news: Fix 'de' translation.

* etc/news.scm: Add new 'de' translation.

gnu: diffoscope: Update to 126.

* gnu/packages/diffoscope (diffoscope): Update to 126.
  [arguments]: Remove add-known-tools phase, merged upstream.

gnu: python-genshi: Update to 0.7.2.

* gnu/packages/python-web.scm (python-genshi): Update to 0.7.2.

gnu: kitty: Update to 0.14.6.

* gnu/packages/terminals.scm (kitty): Update to 0.14.6.

gnu: telegram-purple: Update to 1.4.2.

* gnu/packages/messaging.scm (telegram-purple): Update to 1.4.2.

gnu: tiled: Update to 1.2.5.

* gnu/packages/game-development.scm (tiled): Update to 1.2.5.

gnu: r-bayesm: Update to 3.1-4.

* gnu/packages/cran.scm (r-bayesm): Update to 3.1-4.

gnu: emacs-ivy: Update to 0.13.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-ivy): Update to 0.13.0.

news: Fix ‘nl’ translation typo.

* etc/news.scm: Fix typo.

gnu: python-unidecode: Update to 1.1.1.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-unidecode): Update to 1.1.1.

gnu: python-pygithub: Update to 1.43.8.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pygithub): Update to 1.43.8.

gnu: guix: Update to f63e493.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to f63e493.

news: Add 'de' translation.

* etc/news.scm: Add new 'de' translation.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

news: Add 'fr' translation.

* etc/news.scm: Add 'fr' translation.

news: Add 'nl' translation.

* etc/news.scm: Add 'nl' translation.

news: Add entry for security issue with /var/guix/profiles/per-user.

* etc/news.scm: Add entry for security issue in multi-user setups.

daemon: Make 'profiles/per-user' non-world-writable.

Fixes <https://bugs.gnu.org/37744>.
Reported at <https://www.openwall.com/lists/oss-security/2019/10/09/4>.

Based on Nix commit 5a303093dcae1e5ce9212616ef18f2ca51020b0d
by Eelco Dolstra <edolstra@gmail.com>.

* nix/libstore/local-store.cc (LocalStore::LocalStore): Set 'perUserDir'
to #o755 instead of #o1777.
(LocalStore::createUser): New function.
* nix/libstore/local-store.hh (LocalStore): Add it.
* nix/libstore/store-api.hh (StoreAPI): Add it.
* nix/nix-daemon/nix-daemon.cc (performOp): In 'wopSetOptions', add
condition to handle "user-name" property and honor it.
(processConnection): Add 'userId' parameter.  Call 'store->createUser'
when userId is not -1.
* guix/profiles.scm (ensure-profile-directory): Note that this is now
handled by the daemon.
* guix/store.scm (current-user-name): New procedure.
(set-build-options): Add #:user-name parameter and pass it to the daemon.
* tests/guix-daemon.sh: Test the creation of 'profiles/per-user' when
listening on a TCP socket.
* tests/store.scm ("profiles/per-user exists and is not writable")
("profiles/per-user/$USER exists"): New tests.

build: Remove references to 'NIX_LOCALSTATE_DIR'.

* build-aux/test-env.in: Remove references to 'NIX_LOCALSTATE_DIR'.

daemon: Remove traces of 'NIX_ROOT_FINDER'.

This is a followup to 2e3e5d21988fc2cafb2a9eaf4b00976ea425629d.

* build-aux/test-env.in: Remove mentions of 'NIX_ROOT_FINDER'.
* nix/libstore/gc.cc (LocalStore::collectGarbage): Adjust comment
accordingly.

gnu: emacs-yasnippet: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-yasnippet)[source]: Use GIT-FETCH and
  GIT-FILE-NAME.
[source]: Enable tests.

gnu: emacs-lpy: Update to 0.1.0-3.43b401f.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-lpy): Update to 0.1.0-3.43b401f.

gnu: bind: Update to 9.14.7 [fixes CVE-2019-6475 & CVE-2019-6476].

* gnu/packages/dns.scm (isc-bind): Update to 9.14.7.

gnu: perl-class-method-modifiers: Update to 2.13.

* gnu/packages/perl.scm (perl-class-method-modifiers): Update to 2.13.
[native-inputs]: Replace perl-test-requires with perl-test-needs.

gnu: sudo: Update to 1.8.28p1.

* gnu/packages/admin.scm (sudo): Update to 1.8.28p1.

gnu: rkrlv2: Update to 0-2.7edcb4e.

* gnu/packages/music.scm (rkrlv2): Update to 0-2.7edcb4e.

Revert "gnu: aspell: Update to 0.60.8."

This reverts commit 4fcb6a3558b4212462c7c2afd2f5a834342f41be.

aspell causes about 1400 packages to be rebuilt.

gnu: aspell-dict-pt-pt: Upgrade to 20190329-1-0.

* gnu/packages/aspell.scm (aspell-dict-pt-pt): Upgrade to 20190329-1-0.

gnu: aspell-dict-pt-br: Upgrade to 20131030-12-0.

* gnu/packages/aspell.scm (aspell-dict-pt-br): Upgrade to 20131030-12-0.

gnu: aspell-dict-en: Upgrade to 2019.10.06-0.

* gnu/packages/aspell.scm (aspell-dict-en): Upgrade to 2019.10.06-0.

gnu: aspell-dict-de: Update to 20161207-7-0.

* gnu/packages/aspell.scm (aspell-dict-de): Update to 20161207-7-0.

gnu: aspell: Update to 0.60.8.

* gnu/packages/aspell.scm (aspell): Update to 0.60.8.
[source]: Remove patch.
* gnu/packages/patches/aspell-gcc-compat.patch: Remove file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.

gnu: man-pages: Update to 5.03.

* gnu/packages/man.scm (man-pages): Update to 5.03.

gnu: perl-class-c3-adopt-next: Update to 0.14.

* gnu/packages/perl.scm (perl-class-c3-adopt-next): Update to 0.14.
[native-inputs]: Add perl-module-build and perl-module-build-tiny.

gnu: perl-file-find-object-rule: Update to 0.0311.

* gnu/packages/perl.scm (perl-file-find-object-rule): Update to 0.0311.

gnu: perl-datetime-format-flexible: Make test input native.

* gnu/packages/perl.scm (perl-datetime-format-flexible)
[native-inputs]: Move perl-test-mocktime here…
[propagated-inputs]: …from here.

gnu: perl-datetime-format-flexible: Fix typo in synopsis.

* gnu/packages/perl.scm (perl-datetime-format-flexible)[synopsis]: Fix typo.

gnu: perl-datetime-format-flexible: Update to 0.32.

* gnu/packages/perl.scm (perl-datetime-format-flexible): Update to 0.32.
[native-inputs]: Add perl-test-exception and perl-test-nowarnings.

gnu: perl-net-dns: Update to 1.21.

* gnu/packages/networking.scm (perl-net-dns): Update to 1.21.

gnu: perl-yaml: Update to 1.29.

* gnu/packages/perl.scm (perl-yaml): Update to 1.29.

gnu: perl-yaml-libyaml: Update to 0.80.

* gnu/packages/perl.scm (perl-yaml-libyaml): Update to 0.80.

gnu: perl-test-runvalgrind: Update to 0.2.1.

* gnu/packages/perl-check.scm (perl-test-runvalgrind): Update to 0.2.1.

gnu: perl-gtk2: Update to 1.24993.

* gnu/packages/gtk.scm (perl-gtk2): Update to 1.24993.

gnu: kakoune: Update to 2019.07.01.

* gnu/packages/text-editors.scm (kakoune): Update to 2019.07.01.

gnu: python-pylibmc: Update to 1.6.1.

* gnu/packages/databases.scm (python-pylibmc): Update to 1.6.1.

gnu: python-tornado-http-auth: Update to 1.1.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-tornado-http-auth): Update to 1.1.1.

gnu: onionshare: Update to 2.2.

* gnu/packages/tor.scm (onionshare): Update to 2.2.
[inputs]: Add python-flask-httpauth.
[arguments]: Adjust 'fix-install-path' to new file name.
[description]: Improve wording and clarity.
[license]: Add expat license for bundled jquery.

gnu: python-language-server: Update to 0.29.1.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-language-server): Update to 0.29.1.
[inputs]: Add python-flake8

gnu: econnman: Build with python.

* gnu/packages/connman.scm (econnman)[inputs]: Remove python-2,
python2-dbus, python2-efl. Add python-wrapper, python-dbus, python-efl.

gnu: connman: Update build inputs.

* gnu/packages/connman.scm (connman)[arguments]: Don't enable pptp, it
isn't available.
[native-inputs]: Remove python-2, add python-wrapper.
[inputs]: Remove polkit, add xl2tpd.

gnu: xl2tpd: Update to 1.3.15.

* gnu/packages/vpn.scm (xl2tpd): Update to 1.3.15.

gnu: xl2tpd: Fix install directory.

* gnu/packages/vpn.scm (xl2tpd)[arguments]: Unset DESTDIR, set PREFIX.

gnu: ansible: Update to 2.8.5.

* gnu/packages/admin.scm (ansible): Update to 2.8.5.

gnu: ansible: Work around issues with Guix wrapper scripts.

* gnu/packages/admin.scm (ansible)[arguments]: Remove fix-symlinks phase. Add
replace-symlinks phase.

gnu: pwsafe: Move googletest to native-inputs.

* gnu/packages/password-utils.scm (pwsafe)[inputs]: Move googletest ...
[native-inputs]: ... to here.

gnu: pwsafe: Update to 3.5.0

* gnu/packages/password-utils.scm (pwsafe): Update to 3.5.0.
[source]: Use git-file-name.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: wm.scm: Sort module imports.

* gnu/packages/wm.scm: Sort module imports.

gnu: polybar: Add jsoncpp.

* gnu/packages/wm.scm (polybar)[inputs]: Add jsoncpp.

gnu: polybar: Update source uri.

* gnu/packages/wm.scm (polybar)[source]: Update source uri. Remove
file-name.

gnu: polybar: Update to 3.4.0.

* gnu/packages/wm.scm (polybar): Update to 3.4.0.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

inferior: Set the error port when using older Guix versions.

This makes the behaviour more consistent.

* guix/inferior.scm (inferior-pipe): Wrap the second open-pipe* call with
with-error-to-port, to match the first call to open-pipe*.

inferior: Allow controlling the inferior error port.

Previously, stderr for the inferior process would always be sent to /dev/null
because the current-output-port when the process is launched is a void
port. This change means that it's possible to pass in a different port to use.

* guix/inferior.scm (inferior-pipe): Take the error-port as an argument.
(open-inferior): Add new error-port keyword argument, with a default
of (%make-void-port "w").

gnu: ruby-concurrent: Update to 1.1.5.

* gnu/packages/patches/ruby-concurrent-ignore-broken-test.patch,
gnu/packages/patches/ruby-concurrent-test-arm.patch: Delete files.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/ruby.scm (ruby-concurrent): Update to 1.1.5.
[source](patches): Remove.
[arguments]: Set #:test-target to "ci".  Remove obsolete phases.  Remove
dependencies on 'rake_compiler_dock' and concurrent_ruby.jar.

gnu: ruby-concurrent: Do not use unstable source tarball.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-concurrent)[source]: Switch to GIT-FETCH.

gnu: network-manager-openvpn: Update to 1.8.10.

* gnu/packages/gnome.scm (network-manager-openvpn): Update to 1.8.10.

gnu: network-manager-applet: Don't use NAME in source URI.

* gnu/packages/gnome.scm (network-manager-applet)[source]: Hard-code NAME.

gnu: network-manager-applet: Build libnm-gtk.

Fixes network-manager-openvpn <https://issues.guix.gnu.org/issue/37759>.

* gnu/packages/gnome.scm (network-manager-applet)[arguments]:
Set libnm_gtk=true in #:configure-flags.

gnu: patchmatrix: Update to 0.16.0.

* gnu/packages/music.scm (patchmatrix): Update to 0.16.0.
[arguments]: Remove custom phase make-gzip-archive-writable.

gnu: Add python-cookiecutter.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cookiecutter): New public variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <m.othacehe@gmail.com>

gnu: Add python-whichcraft.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-whichcraft): New public variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <m.othacehe@gmail.com>

gnu: Add python-poyo.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-poyo): New public variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <m.othacehe@gmail.com>

gnu: Add python-jinja2-time.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-jinja2-time): New public variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <m.othacehe@gmail.com>

gnu: Add gnome-mahjongg.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-mahjongg) New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add r-unifiedwmwqpcr.

* gnu/packages/bioconductor.scm (r-unifiedwmwqpcr): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add r-htqpcr.

* gnu/packages/bioconductor.scm (r-htqpcr): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: openmpi: Add dependency on UCX when supported.

* gnu/packages/mpi.scm (openmpi)[inputs]: Add UCX conditionally.

gnu: Add ucx.

* gnu/packages/fabric-management.scm (ucx): New variable.

ssh: Add a longer SSH timeout by default.

* guix/ssh.scm (open-ssh-session): Add #:timeout parameter, and add call
to 'session-set!' to honor it.

offload: Set a longer SSH session timeout.

Fixes <https://bugs.gnu.org/37762>.

* guix/scripts/offload.scm (open-ssh-session): Add 'max-silent-time'
parameter.  Add call to 'session-set!' before returning SESSION.
(transfer-and-offload): Pass MAX-SILENT-TIME to 'open-ssh-session'.
(%short-timeout): New variable.
(choose-build-machine): Pass %SHORT-TIMEOUT to 'open-ssh-session'.
(check-machine-availability): Likewise.
(check-machine-status): Likewise.

tests: Skip container test when lacking kernel support.

This is a followup to 96b35998e610c7fc37bf87bf9e07e63d3bebd0a3.

* tests/containers.scm ("eval/container, non-empty load path"): Add
missing 'skip-if-unsupported' call.

gnu: guix: Update to 88da011.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 88da011.

gnu: emacs-magit: Add patch for compatibility with emacs-forge.

* gnu/local.mk (emacs-magit-format-author-margin.patch): Add patch.
* gnu/packages/emacs-xyz.scm: Add.
* gnu/packages/patches/emacs-magit-log-format-author-margin.patch: Add.

gnu: emacs-prescient: Update to 3.3-1.9505658.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-prescient): Update to 3.3-1.9505658.

gnu: emacs-ghub: Update to 3.2.0-2.e19cd86.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-ghub): Update to 3.2.0-2.e19cd86.
[propagated-inputs]: Add emacs-let-alist.

gnu: emacs-markdown-preview: Fix synopsis.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-markdown-preview): Fix synopsis.

gnu: clamav: Update to 0.102.0.

* gnu/packages/antivirus.scm (clamav): Update to 0.102.0.

gnu: xfsprogs: Install Python script to :python output.

* gnu/packages/linux.scm (xfsprogs)[outputs]: Add ‘python’.
[arguments]: Move ‘xfs_scrub_all’ to :python.
[inputs]: Add python-wrapper to make it actually run.

gnu: xfsprogs: Update to 5.2.1.

* gnu/packages/linux.scm (xfsprogs): Update to 5.2.1.

gnu: quaternion: Wrap with extra inputs.

* gnu/packages/messaging.scm (quaternion)[inputs]: Add qtquickcontrols2.
[arguments]: Use WRAP-QT-PROGRAM.

gnu: zenity: Don't use NAME in source URI.

* gnu/packages/gnome.scm (zenity)[source]: Hard-code NAME.

gnu: zenity: Update to 3.32.0.

* gnu/packages/gnome.scm (zenity): Update to 3.32.0.

gnu: r-cmprsk: Update to 2.2-9.

* gnu/packages/cran.scm (r-cmprsk): Update to 2.2-9.

gnu: r-pkgbuild: Update to 1.0.6.

* gnu/packages/cran.scm (r-pkgbuild): Update to 1.0.6.

gnu: python-git-review: Update to 1.28.0.

* gnu/packages/openstack.scm (python-git-review): Update to 1.28.0.

gnu: python-django-override-storage: Update to 0.1.6.

* gnu/packages/django.scm (python-django-override-storage): Update to 0.1.6.

gnu: python-crate: Update to 0.23.2.

* gnu/packages/databases.scm (python-crate): Update to 0.23.2.

gnu: pioneer: Update to 20190203.

* gnu/packages/games.scm (pioneer): Update to 20190203.
[build-system]: Switch from gnu- to cmake-build-system.
[native-inputs]: Remove autoconf and automake.
[inputs]: Add glew.
[arguments]: Adjust configure-flags for cmake.  Remove phase modification.

packages: 'fold-available-packages' uses 'supported-package?'.

Fixes <https://bugs.gnu.org/37748>.
Reported by Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>.

This is a followup to d2d63e20d5b981009b61bf416b4d7b516e8f1f34.

* gnu/packages.scm (fold-available-packages): Use 'supported-package?'
instead of (member ... (package-supported-systems ...)) to match what
'generate-package-cache' does.

gnu: Add emacs-git-link.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-git-link): New variable.

gnu: Add emacs-apheleia.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-apheleia): New variable.

gnu: Add emacs-git-gutter-fringe.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-git-gutter-fringe): New variable.