gnu: Add GNU Diction.

* gnu/packages/dictionaries.scm (diction): New variable.

gnu: imagemagick: Update to 6.9.4-10.

* gnu/packages/imagemagick.scm (imagemagick): Update to 6.9.4.10.

bournish: Add 'wc' command.

* guix/build/bournish.scm (lines+chars, file-exists?*, wc-print)
(wc-l-print, wc-c-print, wc-command, wc-command-implementation)
(wc-l-command-implementation, wc-c-command-implementation): New procedures.
(%commands): Add 'wc'.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

tests: basic: Don't hard-code the expected architecture name.

* gnu/tests/base.scm (run-basic-test)["uname"]: Don't hard-code the
architecture.

tests: Installation test no longer requires KVM.

* gnu/tests/install.scm (%test-installed-os): Use '-enable-kvm' only
when /dev/kvm exists.

substitute: Use ~/.cache when invoked by an unprivileged user.

This is a followup to ea0c6e0507a6997f12a4f29d0445b51cf53bd81e.

* guix/scripts/substitute.scm (%narinfo-cache-directory): Use
'cache-directory' when (getuid) returns non-zero.
(cache-narinfo!): Remove 'catch'.

utils: 'cache-directory' honors 'XDG_CACHE_HOME'.

* guix/utils.scm (cache-directory): Honor 'XDG_CACHE_HOME', not
'XDG_CONFIG_HOME'.

doc: Document 'make check-system'.

* doc/guix.texi (Running the Test Suite): Document 'make check-system'.

services: Add 'mcron-service'.

* gnu/services/mcron.scm: New file.
* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.
* gnu/tests/base.scm (%mcron-os, %test-mcron): New variables.
(run-mcron-test): New procedure.
* doc/guix.texi (Scheduled Job Execution): New node.

gnu: Add mcron2.

* gnu/packages/guile.scm (mcron2): New variable.

gnu: xorg.scm: Replace http with https in URLs.

* gnu/packages/xorg.scm: Use https for cgit.freedesktop.org,
www.x.org/wiki/, anongit.freedesktop.org.

gnu: haskell.scm: Replace http with https in Hackage, Github.

* gnu/packages/haskell.scm: Use https for Hackage, Github urls.

gnu: efl: Update to 1.17.2.

* gnu/packages/enlightenment.scm (efl): Update to 1.17.2.

gnu: lightning: Fix typo.

This is a followup to commit c283b22e93cbf496e13b25878be3ec8a1242fb73.

* gnu/packages/assembly.scm (lightning): Add 'license' prefix.

gnu: perl-test-harness: Update to 3.36.

* gnu/packages/perl.scm (perl-test-harness): Update to 3.36.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: lightning: Move to (gnu packages assembly).

* gnu/packages/lightning.scm: Remove.  Move 'lightning' to...
* gnu/packages/assembly.scm (lightning): ... here.  New variable.
* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Adjust accordingly.

build: emacs: Search for elisp in "share/emacs/site-lisp".

* guix/build/emacs-build-system.scm (emacs-inputs-el-directories):
Add ".../share/emacs/site-lisp" directory to the returned result as
elisp files can also be placed there.

gnu: beets: Move propagated-inputs to inputs.

* gnu/packages/music.scm (beets)[propagated-inputs]: Replace with ...
[inputs]: ... new field.

gnu: beets: Update to 1.3.18.

* gnu/packages/patches/beets-image-test-failure.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/music.scm (beets): Update to 1.3.18.
[source]: Use patch.

gnu: vsearch: Update to 0.11.2.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (vsearch): Update to 0.11.2.

gnu: nasm: Make build bit-reproducible.

* gnu/packages/patches/nasm-no-ps-pdf.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/assembly.scm (nasm): Use it.  Remove ghostscript, do not
build PS or PDF docs.  Makes build bit-reproducible.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

hydra: Fix the construction of system test jobs.

* build-aux/hydra/gnu-system.scm (system-test-jobs)[test->thunk]: New
procedure.
[->job]: Use it.

hydra: 'evaluate' now validates job alists.

* build-aux/hydra/evaluate.scm (assert-valid-job): New procedure.
<top level>: Use it.

gnu: Add ruby-puma.

gnu/packages/ruby.scm (ruby-puma): New variable.
gnu/packages/patches/ruby-puma-ignore-broken-test.patch: New file.
gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: Add ruby-hoe-git.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-hoe-git): New variable.

gnu: Add r-vegan.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-vegan): New variable.

gnu: Add r-mgcv.

* gnu/packages/statistics.scm (r-mgcv): New variable.

gnu: Add r-permute.

* gnu/packages/statistics.scm (r-permute): New variable.

gnu: texlive: Update to 2016.

* gnu/packages/tex.scm (texlive-extra-src, texlive-texmf-src,
texlive-bin, texlive-texmf, texlive): Update to 2016.
(texlive-texmf)[properies]: Add max-silent-time so grafts don't time out.

gnu: Adjust to yasm change of module.

This is a followup to 15a3fffc593a2385bbac60913909833babc1625f.

* gnu/packages/gnuzilla.scm,
gnu/packages/gstreamer.scm, gnu/packages/kodi.scm,
gnu/packages/video.scm: Adjust import list to yasm move.

gnu: yasm: Move to (gnu packages assembly).

* gnu/packages/yasm.scm: Remove.  Move 'yasm' to...
* gnu/packages/assembly.scm (yasm): ... here.  New variable.
* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Adjust accordingly.

gnu: Add nasm.

* gnu/packages/assembly.scm: New file.
* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

install: Pass a relative file name to 'local-file'.

This is a followup to cbbbb7be0fbaa11ff75bce92f2d82131ff8db104.

* gnu/system/install.scm (/etc/configuration-files): Pass a relative
file name to 'local-file'.

gnu: diamond: Update to 0.8.7.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (diamond): Update to 0.8.7.

gnu: Update american-fuzzy-lop to 2.15b.

* gnu/packages/debug.scm (american-fuzzy-lop): Update to 2.15b.

gnu: Add thefuck.

* gnu/packages/admin.scm (thefuck): New variable.

gnu: shotwell: Update to 0.23.1.

Addresses DWF-2016-89001: validate TLS certificates.

* gnu/packages/gnome.scm (shotwell): Update to 0.23.1.
[inputs]: replace webkitgtk-2.4 with webkitgtk.

gnu: python-wsgi-intercept: Update to 1.2.2.

* gnu/packages/python.scm (python-wsgi-intercept, python2-wsgi-intercept):
Update to 1.2.2.

gnu: python-requests-toolbelt: Update to 0.6.2.

* gnu/packages/python.scm (python-requests-toolbelt,
python2-requests-toolbelt): Update to 0.6.2.

gnu: vdirsyncer: Update to 0.11.2.

* gnu/packages/dav.scm (vdirsyncer): Update to 0.11.2.

gnu: python-click-threading: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/python.scm (python-click-threading, python2-click-threading):
Update to 0.2.0.

gnu: python-click: Update to 6.6.

* gnu/packages/python.scm (python-click, python2-click): Update to 6.6.

gnu: Add warzone2100.

* gnu/packages/games.scm (warzone2100): New variable.

hydra: Set the guile-for-build for the test jobs.

* build-aux/hydra/gnu-system.scm (system-test-jobs): Call
'set-guile-for-build'.

hydra: Add jobs for the system tests.

* build-aux/hydra/gnu-system.scm (%guixsd-supported-systems): New
variable.
(qemu-jobs): Use it.
(system-test-jobs): New procedure.
(hydra-jobs): Use it.

gexp: Use a relative file name.

This is a followup to cbbbb7be0fbaa11ff75bce92f2d82131ff8db104.

* guix/gexp.scm (%utils-module): Use a file name relative to this file
instead of using 'search-path'.

build: 'make check-system' now honors $TESTS.

* build-aux/run-system-tests.scm (run-system-tests)[tests]: Honor the
'TESTS' environment variable.

tests: Add a mechanism to describe and discover system tests.

* gnu/tests.scm (<system-test>): New record type.
(write-system-test, test-modules, fold-system-tests)
(all-system-tests): New procedures.
* gnu/tests/base.scm (%test-basic-os): Turn into a <system-test>.
* gnu/tests/install.scm (%test-installed-os): Likewise.
* build-aux/run-system-tests.scm (%system-tests): Remove.
(run-system-tests): Use 'all-system-tests'.

packages: Export 'scheme-modules'.

* gnu/packages.scm (package-modules): Rename to...
(scheme-modules): ... this.  Export.  Update callers.

tests: Add system installation test.

* gnu/tests.scm (define-os-with-source): New macro.
* gnu/tests/install.scm: New file.
* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.
* build-aux/run-system-tests.scm (%system-tests): Likewise.

vm: 'qemu-command' honors its argument.

* gnu/build/vm.scm (qemu-command): Refer to SYSTEM rather than
%HOST-TYPE in the body.

tests: base: Fully honor the OS passed to 'run-basic-test'.

* gnu/tests/base.scm (run-basic-test)["uname"]: Use the host name of OS.
["shepherd services"]: Use service names from OS.
(%test-basic-os): Add call to 'virtualized-operating-system'.

gnu: guile-next: Update to 2.1.3.

* gnu/packages/guile.scm (guile-next): Update to 2.1.3.

gnu: Add argon2.

* gnu/packages/password-utils.scm (argon2): New variable.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: git: Update to 2.9.0

* gnu/packages/version-control.scm (git): Update to 2.9.0.
(git-manpages)[source]: Update hash.

gnu: chicken: Update to 4.11.0 [fixes CVE-2014-9651].

* gnu/packages/scheme.scm (chicken): Update to 4.11.0.

gnu: Add quesoglc.

* gnu/packages/game-development.scm (quesoglc): New variable.

gnu: perl-uri: Update to 1.71.

* gnu/packages/web.scm (perl-uri): Update to 1.71.

Signed-off-by: 宋文武 <iyzsong@gmail.com>

gnu: Add guile-dbd-sqlite3.

* gnu/packages/guile.scm (guile-dbd-sqlite3): New variable.

gnu: Add guile-dbi.

* gnu/packages/guile.scm (guile-dbi): New variable.

gnu: screen: Update to 4.4.0.

* gnu/packages/screen.scm (screen): Update to 4.4.0.

gnu: Add emacs-lispy.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-lispy): New variable.

gnu: Add emacs-iedit.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-iedit): New variable.

gnu: Add emacs-ace-window.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-ace-window): New variable.

gnu: Add emacs-avy.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-avy): New variable.

gnu: Add emacs-ivy.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-ivy): New variable.

gnu: Add emacs-hydra.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-hydra): New variable.

gnu: Add emacs-org-bullets.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-org-bullets): New variable.

tests: Fix list of exports in (gnu tests).

* gnu/tests.scm: Export 'marionette-service-type'.

tests: Export 'run-basic-test'.

* gnu/tests/base.scm (run-basic-test): New procedure, extracted from ...
(%test-basic-os): ... here.  Use it.

tests: Strengthen regexp in 'packages.scm'.

* tests/packages.scm ("--search-paths with pattern"): Call
'regexp-quote' on the result of 'derivation->output-path'.

gnu: guix: Add 'current-guix' thunk.

* gnu/packages/package-management.scm (source-file?)
(make-git-predicate, current-guix): New procedures.

utils: 'current-source-directory' gracefully handles lack of source info.

* guix/utils.scm (current-source-directory): Add case for when FILE-NAME
is #f.

utils: 'current-source-directory' resolves relative file names at run time.

* guix/utils.scm (absolute-dirname): New procedure.
(current-source-directory): Emit code to use it instead of calling
'search-path'.

store: 'register-path' no longer swallows 'system-error' exceptions.

* guix/store.scm (register-path): Do not catch 'system-error'.

services: Add 'gc-root-service-type'.

* gnu/services.scm (gc-roots->system-entry): New procedure.
(gc-root-service-type): New variable.

gnu: libxslt: Replace with 1.1.29 [fixes CVE-2016-{1683,1684}].

* gnu/packages/xml.scm (libxslt)[replacement]: New field.
(libxslt/fixed): New variable.

gnu: synthv1: Update to 0.7.5.

* gnu/packages/music.scm (synthv1): Update to 0.7.5.

gnu: Add lbzip2.

* gnu/packages/compression.scm (lbzip2): New variable.

gnu: Add emacs-multiple-cursors.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-multiple-cursors): New variable.

gnu: Add guile-sqlite3.

* gnu/packages/guile.scm (guile-sqlite3): New variable.

gnu: bluez: Install 'org.bluez.obex.service' and fix '97-hid2hci.rules'.

* gnu/packages/linux.scm (bluez)[arguments]: Add 'post-install' phase.

gnu: bluez: Update to 5.40.

* gnu/packages/linux.scm (bluez): Update to 5.40.

gnu: bluez: Set sysconfdir and localstatedir.

* gnu/packages/linux.scm (bluez)[arguments]: Add '--sysconfdir=/etc'
and '--localstatedir=/var'.

gnu: services: Add bluetooth-service.

* gnu/services/desktop.scm (bluetooth-shepherd-service)
(bluetooth-service): New Prodecures.
(bluetooth-service-type): New variable.
* doc/guix.text (Desktop Services): Document it.

gnu: Add python2-jsonrpclib

* gnu/packages/python.scm (python2-jsonrpclib): New variable.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: Add emacs-company.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-company): New variable.

gnu: certbot, python-acme: Update to 0.8.1.

These packages should be updated together.

* gnu/packages/tls.scm (certbot): Update to 0.8.1.
(python-acme, python2-acme): Update to 0.8.1

gnu: aria2: Update to 1.24.0.

* gnu/packages/bittorrent.scm (aria2): Updat eto 1.24.0.

services: dicod: Add 'interfaces' configuration field.

This makes 'dicod' listen on 'localhost' by default, whereas it was
previously listening on all the interfaces, which is not a good default
security-wise.

* gnu/services/dict.scm (<dicod-configuration>)[interfaces]: New field.
(dicod-configuration-file)[database->text]: New procedure, with code
formerly in 'dicod-configuration->text'.
[dicod-configuration->text]: Rename to...
[configuration->text]: ... this.  Honor 'interfaces'.
* doc/guix.texi (Various Services): Document 'interfaces'.

gnu: libqtxdg: Move qtbase to propagated-inputs.

* gnu/packages/lxqt.scm (libqtxdg)[inputs]: Move qtbase ...
[propagated-inputs]: ... to here.

This is a follow-up to aa450b2bc41b0cedbebc4f8c0a51867a436cf02b.

gnu: enlightenment: Update to 0.20.9.

* gnu/packages/enlightenment.scm (enlightenment): Update to 0.20.9.
[home-page]: Use https.

gnu: python-efl: Rebuild generated C files.

* gnu/packages/enlightenment.scm (python-efl)[arguments]: Replace 'build
phase to set 'ENABLE_CYTHON=1'.
[native-inputs]: python-cython.

gnu: Add python-bz2file.

* gnu/packages/python.scm (python-bz2file, python2-bz2file): New
variables.

gnu: gnupg: Update to 2.1.13.

* gnu/packages/gnupg.scm (gnupg): Update to 2.1.13.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

utils: 'current-source-directory' returns the absolute directory name.

* guix/utils.scm (current-source-directory): When FILE-NAME is relative,
use 'search-path' to determine the absolute file name.

utils: 'current-source-directory' is now purely an expansion-time thing.

* guix/utils.scm (extract-directory): Remove.
(current-source-directory): Rewrite as a 'syntax-case' macro.

doc: Recommend against marketing phrases in descriptions.

* doc/guix.texi (Synopses and Descriptions): Add note about marketing
phrases.

gnu: lxqt-common: Add missing inputs.

* gnu/packages/lxqt.scm (lxqt-common)[inputs]: Add qtbase,
qttools, qtx11extras.

gnu: lxqt-session: Add missing inputs.

* gnu/packages/lxqt.scm (lxqt-session)[inputs]: Add qtbase,
qttools, qtx11extras.