services: Fix typo in spice-vdagent-service.

* gnu/services/spice.scm (spice-vdagent-service): Fix typo.

Signed-off-by: Danny Milosavljevic <dannym@scratchpost.org>

gnu: ghmm: Fix missing module import.

This is a follow-up to commit 9c2563a80b6f1d8fb8677f5314e6180ea9916aa5.

* gnu/packages/machine-learning.scm (ghmm)[arguments]: Add #:modules.

gnu: kobodeluxe: Provide missing dependency.

* gnu/packages/games.scm (kobodeluxe)[inputs]: Add GLU.

gnu: ir: Update to 1.3.4.

* gnu/packages/audio.scm (ir): Update to 1.3.4.
[source]: Fetch via git.
[home-page]: Update.
[arguments]: Pass INSTDIR.

gnu: libofx: Disable parallel build.

* gnu/packages/finance.scm (libofx)[arguments]: Add #:parallel-build?.

gnu: python-xmlschema: Update to 1.1.0.

* gnu/packages/xml.scm (python-xmlschema): Update to 1.1.0.
[source]: Change to GIT-FETCH.
[arguments]: Adjust test invokation.

gnu: python-elementpath: Update to 1.4.0.

* gnu/packages/xml.scm (python-elementpath): Update to 1.4.0.

gnu: font-mathjax: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/javascript.scm (font-mathjax)[source]: Download using
git-fetch.
[arguments]: Adjust for change in source.
[native-inputs]: Remove gzip, tar.
(js-mathjax)[source]: Adjust for change in source.

gnu: vim-fugitive: Update to 3.2.

* gnu/packages/vim.scm (vim-fugitive): Update to 3.2.

gnu: Add guile3.0-gi.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile3.0-gi): New variable.

gnu: guile-gi: Update to 0.2.2.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-gi): Update to 0.2.2.

gnu: freehdl: Fix build.

* gnu/packages/engineering.scm (freehdl)[native-inputs]: Add gcc-5.

gnu: public-inbox: Update to 1.2.0-0.05a06f3.

* gnu/packages/mail.scm (public-inbox): Update to 1.2.0-0.05a06f3.

gnu: cuirass: Update to 0.0.1-28.b9031db.

* gnu/packages/ci.scm (cuirass): Update to 0.0.1-28.b9031db.

gnu: mgba: Update to 0.8.0.

* gnu/packages/emulators.scm (mgba): Update to 0.8.0.

gnu: musescore: Update to 3.4.1.

* gnu/packages/music.scm (musescore): Update to 3.4.1.
[source]: Remove unnecessary snippet.
[arguments]: Do not build telemetry module.

gnu: silkaj: Update to 0.7.6.

* gnu/packages/finance.scm (silkaj): Update to 0.7.6.
[source]: Move to Pypi.
[home-page]: Update home page.

gnu: python-duniterpy: Update to 0.56.0.

* gnu/packages/finance.scm (python-duniterpy): Update to 0.56.0.
[source]: Move source to Pypi.
[arguments]: Add phase to work around a missing file.  Remove phases building
documentation since they are not applicable anymore.
[native-inputs]: Remove it, since it is not applicable in Pypi package.
[inputs]: Replace "python-attr" with "python-attrs".

gnu: Add emacs-eshell-toggle.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-eshell-toggle): New variable.

gnu: ode: Selectively disable tests.

* gnu/packages/game-development.scm (ode)[arguments]: Run tests only on
x86_64.

gnu: youtube-dl: Update to 2020.01.24.

* gnu/packages/video.scm (youtube-dl): Update to 2020.01.24.

Signed-off-by: Arun Isaac <arunisaac@systemreboot.net>

bootloader: grub: Add gfxmode (resolution) override.

* gnu/bootloader/grub.scm (<grub-theme>): Add `gfxmode' entry.
(eye-candy): Use it.
* doc/guix.texi (Bootloader Configuration): Document it.

gnu: python-parso: Update to 0.5.2.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-parso): Update to 0.5.2.

gnu: python-pympler: Update to 0.8.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pympler): Update to 0.8.

gnu: Remove python2-debian.

This trivial package fails to build and has no users in Guix.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-debian): Remove variable.

gnu: Add bitcoin-unlimited.

* gnu/packages/finance.scm (bitcoin-unlimited): New variable.

gnu: WebKitGTK: Update to 2.26.3.

* gnu/packages/webkit.scm (webkitgtk): Update to 2.26.3.

gnu: QEMU: Update to 4.2.0.

* gnu/packages/virtualization.scm (qemu): Update to 4.2.0.
[source]: Use new patch.
* gnu/packages/patches/qemu-fix-documentation-build-failure.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: QEMU: Install the manual pages.

* gnu/packages/virtualization.scm (qemu)[arguments]: Add '--enable-docs'
to #:configure-flags.
[native-inputs]: Add python-sphinx.
(qemu-minimal-2.10)[native-inputs]: Remove python-sphinx.

gnu: QEMU: Fix CVE-2020-{7039,7211}.

* gnu/packages/patches/qemu-CVE-2020-7039.patch,
gnu/packages/patches/qemu-CVE-2020-7211.patch: New files.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add them.
* gnu/packages/virtualization.scm (qemu)[source]: Use them.

gnu: httpie: Update to 2.0.0.

* gnu/packages/python-web.scm (httpie): Update to 2.0.0.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: python-pygments: Update to 2.5.2.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pygments): Update to 2.5.2.
[home-page]: Follow redirect to https.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: guile-ics: Add "guile3.0-ics" variant.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-ics)[source]: Add 'modules' and 'snippet'.
(guile3.0-ics): New variable.

serialization: 'read-byte-string' makes a single read(2) call.

On "guix build libreoffice -nd", this reduces the number of read(2)
system calls from 10,434 to 8092.

* guix/serialization.scm (sub-bytevector): New procedure.
(read-byte-string): Make a single 'get-bytevector-n*' call and use
'sub-bytevector'.

guix build, archive, graph: Disable absolute file port name canonicalization.

This avoids an 'lstat' storm.  Specifically:

  ./pre-inst-env strace -c guix build -nd libreoffice

goes from 1,711 to 214 'lstat' calls.

* guix/scripts/build.scm (options->things-to-build): When SPEC matches
'derivation-path?', call 'canonicalize-path'.
(guix-build): Remove 'with-fluids' for %FILE-PORT-NAME-CANONICALIZATION.
* guix/scripts/archive.scm (guix-archive): Remove 'with-fluids' for
%FILE-PORT-NAME-CANONICALIZATION.
* guix/scripts/graph.scm (guix-graph): Likewise.

ui: Do not display error messages with bare format strings.

On Guile 3, with, say, an error in ~/.guile, we'd get:

  $ guix repl
  guix repl: error: Unbound variable: ~S

* guix/ui.scm (call-with-error-handling): Add
'&exception-with-kind-and-args' case.

gnu: swi-prolog: Update to 8.1.21.

* gnu/packages/prolog.scm (swi-prolog): Update to 8.1.21.

gnu: emacs-telega: Update to 0.5.10.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-telega): Update to 0.5.10.

gnu: tdlib: Update to 1.5.5.

* gnu/packages/messaging.scm (tdlib): Update to 1.5.5.

gnu: ode: Disable tests.

* gnu/packages/game-development.scm (ode): Tests are failing or other systems
than x86_64, so we disable them.

gnu: wine-staging: Update to 5.0.

* gnu/packages/wine.scm (wine-staging-patchset-data): Update to 5.0.
(wine-staging): Update to 5.0.
[inputs]: Remove faudio, inherited from wine.

gnu: wine: Add FAudio input.

* gnu/packages/wine.scm (wine)[inputs]: Add FAudio.

gnu: wine: Update to 5.0.

* gnu/packages/wine.scm (wine): Update to 5.0.

gnu: Add megatools.

* gnu/packages/sync.scm (megatools): New variable.
(megacmd)[description]: Cross-reference the two packages in the description.

Signed-off-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>

gnu: Add megacmd.

* gnu/packages/sync.scm (megacmd): New variable.

Signed-off-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>

news: Add ‘nl’ translation.

* * etc/news.scm: Add ‘nl’ translation.

gnu: emacs-xr: Update to 1.14.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-xr): Update to 1.14.

news: Add 'de' translation.

* etc/news.scm: Add 'de' translation.

gnu: r-biocset: Fix spelling of "ability".

* gnu/packages/bioconductor (r-biocset)[description]: Fix typo.

gnu: rust-serde-bytes-0.11: Fix spelling of "handle".

* gnu/packages/crates-io (rust-serde-bytes-0.11)[synopsis]: Fix typo.

gnu: rust-rust-argon2-0.5: Fix spelling of "contains".

* gnu/packages/crates-io (rust-rust-argon2-0.5)[description]: Fix typo.

gnu: rust-which-2.0: Fix spelling of "executable".

* gnu/packages/crates-io (rust-which-2.0)[description]: Fix typo.

gnu: emacs-helm-clojuredocs: Fix typo "This package".

* gnu/packages/emacs-xyz (emacs-helm-clojuredocs)[description]: Fix typo.

gnu: ghc-time-compat: Fix typo "This package".

* gnu/packages/haskell-xyz (ghc-time-compat)[description]: Fix typo.

gnu: ocaml-mmap: Fix spelling of "function".

* gnu/packages/ocaml (ocaml-mmap)[description]: Fix typo.

gnu: pinfo: Fix spelling of "additionally".

* gnu/packages/texinfo (pinfo)[description]: Fix typo.

gnu: jimtcl: Update to 0.79.

* gnu/packages/embedded.scm (jimtcl): Update to 0.79.
[home-page]: Update home-page.

gnu: jimtcl: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/embedded.scm (jimtcl)[source]: Download using git-fetch.

gnu: stlink: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/embedded.scm (stlink)[source]: Download using git-fetch.

gnu: spin2cpp: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/embedded.scm (spin2cpp)[source]: Download using git-fetch.

gnu: openspin: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/embedded.scm (openspin)[source]: Download using git-fetch.

gnu: linux-libre: Update to 5.4.14.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.14.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.19: Update to 4.19.98.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.98.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.14: Update to 4.14.167.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.167.
(linux-libre-4.14-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.9: Update to 4.9.211.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9-version): Update to 4.9.211.
(linux-libre-4.9-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.4: Update to 4.4.211.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4-version): Update to 4.4.211.
(linux-libre-4.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre: Update deblob scripts.

* gnu/packages/linux.scm (deblob-scripts-5.4, deblob-scripts-4.19)
(deblob-scripts-4.14, deblob-scripts-4.9, deblob-scripts-4.4): Update
to 5.4.14, 4.19.98, 4.14.167, 4.9.211, and 4.4.211, respectively, and
update hashes.

gnu: tuxguitar: Build and install ALSA plugin.

* gnu/packages/music.scm (tuxguitar): Allows MIDI sound output when using
a synthesizer like TiMidity++.
[inputs]: Add alsa-lib.
[arguments]: No longer change build directory context between phases.  Install
desktop, mime and manual files during the "install" phase.

Signed-off-by: Kei Kebreau <kkebreau@posteo.net>

news: Add entry for Guile 3.0.

* etc/news.scm: Add entry for Guile 3.0.

self: Build with Guile 3.0.

* guix/self.scm (specification->package): Return the "guile3.0-"
variants.
(guix-derivation): Change 'guile' to (specification->package "guile").
Pass "3.0" as #:guile-version.

derivations: Inline 'find' in 'coalesce-duplicate-inputs'.

Previously the first argument to 'find' would show up high in profiles
of 'package-derivation'.  This speeds things up a big, especially on
Guile 3.

* guix/derivations.scm (coalesce-duplicate-inputs)[find]: New
procedure.

compile: Remove incorrect exports.

This is a followup to fed36328129def5f10b1d1f3e4ea8886916fd22a.

* guix/build/compile.scm: Remove exports of '%lightweight-optimizations'
and '%default-optimizations'.
* guix/self.scm: Remove unused (guix build compile) module.

gnu: libqmi: Update to 1.24.4.

* gnu/packages/freedesktop.scm (libqmi): Update to 1.24.4.

gnu: gsasl: Do not build 'libgsasl.a'.

* gnu/packages/gsasl.scm (gsasl)[arguments]: Add "--disable-static" to
 #:configure-flags.

gnu: gsasl: Update to 1.8.1.

* gnu/packages/gsasl.scm (gsasl): Update to 1.8.1.
[source](modules, snippet): Remove.
[inputs]: Add LIBGCRYPT.

gnu: Add ghc-llvm-hs.

* gnu/packages/haskell-xyz.scm (ghc-llvm-hs): New variable.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: Add ghc-llvm-hs-pure.

* gnu/packages/haskell-xyz.scm (ghc-llvm-hs-pure): New variable.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: Add ne.

* gnu/packages/text-editors.scm (ne): New variable.

gnu: wxmaxima: Update to 20.01.3.

* gnu/packages/maths.scm (wxmaxima): Update to 20.01.3.
[home-page]: Update URL.

gnu: fenics: Update to 2019.1.0.post0.

* gnu/packages/simulation.scm (fenics): Update to 2019.1.0.post0.
[arguments]: In the 'pre-check' phase, add three more demos to the
list of demos that are skipped.

gnu: fenics-dolfin: Update to 2019.1.0.post0.

* gnu/packages/simulation.scm (fenics-dolfin): Update to 2019.1.0.post0.
[source](snippet): Remove three substitutions that are no longer needed.
[native-inputs]: Use compatible version of CATCH.
[arguments]: Use CMAKE version 3.15.5 to avoid EXCLUDE_FROM_ALL
regression.  See <https://issues.guix.gnu.org/issue/38060>.

gnu: python-fenics-ffc: Update to 2019.1.0.post0.

* gnu/packages/simulation.scm (python-fenics-ffc): Update to 2019.1.0.post0.

gnu: python-fenics-fiat: Update to 2019.1.0.

* gnu/packages/simulation.scm (python-fenics-fiat): Update to 2019.1.0.

gnu: python-fenics-ufl: Update to 2019.1.0.

* gnu/packages/simulation.scm (python-fenics-ufl): Update to 2019.1.0.

gnu: python-fenics-dijitso: Update to 2019.1.0.

* gnu/packages/simulation.scm (python-fenics-dijitso): Update to 2019.1.0.

gnu: jgmenu: Update to 4.0.1.

* gnu/packages/xdisorg.scm (jgmenu): Update to 4.0.1.
  [native-inputs]: Add cppcheck.
  [inputs]: Add glib and remove python.
  [arguments]: Remove fix-paths phase, add fix-tests phase and update
  configure phase.

gnu: xsecurelock: Fix strange character in description.

* gnu/packages/xdisorg.scm (xsecurelock)[description]: Replace strange
  character by a space.

gnu: udiskie: Update to 2.0.4.

* gnu/packages/freedesktop.scm (udiskie): Update to 2.0.4.
* gnu/packages/patches/udiskie-no-appindicator.patch: Update for 2.0.4.

gnu: guile-present: Add "guile3.0-present".

* gnu/packages/gtk.scm (guile-present)[source](snippet): Add "3.0" to
the supported Guile versions.
(guile3.0-present): New variable.

gnu: guile-present: Pass the right module directories in scripts.

* gnu/packages/gtk.scm (guile-present)[arguments]: In 'post-install'
phase, remove hard-coded "2.0" and replace it by a computed effective
version.  Also, pass "/site-ccache" to -C.

gnu: guile-present: Install .go files in /site-ccache.

* gnu/packages/gtk.scm (guile-present)[source]: Add 'modules' and 'snippet'.

gnu: guile-rsvg: Add "guile3.0-rsvg" variant.

* gnu/packages/gtk.scm (guile3.0-rsvg): New variable.

gnu: guile-cairo: Add "guile3.0-cairo" variant.

* gnu/packages/gtk.scm (guile-cairo)[source](snippet): Add #include
<string.h> everywhere #include <libguile.h> appears.
(guile3.0-cairo): New variable.

gnu: guile-lib: Add "guile3.0-lib" variant.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-lib)[source]: Add 'modules' and
'snippet'.
(guile3.0-lib): New variable.

gnu: mcron: Add "guile3.0-mcron" variant.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (mcron)[arguments]: In 'fix-finding-guile'
phase, add "3.0".
(guile3.0-mcron): New variable.

gnu: haunt: Add "guile3.0-haunt" variant.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (haunt)[source]: Add 'modules' and 'snippet'.
[arguments]: In 'wrap-haunt' phase, assume that INPUTS might lack
"guile-reader".
(guile3.0-haunt): New variable.

gnu: guile-next: Disable JIT on armhf-linux.

* gnu/packages/guile.scm (guile-3.0)[arguments]: New field.

tests: Fix typo in comment.

* gnu/tests.scm: Add missing word in commentary.

installer: Make "TRANSLATORS" comment visible.

* gnu/installer/newt/user.scm (run-root-password-page): Move
"TRANSLATORS" comment right above 'G_' call.

gnu: sassc/libsass-3.5: Hide.

This follows up on commit bed24ecfcd68ca6fbc21f02b477cffff3b4c0450.

Reported-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>
* gnu/packages/web.scm (sassc/libsass-3.5)[properties]: Hide package.