gnu: Add liblo.

* gnu/packages/audio.scm (liblo): New variable.

gnu: Add JACK2.

* gnu/packages/audio.scm (jack-2): New variable.

gnu: Add srt2vtt.

* gnu/packages/video.scm (srt2vtt): New variable.

services: lsh: Add graceful handling of daemonic option.

* gnu/services/ssh.scm (lsh-service): New #:keys (daemonic?, pid-file?,
  pid-file).  Build new lshd-command and expand service-requirement
  field.
* doc/guix.texi (Networking Services): Update accordingly.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

build: Add 'waf-build-system'.

* guix/build-system/waf.scm,
  guix/build/waf-build-system.scm: New files.
* Makefile.am (MODULES): Add them.
* doc/guix.texi (Build Systems): Document waf-build-system.

doc: Remove ".ko" extension in 'base-initrd' example.

Reported by Marek Benc.

* doc/guix.texi (Initial RAM Disk): Remove ".ko" from the 'base-initrd'
  example.  Add a comment.

profiles: Distinguish downgrades from upgrades.

Fixes <http://bugs.gnu.org/19764>.

* guix/profiles.scm (manifest-transaction-effects): Return downgraded
  packages as a fourth value.
* guix/ui.scm (show-manifest-transaction): Adjust accordingly.
* tests/profiles.scm ("manifest-transaction-effects and downgrades"):
  New test.

ui: Simplify 'show-manifest-transaction' test.

* tests/ui.scm ("show-manifest-transaction"): Remove useless call to
  'manifest-transaction-effects'.

ui: Properly report '&nar-error' conditions.

This is a followup to 46b8aad.

* guix/ui.scm (call-with-error-handling): Add 'nar-error?' case.

build: Remove references to 'nix-setuid-helper'.

'nix-setuid-helper' vanished in commit d43eb499a (Jan. 2014.)

* pre-inst-env.in: Remove occurrences of 'NIX_SETUID_HELPER'.

gnu: guile-ssh: Correct post-installation test.

* gnu/packages/ssh.scm (guile-ssh)[arguments]
  <fix-libguile-ssh-file-name>: Call 'zero?' to check the return value of
  'system*'.

gnu: Add p11-kit.

* gnu/packages/gnutls.scm (p11-kit): New variable.

gnu: Add libmtp.

* gnu/packages/libusb.scm (libmtp): New variable.

gnu: tidy: Run bootstrap phase after the unpack phase.

* gnu/packages/web.scm (tidy): Run bootstrap phase after the unpack phase,
  rather than before the configure phase.

gnu: linux-libre: Update to 3.18.6

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre): Update to version 3.18.6.

gnu: Add tidy.

* gnu/packages/web.scm (tidy): New variable.

gnu: lightning: Update to 2.1.0.

* gnu/packages/lightning.scm (lightning): Update to 2.1.0.

Thank Andrei.

daemon: Flush upon '\r' when reading the substituter's stderr.

* nix/libstore/local-store.cc (LocalStore::getLineFromSubstituter):
  Flush when the line contains '\r'.

serialization: Check for EOF and incomplete input conditions.

Fixes <http://bugs.gnu.org/19756>.
Reported by <sleep_walker@suse.cz>.

* guix/serialization.scm (currently-restored-file): New variable.
  (get-bytevector-n*): New procedure.
  (read-int, read-long-long, read-string, read-latin1-string,
  read-contents): Use it instead of 'get-bytevector-n'.
  (restore-file): Parameterize 'currently-restored-file' and set it.
* tests/nar.scm ("restore-file with incomplete input"): New test.

doc: Document the location of the build directory.

Fixes <http://bugs.gnu.org/19771>.
Reported by Andrei Osipov <andrspv@gmail.com>.

* doc/guix.texi (Invoking guix-daemon): Document the build directory
  location.

gnu: gimp: Add EXIF and SVG support, plus color management.

* gnu/packages/gimp.scm (gimp)[inputs]: Add LIBEXIF, LCMS, and LIBRSVG.

gnu: podofo: Add optional input lua.

* gnu/packages/pdf.scm (podofo): Add optional input lua-5.1.

gnu: podofo: Update to 0.9.3.

* gnu/packages/pdf.scm (podofo): Update to 0.9.3.

gnu: podofo: Enable building a shared library.

* gnu/packages/pdf.scm (podofo): Enable building a shared library in addition
    to a static one.

gnu: chmlib: Correct license.

* gnu/packages/ebook.scm (chmlib): Correct copy-pasted license field.

gnu: Add chmlib.

* gnu/packages/ebook.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: dejagnu: Update to 1.5.2.

* gnu/packages/dejagnu.scm (dejagnu): Update to 1.5.2.

gnu: global: Update to 6.3.4.

* gnu/packages/global.scm (global): Update to 6.3.4.

gnu: eigen: Update to 3.2.4.

* gnu/packages/algebra.scm (eigen): Update to 3.2.4.

gnu: imagemagick: Update to 6.9.0-4.

* gnu/packages/imagemagick.scm (imagemagick): Update to 6.9.0-4.

gnu: tumbler: Update to 0.1.30.

* gnu/packages/xfce.scm (tumbler): Update to 0.1.30.  Use latest gstreamer.

gnu: wicd: Fix curses client to work with urwid 1.3.

* gnu/packages/patches/wicd-urwid-1.3.patch: New file.
* gnu-system (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/wicd.scm (wicd): Add patch.

gnu: ntp: Update to 4.2.8p1.

* gnu/packages/ntp.scm (ntp): Update to 4.2.8p1.

gnu: slock: Update to 1.2

* gnu/packages/dwm.scm (slock): Update to 1.2

tests: Disable grafts when comparing derivations.

Fixes a regression introduced with the grafting of Patch in 3f11f01.

* tests/packages.scm ("reference to non-existent output"): Wrap in
  'parameterize'.

guix package: Make custom profiles actual indirect roots.

Before that, any profile generation built when '-p' is used would
effectively become a permanent GC root because the symlink in
/var/guix/gcroots/auto would point directly to /gnu/store/...-profile.

* guix/scripts/package.scm (maybe-register-gc-root): Rename to...
  (register-gc-root): ... this.  Remove conditional, and replace call to
  'canonicalize-path' with (string-append (getcwd) "/" ...).
  (guix-package): Call 'register-gc-root' only if PROFILE is different
  from %CURRENT-PROFILE.
* tests/guix-package.sh: Add test case.

pull: Always install the ~/.config/guix/latest symlink.

Before that, if two users on the same machine ran 'guix pull', the
second one would have the "Guix already up to date" message and their
~/.config/guix/latest link would be left unchanged---effectively
preventing them from updating.

* guix/scripts/pull.scm (build-and-install): Install the 'latest'
  symlink regardless of whether TO-DO? is true or false.

doc: Provide a better illustration of Ethernet interface names.

Reported on #guix.

* doc/guix.texi (System Installation)[USB Stick Installation]: Mention
  "eno1" instead of "eth0" and give other examples.

gnu: patch: Add 2.7.4 and make it a replacement for the default one.

* gnu/packages/base.scm (patch-2.7.4, patch-CVE-2015-1196): New
  variables.
  (patch): Add 'replacement' field.

services: xorg: Add Nouveau driver.

* gnu/services/xorg.scm (xorg-start-command)[xserver.conf]: Add
  XF86-VIDEO-NOUVEAU.

gnu: Add xf86-video-nouveau.

* gnu/packages/xorg.scm (xf86-video-nouveau): New variable.

gnu: xf86-video-nv: Improve description.

* gnu/packages/xorg.scm (xf86-video-nv): Adjust synopsis and
  description.

gnu: orc: Disable the 'test-limits' and 'exec_opcodes_sys' tests.

* gnu/packages/gstreamer.scm (orc)[arguments]: Disable the 'test-limits' and
  'exec_opcodes_sys' tests, which fail on some machines.

offload: Better report failure to create the GC root directory.

Suggested by Ricardo Wurmus <ricardo.wurmus@mdc-berlin.de>.

* guix/scripts/offload.scm (register-gc-root)[script]: Replace
  'false-if-exception' with a finer-grain 'system-error handler.
  Provide the name of MACHINE in 'leave' error message.

gnu: groff: Add "doc" output.

* gnu/packages/groff.scm (groff): Add 'outputs' field.

offload: Warn about SSH client issues.

Suggested by Ricardo Wurmus <ricardo.wurmus@mdc-berlin.de>.

* guix/scripts/offload.scm (remote-pipe): Remove unneeded 'catch'.
  (machine-load): Check the exit value  upon (close-pipe pipe).  Call
  'warning' when it is non-zero.

nls: Update 'eo' translation.

gnu: gnutls: Configure location of system-wide trust store.

* gnu/packages/gnutls.scm (gnutls): Configure the location of the system-wide
  trust store.

gnu: Add ngircd.

* gnu/packages/messaging.scm (ngircd): New variable.
* gnu/packages/patches/ngircd-no-dns-in-tests.patch: New file.
* gnu/packages/patches/ngircd-handle-zombies.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add them.

gnu: Add xfce.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce): New variable.

gnu: gnutls: Propagate zlib.

* gnu/packages/gnutls.scm (gnutls): Move zlib to 'propagated-inputs'.

gnu: gnutls: Update to 3.3.12.

* gnu/packages/gnutls.scm (gnutls): Update to 3.3.12.

gnu: gst-plugins-good: Update to 1.4.5.

* gnu/packages/gstreamer.scm (gst-plugins-good): Update to 1.4.5.

gnu: gst-plugins-base: Update to 1.4.5, re-enable tests.

* gnu/packages/gstreamer.scm (gst-plugins-base): Update to 1.4.5.
  [arguments]: Add #:phases.
  [inputs]: Add cdparanoia and orc.

gnu: gstreamer: Update to 1.4.5, propagate glib.

* gnu/packages/gstreamer.scm (gstreamer): Update to 1.4.5.
  [arguments]: Remove field to re-enable tests.
  [inputs]: Rename to 'propagated-inputs'.

gnu: Add orc.

* gnu/packages/gstreamer.scm (orc): New variable.

gnu: sdl: Don't use dlopen for shared object loading.

* gnu/packages/sdl.scm (sdl)[arguments]<#:configure-flags>:
  Use '--disable-sdl-dlopen'.
  [propagated-inputs]: Add libcap.

gnu: sdl2: Update to 2.0.3.

* gnu/packages/sdl.scm (sdl2): Update to 2.0.3.

gnu: libmikmod: Update to 3.3.7.

* gnu/packages/sdl.scm (libmikmod): Update to 3.3.7.

gnu: wicd: Allow wicd-gtk to find its icons.

* gnu/packages/wicd.scm (wicd)[inputs]: Add hicolor-icon-theme.
  [arguments]: Install icons in $out/share/icons.  Install a copy of
  'index.theme' from 'hicolor-icon-theme' into $out/share/icons/hicolor.

services: Add wicd service.

* gnu/services/networking.scm (wicd-service): New procedure.
* doc/guix.texi (Networking Services): Document it.

gnu: Add wicd.

Based on preliminary work by Pierre-Antoine Rault <par@rigelk.eu>

* gnu/packages/wicd.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: wpa-supplicant: Add dbus support; add wpa-supplicant-light.

* gnu/packages/admin.scm (wpa-supplicant-light): New variable containing the
  previous dbus-free package, but renamed.  Remove outdated TODO comments.
  (wpa-supplicant): Now inherits from wpa-supplicant-light but adds dbus
  support.
* gnu/system/install.scm (installation-os): Use wpa-supplicant-light.

gnu: nss-mdns: Allow the daemon's socket to be found.

* gnu/packages/avahi.scm (nss-mdns)[arguments]: New field.

services: nscd-service: Add #:name-services parameter.

* gnu/services/base.scm (nscd-service): Add #:name-services parameter.
  In 'start' field, set LD_LIBRARY_PATH based on #:name-services.
* doc/guix.texi (Base Services): Document it.
  (Name Service Switch): Link to 'nscd-service'.

system: Add bindings to configure libc's NSS.

* gnu/system/nss.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.
* gnu.scm (%public-modules): Add it.
* gnu/system.scm (<operating-system>)[name-service-switch]: New field.
  (etc-directory): Add #:nss parameter and honor it.
  (operating-system-etc-directory): Adjust call accordingly.
* doc/guix.texi (operating-system Reference): Document
  'name-service-switch'.
  (Name Service Switch): New section.

gnu: wpa-supplicant: Install man pages.

* gnu/packages/admin.scm (wpa-supplicant)[arguments]: Add
  'install-man-pages' phase.

gnu: wpa-supplicant: Use GnuTLS instead of OpenSSL.

* gnu/packages/admin.scm (wpa-supplicant)[arguments] <configure phase>:
  Set CONFIG_TLS.
  [inputs]: Add GNUTLS and LIBGCRYPT.

build: Make 'chroot' a hard requirement.

* config-daemon.ac: Error out when $ac_cv_func_chroot is not "yes".
* nix/nix-daemon/guix-daemon.cc (options): Remove #ifdef HAVE_CHROOT.
  (main): Likewise.

gnu: libffcall: Correct license field.

Suggested by Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>.

* gnu/packages/libffcall.scm (libffcall): Change license to gpl2+.

gnu: Add libffcall.

* gnu/packages/libffcall.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

Co-Authored-By: Joshua S. Grant <jgrant@parenthetical.io>

Add support for 'cvs-fetch' method in origins.

* guix/cvs-download.scm, guix/build/cvs.scm: New files.
* Makefile.am (MODULES): Add them.

gnu: Add python2-dbus.

* gnu/packages/python.scm (python2-dbus): New variable.

gnu: Add python-dbus.

* gnu/packages/python.scm (python-dbus): Add it. Makes use of dbus,
  dbus-glib and glib itself.

Remove outdated comment from svn-fetch.

* guix/svn-download.scm (svn-fetch): Remove outdated comment.

gnu: python-urwid: Remove Fedora mirror from source URI list.

* gnu/packages/python.scm (python-urwid)[source]: Remove Fedora mirror.

gnu: wpa-supplicant: Update to 2.3.

* gnu/packages/admin.scm (wpa-supplicant): Update to 2.3.  Update URLs.

guix: environment: Consider all package outputs.

* guix/scripts/environment.scm (for-each-search-path): Iterate over all
  derivation output paths.
  (packages->transitive-inputs): Process inputs that specify an output, too.

services: xorg: Add sawfish session.

* gnu/services/xorg.scm (%sawfish-session-type): New variable.
* doc/guix.texi (X Window): Mention it.

gnu: Add sawfish.

* gnu/packages/sawfish.scm (sawfish): New variable.

gnu: Add rep-gtk.

* gnu/packages/sawfish.scm (rep-gtk): New variable.

gnu: Add librep.

* gnu/packages/sawfish.scm: New file.
* gnu/packages/patches/librep-rules.mk.patch: New file.
* gnu-system.am: Add them.

gnu: Add python-urwid and python2-urwid.

Based on preliminary work by Omar Radwan <toxemicsquire4@gmail.com>.

* gnu/packages/python.scm (python-urwid, python2-urwid): New variables.

gnu: httpd: Add perl input.

* gnu/packages/web.scm (httpd): Add perl input.

gnu: inkscape: Update to 0.91.

* gnu/packages/inkscape.scm (inkscape): Update to 0.91.

gnu: node: Update to 0.10.36.

* gnu/packages/node.scm (node): Update to 0.10.36.

gnu: elfutils: Update to 0.161.

* gnu/packages/elf.scm (elfutils): Update to 0.161.

gnu: sipwitch: Update to 1.9.6.

* gnu/packages/telephony.scm (sipwitch): Update to 1.9.6.

Set Emacs indentation for `wrap-program'.

* .dir-locals.el (scheme-mode): Set `scheme-indent-function' of `wrap-program'
  to 1.

gnu: ucommon: Update to 6.3.0.

* gnu/packages/telephony.scm (ucommon): Update to 6.3.0.

Revert "gnu: python-matplotlib: Remove python-pillow input."

python-pillow is now fixed, so we can add it back.
This reverts commit dfbc33dceb803a3d54840613b08dc98f7be75f60.

gnu: openjpeg: Upgrade to 2.1.0.

* gnu/packages/image.scm (openjpeg): Upgrade to 2.1.0.
  (openjpeg-2.0): New variable.
* gnu/packages/pdf.scm (mupdf)[inputs]: Use openjpeg-2.0.

gnu: Add hdparm.

* gnu/packages/linux.scm (hdparm): New variable.

store: Remove 'build-derivations'.

* guix/store.scm (build-derivations): Remove.
* guix/derivations.scm (build-derivations): Write in terms of
  'build-things'.
* doc/guix.texi (Invoking guix build): Adjust text accordingly.

tests: Skip 'guix-register' when the socket name length is exceeded.

* tests/guix-register.sh: Before running 'guix-daemon', check whether
  the socket name length exceeds the system limitation.

tests: Don't dump the list of dead items in the test log.

* tests/store.scm ("dead-paths"): Wrap result in '->bool'.

store: Add 'build-things'.

* guix/store.scm (operation-id): Rename 'build-derivations' to
  'build-things', as per Nix commit 1aba0bf0.
  (build-derivations): Rename to...
  (build-things): ... this.  Keep 'build-derivations' as an alias.
  (build): New procedure.
* tests/store.scm ("build-things with output path",
  "substitute + build-things with output path"): New tests.

tests: Add 'with-derivation-substitute' and use it.

* guix/tests.scm (%substitute-directory): New variable.
  (call-with-derivation-narinfo): Use it.
  (call-with-derivation-substitute): New procedure.
  (with-derivation-substitute): New macro.
* tests/store.scm ("substitute"): Use 'with-derivation-substitute'.
  ("substitute, corrupt output hash"): Likewise.

tests: Further factorize substitute mocks.

* guix/tests.scm (derivation-narinfo): Turn 'nar' into a keyword
  parameter.  Add #:sha256 parameter, and honor it.
  (call-with-derivation-narinfo): Add #:sha256 and pass it to
  'derivation-narinfo'.
  (with-derivation-narinfo): Extend with support for (sha256 => value).
* tests/store.scm ("substitute query"): Use 'with-derivation-narinfo'.
  ("substitute"): Likewise.
  ("substitute, corrupt output hash"): Likewise.
  ("substitute --fallback"): Likewise.
* tests/derivations.scm: Remove Emacs local variable.