gnu: Add seq24.

* gnu/packages/music.scm (seq24): New variable.
* gnu/packages/patches/seq24-rename-mutex.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register patch.

gnu: links: Update to 2.14.

* gnu/packages/links.scm (links): Update to 2.14.

gnu: Add openh264.

* gnu/packages/video.scm (openh264): New variable.

gnu: guix: Update development snapshot.

* gnu/packages/package-management.scm (guix-devel): Update to 8d125c.

offload: Increase the connection timeout.

* guix/scripts/offload.scm (open-ssh-session): Set #:timeout to 10.

offload: Send the build log to the right file descriptor.

This fixes a regression introduced in
21531add3205e400707c8fbfd841845f9a71863a whereby the build log would no
longer be sent to FD 4, thereby leading the daemon to not see the build
log.

* guix/scripts/offload.scm (transfer-and-offload): Parameterize
CURRENT-BUILD-OUTPUT-PORT.

gnu: guix: Update development snapshot.

* gnu/packages/package-management.scm (guix-devel): Update to e11c42f.

offload: Fix plural of some messages.

* guix/scripts/offload.scm (send-files): Use 'N_' for possibly plural
message.  Write "store item" instead of "store file".
(retrieve-files): Likewise.

offload: Make the compression methods configurable.

* guix/scripts/offload.scm (<build-machine>)[compression]
[compression-level]: New fields.
(open-ssh-session): Honor them.
* doc/guix.texi (Daemon Offload Setup): Document them.

guix system: If the new system generation already exists, overwrite it.

Fixes <http://bugs.gnu.org/25100>.

Before that, 'guix system reconfigure' would fail if the next generation
already existed.

* guix/scripts/system.scm (switch-to-system): Use 'switch-symlink'
instead of 'symlink'.
* doc/guix.texi (Using the Configuration System, Invoking guix system):
Document the behavior.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: i3-wm: Update to 4.13.

* gnu/packages/wm.scm (i3-wm): Update to 4.13.
[arguments]: Pass '-std=c11' to #:make-flags. Provide path to XML_CATALOG_FILES.
Pass '--disable-builddir' to #:configure-flags. Re-enable the 'configure' phase
to adjust to new Autotools build system.
[inputs]: Add xcb-util-xrm.
[native-inputs]: Add docbook-xsl.

gnu: xcb-util-cursor: Propagate dependencies from 'xcb-cursor.pc'.

* gnu/packages/xorg.scm (xcb-util-cursor)[inputs]: Move xcb-util-renderutil and
xcb-util-image to ...
[propagated-inputs]: ... here.

gnu: ruby-2.2, ruby-2.1, ruby-1.8: Don't replace with ruby-2.3.3.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-2.2, ruby-2.1, ruby-1.8)[replacement]: New field.

gnu: guix: Update development snapshot.

* gnu/packages/package-management.scm (guix-devel): Update to 9328eaf.

services: file-system: Make sure fsck.* commands are in $PATH.

Fixes a regression introduced in
bf7ef1bb848db0977b54ea012789adc68751c68a, whereby the fsck.* commands
would not be found.

* gnu/services/base.scm (file-system-shepherd-service): Call calls to
'setenv'.

nls: Adjust to geeqie.scm removal.

This is a followup to d1a5b20081c30da7503201df260cf20b8d0ba633.

* po/packages/POTFILES.in: Remove gnu/packages/geeqie.scm.

refresh: Indicate that PACKAGE... is optional.

* guix/scripts/refresh.scm (show-help): Add brackets around PACKAGE.

gnu: fuse-exfat: Update to 1.2.5.

* gnu/packages/linux.scm (fuse-exfat): Update to 1.2.5.
[native-inputs]: Remove scons build system which is no longer used.
[arguments]: Remove.
[home-page]: Replace dead Google Code home page.

gnu: exfat-utils: Update to 1.2.5.

* gnu/packages/mtools.scm (exfat-utils): Update to 1.2.5.

gnu: Add mktorrent.

* gnu/packages/bittorrent.scm (mktorrent): New variable.

offload: Add "test" sub-command.

* guix/scripts/offload.scm (assert-node-repl, assert-node-has-guix)
(nonce, assert-node-can-import, assert-node-can-export)
(check-machine-availability): New procedures.
(%random-state): New variable.
(guix-offload): Add case for "test".
* doc/guix.texi (Daemon Offload Setup): Document it.  Remove obsolete
bit about remote invocation of 'guix build'.

daemon: Fix invalid Boost format string.

* nix/libstore/optimise-store.cc (LocalStore::optimisePath_): Use %3%
instead of %m, the latter being an invalid Boost format specifier.

gnu: python-flask: Propagate python-click.

* gnu/packages/python.scm (python-flask, python2-flask)[native-inputs]: Move
python-click to ...
[propagated-inputs]: ... here.

gnu: shepherd: Update to 0.3.2.

* gnu/packages/admin.scm (shepherd): Update to 0.3.2.
[properties]: New field.

nls: Adjust to feh.scm renaming.

This is a followup to d1a5b20081c30da7503201df260cf20b8d0ba633.

* po/packages/POTFILES.in: Remove feh.scm and add image-viewers.scm.

publish: Factorize 'content-length' addition.

* guix/scripts/publish.scm (with-content-length): New procedure.
(http-write) <application/octet-stream>: Use it.

services: tor: Make sure /var/lib is world-readable.

* gnu/services/networking.scm (tor-hidden-service-activation): Add
'chmod' call for /var/lib.

gnu: vim: Update to 8.0.0124.

* gnu/packages/vim.scm (vim, vim-full): Update to 8.0.0124.

gnu: dovecot: Update to 2.2.27.

* gnu/packages/mail.scm (dovecot): Update to 2.2.27.
[source, home-page]: Use HTTPS.

gnu: vim: Update to 8.0.0118.

* gnu/packages/vim.scm (vim, vim-full): Update to 8.0.0118.

nls: Update 'da' package translation.

nls: Update 'da' translation.

gnu: Add qmidiarp.

* gnu/packages/music.scm (qmidiarp): New variable.

gnu: Add Swedish Aspell dictionary.

* gnu/packages/aspell.scm (aspell-dict-sv): New variable.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: Move image viewers to (gnu packages image-viewers).

* gnu/packages/feh.scm (feh): Remove file.  Move package to...
* gnu/packages/geeqie.scm (geeqie): Likewise...
* gnu/packages/sxiv.scm (sxiv): Likewise...
* gnu/packages/image-viewers.scm: ... here.
* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Remove files.

gnu: exiv2: Move to (gnu packages image).

* gnu/packages/geeqie.scm (exiv2): Move to...
* gnu/packages/image.scm: ... here.
* gnu/packages/gnome.scm: Adjust the used modules.
* gnu/packages/gnunet.scm: Likewise.
* gnu/packages/gps.scm: Likewise.

gnu: emms: Update to 4.2.

* gnu/packages/emacs.scm (emms): Update to 4.2.
[arguments]: EMMS installs "emms-print-metadata" now but assumes that
BINDIR exists, so do not install it manually in 'post-install' phase,
and make "/bin" directory in 'pre-install' phase.

gnu: emacs-with-editor: Update to 2.5.6.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-with-editor): Update to 2.5.6.

gnu: emacs-hl-todo: Update to 1.7.4.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-hl-todo): Update to 1.7.4.

gnu: Add ingen.

* gnu/packages/music.scm (ingen): New variable.

gnu: Add raul-devel.

* gnu/packages/audio.scm (raul-devel): New variable.

gnu: Add ganv-devel.

* gnu/packages/gtk.scm (ganv-devel): New variable.

gnu: Add ams-lv2.

* gnu/packages/music.scm (ams-lv2): New variable.

gnu: lvtk: Build UI library.

* gnu/packages/audio.scm (lvtk)[inputs]: Add gtkmm-2.
[arguments]: Pass "-std=c++11" flag.

gnu: Fix header in (gnu packages golang).

* gnu/packages/golang.scm: Replace header line declaring this file as
part of GNU Guix.

gnu: Add econnman.

* gnu/packages/connman.scm (econnman): New variable.

gnu: Add lekha.

* gnu/packages/enlightenment.scm (lekha): New variable.

gnu: Add qsyncthingtray.

* gnu/packages/sync.scm (qsyncthingtray): New variable.

gnu: Rename owncloud.scm to sync.scm.

* gnu/packages/owncloud.scm: Rename to ...
* gnu/packages/sync.scm: ... this.
* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Register it.

gnu: Add rkflashtool.

* gnu/packages/flashing-tools.scm (rkflashtool): New variable.

gnu: uget: Add missing input.

* gnu/packages/bittorrent.scm (uget)[native-inputs]: Add intltool.

gnu: tor: Update to 0.2.8.10.

* gnu/packages/tor.scm (tor): Update to 0.2.8.10.

gnu: acme-client: Update to 0.1.15.

* gnu/packages/tls.scm (acme-client): Update to 0.1.15.
[native-inputs]: Add pkg-config.

gnu: taglib: Update to 1.10.

* gnu/packages/mp3.scm (taglib): Update to 1.10.

gnu: aragorn: Update to 1.2.38.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (aragorn): Update to 1.2.38.

gnu: Add highlight.

* gnu/packages/pretty-print.scm (highlight): New variable.

gnu: git: Fix gitweb.

* gnu/packages/version-control.scm (git)[inputs]: Add perl-cgi.
[arguments]: Wrap "gitweb.cgi" with PERL5LIB.

gnu: Add grantlee.

* gnu/packages/qt.scm (grantlee): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add libksysguard.

* gnu/packages/kde.scm (libksysguard): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: icecat: Update to 45.5.1-gnu1.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (icecat): Update to 45.5.1-gnu1.
[source]: Remove temporary URI for 45.3 beta.  Fix URI computation.  Remove
outdated patches.  Add more cherry-picked bug fixes from upstream
mozilla-esr45.  Use 'list' instead of quasiquote in 'patches' field.

doc: Use @file to mark file names.

* doc/guix.texi: Use @file where appropriate.

gnu: Add Kerberos client service.

* doc/guix.texi (Kerberos Services)[Krb5 Service]: New subsubheading.
* gnu/services/kerberos.scm (krb5-service-type): New variable.
* gnu/services/configuration.scm (configuration-field-serializer,
  configuration-field-getter): Export variables.

gnu: Add fcgiwrap.

* gnu/packages/web.scm (fcgiwrap): New variable.

gnu: Add fcgi.

* gnu/packages/patches/fcgi-2.4.0-gcc44-fixes.patch: New file.
* gnu/packages/patches/fcgi-2.4.0-poll.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register patches.
* gnu/packages/web.scm (fcgi): New variable.

gnu: linux-libre: Update to 4.8.12.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-version, %linux-libre-hash)
(linux-libre): Update to 4.8.12.

gnu: linux-libre@4.4: Update to 4.4.36.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4): Update to 4.4.36.

gnu: linux-libre@4.1: Update to 4.1.36.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.1): Update to 4.1.36.

doc: Remove obsolete bit about networking in VMs.

* doc/guix.texi (Running GuixSD in a VM): Remove "the boot will fail"
wording since that is no longer true since commit
6129dd8b5989f77b2976c68ecdf1f7dbfa63ec46.

gnu: guix: Update development snapshot.

* gnu/packages/package-management.scm (guix-devel): Update to 463fb7d.

gnu: python-cryptography: Update to 1.6.

* gnu/packages/python.scm (python-cryptography, python2-cryptography): Update
to 1.6.
(python-cryptography-vectors, python2-cryptography-vectors): Update to 1.6.

gnu: dblatex: Update comment.

* gnu/packages/docbook.scm (dblatex)[arguments]: Detail comment about why
the use of setuptools needs to be disabled.

gnu: python-numpy: Fix inputs.

This fixes 2efabc5589dc641dce75702b99253a3fb40bb2eb, where some inputs
have been changed to propagated-inputs, but the propagated-inputs are
still extended from inputs and the inputs are not extended at all.

* gnu/packages/python.scm (python-numpy, python2-numpy)[inputs]:
Extend from python-numpy-bootstrap's package-inputs. [propagated-inputs]:
Extend from python-numpy-bootstrap's package-propagated-inputs.

gnu: python2-ipython: Fix inputs.

This fixes e62600feb6a3aca2304925ed8c0bb5a9060e38dd, where the inputs
have been changed to native-inputs, but still extended from inputs.

* gnu/packages/python.scm (python2-ipython)[native-inputs]: Extend
from python-ipython's package-native-inputs.

gnu: python-numpydoc: Correct inputs.

This does what 213d1745c6adbfd274b1edc575529e026b0ab743 was
supposed to do.

* gnu/packages/python.scm (python-numpydoc, python-numpydoc)
Change first of the duplicate [native-inputs] definitions to
[propagated-inputs].

gnu: calibre: Do not use python setuptools for building.

* gnu/packages/ebook.scm (calibre)[arguments]: Set #:use-setuptools?
to false.

gnu: file-system-shepherd-service: Use mount-file-system.

* gnu/services/base.scm (file-system-shepherd-service): Use
  mount-file-system instead of manually mounting the file system.

gnu: Add dnscrypt-proxy.

* gnu/packages/dns.scm (dnscrypt-proxy): New variable.

gnu: Add dnscrypt-wrapper.

* gnu/packages/dns.scm (dnscrypt-wrapper): New variable.

gnu: virt-manager: Do not use python setuptools for building.

* gnu/packages/qemu.scm (virt-manager)[arguments]: Set #use-setuptools? to #f.

gnu: dblatex: Update to 0.3.9.

* gnu/packages/docbook.scm (dblatex): Update to 0.3.9.

gnu: libsigc++: Update to 2.10.0.

* gnu/packages/glib.scm (libsigc++): Update to 2.10.0.

gnu: go-1.7: Update to 1.7.4 [security fixes].

* gnu/packages/golang.scm (go-1.7): Update to 1.7.4.

gnu: vtk: Build with more system libraries.

* gnu/packages/vtk.scm (vtk)[inputs]: Add expat, freetype, hdf5, jpeg,
png, tiff, jsoncpp, libogg, libtheora, and zlib.
[arguments]: Use #:build-type keyword.  Add cmake flags for system
libraries.

gnu: vtk: Upgrade to 7.1.0.

* gnu/packages/vtk.scm (vtk): Upgrade to 7.1.0.
[source]: Remove patches.  Use version-major+minor.
* gnu/packages/patches/vtk-mesa-10.patch: Delete patch.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.

gnu: jsoncpp: Build shared libraries.

* gnu/packages/serialization.scm (jsoncpp)[arguments]: New field.

gnu: netcdf: Upgrade to 4.4.1.1.

* gnu/packages/maths.scm (netcdf, netcdf-parallel-openmpi): Upgrade to
4.4.1.1.
[source]: Adjust patch name, add netcdf-tst_h_par.patch
* gnu/packages/patches/netcdf-config.date.patch: Rename to...
* gnu/packages/patches/netcdf-date-time.patch: ...this.  Adjust for
latest source.
* gnu/packages/patches/netcdf-tst_h_par.patch: New patch.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust patches.

gnu: offlineimap: Update to 7.0.12.

* gnu/packages/mail.scm (offlineimap): Update to 7.0.12.

gnu: dblatex: Do not use python setuptools for building.

* gnu/packages/docbook.scm (dblatex)[arguments]: Set #:use-setuptools?
to false.

offload: Do not abort when a machine is unreachable.

* guix/scripts/offload.scm (machine-load): Wrap 'open-ssh-session' call
in 'false-if-exception'; return +inf.0 if it returns #f.

offload: Gracefully report connection failures.

* guix/scripts/offload.scm (open-ssh-session): Check the return value of
'connect!'.  Call 'leave' when it's not 'ok.

store: Increase buffering for the '%stderr-write' upcall.

* guix/store.scm (process-stderr) <%stderr-write>: Pass #:buffer-size to
'dump-port'.

daemon: Buffer data sent to clients by the 'export-path' RPC.

Before that we'd have STDERR_WRITE round trips for very small amounts of
data, ranging from a few bytes for the metadata of nars to the size of
one file being exported.

With this change, something like:

  guix archive --export /gnu/store/5rrsbaghh5ix1vjcicsl60gsxilhjnf2-coreutils-8.25 | dd of=/dev/null

reports a throughput of 35 MB/s instead of 25 MB/s before.

* nix/nix-daemon/nix-daemon.cc (TunnelSink): Inherit from 'BufferedSink'
rather than 'Sink'.  Rename 'operator ()' to 'write'.
(performOp) <wopExportPath>: Add 'sink.flush' call.

offload: Warn about the lack of zlib support.

* guix/scripts/offload.scm (guix-offload): Print a warning when
'zlib-support?' returns false.

offload: Remove redundant call to 'topologically-sorted' in 'send-file'.

* guix/scripts/offload.scm (send-files): Remove call to
'topologically-sorted'.

gnu: Add uget.

* gnu/packages/bittorrent.scm (uget): New variable.

gnu: ardour: Update to 5.5.

* gnu/packages/audio.scm (ardour): Update to 5.5.

gnu: python-gst: Update to 1.10.2.

* gnu/packages/gstreamer.scm (python-gst): Update to 1.10.2.

gnu: gst-libav: Update to 1.10.2.

* gnu/packages/gstreamer.scm (gst-libav): Update to 1.10.2.

gnu: gst-plugins-ugly: Update to 1.10.2.

* gnu/packages/gstreamer.scm (gst-plugins-ugly): Update to 1.10.2.

gnu: gst-plugins-bad: Update to 1.10.2.

* gnu/packages/gstreamer.scm (gst-plugins-bad): Update to 1.10.2.