gnu: rust-walkdir: Don't include minor version in variable name.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-walkdir-2.3): Rename to...
  (rust-walkdir-2): ...this.
  (rust-walkdir-1.0): Rename to...
  (rust-walkdir-1): ...this.

gnu: Add tascam-gtk.

* gnu/packages/music.scm (tascam-gtk): New variable.

gnu: Add libxmlplusplus-2.6.

* gnu/packages/xml.scm (libxmlplusplus-2.6): New variable.

gnu: Add libxmlplusplus.

* gnu/packages/xml.scm (libxmlplusplus): New variable.

gnu: Add paperview.

* gnu/packages/games.scm (paperview): New variable.

gnu: catch-framework2: Update to 2.13.0.

* gnu/packages/check.scm (catch-framework2): Update to 2.13.0.
* gnu/packages/engineering.scm (libfive)[arguments]: Adjust custom
'find-catch phase for updated include path.
* gnu/packages/xdisorg.scm (j4-dmenu-desktop)[arguments]: Add custom
'find-catch phase to search for updated catch2 include directory.

gnu: pjproject-jami: Reuse more of the base pjproject.

Now that the base pjproject is built as a shared library, the cost of adding
dependencies shared with Jami is minimal.  The pjproject-jami now differs only
by its added patches.

* gnu/packages/jami.scm (pjproject-jami)[arguments]: Use the
substitute-keyword-arguments macro to reuse the base pjproject package
arguments, adding only the 'apply-patches phase.

gnu: opendht: Propagate gnutls.

Propagate gnutls as it's included by the opendht/crypto.h header file.

* gnu/packages/networking.scm (opendht)[inputs]: Move gnutls...
[propagated-inputs]: ...to here.  Move argon2 to inputs.

gnu: pjproject: Enable shared libraries.

* gnu/packages/telephony.scm (pjproject)[outputs]: Add a "static" output.
[phases]: Move the 'check phase after the 'install phase.
{move-static-libraries}: Add phase.
[configure-flags]: Set LDFLAGS to add a runpath reference to self.

gnu: pjproject: Include sensible configure flags from pjproject-jami.

This is done so the regular pjproject has more in common with
pjproject-jami, which allows simplifying its definition.

* gnu/packages/telephony.scm (pjproject)[configure-flags]: Add
'--enable-epoll' when the system is Linux.  Define CFLAGS with
the '-DNDEBUG' options.

gnu: pjproject: Fix problem in pkg-config file.

* gnu/packages/patches/pjproject-correct-the-cflags-field.patch: Add patch.
* gnu/packages/patches/pjproject-fix-pkg-config-ldflags.patch: Likewise.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register the new patches.
* gnu/packages/telephony.scm (pjproject): Use them.
* gnu/packages/jami.scm (pjproject-jami): Remove a patch from
pjproject-jami that is already applied against pjproject.

gnu: pjproject: Fix build and enable tests.

* gnu/packages/telephony.scm (pjproject)[origin]: Simplify snippet definition
and remove all bundled libraries.
[outputs]: Add a debug output.
[arguments]: Enable tests, and explicit the configure flags now required to
build using only system libraries.
[phases]{make-source-files-writable}: Add phase.
{disable-some-tests}: Overhaul phase.
[inputs]: Add bcg729, gsm, libsamplerate, opus, portaudio and speexdsp.

gnu: resample: Improve synopsis and description.

The synopsis mentioned a library but it is instead a set of command line
utilities.

* gnu/packages/audio.scm (resample)[synopsis]: Mention these are utilities.
[description]: Describe the two included command line utilities in more
detail.

gnu: Add inspircd.

* gnu/packages/irc.scm (inspircd): New variable.

gnu: libjpeg-turbo: Replace with 2.0.5 [fixes CVE-2020-13790].

* gnu/packages/image.scm (libjpeg-turbo/fixed): New variable.
(libjpeg-turbo)[replacement]: New field.

gnu: libjpeg: Update to 9d [security fixes].

Includes fixes for CVE-2020-13790 and CVE-2020-14152.

* gnu/packages/image.scm (ijg-libjpeg): Update to 9d.

gnu: Remove libjpeg@8d.

This version of ijg-libjpeg contains security vulnerabilities
and is not used by any other package in Guix.

* gnu/packages/image.scm (ijg-libjpeg-8): Remove variable.

gnu: libxfce4util: Update source URI.

* gnu/packages/xfce.scm (libxfce4util)[source]: Update URI.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: emacs-hl-todo: Update to 3.1.2.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-hl-todo): Update to 3.1.2.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: rust-1.45: Update to 1.45.2.

* gnu/packages/rust.scm (rust-1.45): Update to 1.45.2.

file-systems: Leave room for extension in serialized specs.

* gnu/system/file-systems.scm (spec->file-system): Ignore extra fields.
(file-system->spec): Add comment.

scripts: Pass #:verbosity to 'build-notifier'.

* guix/scripts/archive.scm (guix-archive): Pass #:verbosity to
'build-notifier'.
* guix/scripts/build.scm (guix-build): Likewise.
* guix/scripts/copy.scm (guix-copy): Likewise.
* guix/scripts/deploy.scm (guix-deploy): Likewise.
* guix/scripts/environment.scm (guix-environment): Likewise.
* guix/scripts/pack.scm (guix-pack): Likewise.
* guix/scripts/package.scm (guix-package*): Likewise.
* guix/scripts/pull.scm (guix-pull): Likewise.
* guix/scripts/system.scm (verbosity-level): New procedure.
(process-action): Pass #:verbosity to 'build-notifier'.
(guix-system): Use 'verbosity-level' for 'with-status-verbosity'.

ui: Add #:verbosity to 'show-what-to-build'.

* guix/ui.scm (%default-verbosity): New variable.
(show-what-to-build): Add #:verbosity and honor it.
(build-notifier): Add #:verbosity and pass it to 'show-what-to-build'.

doc: Document 'mount-may-fail?' field.

This is a followup to 7c27bd115b14afd142da7684cc349369965f9eab.

* doc/guix.texi (File Systems): Document 'mount-may-fail?'.

gnu: emacs-guix: Update to latest gitlab version.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-guix): Update to a 0.5.2 snapshot.
fix https://issues.guix.gnu.org/41063
[source] changes to git-getch.
[snippet] removed.
[native-inputs] added tools to build.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: easyrpg-player: Update to 0.6.2.1.

* gnu/packages/easyrpg.scm (easyrpg-player): Update to 0.6.2.1.

gnu: xfce4-terminal: Update to 0.8.9.2.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-terminal): Update to 0.8.9.2.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: xfce4-time-out-plugin: Update to 1.1.1.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-time-out-plugin): Update to 1.1.1.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: emacs: Ignore empty XIM styles.

As of libx11 version 1.6.10, xim may be NULL, which causes a segmentation
fault in the execution of ARRAYELTS.  As a cautionary measure, we
short-circuit this logic.

* gnu/packages/patches/emacs-ignore-empty-xim-styles.patch: New file.
* gnu/packages/emacs.scm (emacs emacs-next)[patches]: Use it.
* gnu/local.mk: Register it.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: android: Export android-liblog.

* gnu/packages/android.scm (android-liblog): Export it.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: android: Export android-libcutils.

* gnu/packages/android.scm (android-libcutils): Export it.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: xfce4-stopwatch-plugin: Update to 0.4.0.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-stopwatch-plugin): Update to 0.4.0.
[arguments]: Enable "tests".

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: Add python-onnx.

* gnu/packages/machine-learning.scm (python-onnx): New variable.
* gnu/packages/patches/python-onnx-use-system-googletest.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: python-protobuf: Update to 3.12.4.

* gnu/packages/protobuf.scm (python-protobuf): Update to 3.12.4.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: cuirass: Update to 0.0.1-42.d332955.

* gnu/packages/ci.scm (cuirass): Update to 0.0.1-42.d332955.

gnu: cuirass: Update to 0.0.1-41.614ea05.

* gnu/packages/ci.scm (cuirass): Update to 0.0.1-41.614ea05.

gnu: emacs-dhall-mode: Update to 0.1.3-1.484bcf8.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-dhall-mode): Update to 0.1.3-1.484bcf8.

gnu: emacs-org-roam: Update to 1.2.1.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-org-roam): Update to 1.2.1.
[propagated-inputs]: Replace emacs-emacsql with emacs-emacsql-sqlite3.
[home-page]: Update URL.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: Add emacs-emacsql-sqlite3.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-emacsql-sqlite3): New variable.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

services: Add zram-device-service.

* gnu/services/linux.scm (<zram-device-configuration>): New record.
(zram-device-service-type): New variable.
* doc/guix.texi (Linux Services): Document it.
* tests/services/linux.scm (zram-swap-device-test): New tests.

gnu: Add cl-qbase64.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-qbase64, cl-qbase64, ecl-qbase64): New
  variables.

Co-authored-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: sbcl-eos: Update to 0.0.0-2.b4413bc.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-eos): Update to 0.0.0-2.b4413bc.

gnu: Add emacs-jenkinsfile-mode.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-jenkinsfile-mode): New variable.

gnu: Add Remake.

* gnu/packages/debug.scm (remake): New variable.
* gnu/packages/patches/remake-impure-dirs.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: nomad: Update to 0.2.0-alpha.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (nomad): Update to 0.2.0-alpha.

This is a significant update to Nomad. This removes the majority of C code and
replaces it with gobject introspection using g-golf.

In the process the nomad package expression has changed significantly.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: starfighter: Update to 2.3.1.

* gnu/packages/games.scm (starfighter): Update to 2.3.1.

gnu: xorg-server: Fix CVE-2020-14347 via graft.

* gnu/packages/patches/xorg-server-CVE-2020-14347.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/xorg.scm (xorg-server/fixed): New variable.
(xorg-server)[replacement]: New field.
(xorg-server-wayland): Use package/inherit.

gnu: libx11: Replace with 1.6.10 [fixes CVE-2020-14344].

* gnu/packages/xorg.scm (libx11/fixed): New variable.
(libx11)[replacement]: New field.

gnu: cuirass: Update to 0.0.1-40.153b49c.

* gnu/packages/ci.scm (cuirass): Update to 0.0.1-40.153b49c.

gnu: sbcl: Update to 2.0.7.

* gnu/packages/lisp.scm (sbcl): Update to 2.0.7.

doc: Explain how to use psql with peer authentication.

* doc/guix.texi (Database Services): Add example of shell commands to use psql
as  system user.  Also add troubleshooting tip when service fails to start
because of incompatible cluster.

services: postgresql: Provide postgresql commands.

* gnu/services/databases.scm (postgresql-service-type): Extend
profile-service-type to provide postgresql commands.

gnu: Add git-cal.

* gnu/packages/version-control.scm (git-cal): New variable.

gnu: texmacs: Update to 1.99.13.

* gnu/packages/text-editors.scm (texmacs): Update to 1.99.13.
[source]: Remove unnecessary snippet.
[native-inputs]: Add xdg-utils.
[inputs]: Replace qt-4 with qtbase.
[arguments]: Add a phase to fix hard-coded paths.
[description]: Fix small typo.

gnu: Add python-wurlitzer.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-wurlitzer): New variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: pulsemixer: Update to 1.5.1.

* gnu/packages/pulseaudio.scm (pulsemixer): Update to 1.5.1.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: xfce4-notifyd: Update to 0.6.1.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-notifyd): Update to 0.6.1.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: plantuml: Update to 1.2020.15.

* gnu/packages/uml.scm (plantuml): Update to 1.2020.15.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: Update xxhash to 0.8.0.

* gnu/packages/digest.scm (xxhash): Update to 0.8.0.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: Add python-pytest-ordering.

* gnu/packages/python-check.scm (python-pytest-ordering): New variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: qtimageformats: Fix build.

Reported by <nefix> on IRC.

* gnu/packages/qt.scm (qtimageformats)[arguments]: Add a 'fix-build phase.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

guix: lint: Ignore unsupported source URL’s.

* guix/lint.scm (check-source): Add match case for #f.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: pavucontrol: Update to 4.0.

From 5312ae2b7bff23268a6546ce89cd349f3183bd2c Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Michael Rohleder <mike@rohleder.de>
Date: Thu, 30 Jul 2020 08:08:38 +0200
Subject: [PATCH] gnu: pavucontrol: Update to 4.0.

* gnu/packages/pulseaudio.scm (pavucontrol): Update to 4.0.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: Add zeal.

* gnu/packages/documentation.scm (zeal): New variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: emacs-dimmer: Update to 0.4.2.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-dimmer): Update to 0.4.2.

gnu: emacs-google-translate: Update to 0.12.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-google-translate): Update to 0.12.0.

gnu: emacs-datetime: Update to 0.6.6.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-datetime): Update to 0.6.6.

[inputs]: Add emacs-extmap.

gnu: Add emacs-extmap.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-extmap): New variable.

gnu: chibi-scheme: Update to 0.9.

* gnu/packages/scheme.scm (chibi-scheme): Update to 0.9.

gnu: linux-libre: Update to 5.4.55.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.55.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.
(deblob-scripts-5.4): Update to 5.4.55.

gnu: linux-libre@5.7: Update to 5.7.12.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.7-version): Update to 5.7.12.
(linux-libre-5.7-pristine-source): Update hash.
(deblob-scripts-5.7): Update to 5.7.12.

gnu: Add blender@2.79b.

Restore blender@2.79b, the last version that does not require OpenGL 3,
and therefore the last version to work on many older computers.  Note
that this commit relies on blender-2.79-newer-ffmpeg.patch and
blender-2.79-python-3.7-fix.patch, which were left in the tree when
blender@2.79b was previously removed in commit
1f14453eedfede4626a78321c66a009c9997bee4.

* gnu/packages/patches/blender-2.79-gcc8.patch,
gnu/packages/patches/blender-2.79-gcc9.patch,
gnu/packages/patches/blender-2.79-oiio2.patch,
gnu/packages/patches/blender-2.79-python-3.8-fix.patch: New files.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add them.
* gnu/packages/graphics.scm (blender-2.79): New variable.

gnu: openimageio: Update to 2.0.13.

* gnu/packages/graphics.scm (openimageio): Update to 2.0.13.
[inputs]: Replace python-2 with python-wrapper.  Add pybind11
and robin-map.

gnu: Add robin-map.

* gnu/packages/datastructures.scm (robin-map): New variable.

gnu: emacs-transient: All phases return #t.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-transient): Return #t from the
build-info-manual phase.

gnu: ruby-netrc: All phases return #t.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-netrc): In check phase, use for-each
instead of map, and return #t.

gnu: linux-libre@4.19: Update to 4.19.136.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.136.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.14: Update to 4.14.191.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.191.
(linux-libre-4.14-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.9: Update to 4.9.232.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9-version): Update to 4.9.232.
(linux-libre-4.9-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.4: Update to 4.4.232.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4-version): Update to 4.4.232.
(linux-libre-4.4-pristine-source): Update hash.

gnu: scintilla: Update to 4.4.4.

* gnu/packages/text-editors.scm (scintilla): Update to 4.4.4.

gnu: snap: Update to 6.1.0.

* gnu/packages/education.scm (snap): Update to 6.1.0.

gnu: thinkfan: Update to 1.2.1.

* gnu/packages/linux.scm (thinkfan): Update to 1.2.1.

file-system: Add efivarfs support.

Tools such as efibootmgr rely on the deprecated /sys/firmware/efi/vars API as
well as on the new /sys/firmware/efi/efivars API. The latter needs to be
mounted.

Reported by Keyhenge here:
https://lists.gnu.org/archive/html/bug-guix/2020-04/msg00274.html

Here is the efivarfs documentation:
https://www.kernel.org/doc/Documentation/filesystems/efivarfs.txt.

* gnu/system/file-systems.scm (%efivars-file-system): New exported variable,
(%base-file-systems): add it.
* gnu/system/install.scm (%efivars-file-system): Add it.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

file-system: Add mount-may-fail? option.

* gnu/system/file-systems.scm (<file-system>): Add a mount-may-fail? field.
(file-system->spec): adapt accordingly,
(spec->file-system): ditto.
* gnu/build/file-systems.scm (mount-file-system): If 'system-error is raised
and mount-may-fail? is true, ignore it. Otherwise, re-raise the exception.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

file-systems: Add %debug-file-system.

* gnu/system/file-systems.scm (%debug-file-system): New variable,
(%base-file-systems): add it.

gnu: Add bpftrace.

* gnu/packages/linux.scm (bpftrace): New variable.
* gnu/packages/patches/bpftrace-disable-bfd-disasm.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: python-mamba: Update to 0.11.1.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-mamba): Update to 0.11.1.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: hashcat: Update to 6.1.1.

* gnu/packages/password-utils.scm (hashcat): Update to 6.1.1.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: vlc: Update to 3.0.11.1.

* gnu/packages/video.scm (vlc): Update to 3.0.11.1.

gnu: rust-1.45: Update to 1.45.1.

* gnu/packages/rust.scm (rust-1.45): Update to 1.45.1.

gnu: python-clikit: Update to 0.6.2.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-clikit): Update to 0.6.2.
[arguments] Explicitly disable tests.
[propagated-inputs]: Add python-crashtest.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

gnu: Add python-crashtest.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-crashtest): New public variable.

Signed-off-by: Oleg Pykhalov <go.wigust@gmail.com>

packages: 'generate-package-cache' is deterministic.

Fixes <https://bugs.gnu.org/42009>.
Reported by Marinus <marinus.savoritias@disroot.org>.

* gnu/packages.scm (generate-package-cache)[entry-key, entry<?]
[variables]: New variables.
[expand-cache]: Change to take two arguments.
[exp]: Fold over VARIABLES.

deploy: Gracefully handle errors.

* guix/scripts/deploy.scm (guix-deploy): Wrap body in 'with-error-handling'.

gnu: Add bcc.

* gnu/packages/linux.scm (bcc): New variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: git: Update to 2.28.0.

* gnu/packages/version-control.scm (git): Update to 2.28.0.

(cherry picked from commit bbee4490d961ceb8d025726b04ea0f2a40355186)

gnu: opam: Fix tests.

* gnu/packages/ocaml.scm (opam)[arguments]: Remove #:tests?.  Adjust the
pre-check phase to make some files writable, patch a hard-coded file name, and
disable mostly-redundant git tests.
[native-inputs]: Remove GIT and PYTHON.  Add OPENSSL, PYTHON-WRAPPER, RSYNC,
UNZIP, and WHICH.

gnu: public-inbox: Make git a regular input.

* gnu/packages/mail.scm (public-inbox)[native-inputs]: Move GIT ...
[inputs]: ... here.

gnu: ruby-hoe-git: Do not propagate git.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-hoe-git)[propagated-inputs]: Remove GIT.