gnu: fetchmail: Update to 6.4.5.

* gnu/packages/mail.scm (fetchmail): Update to 6.4.5.
[arguments]: Remove obsolete ‘create-test-environment’ phase.

gnu: balsa: Don't use NAME in source URI.

* gnu/packages/mail.scm (balsa)[source]: Hard-code NAME.

gnu: balsa: Update to 2.6.1.

* gnu/packages/mail.scm (balsa): Update to 2.6.1.

gnu: nethogs: Migrate to HASH.

* gnu/packages/networking.scm (nethogs)[source]<sha256>: Migrate to…
<hash>: …this I guess.

gnu: nethogs: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/networking.scm (nethogs)[source]: Use GIT-FETCH and
GIT-FILE-NAME.
[arguments]: Don't try (and fail) to determine the version using git.

gnu: nethogs: Update to 0.8.6.

* gnu/packages/networking.scm (nethogs): Update to 0.8.6.

gnu: wxmaxima: Update to 20.04.0.

* gnu/packages/maths.scm (wxmaxima): Update to 20.04.0.

maint: 'authenticate' depends on a couple of .go files.

* Makefile.am (authenticate): Add dependency on guix/{git,openpgp}.go.

compile: Do not optimize "gnu/tests/*".

* guix/build/compile.scm (optimization-options): Add "gnu/tests/" to
level 0.

gexp: The result of 'imported-files/derivation' is non-substitutable.

* guix/gexp.scm (imported-files/derivation): Pass #:substitutable? #f to
'gexp->derivation'.

gnu: qhull: Update to 2019.1

* gnu/packages/maths.scm (qhull): update to 2019.1

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

self: Optimize 'file-append*' for 'local-file?'.

* guix/self.scm (file-append*): Add 'local-file?' case.
* guix/gexp.scm (local-file-select?): Export.

doc: Remove one use of 'file-append*'.

* doc/build.scm (texinfo-manual-source)[build]: Use 'file-append', not
'file-append*', for 'htmlxref.cnf', to ensure it has the right basename.

gexp: Fix expansion for (file-append (local-file ...) ...).

Fixes <https://bugs.gnu.org/41527>.
Regression introduced in d03001a31a6d460b712825640dba11e3f1a53a14.

* guix/gexp.scm (lower+expand-object): When LOWERED is not a struct and
EXPAND is true, call EXPAND.
* tests/gexp.scm ("file-append, raw store item"): New test.

tests: Hide quoted (define-module ...) form from Geiser.

* tests/gexp.scm (%extension-package): Split (define-module ...) form to
fool Geiser.

gnu: Add go-github-com-francoispqt-gojay.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-francoispqt-gojay): New variable.

gnu: python-llfuse: Update to 1.3.6.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-llfuse): Update to 1.3.6.

gnu: perl-timedate: Update to 2.33.

* gnu/packages/perl.scm (perl-timedate): Update to 2.33.

gnu: perl-io-tty: Update to 1.14.

* gnu/packages/perl.scm (perl-io-tty): Update to 1.14.

gnu: quazip: Update to 0.9.1.

* gnu/packages/compression.scm (quazip): Update to 0.9.1.

gnu: perl-cgi: Update to 4.47.

* gnu/packages/web.scm (perl-cgi): Update to 4.47.

gnu: font-gnu-unifont: Update to 13.0.02.

* gnu/packages/fonts.scm (font-gnu-unifont): Update to 13.0.02.

gnu: mpv-mpris: Update to 0.5.

* gnu/packages/video.scm (mpv-mpris): Update to 0.5.

gnu: tuir: Update to 1.29.0.

* gnu/packages/syndication.scm (tuir): Update to 1.29.0.

gnu: OBS: Update to 25.0.8.

* gnu/packages/video.scm (obs): Update to 25.0.8.
[inputs]: Add mbedtls-apache.
[arguments]: Set the version string in #:configure-flags.

gnu: renpy: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/game-development.scm (renpy)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: python2-renpy: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/game-development.scm (python2-renpy)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: taskwarrior: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/task-management.scm (taskwarrior)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: uget: Update to 2.2.0.

* gnu/packages/bittorrent.scm (uget): Update to 2.2.0.

gnu: uget: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/bittorrent.scm (uget)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: xftwidth: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/xdisorg.scm (xftwidth)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: xonotic: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/games.scm (xonotic)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: redkite: Update to 0.8.1.

* gnu/packages/audio.scm (redkite): Update to 0.8.1.

gnu: netcat-openbsd: Update to 1.217-1.

* gnu/packages/admin.scm (netcat-openbsd): Update to 1.217-1.
[arguments]: Remove obsolete #:configure-flags.

gnu: colordiff: Update to 1.0.19.

* gnu/packages/patchutils.scm (colordiff): Update to 1.0.19.

gnu: libnftnl: Update to 1.1.6.

* gnu/packages/linux.scm (libnftnl): Update to 1.1.6.
[source]: Remove patch.
* gnu/packages/patches/libnftnl-dont-check-NFTNL_FLOWTABLE_SIZE.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.

gnu: gcompris: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/education.scm (gcompris)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: czmq: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/networking.scm (czmq)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: cppzmq: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/networking.scm (cppzmq)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: cmark: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/markup.scm (cmark)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: wireshark: Update to 3.2.4.

* gnu/packages/networking.scm (wireshark): Update to 3.2.4.

gnu: denemo: Update to 2.4.0.

* gnu/packages/music.scm (denemo): Update to 2.4.0.

gnu: cataclysm-dda: Update to 0.E-2.

* gnu/packages/games.scm (cataclysm-dda): Update to 0.E-2.

gnu: dia: Update to 0.97.3-2.3cf7ec4 [fixes CVE-2019-19451].

* gnu/packages/gnome.scm (dia): Update to 0.97.3-2.3cf7ec4.
[build-system]: Use Meson.
[inputs]: Add graphene, libxslt, poppler, and python-2.
Remove freetype, gdk-pixbuf, libart-lgpl, and pango.
[native-inputs]: Add appstream-glib and docbook-xsl.
Remove autoconf, automake, libtool, perl, and python-wrapper.

gnu: parallel: Update to 20200522.

* gnu/packages/parallel.scm (parallel): Update to 20200522.

doc: Fix typos.

* doc/guix.texi: Fix typos.
* doc/contributing.texi: Fix typos.

Signed-off-by: Julien Lepiller <julien@lepiller.eu>

gnu: Add emacs-interleave.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-interleave): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: tensorflow: Fix build with python-3.8.

* gnu/packages/machine-learning.scm (tensorflow)[arguments]: Also import
python-version from python-build-system. Adjust 'python3.7-compatibility
to also add python-3.8 compatibility. Adjust 'install-python to not
hardcode the python version.

gnu: efl: Update to 1.24.2.

* gnu/packages/enlightenment.scm (efl): Update to 1.24.2.

gnu: emacs-helm-emms: Update to 20200322.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-helm-emms): Update to 20200322.

Updating python-argon2-cffi to 20.1.0

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: enlightenment: Fix screen unlocking.

Without this the password is never collected and checked.

* gnu/packages/patches/enlightenment-fix-setuid-path.patch: Fix patch so
that it collects the entered password.

gnu: libexif: Update to 0.6.22 [security fixes].

This fixes CVE-2020-13114, CVE-2020-13113, CVE-2020-13112, CVE-2020-0093,
CVE-2019-9278, and CVE-2020-12767.

* gnu/packages/patches/libexif-CVE-2016-6328.patch,
gnu/packages/patches/libexif-CVE-2017-7544.patch,
gnu/packages/patches/libexif-CVE-2018-20030.patch: Delete files.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/photo.scm (libexif): Update to 0.6.22.
[source](uri): Adjust for upstream GitHub migration.

gnu: libgphoto2: Update to 2.5.25.

* gnu/packages/photo.scm (libgphoto2): Update to 2.5.25.

pull: Protect against downgrade attacks.

* guix/scripts/pull.scm (%default-options): Add 'validate-pull'.
(%options, show-help): Add '--allow-downgrades'.
(warn-about-backward-updates): New procedure.
(guix-pull): Pass #:current-channels and #:validate-pull to
'latest-channel-instances'.
* guix/channels.scm (ensure-forward-channel-update): Add hint for
when (channel-commit channel) is true.
* doc/guix.texi (Invoking guix pull): Document '--allow-downgrades'.

channels: 'latest-channel-instances' guards against non-forward updates.

* guix/channels.scm (latest-channel-instance): Add #:starting-commit and
pass it to 'update-cached-checkout'.  Return the commit relation as a
second value.
(ensure-forward-channel-update): New procedure.
(latest-channel-instances): Add #:current-channels and #:validate-pull.
[current-commit]: New procedure.
Pass #:starting-commit to 'latest-channel-instance'.  When the returned
relation is true, call VALIDATE-PULL.
(latest-channel-derivation): Add #:current-channels and #:validate-pull.
Pass them to 'latest-channel-instances*'.
* tests/channels.scm ("latest-channel-instances #:validate-pull"): New
test.

git: 'update-cached-checkout' returns the commit relation.

* guix/git.scm (update-cached-checkout): Add #:starting-commit
parameter.  Call 'commit-relation' when #:starting-commit is true.
Always return the relation or #f as the third value.
(latest-repository-commit): Adjust accordingly.
* guix/import/opam.scm (get-opam-repository): Likewise.
* tests/channels.scm ("latest-channel-instances includes channel dependencies")
("latest-channel-instances excludes duplicate channel dependencies"):
Update mock of 'update-cached-checkout' accordingly.

channels: 'latest-channel-instances' doesn't leak internal state.

* guix/channels.scm (latest-channel-instances): Remove
'previous-channels' argument.  Introduce 'loop' and use it.

git: Add 'commit-relation'.

* guix/git.scm (commit-relation): New procedure.
* tests/git.scm ("commit-relation"): New test.

gnu: protonvpn-cli: Tweak description.

* gnu/packages/vpn.scm (protonvpn-cli)[description]: Tweak.

gnu: Add protonvpn-cli.

* gnu/packages/vpn.scm (protonvpn-cli): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: guile-dsv: Build with Guile 3.0.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-dsv)[inputs]: Replace guile-2.2 with
  guile-3.0.
  [propagated-inputs]: Replace guile2.2-lib with guile-lib.
  [arguments]: Add "configure support guile3.0" phase.
  (guile2.2-dsv): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: guile-dsv: Wrap script.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-dsv)[arguments]: Add "wrap program"
  phase. Import target-guile-effective-version from guile-build-system for use
  in new phase.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

doc: cookbook: Add subsection about session locking with xss-lock.

* doc/guix-cookbook.texi (Session lock): New node.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: pwsafe: Update to 3.52.0.

* gnu/packages/password-utils.scm (pwsafe): Update to 3.52.0.
[arguments]: Remove obsolete work-arounds.

Co-authored-by: Tobias Geerinckx-Rice <me@tobias.gr>

gnu: emacs-auctex: Update to 12.2.2.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-auctex): Update to 12.2.2.

doc: Update to the new 'grub-theme' procedure.

This is a follow-up commit to 9cdb10d52e34f7e8fa3b6238fe268646a4bbb877:
gnu: grub: Allow a PNG image and replace "aspect-ratio" with "resolution".

* doc/guix.texi (Bootloader Configuration): Describe and use the 'grub-theme'
procedure instead of the removed '%default-theme' variable.

gnu: enlightenment: Update to 0.24.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (enlightenment): Update to 0.24.0.
[arguments]: Change configure-flags to hardcode efl binary locations.
Remove custom 'fix-dot-desktop-creation phase. Update 'set-system-actions
phase.
* gnu/packages/patches/enlightenment-fix-setuid-path.patch: Update for
new upstream version.
* gnu/services/desktop.scm (enlightenment-setuid-programs): Same.

gnu: python-efl: Update to 1.24.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (python-efl): Update to 1.24.0.

gnu: efl: Update to 1.24.1.

* gnu/packages/enlightenment.scm (efl): Update to 1.24.1.
[propagated-inputs]: Remove bullet. Add libpng. Move libtiff, libwebp,
util-linux:lib ...
[inputs]: ... to here. Add openjpeg. Remove libxp.
[arguments]: In configure-flags disable scim, enable avahi, glib. Use
setuid mount/umount binaries. Rename hardcode-libcurl-location to
hardcode-dynamic-libraries and add pulseaudio, libsndfile.

squash! efl-1.24.1

gnu: go-github-com-kr-pretty: Fix source sha256.

This follows on from 618df2e335acb49a27ca014b555ede34f79503f3, which left the
hash suspiciously similar to the previous value.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-kr-pretty): Change the sha256 hash.

build: Add missing twinkle patch to gnu/local.mk.

This follows up on e5463baf2ce21cd2abc7ac5576401ae7ee7eb28c.

* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add twinkle-bcg729.patch.

Signed-off-by: Tobias Geerinckx-Rice <me@tobias.gr>

gnu: pidgin: Fix build with Meson network-manager.

This is a follow-up commit to 255ff74f3ab514a76068f6cfccc7f8dbcf8b7f3f:
building network-manager with Meson breaks users of NetworkManager.pc.

* gnu/packages/messaging.scm (pidgin)[source]: Add pidgin-libnm.patch.
Force re-bootstrapping in a new snippet.
[native-inputs]: Add autoconf, automake, and libtool.
* gnu/packages/patches/pidgin-libnm.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: nano: Update to 4.9.3.

* gnu/packages/nano.scm (nano): Update to 4.9.3.

gnu: redshift-wayland: Install redshift.desktop.

* gnu/packages/xdisorg.scm (redshift-wayland)[arguments]: New field.

gnu: local.mk: Remove absent patch.

This follows on from 899ffa1381afbf5f955aeba4839e920b3d910953.

* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove
packages/patches/deja-dup-use-ref-keyword-for-iter.patch.

gnu: gnome-shell: Use libnma.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-shell)[inputs]: Add 'libnma'.

gnu: dconf: Appease 'guix lint'.

* gnu/packages/gnome.scm (dconf)[homepage]: Avoid permanent redirect.

gnu: deja-dup: Update to 40.6.

* gnu/packages/gnome.scm (deja-dup): Update to 40.6.
[origin]: Use gitlab.gnome.org since the project migrated away from
launchpad.
[home-page]: Use 'wiki.gnome.org' instead of 'launchpad.net'.
[build-system]: Switch to 'meson-build-system' because upstream removed
cmake support.
[arguments]: Enable tests.  Remove arguments 'modules',
'imported-modules' and 'test-target'.  Use argument 'glib-or-gtk?'.
Replace configure-flags to only adjust 'RUN_PATH'.  Use standard phases
for 'configure' and 'check'.  Adjust and rename phase
'patch-lockfile-deletion' to 'patch-paths'.  Add phases
'patch-libgpg-error' and 'skip-gtk-update-icon-cache'.
[inputs]: Remove 'libpeas', 'gobject-introspection'.  Replace 'python-2'
and 'python2-pygobject' with python-3 versions. Add 'json-glib',
'libsoup' and 'libgpg-error'.
[native-inputs]: Remove 'cmake-minimal' and 'intltool'.  Add
'appstream-glib','desktop-file-utils', 'glib:bin' and
'gobject-introspection'.
* gnu/packages/patches/deja-dup-use-ref-keyword-for-iter.patch: Delete
file.

gnu: upower: Enable tests.

* gnu/packages/gnome.scm (upower)[arguments]: Enable tests and add
phases 'pre-check'.
[native-inputs]: Add 'python-pygobject', 'python-dbus',
'python-dbusmock' and 'umockdev'.

gnu: umockdev: Update to 0.14.1.

* gnu/packages/check.scm (umockdev) Update to 0.14.1.

gnu: umockdev: Add 'gobject-introspection'.

* gnu/packages/check.scm (umockdev)[native-inuputs]: Add
'gobject-introspection'.

gnu: python-argcomplete: Update to 1.11.1.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-argcomplete)[version]: Update to 1.11.1.
[arguments]: Remove, obsolete.
[inputs]: Remove as well.
* gnu/packages/patches/python-argcomplete-1.11.1-fish31.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: Add python-epc.

* gnu/packages/python-xyz.py (python-epc): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: Add python-sexpdata.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-sexpdata): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: Add python-importmagic.

* gnu/packages/python-xyz.el (python-importmagic): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: icedove: Add a desktop file.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (icedove)[phases]: Add install-desktop-file phase.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: mediainfo: Update to 20.03.

* gnu/packages/video.scm (mediainfo): Update to 20.03.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: libmediainfo: Update to 20.03.

* gnu/packages/video.scm (libmediainfo): Update to 20.03.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

guix package: Support multiple profiles with '--list-installed'.

* guix/scripts/package.scm (process-query): List installed multiple profiles.
* tests/guix-package-net.sh: Test it.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

tests: Use a #:prefix for (gcrypt hash).

* tests/packages.scm: Use #:prefix instead of #:hide for (gcrypt hash).
This accomodates for 'sha512' syntax literal matches with Guile-Gcrypt 0.3.0,
which exports 'sha512' in addition to 'sha256'.

gnu: guile-gcrypt: Update to 0.3.0.

* gnu/packages/gnupg.scm (guile-gcrypt): Update to 0.3.0.

guix-install.sh: Fix ‘systemctl not found’ error message at probe.

* etc/guix-install.sh (chk_init_sys): Redirect systemctl errors to
/dev/null.

Signed-off-by: Tobias Geerinckx-Rice <me@tobias.gr>

guix-install.sh: Add xz to requirements.

* etc/guix-install.sh (REQUIRE): Add xz to requirements list.

Signed-off-by: Tobias Geerinckx-Rice <me@tobias.gr>

build: Add a comment above the sysvinit section.

* nix/local.mk (sysvinitservicedir): Add a comment.

Signed-off-by: Tobias Geerinckx-Rice <me@tobias.gr>

gnu: spice-protocol: Update to 0.14.2.

* gnu/packages/spice.scm (spice-protocol): Update to 0.14.2.
[arguments]: Install COPYING manually now.

gnu: qtractor: Update to 0.9.14.

* gnu/packages/music.scm (qtractor): Update to 0.9.14.
[source]: Fetch over HTTPS.

gnu: polybar: Update to 3.4.3.

* gnu/packages/wm.scm (polybar): Update to 3.4.3.

gnu: inxi: Update to 3.1.00-1.

* gnu/packages/admin.scm (inxi-minimal): Update to 3.1.00-1.

gnu: redshift: Build and install redshift-gtk in a separate output.

This also installs a redshift.desktop file as a side-effect.

* gnu/packages/xdisorg.scm (redshift)[outputs, arguments]: New fields.