guix: Update to Bioconductor 3.9.
authorRicardo Wurmus <rekado@elephly.net>
Sat, 4 May 2019 08:26:31 +0000 (10:26 +0200)
committerRicardo Wurmus <rekado@elephly.net>
Sun, 5 May 2019 22:14:27 +0000 (00:14 +0200)
* guix/build-system/r.scm (bioconductor-uri): Use 3.9 archive URL.
* guix/import/cran.scm (%bioconductor-version): Update to 3.9.

guix/build-system/r.scm
guix/import/cran.scm

index 664515d..e721415 100644 (file)
@@ -53,7 +53,7 @@ release corresponding to NAME and VERSION."
   (list (string-append "https://bioconductor.org/packages/release/bioc/src/contrib/"
                        name "_" version ".tar.gz")
         ;; TODO: use %bioconductor-version from (guix import cran)
-        (string-append "https://bioconductor.org/packages/3.8/bioc/src/contrib/Archive/"
+        (string-append "https://bioconductor.org/packages/3.9/bioc/src/contrib/Archive/"
                        name "_" version ".tar.gz")))
 
 (define %r-build-system-modules
index b287be6..f08ff61 100644 (file)
@@ -128,9 +128,9 @@ package definition."
 (define %cran-url "https://cran.r-project.org/web/packages/")
 (define %bioconductor-url "https://bioconductor.org/packages/")
 
-;; The latest Bioconductor release is 3.8.  Bioconductor packages should be
+;; The latest Bioconductor release is 3.9.  Bioconductor packages should be
 ;; updated together.
-(define %bioconductor-version "3.8")
+(define %bioconductor-version "3.9")
 
 (define %bioconductor-packages-list-url
   (string-append "https://bioconductor.org/packages/"