gnu: libnsl: Fix build with gettext 0.20.

* gnu/packages/onc-rpc.scm (libnsl)[arguments]: New field.

gnu: sooperlooper: Adjust for GCC 7.

* gnu/packages/music.scm (sooperlooper)[arguments]: Remove <#:make-flags>.
Preserve CPATH in <#:phases>.

gnu: Adjust CPATH overrides to work with GCC 7 search paths.

* gnu/packages/education.scm (gcompris)[arguments]: Preserve original CPATH,
if any.
* gnu/packages/games.scm (ltris, prboom-plus, abbaye, red-eclipse, btanks,
4dtris, edgar)[arguments]: Likewise.

gnu: msgpack: Update to 3.2.0.

* gnu/packages/serialization.scm (msgpack): Update to 3.2.0.
[build-system]: Change to CMAKE-BUILD-SYSTEM.
[native-inputs]: Remove AUTOCONF, AUTOMAKE and LIBTOOL.

gnu: lua-libmpack: Update to 1.0.8.

* gnu/packages/serialization.scm (lua-libmpack): Update to 1.0.8.

gnu: lua-libmpack: Do not use unstable source tarball.

* gnu/packages/serialization.scm (lua-libmpack)[source]: Change to GIT-FETCH.

gnu: salmon: Fix build with GCC 7.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (salmon)[arguments]: Do not read from
CPLUS_INCLUDE_PATH, and add headers to CPATH only.

gnu: python-datrie: Update to 0.8.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-datrie): Update to 0.8.
[arguments]: Remove.

gnu: python-gevent: Fix build with libev 4.25 and GCC 7.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-gevent)[arguments]: Simplify libev
unbundling, which failed with the newer libev.  Use C_INCLUDE_PATH instead of CPATH.
[native-inputs]: Remove (PACKAGE-SOURCE LIBEV).

gnu: gRPC: Re-add custom c-ares variant.

Commit e8393ebe46d9ad09aceb152618db490378ba5ded updated c-ares without knowing
that cmake-build-system was the most important feature of 'c-ares-next'.

* gnu/packages/adns.scm (c-ares/cmake): New hidden package.
* gnu/packages/machine-learning.scm (grpc)[inputs]: Change C-ARES to C-ARES/CMAKE.

gnu: python-hamcrest: Update to 1.9.0-0.25fdc5f.

* gnu/packages/check.scm (python-pyhamcrest): Update to 1.9.0-0.25fdc5f.
[arguments]: Replace CHECK phase with custom Pytest invokation.

gnu: libgweather: Update to 3.28.3.

* gnu/packages/gnome.scm (libgweather): Update to 3.28.3.

gnu: dconf-editor: Update to 3.30.2.

* gnu/packages/gnome.scm (dconf-editor): Update to 3.30.2.

gnu: gnome-clocks: Update to 3.30.1.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-clocks): Update to 3.30.1.

gnu: gnome-calendar: Update to 3.30.1.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-calendar): Update to 3.30.1.

gnu: gnome-shell-extensions: Update to 3.30.1.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-shell-extensions): Update to 3.30.1.

gnu: orca: Update to 3.30.2.

* gnu/packages/gnome.scm (orca): Update to 3.30.2.

gnu: gnome-screenshot: Update to 3.30.0.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-screenshot): Update to 3.30.0.
[home-page]: Update URI.

gnu: cheese: Update to 3.30.0.

* gnu/packages/gnome.scm (cheese): Update to 3.30.0.

gnu: shotwell: Update to 0.30.4.

* gnu/packages/gnome.scm (shotwell): Update to 0.30.4.
[build-system]: Use meson-build-system.
[arguments]: Set glib-or-gtk? flag.
[native-inputs]: Add desktop-file-utils.  Remove itstool duplicate.  Order
inputs alphabetically.

gnu: gexiv2: Update to 0.12.0.

* gnu/packages/gnome.scm (gexiv2): Update to 0.12.0.
[native-inputs]: Add gcr and vala.

gnu: gdm: Update to 3.30.3.

* gnu/packages/gnome.scm (gdm): Update to 3.30.3.

gnu: devhelp: Update to 3.30.1.

* gnu/packages/gnome.scm (devhelp): Update to 3.30.1.
[build-system]: Use meson-build-system.
[native-inputs]: Add gobject-introspection, glib:bin and gtk+:bin.
[inputs]: Add amtk.

gnu: Add amtk.

* gnu/packages/gnome.scm (amtk): New variable.

gnu: gjs: Update to 1.56.2.

* gnu/packages/gnome.scm (gjs): Update to 1.56.2.
[arguments]: Adjust pre-check phase.
[propagated-inputs]: Replace mozjs-52 with mozjs-60.

gnu: gnome-tweaks: Update to 3.30.2.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-tweaks): Update to 3.30.2.

gnu: gcr: Update to 3.28.1.

* gnu/packages/gnome.scm (gcr): Update to 3.28.1.
[native-inputs]: Add vala.

gnu: totem: Update to 3.30.0.

* gnu/packages/gnome.scm (totem): Update to 3.30.0.

gnu: shared-mime-info: Update to 1.10.

* gnu/packages/gnome.scm (shared-mime-info): Update to 1.10.

gnu: nautilus: Update to 3.30.5.

* gnu/packages/gnome.scm (nautilus): Update to 3.30.5.

gnu: gvfs: Update to 1.40.1.

* gnu/packages/gnome.scm (gvfs): Update to 1.40.1.

gnu: gucharmap: Update to 12.0.1.

* gnu/packages/gnome.scm (gucharmap): Update to 12.0.1.
[native-inputs]: Update unicode-files.

gnu: gnome-terminal: Update to 3.30.3.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-terminal): Update to 3.30.3.

gnu: gnome-settings-daemon: Update to 3.30.2.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-settings-daemon): Update to 3.30.2.

gnu: gnome-session: Update to 3.30.1.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-session): Update to 3.30.1.

gnu: gnome-online-accounts: Update to 3.30.2.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-online-accounts): Update to 3.30.2.

gnu: gnome-control-center: Update to 3.30.3.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-control-center): Update to 3.30.3.
[source](patches): New field.
[arguments]: Adjust "patch-paths" phase.
[inputs]: Add libsecret and udisks.
* gnu/packages/patches/gnome-control-center-use-udisks-to-get-disk-size.patch:
New patch.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: MariaDB: Disable the TokuDB plugin.

Fixes <https://bugs.gnu.org/35521>.
Reported by Mark H Weaver <mhw@netris.org>.

* gnu/packages/databases.scm (mariadb)[arguments]: Pass "-DTOKUDB_OK" in
<#:configure-flags>.  Enable the "innodb_fts.crash_recovery" test, which
likely failed because of the high I/O load induced by TokuDB.
[inputs]: Remove SNAPPY.

gnu: gnome-backgrounds: Update to 3.30.0.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-backgrounds): Update to 3.30.0.

gnu: zenity: Update to 3.30.0.

* gnu/packages/gnome.scm (zenity): Update to 3.30.0.

gnu: gedit: Update to 3.30.2.

* gnu/packages/gnome.scm (gedit): Update to 3.30.2.

gnu: file-roller: Update to 3.30.1.

* gnu/packages/gnome.scm (file-roller): Update to 3.30.1.

gnu: epiphany: Update to 3.30.4.

* gnu/packages/gnome.scm (epiphany): Update to 3.30.4.

gnu: font-abattis-cantarell: Update to 0.111.

* gnu/packages/fonts.scm (font-cantarell): Update to 0.111.
[build-system]: Use meson-build-system.
[native-inputs]: Add appstream-glib and gettext-minimal.

gnu: baobab: Update to 3.30.0.

* gnu/packages/gnome.scm (baobab): Update to 3.30.0.

gnu: criu: Fix typo.

This is a follow-up to commit a46cf184fecb62fe93f3510eb32cc4772cf51cb8.

* gnu/packages/virtualization.scm (criu)[arguments]: Add missing ":".

gnu: criu: Fix build with GCC 7.

* gnu/packages/virtualization.scm (criu)[arguments]: Do not read from
C_INCLUDE_PATH, but add LINUX-LIBRE-HEADERS on it.

gnu: Adjust uses of C{,PLUS}_INCLUDE_PATH for GCC 7.

These variables are no longer set in the build environment by default.  GCC
still respects these search paths and treats them as "system headers" so we
can continue to use them, just not expect them to be available.

* gnu/packages/mpi.scm (openmpi)[arguments]: Do not attempt to read from
C_INCLUDE_PATH, nor CPLUS_INCLUDE_PATH.
* gnu/packages/games.scm (kiki)[arguments]: Likewise.
* gnu/packages/networking.scm (hcxtools)[arguments]: Likewise.
* gnu/packages/synergy.scm (synergy)[arguments]: Likewise.
* gnu/packages/bioinformatics.scm (gemma, sailfish)[arguments]: Likewise.
* gnu/packages/maths.scm (dune-alugrid)[arguments]: Likewise.

gnu: gst-kaldi-nnet2-online: Adjust for GCC 7.

* gnu/packages/machine-learning.scm (gst-kaldi-nnet2-online)[arguments]: Don't
read CPLUS_INCLUDE_PATH, or pass -std=c++11.  End phases on #t.

gnu: rdma-core: Update to 22.3.

* gnu/packages/linux.scm (rdma-core): Update to 22.3.

gnu: python-gst: Fix build failure.

Building python-gst fails with:

  Unbound variable: python-version

Therefore, add python-build-system to #:modules so that it's imported, and
give it a prefix to avoid clashing with the gnu-build-system.

Also, simplify the code by using the site-packages function from the
python-build-system module.

* gnu/packages/gstreamer.scm (python-gst)[arguments]: Rework to fix build
failure.

gnu: python-pep8: Patch to fix test failure with Python 3.7.

Patch from the upstream repository, see
https://github.com/PyCQA/pycodestyle/issues/786 for more details.

* gnu/packages/patches/python-pep8-stdlib-tokenize-compat.patch: New file.
* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pep8)[source]: Add it.

build-system/go: Fix typo.

* guix/build/go-build-system.scm (install): Fix typo.

gnu: Go: Use the default libgcc.

* gnu/packages/golang.scm (go-1.4)[inputs]: Replace gcc-6 with gcc.

gnu: gobject-introspection: Remove hardcoded store from patch.

* gnu/packages/patches/gobject-introspection-absolute-shlib-path.patch: Use
the NIX_STORE environment variable, rather than hardcoding the store
directory.

gnu: fontforge: Fix segfault on i686 (and possibly other platforms).

* gnu/packages/fontutils.scm (fontforge)[source](patches): New field.

gnu: fontforge: Remove superfluous input.

Pango propagates Glib nowadays, no need to list it eplicitly.

* gnu/packages/fontutils.scm (fontforge)[inputs]: Remove GLIB.

gnu: gexiv2: Enable tests on all platforms.

* gnu/packages/gnome.scm (gexiv2)[arguments]: Remove.

gnu: python-cython: Speed up test suite.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cython)[arguments]: In the CHECK phase,
disable compiler optimizations and enable (some) parallel tests.

gnu: python2-cython: Fix failing test.

This started failing because Python no longer bundles libexpat since
commit d1659c0fb27c4f71c8ddc6a85d3cd9f3a10cca97.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-cython)[arguments]: New field.

gnu: node: Update to 10.16.0.

* gnu/packages/node.scm (node): Update to 10.16.0.
[arguments]: Enable previously failing tests.  Disable
'sequential/test-performance.js' and 'parallel/test-dns.js'.

gnu: gnome-online-accounts: Fix cyclic reference in outputs.

This exploits a new feature of 'gobject-introspection-absolute-shlibs.patch'.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-online-accounts)[arguments]: Set the "outputs"
variable before building.

gnu: libgnomekbd: Update to 3.26.1.

* gnu/packages/gnome.scm (libgnomekbd): Update to 3.26.1.

gnu: vte: Update to 0.56.3.

* gnu/packages/gnome.scm (vte): Update to 0.56.3.

gnu: samba: Provide 'rpcgen'.

Glibc no longer includes Sun/ONC RPC support since commit
3670ea70e2e932969a3ffc0acf75a714c7b42540.

* gnu/packages/samba.scm (samba)[native-inputs]: Add RPCSVC-PROTO.

gnu: Add rpcsvc-proto.

* gnu/packages/onc-rpc.scm (rpcsvc-proto): New public variable.

gnu: gnome-calculator: Update to 3.32.2.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-calculator): Update to 3.32.2.
[inputs]: Change GTKSOURCEVIEW-3 to GTKSOURCEVIEW.

gnu: gtksourceview: Update to 4.2.0.

* gnu/packages/gtk.scm (gtksourceview): Update to 4.2.0.

gnu: gcr: Fix build with recent Glib.

* gnu/packages/gnome.scm (gcr)[source](patches): New field.

gnu: glib-networking: Remove unused input.

This is a follow-up to commit 0d75c64d7844bf35b4e1cd09bcc50b2a1005c191.

* gnu/packages/gnome.scm (glib-networking)[inputs]: Remove P11-KIT.

gnu: glib: Fix argument handling in keyfile backend.

* gnu/packages/patches/glib-keyfile-arguments.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/glib.scm (glib)[source](patches): Add it.

gnu: Remove expat/fixed.

The merge preceding this commit (fb9a23a3f3) ignored the replacement added in
5a836ce38c (gnu: expat: fix CVE-2018-20843), because the fix is already
present in Expat 2.2.7.  This commit removes the remaining bits.

* gnu/packages/patches/expat-CVE-2018-20843.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/xml.scm (expat/fixed): Remove variable.

Merge branch 'master' into core-updates

 Conflicts:
gnu/local.mk
gnu/packages/python-xyz.scm
gnu/packages/xml.scm
guix/gexp.scm
po/guix/POTFILES.in

gnu: expat: fix CVE-2018-20843

* gnu/packages/xml.scm (expat)[replacement]: New field.
(expat/fixed): New variable.
* gnu/packages/patches/expat-CVE-2018-20843.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add patch file.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: expat: Add additional source URI

The expat sourceforge page announces that the project is in the process of
moving to GitHub.

* gnu/packages/xml.scm (expat)[source]: Add GitHub URI.

Signed-off-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: mumi: Update to 0.0.0-4.ea0a28f.

* gnu/packages/mail.scm (mumi): Update to 0.0.0-4.ea0a28f.

gnu: sbcl-clx: Update to 0.7.5.

* gnu/packages/lisp.scm (sbcl-clx): Update to 0.7.5.
[origin]: Drop "clx-remove-demo.patch" and the snippet that removes demo code.
* gnu/packages/patches/clx-remove-demo.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: pies: Update to 1.4.

* gnu/packages/admin.scm (pies): Update to 1.4.
[arguments]: Modify /bin/sh reference in src/comp.c as well.

guix gc: Correctly handle '--delete-generations' with no arguments.

Previously, 'guix gc --delete-generations' would crash: the "" pattern
would be passed to 'matching-generations', which would return #f instead
of returning a list.

Reported by Raghav Gururajan <rvgn@disroot.org>
in <https://bugs.gnu.org/36466>.

* guix/ui.scm (matching-generations): Raise an error when passed an
invalid pattern.
* guix/scripts/gc.scm (delete-old-generations): Check if PATTERN is
true.
(%options): Leave ARG as-is for 'delete-generations'.
(guix-gc): Use 'assq' instead of 'assoc-ref' for 'delete-generations'.
* guix/scripts/package.scm (delete-matching-generations):
Replace (string-null? pattern) with (not pattern).  Remove 'else'
clause.
(%options): Leave ARG as-is for 'delete-generations'.
* guix/scripts/pull.scm (%options): Leave ARG as-is for
'list-generations'.
(process-query): Replace (string-null? pattern) with (not pattern).
* guix/scripts/system.scm (list-generations): Likewise, and remove
'else' clause.
(process-command): Use #f instead of "" when no pattern is given.

Merge branch 'staging'

gnu: harfbuzz: Create hb-gobject-enums.h.

* gnu/packages/gtk.scm (harfbuzz)[native-inputs]: Add GLIB:BIN.

gnu: linux-libre: Update to 5.1.17.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-version): Update to 5.1.17.
(%linux-libre-hash): Update hash.

gnu: linux-libre@4.19: Update to 4.19.58.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.58.
(%linux-libre-4.19-hash): Update hash.

gnu: linux-libre@4.14: Update to 4.14.133.

* gnu/packages/linux.scm (%linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.133.
(%linux-libre-4.14-hash): Update hash.

gnu: linux-libre@4.9: Update to 4.9.185.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9): Update to 4.9.185.

gnu: linux-libre@4.4: Update to 4.4.185.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4): Update to 4.4.185.

gnu: python-pyicu: Update to 2.3.1.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pyicu): Update to 2.3.1.

gnu: libselinux: Install python bindings to separate output.

This reduces the closure size of glib from 203.1 to 111.3 MiB.

* gnu/packages/selinux.scm (libselinux)[outputs]: New field.
[arguments]: Set PYSITEDIR to the new "python" output.

gnu: vim-airline-themes: Update to 0.0.0-2.e6f2332.

* gnu/packages/vim.scm (vim-airline-themes): Update to 0.0.0-2.e6f2332.
[version]: Use 'git-version'.
[source]: Use 'git-file-name'.

gnu: msmtp: Install additional files.

* gnu/packages/mail.scm (msmtp)[arguments]: Rename custom phase
install-msmtpq to install-additional-files. Install vim plugins.

gnu: perl-xml-compile: Update to 1.63.

* gnu/packages/xml.scm (perl-xml-compile): Update to 1.63.

gnu: perl-html-form: Update to 6.04.

* gnu/packages/web.scm (perl-html-form): Update to 6.04.

gnu: xscreensaver: Remove CFLAG for old gcc versions.

* gnu/packages/xdisorg.scm (xscreensaver)[arguments]: Do what the
comment tells us.

gnu: xscreensaver: Update to 5.43.

* gnu/packages/xdisorg.scm (xscreensaver): Update to 5.43.

gnu: acpica: Update to 20190703.

* gnu/packages/admin.scm (acpica): Update to 20190703.

gnu: sedsed: Edit description.

* gnu/packages/admin.scm (sedsed)[description]: Use @command{} instead
of command(n) and do some minor editing.

gnu: sedsed: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/admin.scm (sedsed)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: cvs: Rename patch file.

* gnu/packages/version-control.scm (cvs)[source]: Rename patch.
* gnu/packages/patches/cvs-2017-12836.patch: Rename to ...
* gnu/packages/patches/cvs-CVE-2018-12836.patch: ... this.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register it.

gnu: libexif: Fix CVE-2018-20030.

* gnu/packages/photo.scm (libexif)[source]: Add patch.
* gnu/packages/patches/libexif-CVE-2018-20030.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register it.

gnu: strongswan: Update to 5.8.0 [fixes CVE-2018-17540, CVE-2018-2065{0,1}].

* gnu/packages/networking.scm (strongswan): Update to 5.8.0.