gnu: mupen64plus-video-z64: Fix glew.h location.

* gnu/packages/patches/mupen64plus-video-z64-glew-correct-path.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/emulators.scm (mupen64plus-video-z64)[source]: Use it.

gnu: xscreensaver: Update to 5.39.

* gnu/packages/xdisorg.scm (xscreensaver): Update to 5.39.

gnu: nginx: Update to 1.13.12.

* gnu/packages/web.scm (nginx): Update to 1.13.12.

gnu: efivar: Update to 35.

* gnu/packages/linux.scm (efivar): Update to 35.

gnu: efibootmgr: Update to 16.

* gnu/packages/linux.scm (efibootmgr): Update to 16.
[arguments]: Add EFIDIR to #:make-flags.  Remove related 'branding' phase.

gnu: offlineimap: Update to 7.2.0.

* gnu/packages/mail.scm (offlineimap): Update to 7.2.0.

gnu: htop: Update to 2.2.0.

* gnu/packages/patches/htop-fix-process-tree.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.
* gnu/packages/admin.scm (htop): Update to 2.2.0.
[source](patches): Remove.

gnu: libsoup: Update to 2.62.1.

* gnu/packages/gnome.scm (libsoup): Update to 2.62.1.

gnu: python-paramiko: Update to 2.4.1 [fixes CVE-2018-7750].

* gnu/packages/python-crypto.scm (python-paramiko): Update to 2.4.1.
[arguments]: Set #:tests? #f.

gnu: mgba: Update to 0.6.3.

* gnu/packages/emulators.scm (mgba): Update to 0.6.3.

gnu: Add uefitool.

* gnu/packages/flashing-tools.scm (uefitool): New variable.

gnu: Factorize rust-bootstrapped-package.

* gnu/packages/rust.scm (rust-bootstrapped-package): New procedure.
(rust): Use rust-bootstrapped-package.

gnu: Add rust@1.19.0.

* gnu/packages/rust.scm (rust-1.23)[build-system, native-inputs, inputs,
native-search-paths, synopsis, description, home-page, license]: Move to...
(rust-1.19): ... here. New variable.
(rust-1.23)[arguments]<#:phases>[set-env, patch-tests, patch-cargo-checksums]:
Move to...
(rust-1.19): ... here.
(rust-1.19)[arguments]<#:phases>[configure, check, install]: Replace by no-op.

gnu: tmux: Update to 2.7.

* gnu/packages/tmux.scm (tmux): Update to 2.7.

gnu: linux-libre@4.9: Update to 4.9.94.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9): Update to 4.9.94.

gnu: linux-libre@4.4: Update to 4.4.128.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4): Update to 4.4.128.

gnu: python-sge-pygame: Fix typo in description.

* gnu/packages/game-development.scm (python-sge-pygame) [description]: Fix
typo.

gnu: emacs-polymode: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-polymode)[arguments]: Add modes subdirectory
to #:include. Add add-modes-subdir-to-load-path phase.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: emacs-dired-hacks: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-dired-hacks)[propagated-inputs]: Add
emacs-eimp.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: Add emacs-eimp.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-eimp): New variable.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: emacs-request: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-request)[propagated-inputs]: Add
emacs-deferred.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: emacs-org-trello: Update to 0.8.0.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-org-trello): Update to 0.8.0.

gnu: emacs-org-trello: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-org-trello)[propagated-inputs]: Add emacs-f
and emacs-helm. Sort.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: Add emacs-ert-expectations.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-ert-expectations): New variable.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: wine-staging: Update to 3.6.

* gnu/packages/wine.scm (wine-staging): Update to 3.6.

gnu: wine-staging-patchset-data: Update to 3.6.

* gnu/packages/wine.scm (wine-staging-patchset-data): Update to 3.6.

gnu: Add ghostwriter.

* gnu/packages/text-editors.scm (ghostwriter): New variable.

gnu: emacs-smartparens: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-smartparens)[propagated-inputs]: Add
emacs-markdown-mode.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: emacs-mu4e-alert: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-mu4e-alert)[propagated-inputs]: Add mu.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: emacs-evil-matchit: Update to 2.2.6.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-evil-matchit): Update to 2.2.6.

gnu: emacs-evil-matchit: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-evil-matchit)[propagated-inputs]: Add
emacs-evil.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: emacs-es-mode: Update to 4.3.0.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-es-mode): Update to 4.3.0.

gnu: emacs-es-mode: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-es-mode)[propagated-inputs]: Add emacs-dash
and emacs-spark.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: Add emacs-spark.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-spark): New variable.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: emacs-cdlatex: Fix byte compilation.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-cdlatex)[propagated-inputs]: Add
emacs-auctex.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

gnu: antlr3-3.1: Fix installed script.

* gnu/packages/java.scm (antlr3-3.1)[arguments]: Fix jar name in script.

gnu: joe: Update to 4.6.

* gnu/packages/text-editors.scm (joe): Update to 4.6.

gnu: hexchat: Update to 2.14.1.

* gnu/packages/messaging.scm (hexchat): Update to 2.14.1.
[source]: Remove obsolete snippet.
[build-system]: Use the meson-build-system.
[native-inputs]: Add perl, and gettext-minimal. Remove autoconf,
autoconf-archive, automake, intltool, and libtool.
[inputs]: Add libproxy.
[arguments]: Add a phase to skip generation of icon and .desktop file databases.
Remove #:make-flags.

gnu: Add iRRAM.

* gnu/packages/multiprecision.scm (irram): New variable.

gnu: linux-libre: Update to 4.16.2.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-version): Update to 4.16.2.
(%linux-libre-hash): Update hash.

gnu: linux-libre@4.14: Update to 4.14.34.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.34.
(%linux-libre-4.14-hash): Update hash.

gnu: Add missing freeimage patch.

This is a follow-up to a5d4c96b8d90b8bb87e07bd6a7be78991db91bc9.

* gnu/packages/patches/freeimage-unbundle.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register it.

gnu: freeimage: Remove bundled libraries.

This fixes bug #28261.

* gnu/packages/image.scm (freeimage)[source]: Remove bundled libraries.
[arguments]: Replace 'configure phase, add phase to replace unbuildable
files with empty ones. Adjust makeflags to new inputs.
[native-inputs]: Add pkg-config.
[inputs]: Add libjpeg, libjxr, libpng, libraw, libtiff, libwebp,
openexr, openjpeg, zlib.
[supported-systems]: Add mips64el-linux as a supported system.

gnu: datamash: Fix tests on ARM systems.

* gnu/packages/patches/datamash-arm-tests.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/datamash.scm (datamash)[source]: Use it.

gnu: Add fasd.

* gnu/packages/admin.scm (fasd): New variable.

gnu: pioneer: Update to 20180203.

* gnu/packages/games.scm (pioneer): Update to 20180203.
[source]: Use git-fetch method to avoid github tarball.

gnu: cool-retro-term: Update to 1.0.1.

* gnu/packages/terminals.scm (cool-retro-term): Update to 1.0.1.
[source]: Programmatically remove fonts.
[arguments]: Simplify 'configure phase and use 'invoke'.  Add 'install-man
phase.  'let*' -> 'let' where possible.
* gnu/packages/patches/cool-retro-term-remove-non-free-fonts.patch: Delete.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.

Revert "Revert "gnu: nghttp2: Update to 1.31.1 [fixes CVE-2018-1000168].""

This reverts commit 4ccbdcbcadd6d2e432ee0afa220bc003e72a5b8a.

Revert "gnu: nghttp2: Update to 1.31.1 [fixes CVE-2018-1000168]."

This reverts commit 65bfe30d8a4e930599603f6d835023bbd0dbcb9a.

gnu: xf86-input-libinput: Update to 0.27.1.

* gnu/packages/xorg.scm (xf86-input-libinput): Update to 0.27.1.

gnu: nghttp2: Update to 1.31.1 [fixes CVE-2018-1000168].

* gnu/packages/web.scm (nghttp2): Update to 1.31.1.

gnu: lrdf: Update to 0.6.1.

* gnu/packages/rdf.scm (lrdf): Update to 0.6.1.
[source](uri): Adjust to version prefix.
[arguments]: Remove obsolete deletions.
[inputs]: Remove OPENSSL.

gnu: gnupg: Remove unreferenced inputs.

* gnu/packages/gnupg.scm (gnupg)[inputs]: Remove bzip2, curl.

gnu: gnupg: Update to 2.2.6.

* gnu/packages/gnupg.scm (gnupg): Update to 2.2.6.

gnu: krita: Update to 4.0.1.

* gnu/packages/kde.scm (krita): Update to 4.0.1.

system: Provide a fall-back PATH for non-login shells started with su(1).

* gnu/system.scm (operating-system-etc-service): Provide values for
ENV_PATH and ENV_SUPATH in '/etc/login.defs'.

gnu: icecat: Add more fixes from upstream mozilla-esr52.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (icecat)[source]: Add selected fixes from the
upstream mozilla-esr52 repository.

gnu: icecat: Add more configure flags and rename a phase.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (icecat)[arguments]: To configure-flags, add
"--with-distribution-id=org.gnu", "--disable-tests", "--disable-updater",
"--disable-crashreporter", "--disable-maintenance-service", and
"--disable-eme".  Rename the
'arrange-to-link-libxul-with-libraries-it-might-dlopen' phase to
'link-libxul-with-libraries'.

services: cgit: Add support for project-list.

* doc/guix.texi (Version Control Services): Update accordingly.
* gnu/services/cgit.scm (cgit-configuration)[project-list]: New field.
(serialize-project-list): New procedure that uses PLAIN-FILE to generate a
file from the string list given by the user as input.
(serialize-cgit-configuration): Make sure to serialize 'project-list' before
'repostory-directory'.

services: cgit: Enforce serialization order.

* gnu/services/cgit.scm (serialize-cgit-configuration): New procedure that
serializes fields with a precise order.
(cgit-activation): Replace the generic SERIALIZE-CONFIGURATION with
SERIALIZE-CGIT-CONFIGURATION.

services: cgit: Add support for file-like objects.

* doc/guix.texi (Version Control Services): Update accordingly.
* gnu/services/cgit.scm (serialize-field, serialize-string, serialize-boolean,
serialize-integer, serialize-repository-cgit-configuration-list,
serialize-nginx-server-configuration-list, serialize-repo-field,
serialize-repo-boolean, serialize-repo-integer, serialize-module-link-path,
serialize-repository-directory, serialize-mimetype-alist): Return strings or
string-valued gexps and stop printing.
(repository-cgit-configuration)[source-filter, about-filter, commit-filter,
logo, owner-filter], (cgit-configuration)[auth-filter, commit-filter, css,
email-filter, favicon, include, logo, owner-filter, mimetype-file, readme,
source-filter]: Replace STRING with FILE-OBJECT.
(file-object?, serialize-file-object, repo-file-object?,
serialize-repo-file-object): New procedures.
(cgit-activation): Use SERIALIZE-CONFIGURATION's return value with
MIXED-TEXT-FILE instead of using its output with PLAIN-FILE.

services: cgit: Simplify 'serialize-module-link-path'.

* gnu/services/cgit.scm (serialize-module-link-path): Remove STRING-DROP-RIGHT
and UGLIFY-FIELD-NAME.

services: cgit: Simplify 'uglify-field-name'.

* gnu/services/cgit.scm (uglify-field-name): Remove STRING-JOIN and
STRING-SPLIT.

gnu: linux-libre: Update to 4.16.1.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-version): Update to 4.16.1.
(%linux-libre-hash): Update hash.
* gnu/packages/aux-files/linux-libre/4.15-arm.conf,
gnu/packages/aux-files/linux-libre/4.15-i686.conf,
gnu/packages/aux-files/linux-libre/4.15-x86_64.conf: Delete files.
* gnu/packages/aux-files/linux-libre/4.16-arm.conf,
gnu/packages/aux-files/linux-libre/4.16-i686.conf,
gnu/packages/aux-files/linux-libre/4.16-x86_64.conf: New files.
* Makefile.am (AUX_FILES): Update accordingly.

gnu: linux-libre: Add 'patch-/bin/pwd' phase.

* gnu/packages/linux.scm (make-linux-libre)[arguments]: Add 'patch-/bin/pwd'
phase.

gnu: elfutils: Disable failing test.

* gnu/packages/elf.scm (elfutils)[arguments]: Skip test which always
fails on aarch64-linux.

gnu: guile-config: Update to 0.2.

* gnu/packages/guile.scm (guile-config): Update to 0.2.
  [source]: Change to github repo.
  [native-inputs]: Add make dist dependencies.
  [license]: Update license.

nls: Add Spanish translation.

self: Produce a spliced (guix config) to placate Guile 2.0.

Fixes 'guix pull' with Guile 2.0.
See <https://debbugs.gnu.org/cgi/bugreport.cgi?bug=27284#153>.

* guix/self.scm (make-config.scm): Remove 'begin' in 'scheme-file'
argument and pass #:splice? #t.

gexp: 'scheme-file' can splice expressions.

* guix/gexp.scm (<scheme-file>)[splice?]: New field.
(scheme-file): Add #:splice? and pass it to '%scheme-file'.
(scheme-file-compiler): Pass SPLICE? to 'gexp->file'.
(gexp->file): Add #:splice? and honor it.
* tests/gexp.scm ("gexp->file + #:splice?"): New test.
("gexp->derivation & with-imported-module & computed module"): Use
 #:splice? #t.

self: 'package-for-guile' really honors GUILE-VERSION.

* guix/self.scm (package-for-guile): Pass GUILE-VERSION to
'false-if-wrong-guile'.

self: Remove 'eval-when' from in generated (guix config).

* guix/self.scm (make-config.scm): Remove unneeded 'eval-when'.

gnu: Add qBittorrent.

* gnu/packages/bittorrent.scm (qBittorrent): New public variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: libtorrent-rasterbar: Add CXXFLAGS.

* gnu/packages/bittorrent.scm (libtorrent-rasterbar): Add CXXFLAGS.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: tlsdate: Fix compilation on aarch64-linux-gnu.

* gnu/packages/ntp.scm (tlsdate)[arguments]: Add #:configure-flags.

gnu: guix: Update to 486de73.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 486de73.

gnu: mes: Update to 0.12.

* gnu/packages/mes.scm (mes): Update to 0.12.

gnu: cuirass: Update to 238f856.

* gnu/packages/ci.scm (cuirass): Update to 238f856.

self: Don't use deprecated package names.

* guix/self.scm (compiled-guix)[guile-json, guile-ssh]: Don't refer t
"guile2.2-json" and "guile2.2-ssh", which are deprecated.

self: Export '%guix-register-program' in generated (guix config).

* guix/self.scm (make-config.scm): Export '%guix-register-program'.

self: Fix package names for compilation with Guile 2.0.

Reported by Ricardo Wurmus.

* guix/self.scm (specification->package): Add guile2.0-{json,git,ssh}.
(guile-for-build): Use 'module-ref' for Guile 2.0.

self: Display a new line at the end of module compilation.

* guix/self.scm (compiled-modules)[build]: Add a 'newline' call at the
end.

self: Don't substitute the '-source' derivations.

With substitution enabled we would end up downloading 10+ MiB of source
that's already available locally on disk.

* guix/self.scm (imported-files): Pass #:options to 'computed-file'.

gnu: hwloc: Skip 'linux-libnuma' test.

That test would fail on some machines, for instance build machines
behind berlin.guixsd.org.

* gnu/packages/mpi.scm (hwloc)[arguments]: Add 'skip-linux-libnuma-test'
phase.
(hwloc-2.0)[arguments]: Replace it.

gnu: Add libcgroup.

 * gnu/packages/linux.scm (libcgroup): New variable.

gnu: chromaprint: Fix typo.

* gnu/packages/mp3.scm (chromaprint): Fix typo.

gnu: retroarch: Update checksum.

* gnu/packages/emulators.scm (retroarch): Update checksum.

gnu: mgba: Update to 0.6.2.

* gnu/packages/emulators.scm (mgba): Update to 0.6.2.

gnu: eyeD3: Update to 0.8.5.

* gnu/packages/mp3.scm (eyed3): Update to 0.8.5.
[source]: Use pypi-uri.
[propagated-inputs]: Add python-magic and python-pathlib.

gnu: linux-libre: Add elfutils to native-inputs.

Suggested by Leo Famulari <leo@famulari.name>

* gnu/packages/linux.scm (make-linux-libre)[native-inputs]: Add elfutils.

gnu: linux-libre: Add flex and bison to native-inputs.

* gnu/packages/linux.scm (make-linux-libre)[native-inputs]: Add flex and
bison.

gnu: linux-libre: Update to 4.15.16.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-version): Update to 4.15.16.
(%linux-libre-hash): Update hash.

gnu: linux-libre@4.14: Update to 4.14.33.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.33.
(%linux-libre-4.14-hash): Update hash.

gnu: linux-libre@4.9: Update to 4.9.93.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9): Update to 4.9.93.

gnu: linux-libre@4.4: Update to 4.4.127.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4): Update to 4.4.127.

hydra: Fix uses of 'eval-when'.

* build-aux/hydra/gnu-system.scm: Use (expand load eval) in 'eval-when'
clause so as to not poison a cat and to ensure %load-compiled-path is
properly set when the 'use-modules' clauses are expanded.
* build-aux/hydra/guix.scm: Likewise.

gnu: Add bear.

* gnu/packages/build-tools.scm (bear): New public variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add unittest-cpp.

* gnu/packages/check.scm (unittest-cpp): New public variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: ghc-psqueues: Update to 0.2.6.0.

* gnu/packages/haskell.scm (ghc-psqueues): Update to 0.2.6.0.
[arguments]: Enable tests.
[home-page]: Update link.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: gnurl: Update to version 7.59.0.

* gnu/packages/gnunet.scm (gnurl): Update to version 7.59.0.
[source]: Add temporary second source at ftp.n0.is.

Signed-off-by: Nils Gillmann <ng0@n0.is>
Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>