/compression.scm (zutils): Update to 1.9.

gnu: dash: Update to 0.5.11.1.

* gnu/packages/shells.scm (dash): Update to 0.5.11.1.

gnu: zutils: Fix test failure.

* gnu/packages/compression.scm (zutils)[arguments]: Add a
‘disable-failing-tests’ phase.

gnu: tor: Update to 0.4.3.6 [fixes CVE-2020-15572].

* gnu/packages/tor.scm (tor): Update to 0.4.3.6.

gnu: snd: Update to 20.5.

* gnu/packages/audio.scm (snd): Update to 20.5.