doc: Fix minor typo in Programming Interface.

* doc/guix.texi (Programming Interface): Replace "under a specific build
users" with "under specific build users".

gnu: python-pynvim: Update to 0.4.1.

* gnu/packages/vim.scm (python-pynvim): Update to 0.4.1.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: chessx: Update to 1.5.4.

* gnu/packages/games.scm (chessx): Update to 1.5.4,
[inputs]: add "qtspeech",
[arguments]: fix missing translations.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: icedove: Update to 68.10.0.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (%icedove-build-id): Update.
(icedove): Update version and corresponding hg changeset.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

gnu: flatpak: Update to 1.8.0.

* gnu/packages/package-management.scm (flatpak): Update to 1.8.0,
[native-inputs]: add "python-pyparsing".

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

system: Do not use "hurd-target?".

Fix the following issue, that happens during CI evaluation:

In guix/gexp.scm:
    782:4 19 (_ _)
In guix/store.scm:
  1907:12 18 (_ #<store-connection 256.99 7f3727b6de10>)
   1340:2 17 (map/accumulate-builds #<store-connection 256.99 7f372…> …)
In srfi/srfi-1.scm:
   586:29 16 (map1 ((#<file-append #<package hurd@0.9-1.91a516…> …) …))
   586:29 15 (map1 ((#<file-append #<<parameterized> bindings:…> …) …))
   586:29 14 (map1 ((#<file-append #<package hurd@0.9-1.91a516…> …) …))
   586:17 13 (map1 ((#<<operating-system> kernel: #<<parameter…> …) …))
In guix/store.scm:
   1299:8 12 (call-with-build-handler #<procedure build-accumulator…> …)
  2025:24 11 (run-with-store #<store-connection 256.99 7f3727b6de10> …)
In guix/gexp.scm:
   785:13 10 (_ _)
In guix/store.scm:
   1859:8  9 (_ _)
In guix/gexp.scm:
   243:18  8 (_ _)
In guix/store.scm:
  1894:38  7 (_ #<store-connection 256.99 7f3727b6de10>)
In gnu/system.scm:
  1012:19  6 (_ #<store-connection 256.99 7f3727b6de10>)
   634:11  5 (operating-system-services #<<operating-system> kernel:…>)
   611:17  4 (hurd-default-essential-services #<<operating-system> k…>)
   555:18  3 (operating-system-directory-base-entries #<<operating-s…>)
  1270:18  2 (operating-system-boot-parameters-file #<<operating-sy…> …)
  1225:35  1 (operating-system-boot-parameters #<<operating-system>…> …)
  1225:35  0 (operating-system-boot-parameters (#<<file-system> de…>) …)

gnu/system.scm:1225:35: In procedure operating-system-boot-parameters:
Wrong type to apply: #f

"hurd-target?" is returning false when it should return true in that context.

* gnu/system.scm (operating-system-boot-parameters): Check for "hurd" target
field of "os" instead of using the "hurd-target?" procedure.

download: Replace misconfigured Apache mirror.

E.g. <http://apache.belnet.be/jakarta/oro/jakarta-oro-2.0.8.tar.gz>
redirects to a bogus 200 HTML page.

* guix/download.scm (%mirrors): Replace apache.belnet.be with
ftp.nluug.nl.

gnu: links: Enable framebuffer (fb) graphics driver.

* gnu/packages/web-browsers.scm (links)[native-inputs]:
Add linux-libre-headers.
[inputs]: Add gpm.

gnu: links: Sort inputs.

* gnu/packages/web-browsers.scm (links)[inputs]: Order alphabetically.

gnu: Sort (gnu packages web-browsers) module imports.

* gnu/packages/web-browsers.scm: Order module imports alphabetically.

gnu: mosh: Remove ‘/bin/sh’ dependency.

* gnu/packages/ssh.scm (mosh)[arguments]: Add ‘patch-FHS-file-names’ phase.

gnu: bcachefs-tools: Display the correct version.

* gnu/packages/file-systems.scm (bcachefs-tools)[arguments]: Add VERSION
to make-flags.

gnu: cryptsetup: Update to 2.3.1.

* gnu/packages/cryptsetup.scm (cryptsetup): Update to 2.3.1.

Signed-off-by: Jakub Kądziołka <kuba@kadziolka.net>

combinators: Fix typo.

* guix/combinators.scm (fold2): Replace "a two lists" with "two lists".

gnu: hplip: Update source hash.

The tarball was modified in place: <http://issues.guix.gnu.org/42191>.

* gnu/packages/cups.scm (hplip)[source]: Update hash.

gnu: Add phockup.

* gnu/packages/image.scm (phockup): New variable.

gnu: emacs-exwm-x: Fix build.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-exwm-x)[propagated-inputs]: Replace
emacs-ivy with emacs-counsel.

gnu: emacs-lispy: Fix build.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-lispy)[propagated-inputs]: Replace
emacs-ivy with emacs-swiper.

gnu: emacs-counsel-projectile: Fix build.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-counsel-projectile)[propagated-inputs]:
Replace emacs-ivy with emacs-counsel.

gnu: emacs-counsel-tramp: Update to 0.7.5.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-counsel-tramp): Update to 0.7.5.
[propagated-inputs]: Replace emacs-ivy with emacs-counsel.

gnu: emacs-counsel-dash: Update to 0.1.3-4-370d5f6.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-counsel-dash): Update to 0.1.3-4-370d5f6.
[arguments]: Remove unnecessary phase.
[propagated-inputs]: Replace emacs-ivy with emacs-counsel.

gnu: emacs-counsel-etags: Update to 1.9.11.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-counsel-etags): Update to 1.9.11.
[propagated-inputs]: Replace emacs-ivy with emacs-counsel.

gnu: Add emacs-counsel.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-counsel): New variable.

gnu: Add emacs-swiper.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-swiper): New variable.

gnu: r-nloptr: Update to 1.2.2.2.

* gnu/packages/statistics.scm (r-nloptr): Update to 1.2.2.2.

gnu: r-dalex: Update to 1.3.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-dalex): Update to 1.3.0.

gnu: r-spdata: Update to 0.3.8.

* gnu/packages/cran.scm (r-spdata): Update to 0.3.8.

gnu: r-glmmtmb: Update to 1.0.2.1.

* gnu/packages/cran.scm (r-glmmtmb): Update to 1.0.2.1.

gnu: r-abn: Update to 2.2.2.

* gnu/packages/cran.scm (r-abn): Update to 2.2.2.

gnu: r-depecher: Update to 1.4.1.

* gnu/packages/bioconductor.scm (r-depecher): Update to 1.4.1.

gnu: r-rsubread: Update to 2.2.3.

* gnu/packages/bioconductor.scm (r-rsubread): Update to 2.2.3.

gnu: Add emacs-bluetooth.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-bluetooth): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: diffoscope: Update to 150.

* gnu/packages/diffoscope (diffoscope): Update to 150.

gnu: Add emacs-calibredb.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-calibredb): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add emacs-org-beautify-theme.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-org-beautify-theme): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: emacs-auctex: Update to 12.2.4.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-auctex): Update to 12.2.4.

gnu: emacs-markdown-mode: Update hash too.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-markdown-mode): Update hash. This is
a followup to 3f452712438a5133c692c73b32bf91b5954d2b7b.

gnu: emacs-markdown-mode: Update to 2.4.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-markdown-mode): Update to 2.4.

gnu: emacs-ivy: Update to 0.13.1.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-ivy): Update to 0.13.1.
[source]: Use GNU ELPA repository.
[homepage]: Point to GitHub instead of manual.

gnu: Add curlpp library.

* gnu/packages/curl.scm (curlpp): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add guix-simplyblack-sddm-theme.

* gnu/packages/display-managers.scm (guix-simplyblack-sddm-theme): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

import: Do not assume that 'package-source' returns an origin.

* guix/gnu-maintenance.scm (gnu-package?): Check whether
'package-source' returns an origin.
* guix/import/github.scm (updated-github-url): Likewise.
* guix/import/launchpad.scm (updated-launchpad-url): Likewise.

upstream: Define 'url-predicate' and use it.

* guix/upstream.scm (url-predicate): New procedure.
(url-prefix-predicate): Define in terms of 'url-predicate'.
* guix/import/cpan.scm (cpan-package?): Use 'url-predicate'.
* guix/import/cran.scm (cran-package?)
(bioconductor-package?)
(bioconductor-data-package?)
(bioconductor-experiment-package?): Likewise.
* guix/import/crate.scm (crate-package?): Likewise.
* guix/import/elpa.scm (package-from-gnu.org?): Likewise.
* guix/import/hackage.scm (hackage-package?): Likewise.
* guix/import/pypi.scm (pypi-package?): Likewise.
* guix/import/gem.scm (gem-package?): Use 'url-prefix-predicate'.

lint: Do not assume that a package's source is an origin.

* guix/lint.scm (check-source-file-name): Ensure ORIGIN is an origin.
(check-patch-file-names)[patches]: Likewise.
(check-source): Likewise.

gnu: hpcguix-web: Add guix to inputs.

* gnu/packages/web.scm (hpcguix-web)[inputs]: Add guix.

gnu: Update synergy to 1.11.1.

* gnu/packages/synergy.scm (synergy): Update to 1.11.1.
[arguments]: Add "patch-desktop" phase.
[native-inputs]: New field.
[inputs]: Remove unused "xinput" input.

gnu: nyxt (formerly 'next'): Update to 20200702.

* gnu/packages/web-browsers.scm (next): Deprecate in favour of nyxt.
(nyxt): New variable.

gnu: sbcl: Add comment explaining out-of-date version.

Make sure no one repeats this mistake.

This is a follow-up to commit 809aa3c51c5a0f3d8e3d8133b22684702cb90287.

* gnu/packages/lisp.scm (sbcl): Add a comment advising against updating
  to 2.0.6.

gnu: js8call: Update to 2.2.0.

* gnu/packages/radio.scm (js8call): Update to 2.2.0.
  [inputs]: Use wsjtx-hamlib instead of regular hamlib.

Revert "gnu: sbcl: Update to 2.0.6."

This reverts commit 1ac4959c6a94a89fc8d3a73239d107cfb1d96240.

SBCL 2.0.6 breaks named-readtables and consequently many Common Lisp packages.
See https://github.com/melisgl/named-readtables/issues/19.

gnu: Add cl-napa-fft3.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-napa-fft3, cl-napa-fft3): New variables.

gnu: Add cl-bordeaux-fft.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-bordeaux-fft, cl-bordeaux-fft,
  ecl-bordeaux-fft): New variables.

guix system: "describe" displays multiboot info.

* guix/scripts/system.scm (display-system-generation): Display
multiboot-modules commands if set.

services: system-service-type: Add entries support for the Hurd.

When creating a disk-image using --save-provenance, "guix system describe"
now works.

* gnu/system.scm (operating-system-directory-base-entries): Add conditional
"hurd" parameter, make "initrd" parameter conditional.
(hurd-default-essential-services): Use them.
(operating-system-boot-parameters-file): Only add 'initrd' when set.

system: 'read-boot-parameters' allow initrd to be missing.

* gnu/system.scm (read-boot-parameters): Allow initrd to be missing.

system: 'read-boot-parameters' bugfix for multiboot.

* gnu/system.scm (read-boot-parameters): Oops, only return value for
multiboot-modules instead of (key value).

gnu: Add pfetch.

* gnu/packages/admin.scm (pfetch): New variable.

gnu: Add ufetch.

* gnu/packages/admin.scm (ufetch): New variable.

gnu: Add lld.

* gnu/packages/llvm.scm (lld): New variable.

gnu: llvm-9: Backport patch to fix miscompilation for big-endian targets.

* gnu/packages/llvm.scm (llvm-9)[source]: Add new patch.
* gnu/packages/patches/llvm-9-fix-bitcast-miscompilation.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register new file.

gnu: rust: Bootstrap up to rustc 1.44.

* gnu/packages/rust.scm (rust-1.40, rust-1.41, rust-1.42, rust-1.43,
  rust-1.44): New variables.

gnu: llvm-9: Backport patches to fix miscompilations.

* gnu/packages/llvm.scm (llvm-9)[source]: Add new patches.
* gnu/packages/patches/llvm-9-fix-lpad-miscompilation.patch,
  gnu/packages/patches/llvm-9-fix-scev-miscompilation.patch: New files.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register new patches.

gnu: python-gevent: Propagate dependencies.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-gevent)[native-inputs]: Move
python-zope-event and python-zone-interface to ...
[propagated-inputs]: ... here.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: gash, gash-utils: Build with Guile 3.0.

* gnu/packages/shells.scm (gash)[source]: Add 'modules' and 'snippet'.
[inputs]: Change GUILE-2.2 to GUILE-3.0.
(gash-utils)[source]: Add 'modules' and 'snippet'.
[inputs]: Change GUILE-2.2 to GUILE-3.0.
* gnu/packages/commencement.scm (gash-utils-boot)[source]: Remove
unneeded 'modules' field, and add 'snippet'.
(gash-utils-boot)[source]: New field.
* gnu/packages/patches/gash-utils-ls-test.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: network-manager-openconnect: Patch all the 'openconnect' file names.

* gnu/packages/gnome.scm (network-manager-openconnect)[arguments]: Make
sure all the references to the 'openconnect' executable are patched.

gnu: Add tor-client.

* gnu/packages/tor.scm (tor-client): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

Revert "ui: Use package-description-string."

This reverts commit bd03e99f66be1a038e3a8aeb502f5153fd05cc67.

Reported by Ekaitz Zarraga <ekaitz@elenq.tech> at
<https://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2020-06/msg00338.html>.

That commit broke would prevent "description: " from being taken into
account by the 'texi->plain-text' paragraph filling code.

gnu: Add drbd-utils.

* gnu/packages/cluster.scm (drbd-utils): New variable.

gnu: audacity: Update to 2.4.1.

* gnu/packages/audio.scm (audacity): Update to 2.4.1.

gnu: Add parprouted.

* gnu/packages/networking.scm (parprouted): New public variable.

services: wpa-supplicant: Support specifying additional service dependencies.

* gnu/services/networking.scm (<wpa-supplicant-configuration>)[requirement]:
New parameter.
(wpa-supplicant-shepherd-service): Use it instead of hard-coded list.
* doc/guix.texi (Networking Services): Document accordingly.

services: wpa-supplicant: Do not export the <wpa-supplicant-configuration> record.

* gnu/services/networking.scm: Remove <wpa-supplicant-configuration> from exports.

gnu: Add debianutils.

* gnu/packages/debian.scm (debianutils): New public variable.

gnu: Add UFO: Alien Invasion.

* gnu/packages/games.scm (%ufoai-commit, %ufoai-revision, %ufoai-version,
ufoai-source, ufo2map, ufoai-data, ufoai): New variables.

gnu: cuirass: Update to 0.0.1-38.136a829.

* gnu/packages/ci.scm (cuirass): Update to 0.0.1-38.136a829.

gnu: python-grequests: Fix tests by adding zope dependencies.

* gnu/packages/python-web.scm (python-grequests)[native-inputs]:
  Add python-zope.interface, python-zope.event.

gnu: guix: Update to 1.1.0-16.d3eee3c.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 1.1.0-16.d3eee3c.

gnu: guix: Update to 1.1.0-15.03deb1e.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 1.1.0-15.03deb1e.

Revert "gnu: guix-minimal: Remove as failing and unused."

This reverts commit 044cffdf34c506d2f9f1fbbc07462f29d3edaf54.

Fix build without SSH support.

* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Only include
gnu/machine/digital-ocean.scm and gnu/machine/ssh.scm if HAVE_GUILE_SSH is
set.

gnu: r-mnormt: Update to 2.0.1.

* gnu/packages/statistics.scm (r-mnormt): Update to 2.0.1.

gnu: r-mda: Update to 0.5-2.

* gnu/packages/cran.scm (r-mda): Update to 0.5-2.

gnu: r-ingredients: Update to 1.3.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-ingredients): Update to 1.3.0.

gnu: r-spdep: Update to 1.1-5.

* gnu/packages/cran.scm (r-spdep): Update to 1.1-5.
[native-inputs]: Add r-knitr.

gnu: r-blockmodeling: Update to 1.0.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-blockmodeling): Update to 1.0.0.

gnu: r-future-apply: Update to 1.6.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-future-apply): Update to 1.6.0.

gnu: r-fs: Update to 1.4.2.

* gnu/packages/cran.scm (r-fs): Update to 1.4.2.

gnu: r-rdpack: Update to 1.0.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-rdpack): Update to 1.0.0.

gnu: r-annotationdbi: Update to 1.50.1.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-annotationdbi): Update to 1.50.1.

gnu: python-folium: Update to 0.11.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-folium): Update to 0.11.0.

gnu: wireshark: Update to 3.2.5.

* gnu/packages/networking.scm (wireshark): Update to 3.2.5.

gnu: emacs-tramp: Update to 2.4.4.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-tramp): Update to 2.4.4.

gnu: rust-bumpalo-2: Update to 2.6.0.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-bumpalo-2): Update to 2.6.0.
[arguments]: Don't skip build. Skip tests.

gnu: rust-bumpalo-2.5: Rename to rust-bumpalo-2.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-bumpalo-2.5): Rename to ...
(rust-bumpalo-2): ... this.

gnu: rust-crossbeam-utils-0.6: Update to 0.6.6.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-crossbeam-utils-0.6): Update to0.6.6.
[arguments]: Don't skip build. Replace rust-rand-0.4 with 0.6 in
cargo-development-inputs.

gnu: rust-crossbeam-queue-0.1: Don't skip build.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-crossbeam-queue-0.1[arguments]: Don't
skip build. Replace rust-rand-0.4 with 0.6 in cargo-development-inputs.

gnu: rust-crossbeam-epoch-0.7: Update to 0.7.2.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-crossbeam-epoch-0.7): Update to 0.7.2.
[arguments]: Don't skip build. In cargo-inputs replace
rust-memoffset-0.2 with 0.5, rust-scopeguard-0.3 with 1.0. Replace
rust-rand-0.4 with 0.6 in cargo-development-inputs.

gnu: rust-crossbeam-epoch-0.8: Update to 0.8.2.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-crossbeam-epoch-0.8): Update to 0.8.2.
[arguments]: Don't skip build. In cargo-inputs replace rust-autocfg-0.1
with 1.0. Add rust-maybe-uninit-2.0.

gnu: rust-crossbeam-deque-0.7: Update to 0.7.3.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-crossbeam-deque-0.7): Update to 0.7.3.
[arguments]: Don't skip build. Add rust-maybe-unint-2.0 to cargo-inputs.

gnu: rust-crossbeam-channel-0.3: Don't skip build.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-crossbeam-channel-0.3)[arguments]:
Don't skip build.