gnu: swaylock: Update to 1.5.

* gnu/packages/wm.scm (swaylock): Update to 1.5.

gnu: swayidle: Update to 1.6.

* gnu/packages/wm.scm (swayidle): Update to 1.6.

gnu: sway: Update to 1.5.1.

* gnu/packages/wm.scm (sway): Update to 1.5.1.
[native-inputs]: Remove LIBCAP.

gnu: wlroots: Update to 0.12.0.

* gnu/packages/wm.scm (wlroots): Update to 0.12.0.
[arguments]: Add #:meson.  Adjust Xwayland substitution in #:phases.
[inputs]: Move everything ...
[propagated-inputs]: ... here.  Add XCB-UTIL-ERRORS and XCB-UTIL-WM.
[native-inputs]: Remove FFMPEG, LIBCAP, and LIBPNG.

Merge branch 'master' into staging

gnu: transmission: Move remaining GUI-related files to "gui" output.

* gnu/packages/bittorrent.scm (transmission)[arguments]<phases>: Expand
"move-gui" phase to move remaining GUI-related files (AppData file,
localization files, man page) to "gui" output.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add uuid support to recutils.

* gnu/packages/databases.scm (recutils): [inputs] Add lib output of
util-linux.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: ocaml-cairo2: Disable tests.

* gnu/packages/ocaml.scm (ocaml-cairo2): Disable tests.

Issue: #44725

gnu: Add python-telethon.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-telethon): New variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: Add axel.

* gnu/packages/networking.scm (axel): New variable.

nls: Update add missing script files.

* po/guix/POTFILES.in: Add missing script files.

guix: refresh: Do not use argument jumping with ngettext.

* guix/scripts/refresh.scm (list-dependents)[lst]: Use ~d for the
singular format string, as the argument jumping would trigger an error
during en@boldquot.mo generation.

gnu: scribus: Update to 1.5.6.1.

* gnu/packages/scribus.scm (scribus): Update to 1.5.6.1.

Merge remote-tracking branch 'upstream/version-1.2.0'

gnu: fldigi: Update to 4.1.16.

* gnu/packages/radio.scm (fldigi): Update to 4.1.16.

gnu: splix: Compress PPDs.

* gnu/packages/cups.scm (splix)[arguments]: Import SRFI-26 and add a
‘compress-PPDs’ phase.

gnu: splix: Update to 2.0.0-315.76268c4.

* gnu/packages/cups.scm (splix): Update to 2.0.0-315.76268c4.
[source]: Fetch from a more maintained git repository.
[arguments]: Add an ‘enter-subdirectory’ phase.
[inputs]: Remove instructions for building without JBIG.  It's no longer
patented.

gnu: xlockmore: Update to 5.66.

* gnu/packages/xdisorg.scm (xlockmore): Update to 5.66.

gnu: zabbix-agentd, zabbix-server: Update to 5.2.1.

* gnu/packages/monitoring.scm (zabbix-agentd): Update to 5.2.1.

gnu: emacs-gcmh: Update to 0.2.1.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-gcmh): Update to 0.2.1.

gnu: emacs-posframe: Update to 0.8.3.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-posframe): Update to 0.8.3.

gnu: python-semver: Fix build, again.

This reverts "gnu: python-semver: Fix build." (commit
b4e1ca0675571f3cda2a00afb3a2f0f01ff500f9) and overrides the check phase.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-semver)[phases]: Override the 'check
phase.
[native-inputs]: Remove all existing native-inputs.  Add python-pytest.

guix-install.sh: don't throw away release candidates when picking the latest version

* etc/guix-install.sh (guix_get_bin_list): modify regexes to allow rcN syntax

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

.dir-locals.el: Add upstream report link.

Follow up from 1d6e7732b163c9e945c9e5b32c726fe3b5f09c3a.

* .dir-locals.el: Modify comment to point at the report to bug-gnu-emacs.

.dir-locals.el: Use setq-local on guix-directory.

* .dir-locals.el: Use setq-local on guix-directory.  While a problem with
using setq hasn't been identified, this seems like good hygiene.

.dir-locals.el: Prevent errors if .dir-locals.el isn't found.

While this repo should presumably always have a .dir-locals.el
by the nature of this file itself, it seems that this behavior "leaks".
See added comment for more details on the fix to this strange bug,
which is likely an upstream emacs or vc-mode issue.

Thanks to Miguel Ángel Arruga Vivas and Maxim Cournoyer for helping
investigate this problem.

* .dir-locals.el: Don't error out if .dir-locals.el isn't found.

gnu: astroid: Fix build.

* gnu/packages/mail.scm (astroid)[arguments]: Add phase to wrap binary
in GI_TYPELIB_PATH. Add 'glib-or-gtk-compile-schemas and
'glib-or-gtk-wrap phases from the glib-or-gtk build system.
[propagated-inputs]: Add adwaita-icon-theme.

Co-authored with Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>
Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: vpn: Make ca, key and cert optional.

* gnu/services/vpn.scm (openvpn-client-configuration)
(openvpn-server-configuration): Make ca, key an cert fields optional.
* doc/guix.texi (VPN Services): Document the change.

gnu: gnubg: Prevent building with AVX instructions.

* gnu/packages/games.scm (gnubg)[arguments]: Add configure-flags for Intel
systems to build without AVX instructions.

Signed-off-by: Kei Kebreau <kkebreau@posteo.net>

gnu: bennu-game-development: Update to 353.

* gnu/packages/game-development.scm (bennu-game-development): Update to 353.

services: shepherd: Map all the invalid store characters to dash.

Fixes a regression introduced in
977eb5d023cfdf8e336f1896480eea9cef5c04e9 whereby file system services
would now have a different name.

* gnu/services/base.scm (file-system->shepherd-service-name): Revert
changes introduced in 977eb5d023cfdf8e336f1896480eea9cef5c04e9.
* gnu/services/shepherd.scm (%store-characters): New variable
(shepherd-service-file-name): Map all the characters outside
%STORE-CHARACTERS to #\-.

gnu: komikku: Update to 0.22.1.

* gnu/packages/gnome.scm (komikku): Update to 0.22.1.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: Add mblaze.

* gnu/packages/mail.scm (mblaze): New variable.

Signed-off-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>

services: cups: Add some extensions by default.

* gnu/services/cups.scm (cups-configuration): Add some extensions by default.
doc/guix.texi (Printing Services): Document the default value.

gnu: bitcoin-core: Update to 0.20.1.

* gnu/packages/finance.scm (bitcoin-core): Update to 0.20.1.
[source]: Remove obsolete patch.
[native-inputs]: Add autoconf, automake and libtool.
[inputs]: Remove protobuf.
[arguments]: Add "set-no-git-flag" phase to indicate the build is not taking
place within a git repository.
* gnu/packages/patches/bitcoin-core-python-compat.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.

Signed-off-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>

gnu: Add python-git-hammer.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-git-hammer): New variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: Add python-globber.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-globber): New variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: Add python-beautifultable.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-beautifultable): New variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: gpgme: Update to 1.15.0.

* gnu/packages/gnupg.scm (gpgme): Update to 1.15.0.

gnu: icecat: Update to 78.5.0-guix0-preview1 [security fixes].

Includes fixes for CVE-2020-15999, CVE-2020-16012, CVE-2020-26951,
CVE-2020-26953, CVE-2020-26956, CVE-2020-26958, CVE-2020-26959,
CVE-2020-26960, CVE-2020-26961, CVE-2020-26965, CVE-2020-26966, and
CVE-2020-26968.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (%icecat-version, %icecat-build-id): Update.
(icecat-source): Update gnuzilla commit, base version, and hashes.
* gnu/packages/patches/icecat-makeicecat.patch: Adapt to new version.

doc: Add a backslash escape to the disk-image example.

* doc/guix.texi (Invoking guix system): Add a backslash escape.

Merge remote-tracking branch 'origin/version-1.2.0' into master

Conflicts:
gnu/packages/bioinformatics.scm

The python-pysam package fixed in master was kept instead of the update done
in the version-1.2.0 branch.

gnu: snap: Update to 6.3.3.

* gnu/packages/education.scm (snap): Update to 6.3.3.

gnu: guix: Fix typo in comment.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Fix typo in comment.

gnu: units: Update to 2.21.

* gnu/packages/maths.scm (units): Update to 2.21.

gnu: python-parted: Update to 3.11.7.

* gnu/packages/disk.scm (python-parted): Update to 3.11.7.

gnu: oath-toolkit: Update to 2.6.4.

* gnu/packages/authentication.scm (oath-toolkit): Update to 2.6.4.

gnu: nnn: Update to 3.5.

* gnu/packages/admin.scm (nnn): Update to 3.5.

gnu: gnupg: Update to 2.2.24.

* gnu/packages/gnupg.scm (gnupg): Update to 2.2.24.

gnu: libksba: Update to 1.4.0.

* gnu/packages/gnupg.scm (libksba): Update to 1.4.0.

gnu: libassuan: Update to 2.5.4.

* gnu/packages/gnupg.scm (libassuan): Update to 2.5.4.

system: vm: Remove unused system-disk-image-in-vm.

* gnu/system/vm.scm (system-disk-image-in-vm): Remove.

Reported-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

guix: system: Make disk-image root file system non-volatile by default.

And add a new '--volatile' option to have it volatile otherwise.

* guix/scripts/system.scm (%options)[volatile-root?]: New boolean option.
(%default-options): Set its default value to #f.
(show-help): Add help doc.
* guix/scripts/system.scm (perform-action): Propagate option...
(system-derivation-for-action): ...here.  Use it to set the volatile-root?
field of the image object passed to SYSTEM-IMAGE.
* doc/guix.texi (Invoking guix system): Document it.

doc: Detail which bootloader get used with disk-image or vm-image.

* doc/guix.texi (Invoking guix system): Extend doc.

bootloader: grub: Skip install-grub-efi when producing a disk image.

Fixes <http://issues.guix.gnu.org/44353>.

Every bootloader should try their best to install themselves using only the
MOUNT-POINT and otherwise do nothing.  This requirement comes from the
necessity to call INSTALL-GRUB when installing the (non-EFI) GRUB bootloader,
which needs to populate the root file system with extra modules that cannot be
fit in the core.img file, limited in size to 491520 bytes (by the i386-pc
format required for legacy BIOS compatibility).

As introducing bootloader knowledge at the level of the image code is
undesirable, every bootloader should be adapted to support this fall-back for
their installation procedure (TODO).

* gnu/bootloader/grub.scm (install-grub-efi)[efi-dir]: Skip when the EFI-DIR
argument is set to #f.

image: Remove conflicting user-provided EFI file system.

When the image type is "raw" or derived from it (such as "qcow2"), an ESP
partition and file system is already added by the image generator.  If a
conflicting user-provided EFI file system is provided, it causes the boot to
fail, as happens for the lightweight-desktop.tmpl and desktop.tmpl templates
under gnu/system/examples.

* gnu/system/image.scm (operating-system-for-image): Remove file systems whose
mount point is "/boot/efi".

gnu: Add astroid.

* gnu/packages/mail.scm (astroid): New variable.

Co-authored with Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>.
Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: gmime: Enable introspection.

* gnu/packages/mail.scm (gmime)[arguments]: Add the "--enable-introspection"
flag to configure-flags.
[native-inputs]: Add gobject-introspection.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: libhandy: Update to 1.0.2.

* gnu/packages/gnome.scm (libhandy): Update to 1.0.2.

gnu: libhandy: Update home page.

* gnu/packages/gnome.scm (libhandy)[home-page]: Update.

gnu: arc-theme: Add missing configure flag.

* gnu/packages/gnome.scm (arc-theme)[arguments]: Add ‘--disable-cinnamon’
to #:configure-flags.

gnu: node@10.22: Update to 10.22.1.

* gnu/packages/node.scm (node-10.22): Update to 10.22.1.

installer: Fix device synchronization.

Reported by Florian Pelz:
https://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2020-11/msg00326.html.

* gnu/installer/utils.scm (call-with-time): New procedure,
(let/time): new macro.
* gnu/installer/parted.scm (with-delay-device-in-use?): Increase the retry
count to 16.
(non-install-devices): Remove the call to with-delay-device-in-use? as it
doesn't return the expected result, and would block much longer now.
(free-parted): Log the time required to sync each device.

installer: Fix device synchronization.

Reported by Florian Pelz:
https://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2020-11/msg00326.html.

* gnu/installer/utils.scm (call-with-time): New procedure,
(let/time): new macro.
* gnu/installer/parted.scm (with-delay-device-in-use?): Increase the retry
count to 16.
(non-install-devices): Remove the call to with-delay-device-in-use? as it
doesn't return the expected result, and would block much longer now.
(free-parted): Log the time required to sync each device.

gnu: tomb: Update to 2.8.

Fixes CVE-2020-28638.

* gnu/packages/crypto.scm (tomb): Update to 2.8
[source]: Remove obsolete patch.
* gnu/packages/patches/tomb-fix-errors-on-open.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.

gnu: bootloader: efi-bootloader-chain: Allow multiple HOOKS.

* gnu/bootloader.scm (efi-bootloader-profile): Allow multiple HOOKS.
(efi-bootloader-chain): Allow multiple HOOKS.

Signed-off-by: Danny Milosavljevic <dannym@scratchpost.org>

gnu: emacs-helm: Update to 3.7.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-helm): Update to 3.7.0.

gnu: emacs-djvu: Update to 1.1.1.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-djvu): Update to 1.1.1.

gnu: enet: Update to 1.3.17.

* gnu/packages/networking.scm (enet): Update to 1.3.17.

gnu: mpop: Update to 1.4.11.

* gnu/packages/mail.scm (mpop): Update to 1.4.11.

gnu: livemedia-utils: Cross-compile.

* gnu/packages/video.scm (livemedia-utils)[arguments]: Use CC-FOR-TARGET
and CXX-FOR-TARGET.

gnu: livemedia-utils: Update to 2020.11.05.

* gnu/packages/video.scm (livemedia-utils): Update to 2020.11.05.
[inputs]: Add openssl.

gnu: wireguard-linux-compat: Update to 1.0.20201112.

* gnu/packages/vpn.scm (wireguard-linux-compat): Update to 1.0.20201112.
[arguments]: Build with linux-libre-5.4.

gnu: arc-theme: Update to 20201013.

* gnu/packages/gnome.scm (arc-theme): Update to 20201013.
[source]: Use new upstream.

gnu: python-pypika: Update to 0.44.0.

* gnu/packages/databases.scm (python-pypika): Update to 0.44.0.

gnu: python-peewee: Update to 3.14.0.

* gnu/packages/databases.scm (python-peewee): Update to 3.14.0.

gnu: xsimd: Define SIMD.

* gnu/packages/cpp.scm (xsimd)[description]: Expand the @acronym.

gnu: xsimd: Update to 7.4.9.

* gnu/packages/cpp.scm (xsimd): Update to 7.4.9.

gnu: gnu-pw-mgr: Update to 2.7.4.

* gnu/packages/gnu-pw-mgr.scm (gnu-pw-mgr): Update to 2.7.4.

gnu: youtube-dl: Update to 2020.11.17.

* gnu/packages/video.scm (youtube-dl): Update to 2020.11.17.

gnu: pdfpc: Update to 4.4.1.

* gnu/packages/pdf.scm (pdfpc): Update to 4.4.1.

gnu: guix: Use libexec/guix/guile in the 'guix' shebang.

This is a followup to 880fe019ae64df37815bbdb1a22305f99dae759d.

* gnu/packages/package-management.scm (guix)[arguments]: Delete
'patch-shebangs' phase.

gnu: z3: Update to 4.8.9.

* gnu/packages/maths.scm (z3): Update to 4.8.9.

Signed-off-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>

gnu: git: Add phase to restore hooks shebang.

Fixes <https://bugs.gnu.org/25508>.

* gnu/packages/version-control.scm (git)[arguments]: New phase
restore-sample-hooks-shebang.

.dir-locals.el: Add upstream report link.

Follow up from 1d6e7732b163c9e945c9e5b32c726fe3b5f09c3a.

* .dir-locals.el: Modify comment to point at the report to bug-gnu-emacs.

gnu: grub: Cross-compile for mips64el-linux.

* gnu/packages/bootloaders.scm (grub)[arguments]: Add custom phase to
set BUILD_FREETYPE_* flags.
[native-inputs]: Add freetype.

gnu: grub: Don't run tests when cross compiling.

* gnu/packages/bootloaders.scm (grub)[arguments]: Skip tests when
cross-compiling.

gnu: Add emacs-boon.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-boon): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add emacs-modalka.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-modalka): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: emacs-matrix-client: Update to 0.0.0-5.59c7924.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-matrix-client): Update to 0.0.0-5.59c7924.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: lz4: Update to 1.9.3.

* gnu/packages/compression.scm (lz4): Update to 1.9.3.

services: mingetty: Export configuration accessors.

* gnu/services/base: Export configuration accessors for mingetty.

.dir-locals.el: Use setq-local on guix-directory.

* .dir-locals.el: Use setq-local on guix-directory.  While a problem with
using setq hasn't been identified, this seems like good hygiene.

.dir-locals.el: Prevent errors if .dir-locals.el isn't found.

While this repo should presumably always have a .dir-locals.el
by the nature of this file itself, it seems that this behavior "leaks".
See added comment for more details on the fix to this strange bug,
which is likely an upstream emacs or vc-mode issue.

Thanks to Miguel Ángel Arruga Vivas and Maxim Cournoyer for helping
investigate this problem.

* .dir-locals.el: Don't error out if .dir-locals.el isn't found.

gnu: icedove: Update to 78.4.3.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (icedove): Update to 78.4.3.

maint: Install 'guix-daemon.cil' SELinux file.

Fixes <https://bugs.gnu.org/44649>.
Reported by Daniel Brooks <db48x@db48x.net>.

This is a followup to 6799e6e5780683cc20f250192fb84cbec135073b, which
rightfully removed the '.cil' file from the distribution, but wrongfully
installed the '.cil.in' file instead of the '.cil' file.

* Makefile.am (nodist_selinux_policy_DATA): Remove ".in".

gnu: gcc-vc4: Update to commit 0fe4b83897341742f9df65797474cb0feab4b377.

* gnu/packages/patches/gcc-6-fix-buffer-size.patch: New file.
* gnu/packages/patches/gcc-6-fix-isl-includes.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add them.
* gnu/packages/embedded.scm (gcc-vc4): Update to commit
0fe4b83897341742f9df65797474cb0feab4b377.
[source]: Add the patches from above.

pull: Do not suggest running `guix pull --news' on the first run.

* guix/scripts/pull.scm (display-channel-news-headlines): If there
are no news to display, return false instead of <unspecified>.

gnu: pzstd: Cross compile.

* gnu/packages/compression.scm (pzstd)[arguments]: use cc-for-target,
cxx-for-target in make-flags.
[native-inputs]: Only use googletest when compiling natively.
[inputs]: Add googletest when cross compiling.

gnu: zstd: Cross compile.

* gnu/packages/compression.scm (zstd)[arguments]: When targeting another
system use cc-for-target in make-flags.