gnu: openssh: Update to 8.2p1.

* gnu/packages/ssh.scm (openssh): Update to 8.2p1.
[arguments]: Adjust ‘patch-tests’ phase.

gnu: openssh: Don't use NAME in source URI.

* gnu/packages/ssh.scm (openssh)[source]: Hard-code NAME.

gnu: endlessh: Update to 1.1.

* gnu/packages/ssh.scm (endlessh): Update to 1.1.
[source]: Use GIT-FETCH and GIT-FILE-NAME.

services: shepherd: Spawn services with nothing but the PATH variable.

Previously, services spawned with 'make-forkexec-constructor' &
co. would all inherit the environment variables of PID 1, which includes
things like 'BOOT_IMAGE'.  This change resets it to the bare minimum.

* gnu/services/shepherd.scm (shepherd-configuration-file): Add call to
'default-environment-variables'.  Remove 'setenv' call.

gnu: shepherd: Add "guile3.0-shepherd" variant.

* gnu/packages/admin.scm (guile3.0-shepherd): New variable.

gnu: shepherd: Update to 0.7.0.

* gnu/packages/admin.scm (shepherd): Update to 0.7.0.

gnu: python-reno: Update home page.

* gnu/packages/openstack.scm (python-reno)[home-page]: Follow (HTTPS)
redirection.

gnu: autoconf: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/autotools.scm (autoconf)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: python2-enum: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-enum)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: r-sdmtools: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/cran.scm (r-sdmtools)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: r-tcltk2: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/cran.scm (r-tcltk2)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: r-rocr: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/statistics.scm (r-rocr)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: wabt: Use Texinfo mark-up.

* gnu/packages/web.scm (wabt)[description]: Mark up more better.

gnu: libmicrohttpd: Update to 0.9.70.

* gnu/packages/gnunet.scm (libmicrohttpd): Update to 0.9.70.

gnu: freeorion: Update to 0.4.9.

* gnu/packages/games.scm (freeorion): Update to 0.4.9.
[source]: Use release tarball.

gnu: openscenegraph: Fix typo in description.

* gnu/packages/graphics.scm (openscenegraph)[synopsis, description]: Add missing hyphen.

gnu: openscenegraph: Update to 3.6.5.

* gnu/packages/graphics.scm (openscenegraph): Update to 3.6.5.

gnu: flashrom: Update to 1.2.

* gnu/packages/flashing-tools.scm (flashrom): Update to 1.2.

gnu: fio: Update to 3.18.

* gnu/packages/benchmark.scm (fio): Update to 3.18.

gnu: fasm: Update to 1.73.22.

* gnu/packages/assembly.scm (fasm): Update to 1.73.22.

gnu: sbsigntools: Update to 0.9.3.

* gnu/packages/efi.scm (sbsigntools): Update to 0.9.3.

gnu: libasr: Update to 1.0.4.

* gnu/packages/dns.scm (libasr): Update to 1.0.4.
[arguments]: Remove obsolete ‘bootstrap’ phase replacement.

gnu: lttoolbox: Remove redundant FILE-NAME.

* gnu/packages/dictionaries.scm (lttoolbox)[source]: Remove FILE-NAME field.

gnu: lttoolbox: Update to 3.5.1.

* gnu/packages/dictionaries.scm (lttoolbox): Update to 3.5.1.
[arguments]: Replace ‘bootstrap’ phase.
[native-inputs]: Add autoconf, automake, and libtool.

gnu: camlp5: Update to 7.11.

* gnu/packages/ocaml.scm (camlp5): Update to 7.11.

gnu: ddclient: Update home page.

* gnu/packages/dns.scm (ddclient)[home-page]: Update.

gnu: ddclient: Update to 3.9.1.

* gnu/packages/dns.scm (ddclient): Update to 3.9.1.
[source]: Use GIT-FETCH and add a FILE-NAME.
[native-inputs]: Remove gzip and tar.
[arguments]: Adapt to git checkout source.

gnu: boinc-client: Trim synopsis.

* gnu/packages/distributed.scm (boinc-client)[synopsis]: Remove package name.

gnu: boinc-client: Update to 7.16.4.

* gnu/packages/distributed.scm (boinc-client): Update to 7.16.4.

gnu: noise-repellent: Update to 0.1.5.

* gnu/packages/audio.scm (noise-repellent): Update to 0.1.5.
[build-system]: Switch to meson-build-system.
[arguments]: Remove GNU build system flags & set installation prefix.

gnu: Remove blender@2.79b.

As discussed on #guix with lfam and raingloom, it no longer builds and
users with hardware that requires it can use ‘guix time-machine’.

* gnu/packages/graphics.scm (blender-2.79): Remove variable.

gnu: blender: Update to 2.82.

* gnu/packages/graphics.scm (blender): Update to 2.82.
[arguments]: Uncomment ‘fix-broken-import’ phase.

gnu: Add rtl8812au-aircrack-ng-linux-module.

* gnu/packages/linux.scm (rtl8812au-aircrack-ng-linux-module):
New public variable.

gnu: virt-manager: Move gobject-introspection to native-inputs

* gnu/packages/virtualization.scm (virt-manager): Move
  gobject-introspection from inputs to native-inputs.

gnu: libvirt, virt-manager: Don't use tabs for indentation

* gnu/packages/virtualization.scm: Replace tabs with spaces.

gnu: rust-same-file-1.0: Don't skip build.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-same-file-1.0)[arguments]: Don't skip build.

gnu: rust-ignore-0.4: Add rust-winapi-util-0.1 to inputs.

This is a followup to 566997236494d83a48182d69311897789b5c9cd4. At the
time, it seemed like the input is only used on Windows and therefore
unnecessary. However, the package kept building only because the crate
was still being used transitively, through rust-same-file-1.0.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-ignore-0.4)[arguments](cargo-inputs):
  Add rust-winapi-util-0.1.

gnu: accountsservice: 'Add patch-/bin/cat' phase.

* gnu/packages/freedesktop.scm (accountsservice)[arguments]: Add 'patch-/bin/cat'
phase.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: elixir: Update to 1.10.0.

* gnu/packages/elixir.scm (elixir): Update to 1.10.0.
* gnu/packages/patches/elixir-path-length.patch: Update patch so it can
be applied to v1.10.0 source

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: whois: Update to 5.5.6.

* gnu/packages/networking.scm (whois): Update to 5.5.6.

gnu: gwl: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/package-management.scm (gwl): Update to 0.2.0.
[source]: Fetch from gnu.org.
[native-inputs]: Add texinfo and graphviz.
[propagated-inputs]: Add guile-gcrypt, guile-pfds, guile-syntax-highlight, and
guile-wisp.
[home-page]: Use workflows.guix.info.
[description]: Use official project description.

doc: Fix typo.

* doc/guix.texi (X Window)[sddm-service-type]: SSDM -> SDDM typo fix.
[sddm-configuration]: Also list 'maya' theme.
* gnu/services/sddm.scm (sddm-service): Fix typo in doc string.
(sddm-configuration): Also list 'maya' theme.

gnu: emulation-station: Fix build.

* gnu/packages/emulators.scm (emulation-station): Switch to an
  unreleased git commit.

services: xorg: Filter modules based on system

Fixes <https://bugs.gnu.org/39402>.
Reported by shtwzrd <shtwzrd@protonmail.com>.

* gnu/services/xorg.scm (xorg-configuration):
  Apply a filter over %default-xorg-modules packages, excluding
  those for which the %current-system is not among the package's
  supported-systems.

This patch makes it possible to use xorg-configuration on systems
other than x86_64 and i686, as without it, xf86-video-intel would
be pulled in on the unsupported architecture and fail.

Signed-off-by: Jakub Kądziołka <kuba@kadziolka.net>

gnu: higan: Explain why v106, and not v107, is being packaged

* gnu/packages/emulators.scm (higan): Add a comment.

gnu: higan: Don't use auto-generated tarball.

* gnu/packages/emulators.scm (higan)[source]: Don't use autogenerated
  tarball. Fetch from the new location for the repository.

gnu: higan: End phases with #t

* gnu/packages/emulators.scm (higan)[arguments]: End all phases with #t.

gnu: emacs-org-contrib: Update to 20200213.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-org-contrib): Update to 20200213.

gnu: emacs-org: Update to 9.3.6.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-org): Update to 9.3.6.

gnu: python-markdown: Update to 3.2.1.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-markdown): Update to 3.2.1.

gnu: libtorrent-rasterbar: Update to 1.1.14.

* gnu/packages/bittorrent.scm (libtorrent-rasterbar): Update to 1.1.14.

gnu: le-certs: Update input hashes.

These unversioned files were modified upstream.  The result of

  $ openssl x509 -in <FILE> -text

for each old/new pair remains the same, however.

* gnu/packages/certs.scm (le-certs)[inputs]: Update hash for
isrgrootx1.pem, letsencryptauthorityx3.pem, and
letsencryptauthorityx4.pem.

gnu: Add fbset.

* gnu/packages/linux.scm (fbset): New public variable.

gnu: thunar: Update to 1.8.12.

* gnu/packages/xfce.scm (thunar): Update to 1.8.12.

gnu: unbound: Update to 1.9.6 [security improvements].

* gnu/packages/dns.scm (unbound): Update to 1.9.6.

gnu: you-get: Update to 0.4.1403.

* gnu/packages/video.scm (you-get): Update to 0.4.1403.

gnu: xvid: Update to 1.3.7.

* gnu/packages/video.scm (xvid): Update to 1.3.7.

gnu: tumbler: Update to 0.2.8.

* gnu/packages/xfce.scm (tumbler): Update to 0.2.8.

gnu: diction: Update to 1.14.

* gnu/packages/dictionaries.scm (diction): Update to 1.14.

gnu: emacs-markdown-mode: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-markdown-mode)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: ebtables: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/linux.scm (ebtables)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: sbcl-ningle: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-ningle)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: cl-trivial-mimes: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-trivial-mimes)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: abc: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/fpga.scm (abc)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: monero: Disable core tests.

Core tests sometimes fail at least on i686-linux.
Let's disable them for now and just try hash tests and unit tests.

* gnu/packages/finance.scm (monero)[arguments]: Don't run 'core_tests' in
  'check' phase.

gnu: containerd: Fix test failure with Go 1.13.

* gnu/packages/docker.scm (containerd)[source]: Add patch.
* gnu/packages/patches/containerd-test-with-go1.13.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add patch.

gnu: python-fuzzywuzzy: Capitalize Python in synopsis

Follow-up to commit da8ca4c3fc2ac36977e3190bb05802c487619e8c

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-fuzzywuzzy)[synopsis]:
  python -> Python

gnu: radare2: Improve description.

* gnu/packages/engineering.scm (radare2)[synopsis, description]: Re-write.

gnu: sbcl-fare-quasiquote-extras: Fix build.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-fare-quasiquote-extras)[arguments]: Fix
  'build' phase.

gnu: sbcl-fare-quasiquote: Fix source and home-page.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-fare-quasiquote)[source]: Use main
  repository instead of Quicklisp archive.
  [home-page]: Fix URL.
  [synopsis]: Shorten it.

gnu: sbcl-parse-declarations: Fix source.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-parse-declarations)[source]: Use main
  repository instead of Quicklisp archive.

gnu: sbcl-puri: Fix source and license.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-puri)[source]: Use main repository instead
  of Quicklisp archive.
  [description]: Fix typo.
  [license]: Source code indicates LLGPL license.

gnu: sbcl-ptester: Fix source and license.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-ptester)[source]: Use main repository
  instead of Quicklisp archive.
  [license]: Source code indicates LLGPL license.

gnu: sbcl-rt: Fix source, home-page and license.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-rt)[source]: Use main repository instead of
  Quicklisp archive.
  [home-page]: Link to CLiki page.
  [license]: Source code indicates MIT license.

gnu: sbcl-iterate: Update to 1.5.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-iterate): Update to 1.5.
  [source]: Fetch from official project URL instead of Quicklisp archive.

gnu: linux-libre: Update to 5.4.20.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.20.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.19: Update to 4.19.104.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.104.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.14: Update to 4.14.171.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.171.
(linux-libre-4.14-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.9: Update to 4.9.214.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9-version): Update to 4.9.214.
(linux-libre-4.9-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.4: Update to 4.4.214.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4-version): Update to 4.4.214.
(linux-libre-4.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre: Update deblob scripts.

* gnu/packages/linux.scm (deblob-scripts-5.4): Update to 5.4.19.
(deblob-scripts-4.19, deblob-scripts-4.14, deblob-scripts-4.9)
(deblob-scripts-4.4): Update versions, although the scripts are unchanged.

gnu: Add guile-webutils.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-webutils): New variable.

gnu: Add python-fuzzywuzzy.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-fuzzywuzzy, python2-fuzzywuzzy):
  New variables.

Signed-off-by: Jakub Kądziołka <kuba@kadziolka.net>

gnu: VIGRA: Try to fix a build failure on the build farm.

* gnu/packages/image.scm (vigra)[properties]: Set the maximum silent time to
7200 seconds.

doc: Use @itemx as needed.

This is a followup to 459e0967705945bf6b5861598202aefef27451cd.

* doc/guix.texi (Invoking guix environment): Use @itemx for '--share'.

gnu: btrfs-progs: Install udev-rules.

* gnu/packages/linux.scm (btrfs-progs)[arguments]: Add phase
patch-makefile.
[native-inputs]: Add lvm2, eudev.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: mumps: Change "5.1.2" to "5.2.1" in library file names.

* gnu/packages/patches/mumps-shared-libseq.patch,
gnu/packages/patches/mumps-shared-mumps.patch,
gnu/packages/patches/mumps-shared-pord.patch: Replace "5.1.2" with
"5.2.1" in file names.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

doc: Clarify documentation of guix environment --expose vs. --share

The documentation for --expose and --share parameters are so similar that the
reader has to read both descriptions in parallel to find the difference.

* doc/guix.texi (Invoking guix environment)[--expose, --share]: Merge the two
  descriptions into one.

Signed-off-by: Jakub Kądziołka <kuba@kadziolka.net>

gnu: go-ipfs: Update to 0.4.23

* gnu/packages/ipfs.scm (go-ipfs): Update to 0.4.23

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

doc: Clarify how sudo and guix interact when updating

* doc/guix.texi (After System Installation): Explicitly explain the
  mechanics of how sudo differs from a login shell.

Some recent discussions on IRC suggest that the existing wording wasn't
entirely clear.

gnu: Add gst-editing-services.

* gnu/packages/gstreamer.scm (gst-editing-services): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: mrustc: Fix typo in description.

* gnu/packages/rust.scm (mrustc) [synopsis]: Fix a typo

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: WebKitGTK: Update to 2.26.4 [security fixes].

This fixes CVE-2020-3862, CVE-2020-3864, CVE-2020-3865, CVE-2020-3867, and
CVE-2020-3868.

* gnu/packages/webkit.scm (webkitgtk): Update to 2.26.4.

gnu: LVM2: Update to 2.03.08.

* gnu/packages/linux.scm (lvm2): Update to 2.03.08.

guix build: Add '--manifest' option.

* guix/scripts/build.scm (show-help): Document --manifest argument.
(options->things-to-build): When given a manifest, evaluate all the entries.
* tests/guix-build.sh: Add test for --manifest.
* doc/guix.texi (Additional Build Options): Mention --manifest.
* etc/completion/bash/guix: Complete file name if 'guix build' argument is
-m.

gnu: Add librocket.

* gnu/packages/web.scm (librocket): New variable.

gnu: emacs-ess: Do not install files in "guix.d".

* gnu/packages/statistics.scm (emacs-ess)[arguments]: Move the etc and
lisp directories out of "guix.d".

gnu: Add haproxy.

* gnu/packages/networking.scm (haproxy): New variable.

gnu: dxvk: Update to 1.5.4.

* gnu/packages/wine.scm (dxvk): Update to 1.5.4.

Revert "nls: Update 'es' translation of the manual."

I believe this change breaks guix pull:

  ./guix.es.texi:20971: @samp missing closing brace

This reverts commit d156e3fbcd6fc61a39d1d32622b90b0f8f741729.