utils: Move <location> and '&error-location' to (guix diagnostics).

* guix/utils.scm (<location>, source-properties->location)
(location->source-properties, &error-location): Move to...
* guix/diagnostics.scm: ... here.
* gnu.scm: Adjust imports accordingly.
* gnu/machine.scm: Likewise.
* gnu/system.scm: Likewise.
* gnu/tests.scm: Likewise.
* guix/inferior.scm: Likewise.
* tests/channels.scm: Likewise.
* tests/packages.scm: Likewise.

gnu: beets: Support replaygain plugin.

* gnu/packages/music.scm (beets)[arguments]: Add 'wrap-typelib phase.
[inputs]: Add gstreamer, gst-plugins-base, gst-plugins-good,
gobject-introspection and python-pygobject.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-pre-commit.

* gnu/packages/version-control.scm (pre-commit): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-pytest-env.

* gnu/packages/python-check.scm (python-pytest-env): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-nodeenv.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-nodeenv): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-identify.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-identify): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-cfgv.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cfgv): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-covdefaults.

* gnu/packages/python-check.scm (python-covdefaults): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-pytest-mpl.

* gnu/packages/python-check.scm (python-pytest-mpl): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-pytest-remotedata.

* gnu/packages/python-check.scm (python-pytest-remotedata): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-pytest-openfiles.

* gnu/packages/python-check.scm (python-pytest-openfiles): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-pytest-filter-subpackage.

* gnu/packages/python-check.scm (python-pytest-filter-subpackage): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-pytest-doctestplus.

* gnu/packages/python-check.scm (python-pytest-doctestplus): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add python-pytest-arraydiff.

* gnu/packages/python-check.scm (python-pytest-arraydiff): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: python-typing-extension: Update to 3.7.4.2.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-typing-extension): Update to 3.7.4.2.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: Add syncthing-gtk.

* gnu/packages/syncthing.scm (syncthing-gtk): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <marius@gnu.org>

gnu: procenv: Check is a native input.

* gnu/packages/linux.scm (procenv)[inputs]: Move CHECK ...
[native-inputs]: ... here.

gnu: libsigrok: Remove unused input.

* gnu/packages/electronics.scm (libsigrok)[native-inputs]: Remove CHECK.

gnu: ao: Update source URI.

* gnu/packages/xiph.scm (ao)[source](uri): Adjust to current.

gnu: Add emacs-shx.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-shx): New variable.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: Add guile-lzlib.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-lzlib): New variable.

gnu: Add guile-zlib.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-zlib): New variable.

gnu: emacs-erc-hl-nicks: Update to 1.3.4.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-erc-hl-nicks): Update to 1.3.4.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: emacs-helm: Update to 3.6.4.

From 451290515c14b44aa00bd542e13a00a3898d4a90 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Michael Rohleder <mike@rohleder.de>
Date: Mon, 20 Jul 2020 18:36:09 +0200
Subject: [PATCH] gnu: emacs-helm: Update to 3.6.4.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-helm): Update to 3.6.4.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: emacs-org-re-reveal: Update to 3.0.2.

From 1c27f0dd4ab904319ba2b11c29afea07b7f4aca9 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Michael Rohleder <mike@rohleder.de>
Date: Mon, 20 Jul 2020 18:55:29 +0200
Subject: [PATCH] gnu: emacs-org-re-reveal: Update to 3.0.2.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-org-re-reveal): Update to 3.0.2.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: Add azimuth.

* gnu/packages/games.scm (azimuth): New variable.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: squeak-vm: Enter build directory once.

* gnu/packages/smalltalk.scm (squeak-vm)[arguments]: Use CHDIR instead of
pseudofunctional WITH-DIRECTORY-EXCURSIONs.  Drop the custom ‘build’ phase.

gnu: squeak-vm: Update home page.

* gnu/packages/smalltalk.scm (squeak-vm)[source, home-page]: Drop ‘www’ subdomain.

gnu: wine-staging: Update to 5.13.

* gnu/packages/wine.scm (wine-staging-patchset-data): Update to 5.13.

gnu: mpg123: Update to 1.26.3.

* gnu/packages/mp3.scm (mpg123): Update to 1.26.3.

gnu: burp: Enable the live status monitor.

* gnu/packages/backup.scm (burp)[inputs]: Add ncurses.

gnu: bshapr: Update to 0.9.

* gnu/packages/music.scm (bshapr): Update to 0.9.

gnu: fswatch: Update to 1.15.0.

* gnu/packages/monitoring.scm (fswatch): Update to 1.15.0.

gnu: python-tomlkit: Update to 0.6.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-tomlkit): Update to 0.6.0.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: python-pifpaf: Update to 2.5.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pifpaf): Update to 2.5.0.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: poetry: Update to 1.0.10.

* gnu/packages/python-xyz.scm (poetry): Update to 1.0.10.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: emacs-writeroom: Update to 3.10.

From f5c5d622aaf58bc485f73568513998cda35a8d2e Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Michael Rohleder <mike@rohleder.de>
Date: Fri, 24 Jul 2020 13:46:39 +0200
Subject: [PATCH] gnu: emacs-writeroom: Update to 3.10.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-writeroom): Update to 3.10.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: emacs-helm-ag: Update to 0.62.

From 2a2b347b4abbd91eaf09f61643fdd22b51b21d4d Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Michael Rohleder <mike@rohleder.de>
Date: Fri, 24 Jul 2020 13:17:59 +0200
Subject: [PATCH] gnu: emacs-helm-ag: Update to 0.62.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-helm-ag): Update to 0.62.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: emacs-helm-gtags: Update to 1.5.7.

From 4399c3eb815a16ae21c85bad33cd3c69e8d43c4f Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Michael Rohleder <mike@rohleder.de>
Date: Fri, 24 Jul 2020 12:14:34 +0200
Subject: [PATCH] gnu: emacs-helm-gtags: Update to 1.5.7.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-helm-gtags): Update to 1.5.7.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

services: nix: Add extra-options.

* gnu/services/nix.scm (<nix-configuration>)[extra-options]: New field.
(nix-shepherd-service): Add this.
(nix-activation): Add new line to the end of /etc/nix/nix.conf file.
* doc/guix.texi (Miscellaneous Services)[Nix service]: Document this.

services: nix: Fix typo.

* gnu/services/nix.scm (<nix-configuration>): Fix typo.

services: nix: Export nix-configuration.

* gnu/services/nix.scm (nix-configuration, nix-configuration?): Export.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

services: nix: Provide nix commands.

* gnu/services/nix.scm (nix-service-type): Extend profile-service-type to
provide nix commands.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: Add srain.

* gnu/packages/irc.scm (srain): New package.

Signed-off-by: 宋文武 <iyzsong@member.fsf.org>

gnu: Add bashtop.

* gnu/packages/admin.scm (bashtop): New variable.

Signed-off-by: 宋文武 <iyzsong@member.fsf.org>

gnu: Replace transset-df with transset.

transset-df was last updated in 2007.  The patches got merged upstream a long
time ago, which is maintained by the X.Org project.

* gnu/packages/xorg.scm (transset): New variable.
(transset-df): Define as ‘deprecated package’.

Signed-off-by: 宋文武 <iyzsong@member.fsf.org>

gnu: emacs-use-package: Install texinfo manual.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-use-package).

[native-inputs]: Add texinfo.

[arguments]: Add phase for installation of the texinfo manual.

Signed-off-by: Brett Gilio <brettg@gnu.org>

gnu: chroma: Configure with inline attribute.

* gnu/packages/games.scm (chroma)[configure-flags]: Add flag to properly
support inline attribute of STD C89.

Signed-off-by: Brett Gilio <brettg@gnu.org>

gnu: emacs-telega: Update to 0.6.28.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-telega): Update to 0.6.28.

gnu: i3-gaps: Update to 4.18.1.

* gnu/packages/wm.scm (i3-gaps): Update to 4.18.1.

Signed-off-by: Brett Gilio <brettg@gnu.org>

gnu: libseccomp: Skip test that fails in QEMU user-mode emulation.

* gnu/packages/linux.scm (libseccomp)[arguments]: Add phase to skip one test.

gnu: libseccomp: Do not build the static library.

* gnu/packages/linux.scm (libseccomp)[arguments]: New field.

gnu: ccid: Update to 1.4.33.

* gnu/packages/security-token.scm (ccid): Update to 1.4.33.

gnu: nginx: Update to 1.19.1.

* gnu/packages/web.scm (nginx): Update to 1.19.1.

gnu: rocksdb: Update to 6.11.4.

* gnu/packages/databases.scm (rocksdb): Update to 6.11.4.

gnu: libseccomp: Update to 2.5.0.

* gnu/packages/linux.scm (libseccomp): Update to 2.5.0.
[native-inputs]: Add GPERF.

gnu: hitch: Update to 1.6.0.

* gnu/packages/web.scm (hitch): Update to 1.6.0.

gnu: libaacs: Update to 0.11.0.

* gnu/packages/video.scm (libaacs): Update to 0.11.0.

gnu: ffmpeg: Update to 4.3.1.

* gnu/packages/video.scm (ffmpeg): Update to 4.3.1.

gnu: re2: Update to 2020-07-06.

* gnu/packages/regex.scm (re2): Update to 2020-07-06.
[source](modules, snippet): Remove.

gnu: spdlog: Update to 1.7.0.

* gnu/packages/logging.scm (spdlog): Update to 1.7.0.

gnu: fluidsynth: Update to 2.1.4.

* gnu/packages/audio.scm (fluidsynth): Update to 2.1.4.

gnu: exiv2: Update to 0.27.3.

* gnu/packages/image.scm (exiv2): Update to 0.27.3.

gnu: libebml: Update to 1.4.0.

* gnu/packages/xml.scm (libebml): Update to 1.4.0.

gnu: libmatroska: Update to 1.6.0.

* gnu/packages/video.scm (libmatroska): Update to 1.6.0.

gnu: LibRaw: Update to 0.20.0 [fixes CVE-2020-15503].

* gnu/packages/photo.scm (libraw): Update to 0.20.0.
* gnu/packages/image.scm (freeimage)[source](patches): Add LibRaw
compatibility patch.

quirks: Adjust patch to allow traveling back to Dec. 2018.

Fixes <https://bugs.gnu.org/42519>.

This fixes:

  guix time-machine --commit=897f303d2fa61497a931cf5fcb43349eb5f44c14

a commit dated Dec. 2018.

* guix/quirks.scm (%bug-41214-patch)[accesses-guile-2.2-optimization-options?]:
Add second 'match' clause.

doc: Mention the channel keyring branch.

Reported by Pierre Neidhardt <mail@ambrevar.xyz>.

* doc/guix.texi (Channels): Mention the keyring branch and the
'keyring-reference' bit in '.guix-channel'.

doc: Use an existing commit in channel example.

Suggested by zimoun <zimon.toutoune@gmail.com>.

* doc/guix.texi (Channels): Use the commit for 'v1.0.0' instead of a
non-existing commit in example.

gnu: luminance-hdr: Update to 2.6.0.

* gnu/packages/patches/luminance-hdr-qt-printer.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/image-viewers.scm (luminance-hdr): Update to 2.6.0.
[inputs]: Add QTSVG and EIGEN.
[arguments]: Add #:tests? #f.

gnu: enigma: Fix build with GCC >= 6.

* gnu/packages/games.scm (enigma)[arguments]: Add phase to substitute faulty
comparison.

gnu: gpscorrelate: Update to 2.0.

* gnu/packages/gps.scm (gpscorrelate): Update to 2.0.
[arguments]: Remove #:tests?.
[inputs]: Remove GTK+-2.  Add GTK+.

gnu: Add dkgpg.

* gnu/packages/openpgp.scm (dkgpg): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add libtmcg.

* gnu/packages/openpgp.scm: New file.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

import: github: Gracefully handle projects that have disappeared.

Fixes <https://bugs.gnu.org/42509>.
Reported by Alexandru-Sergiu Marton <brown121407@posteo.ro>.

* guix/import/github.scm (fetch-releases-or-tags): Use 'http-fetch'
instead of 'json-fetch', and guard against 404 errors.  Upon 404, emit a
warning and return the empty vector.

pack: '-R' applies to propagated inputs too.

Fixes <https://bugs.gnu.org/42510>.

* guix/scripts/pack.scm (wrapped-manifest-entry): Recurse on
'dependencies' field.
* tests/guix-pack-relocatable.sh: Add test.

gnu: gcc: Fix libstdc++ misconfiguration.

Fixes <https://bugs.gnu.org/42392>.
Reported by Maxim Cournoyer and Erik Garrison.

Until now, the generated <bits/c++config.h> would be incorrect (many
_GLIBCXX_HAVE macros would be undefined), which in turn would lead to
build failures for most C++ programs.

* gnu/packages/gcc.scm (gcc-6)[inputs]: Add LIBSTDC++-HEADERS.
(libstdc++, libstdc++-headers): New variables.
* gnu/packages/gcc.scm (gfortran): Change first argument to 'custom-gcc'
to remove dependency on LIBSTDC++-HEADERS.

gnu: gcc@10: Update to 10.2.0.

* gnu/packages/gcc.scm (gcc-10): Update to 10.2.0.

gnu: Add sleef.

* gnu/packages/maths.scm (sleef): New variable.

Signed-off-by: Brett Gilio <brettg@gnu.org>

gnu: duplicity: Update to 0.8.14.

* gnu/packages/backup.scm (duplicity): Update to 0.8.14.
[native-inputs]: Add gettext, python-future, python-pytest,
python-pytest-runner, and python-setuptools-scm.  Move other python2 packages
to python.
[propagated-inputs]: Ditto.
[inputs]: Use latest librsync.
[arguments]: Remove #:python argument.  Adjust gpg substitution regex for
latest source.

gnu: Fix Krita.

Fixes <https://bugs.gnu.org/42476>.
Reported by linka on #guix.

* gnu/packages/patches/qtbase-fix-krita-deadlock.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/qt.scm (qtbase-for-krita): New variable.
* gnu/packages/kde.scm (krita)[inputs]: Replace qtbase with qtbase-for-krita.

gnu: blender: Update to 2.83.3.

* gnu/packages/graphics.scm (blender): Update to 2.83.3.

gnu: dnsmasq: Update to 2.82.

* gnu/packages/dns.scm (dnsmasq): Update to 2.82.

gnu: jo: Update to 1.4.

* gnu/packages/web.scm (jo): Update to 1.4.

gnu: wavpack: Update to 5.3.2.

* gnu/packages/audio.scm (wavpack): Update to 5.3.2.
[source]: Use GIT-FETCH and GIT-FILE-NAME.
[arguments]: Replace the ‘bootstrap’ phase.
[native-inputs]: Add autoconf, automake, and libtool.

gnu: burp: Add ACL support.

* gnu/packages/backup.scm (burp)[inputs]: Add acl.

gnu: burp: Update to 2.3.30.

* gnu/packages/backup.scm (burp): Update to 2.3.30.
[source]: Use GIT-FETCH and GIT-FILE-NAME.
[native-inputs]: Add autoconf and automake.

gnu: parallel: Update to 20200722.

* gnu/packages/parallel.scm (parallel): Update to 20200722.

Revert "gnu: Fix Krita."

This reverts commit 5f63905096e456097fca206f56ce9257f72faf64.

This commit caused `guix pull` to crash like this:

------
Backtrace:
In ice-9/boot-9.scm:
   222:29 19 (map1 _)
   222:29 18 (map1 _)
   222:29 17 (map1 _)
   222:29 16 (map1 _)
   222:17 15 (map1 (((gnu packages kde)) ((gnu packages libevent)) ((gnu packages libidn)) ((gnu packages #)) ((?)) ?))
  3297:17 14 (resolve-interface (gnu packages kde) #:select _ #:hide _ #:prefix _ #:renamer _ #:version _)
In ice-9/threads.scm:
    390:8 13 (_ _)
In ice-9/boot-9.scm:
  3223:13 12 (_)
In ice-9/threads.scm:
    390:8 11 (_ _)
In ice-9/boot-9.scm:
  3507:20 10 (_)
   2806:4  9 (save-module-excursion _)
  3527:26  8 (_)
In unknown file:
           7 (primitive-load-path "gnu/packages/kde" #<procedure 7f68d6fe5da0 at ice-9/boot-9.scm:3514:37 ()>)
In ice-9/eval.scm:
   626:19  6 (_ #<directory (gnu packages kde) 7f68d6175b40>)
   293:34  5 (_ #<directory (gnu packages kde) 7f68d6175b40>)
   173:47  4 (_ #(#<directory (gnu packages kde) 7f68d6175b40> #<promise #<procedure 7f68dc5a5d00 at ice-9/eval.sc?>))
    159:9  3 (_ #(#<directory (gnu packages kde) 7f68d6175b40> #<promise #<procedure 7f68dc5a5d00 at ice-9/eval.sc?>))
   191:35  2 (_ #(#<directory (gnu packages kde) 7f68d6175b40> #<promise #<procedure 7f68dc5a5d00 at ice-9/eval.sc?>))
   223:20  1 (proc #(#<directory (gnu packages kde) 7f68d6175b40> #<promise #<procedure 7f68dc5a5d00 at ice-9/eval?>))
In unknown file:
           0 (%resolve-variable (7 . qtbase) #<directory (gnu packages kde) 7f68d6175b40>)

ERROR: In procedure %resolve-variable:
error: qtbase: unbound variable
------

gnu: Fix Krita.

Fixes <https://bugs.gnu.org/42476>.
Reported by linka on #guix.

* gnu/packages/patches/qtbase-fix-krita-deadlock.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/kde.scm (qtbase-for-krita): New variable.
(krita)[inputs]: Replace qtbase with qtbase-for-krita.

gnu: ungoogled-chromium: Avoid top-level reference to LLD.

* gnu/packages/chromium.scm (lld-as-ld, lld-wrapper, lld/wrapped): Move into ...
(make-lld-wrapper): ... here.  New procedure.

gnu: Add mercury.

* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Add mercury.scm.
* gnu/packages/mercury.scm: New file.

gnu: ccache: Update to 3.7.11.

* gnu/packages/ccache.scm (ccache): Update to 3.7.11.

gnu: ansible: Update to 2.9.11.

* gnu/packages/admin.scm (ansible): Update to 2.9.11.

gnu: rgbds: Update to 0.4.1.

* gnu/packages/assembly.scm (rgbds): Update to 0.4.1.

gnu: fio: Update to 3.21.

* gnu/packages/benchmark.scm (fio): Update to 3.21.

gnu: warzone2100: Update to 3.4.1.

* gnu/packages/games.scm (warzone2100): Update to 3.4.1.

gnu: python-django: Add optional inputs.

* gnu/packages/django.scm (python-django)[propagated-inputs]: Add
python-argon2-cffi, python-bcrypt.

gnu: python-django: Update to 1.11.29.

* gnu/packages/django.scm (python-django): Update to 1.11.29.

gnu: khal: Fix a failing test.

* gnu/packages/calendar.scm (khal)[arguments]: Fix a failing test.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>