emacs: Add customization groups for faces.

* emacs/guix.el (guix-faces): New custom group.
* emacs/guix-base.el (guix-operation-option-key): Use it.
  (guix-define-buffer-type): Generate faces group.
* emacs/guix-info.el: Adjust faces to use new groups.
  (guix-info-faces): New custom group.
* emacs/guix-list.el: Likewise
  (guix-list-faces): New custom group.

guix: lint: Check for meaningful origin file names.

* guix/scripts/lint.scm (check-source-file-name): New procedure.
  (%checkers): Add 'source-file-name' checker.
* tests/lint.scm ("source-file-name", "source-file-name: v prefix")
  ("source-file-name: valid", "source-file-name: bad checkout")
  ("source-file-name: good checkout"): New tests.
* doc/guix.texi (Invoking guix lint): Mention file name check.

guix: packages: Add origin-actual-file-name.

* guix/scripts/graph.scm (uri->file-name, node-full-name): Move origin file
  name logic to...
* guix/packages.scm (origin-actual-file-name): ...here.
* tests/packages.scm ("origin-actual-file-name")
  ("origin-actual-file-name, file-name"): New tests.

download: Avoid type errors when formatting download progress output.

* guix/build/download.scm (nearest-exact-integer): New procedure.
  (seconds->string, byte-count->string): Use it.

guix system: Gracefully handle incomplete commands.

Fixes <http://bugs.gnu.org/21451>.
Reported by Steve Sprang <steve.sprang@gmail.com>.

* guix/scripts/system.scm (guix-system)[option-arguments]: Error out
  when ACTION is #f.

doc: Use the recommended Scheme format.

Apply the recommended formatting rules from '.dir-locals.el' to the
examples in the manual in order to fulfill it's purpose of being a
reference.

* doc/package-hello.scm: Indent it.
* doc/guix.texi (Defining Packages, Version Numbers): Likewise.
* gnu/packages/base.scm (hello): Be consistent with the manual.

gnu: Add bio-locus.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (bio-locus): New variable.

Revert "gnu: Add bio-locus."

This reverts commit b429c4fbb06299ce10ecc113a7818bf777c63a6e.

gnu: Add bio-locus.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (bio-locus): New variable.

gnu: system: Add Linux container module.

* gnu/system/linux-container.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.
* gnu/system.scm: Export 'operating-system-etc-directory',
  'operating-system-boot-script', 'operating-system-locale-directory', and
  'file-union'.
  (operating-system-boot-script): Add #:container? keyword argument.
  (operating-system-activation-script): Add #:container?  keyword argument.
  Don't call 'activate-firmware' or 'activate-ptrace-attach' when activating a
  container.

build: ruby: Add support for tarball and directory sources.

Previously, the Ruby build system only knew how to work with gem archives,
which made it difficult to build unreleased gems from a Git repository or
released gems in tarball form.

* gnu/build/ruby-build-system.scm (gnu:unpack, gem-archive?): New procedures.
  (unpack): Use GNU build system unpack phase for non-gem sources.
  (build): Rebuild the gemspec iff the source is a gem archive.
* guix.texi ("ruby-build-system"): Mention that tarballs and directories are
  acceptable.

gnu: Add python-oslo.utils.

* gnu/packages/openstack.scm (python-oslo.utils, python2-oslo.utils): New variables.

gnu: Add python-debtcollector.

* gnu/packages/openstack.scm (python-debtcollector,
  python2-debtcollector): New variables.

gnu: Add python-monotonic.

* gnu/packages/python.scm (python-monotonic, python2-monotonic): New variables.

gnu: Add python-iso8601.

* gnu/packages/python.scm (python-iso8601, python2-iso8601): New variables.

gnu: Add python-wrapt

* gnu/packages/python.scm (python-wrapt, python2-wrapt): New variables.

gnu: Add python-oslo.config.

* gnu/packages/openstack.scm (python-oslo.config, python2-oslo.config): New variables.

gnu: Add python-stevedore.

* gnu/packages/openstack.scm (python-stevedore, python2-stevedore): New variables.

gnu: Add python-netaddr.

* gnu/packages/python.scm (python-netaddr, python2-netaddr): New variables.

gnu: Add cvs-fast-export.

* gnu/packages/version-control.scm (cvs-fast-export): New variable.

gnu: gnupg: Update to 2.1.8.

* gnu/packages/gnupg.scm (gnupg): Update to 2.1.8.

gnu: cpio: Upgrade to 2.12.

* gnu/packages/cpio.scm (cpio): Update to 2.12.
  [source]: Remove 'patches' field.
* gnu/packages/patches/cpio-CVE-2014-9112-pt1.patch,
  gnu/packages/patches/cpio-CVE-2014-9112-pt2.patch,
  gnu/packages/patches/cpio-CVE-2014-9112-pt3.patch,
  gnu/packages/patches/cpio-CVE-2014-9112-pt4.patch,
  gnu/packages/patches/cpio-CVE-2014-9112-pt5.patch,
  gnu/packages/patches/cpio-fix-symlink-bad-length-test.patch: Remove.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Remove.

gnu: tiled: Update to 0.13.1.

* gnu/packages/game-development.scm (tiled): Update to 0.13.1.

gnu: redis: Update to 3.0.4

* gnu/packages/databases.scm (redis): Update to 3.0.4.

Revert "services: 'mingetty-service' no longer takes monadic values."

This reverts commit daa48c31797b27e3a0991d0db7406c951ebc86df.

gnu: Add lz4.

* gnu/packages/compression.scm (lz4): New variable.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

services: 'mingetty-service' no longer takes monadic values.

* gnu/services/base.scm (mingetty-service): Change default value of
  #:motd from a monadic value to a <plain-file>.  Assume MOTD to be a
  file-like object.  Assume LOGIN-PROGRAM is a gexp or #f.
  (%base-services): Use 'plain-file' instead of 'text-file' for motd.
* gnu/system/linux.scm (unix-pam-service): Update docstring to mention
  that MOTD is a file-like object.
* doc/guix.texi (Base Services): Adjust 'mingetty-service' documentation
  accordingly.

gnu: Add ibus-libpinyin.

* gnu/packages/ibus.scm (ibus-libpinyin): New variable.

gnu: Add libpinyin.

* gnu/packages/ibus.scm (libpinyin): New variable.

gnu: minetest: Update to 0.4.13.

* gnu/packages/games.scm (minetest-data, minetest): Update to 0.4.13.

Revert "gnu: lzo: Update to 2.09."

This reverts commit 5cfb91c7d40e66c9357734bbff0ec297a72c133d.

gnu: lzo: Update to 2.09.

* gnu/packages/compression.scm (lzo): Update to 2.09.

gnu: enlightenment: Update to 0.19.9.

* gnu/packages/enlightenment (enlightenment): Update to 0.19.9.

Signed-off-by: Mathieu Lirzin <mthl@openmailbox.org>

gnu: emotion-generic-players: Update to 1.15.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (emotion-generic-players):
  Update to 1.15.0.

Signed-off-by: Mathieu Lirzin <mthl@openmailbox.org>

gnu: evas-generic-loaders: Update to 1.15.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (evas-generic-loaders):
  Update to 1.15.0.

Signed-off-by: Mathieu Lirzin <mthl@openmailbox.org>

gnu: elementary: Update to 1.15.1.

* gnu/packages/enlightenment.scm (elementary): Update to 1.15.1.

Signed-off-by: Mathieu Lirzin <mthl@openmailbox.org>

gnu: efl: Update to 1.15.1.

* gnu/packages/enlightenment.scm (efl): Update to 1.15.1.

Signed-off-by: Mathieu Lirzin <mthl@openmailbox.org>

gnu: terminology: Update to 0.9.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (terminology): Update to 0.9.0.

Signed-off-by: Mathieu Lirzin <mthl@openmailbox.org>

gnu: ncdu: Update to 1.11.

* gnu/packages/ncdu.scm (ncdu): Update to 1.11.

Signed-off-by: Mathieu Lirzin <mthl@openmailbox.org>

Revert "gnu: bdb: Fix indentation."

This reverts commit 41996f22abd9a0f03893177f1fcf1a76731025bb.

Revert "gnu: bdb: Add configure flag to fix C++ header file."

This reverts commit e4c3e2cd439f6a330fbd459097a1b79be41b4e56.

gnu: bdb: Add configure flag to fix C++ header file.

* gnu/packages/databases.scm (bdb): Build with "--enable-cxx", which causes
  HAVE_CXX_STDHEADERS to be defined in db_cxx.h in the output.

gnu: bdb: Fix indentation.

* gnu/packages/databases.scm (bdb): Fix indentation.

gnu: Add emacs-debbugs.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs-debbugs): New variable.

gnu: Add ghc-xmonad-contrib.

* gnu/packages/wm.scm (ghc-xmonad-contrib): New variable.

Signed-off-by: Eric Bavier <bavier@member.fsf.org>

gnu: Add xmonad.

* gnu/packages/wm.scm (xmonad): New variable.

Co-authored-by: Eric Bavier <bavier@member.fsf.org>

services: elogind-configuration: Disable hibernation key by default.

* gnu/services/desktop.scm (<elogind-configuration>): Change the default value
  of the 'handle-hibernate-key' field to 'ignore'.

services: Add udev rules for (upower colord elogind) to %desktop-services.

* gnu/services/desktop.scm (%desktop-services): Replace the 'udev-service'
  from %base-services.
* gnu/services/base.scm (%base-services): Add a comment to keep them in sync.

file-systems: Add %elogind-file-systems; add it to %base-file-systems.

* gnu/system/file-systems.scm (%elogind-file-systems): New variable.
  (%base-file-systems): Add %elogind-file-systems.

guix build: '--log-file' can return URLs.

* guix/scripts/build.scm (%default-log-urls): New variable.
  (log-url): New procedure.
  (guix-build): Use it.
* doc/guix.texi (Invoking guix build): Document it.

http-client: Backport delimited input port fix from Guile.

* guix/http-client.scm (make-delimited-input-port): Backport Guile
  commit 5a10e41.
  Monkey-patch 'make-delimited-input-port' for any Guile <= 2.0.11.

http-client: Remove redundant import clause.

* guix/http-client.scm: Remove redundant #:use-module (guix utils).

gnu: gnucash: Add Finance::Quote support.

* gnu/packages/patches/gnucash-price-quotes-perl.patch: New patch.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/gnucash.scm (gnucash)[source]: Use it.
  [inputs]: Add perl-date-manip and perl-finance-quote.
  [arguments]: Add 'wrap-programs' phase.  Move below inputs.

guix: packages: Add transitive-input-references.

* guix/packages.scm (transitive-input-references): New procedure.
* gnu/packages/version-control.scm (package-transitive-propagated-labels*)
  (package-propagated-input-refs): Delete.
  (git)[arguments]: Adjust to transitive-input-references.

gnu: Add perl-finance-quote.

* gnu/packages/web.scm (perl-finance-quote): New variable.
* gnu/packages/patches/perl-finance-quote-unuse-mozilla-ca.patch: New patch.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: Add perl-date-manip.

* gnu/packages/perl.scm (perl-date-manip): New variable.

gnu: Add perl-html-tableextract.

* gnu/packages/web.scm (perl-html-tableextract): New variable.

gnu: Add perl-html-element-extended.

* gnu/packages/web.scm (perl-html-element-extended): New variable.

gnu: ffmpeg: Update to 2.8.

* gnu/packages/video.scm (ffmpeg): Update to 2.8.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

pull: Update to the new cgit snapshot URL.

* guix/scripts/pull.scm (%snapshot-url): Update to the new URL.

gnu: gdb: Remove headers and libraries already in Binutils.

* gnu/packages/gdb.scm (gdb)[arguments]: Add #:modules.  Rename
  'post-install' phase to 'remove-libs-already-in-binutils'.  Change it
  to compute the intersection of the set of headers and libraries of GDB
  vs. Binutils and to remove each of the files found in both.

gnu: gdb: Use 'modify-phases'.

* gnu/packages/gdb.scm (gdb)[arguments]: Use 'modify-phases'.

gnu: gdb: Update to 7.10.

* gnu/packages/gdb.scm (gdb): Update to 7.10.

linux-initrd: Compress cpio archives deterministically.

* gnu/build/linux-initrd.scm (write-cpio-archive): Use '--no-name'.

gnu: xfce4-settings: Set the default icon theme to "gnome".

Fixes <http://bugs.gnu.org/21217>.

* gnu/packages/patches/xfce4-settings-defaults.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-settings)[source]: Add patch.

gnu: ibus: Suggest search path.

* gnu/packages/ibus.scm (ibus)[native-search-paths]: Add path specification
  for IBUS_COMPONENT_PATH.

gnu: Add gMTP.

* gnu/packages/libusb.scm (gmtp): New variable.

gnu: ibus: Update to 1.5.11.

* gnu/packages/ibus.scm (ibus): Update to 1.5.11.

gnu: qsynth: Update to 0.4.0.

* gnu/packages/audio.scm (qsynth): Update to 0.4.0.

gnu: oslotest: Update to 1.10.0

* gnu/packages/openstack.scm (python-oslotest): Update to 1.10.0.

gnu: sqlite: Switch to alternate source URL.

* gnu/packages/databases.scm (sqlite)[source]: Add fossies.org URL.

build: Improve information density and appearance of download progress output.

* guix/build/download.scm (seconds->string): New function.
  (byte-count->string): New function.
  (progress-bar): New function.
  (throughput->string): Remove function.
  (progress-proc): Display base file name, elapsed time, and progress bar.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

ui: Add package-description-string.

Provide support for Texinfo's markup in package description.

* guix/ui.scm (%text-width): New parameter.
  (texi->plain-text): New variable.
  (package->recutils): Use them.
  (package-description-string): New variable.
* emacs/guix-main.scm (%package-param-alist): Use it.
* gnu/packages/perl.scm (perl-devel-globaldestruction)
  (perl-devel-lexalias, perl-exporter-lite): Adapt to Texinfo's markup.
* gnu/packages/python.scm (python2-empy): Likewise.

gnu: Add oslo.i18n.

* gnu/packages/openstack.scm (python-oslo.i18n, python2-oslo.i18n): New
  variables.

gnu: python-testtools: fix propagated inputs.

* gnu/packages/python.scm (python-testools): turn python-fixtures and
  python-testtools into propagated inputs.

gnu: pbr: Update to 1.6.0

* gnu/packages/openstack.scm (python-pbr): Update to 1.6.0.

gnu: Add ruby-rack.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-rack): New variable.

build: container: Use the same clone flags as fork(3).

The intent is to make 'clone' behave a lot more like 'primitive-fork', which
calls clone(2) with SIGCHLD, CLONE_CHILD_CLEARTID, and CLONE_CHILD_SETTID
flags.  Notably, running 'clone' at the REPL without these flags would break
the REPL beyond repair.

* guix/build/syscalls.scm (CLONE_CHILD_CLEARTID, CLONE_CHILD_SETTID): New
  variables.
* gnu/build/linux-container.scm (namespaces->bit-mask): Add
  CLONE_CHILD_CLEARTID and CLONE_CHILD_SETTID to bit mask.

build: container: Setup /dev/console.

* gnu/build/linux-container.scm (mount-file-systems): Bind mount the
  controlling terminal as /dev/console.

gnu: Add ruby-byebug.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-byebug): New variable.

gnu: Add ruby-pg.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-pg): New variable.

build: ruby: Avoid long build directory names.

Having the hash of the source gem in the source directory file name proved to
be problematic when running the test suite for the 'pg' gem that creates
UNIX-domain sockets in the source directory and exceeded the 108 character
limit on GNU/Linux systems.

* guix/build/ruby-build-system.scm (unpack): Rename unpacked gem directory to
  "gem".

gnu: Add enblend-enfuse.

* gnu/packages/photo.scm (enblend-enfuse): New variable.

gnu: calibre: Update to 2.37.1.

* gnu/packages/ebook.scm (calibre): Update to 2.37.1.

gnu: Add FLANN.

* gnu/packages/maths.scm (flann): New variable.

gnu: youtube-dl: Update to 2015.09.03.

* gnu/packages/video.scm (youtube-dl): Update to 2015.09.03.

gnu: Add libpano13.

* gnu/packages/photo.scm (libpano13): New variable.

ui: Change 'P_' to return the empty string when passed the empty string.

Reported by Mathieu Lirzin <mathieu.lirzin@etu.u-bordeaux.fr>
at <https://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2015-09/msg00111.html>.

* guix/ui.scm (P_): Check whether MSGID is empty, and return it if it is.

Update copyright information in (gnu packages ruby).

gnu: Add ruby-ox.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-ox): New variable.

gnu: Add ruby-activesupport.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-activesupport): New variable.

gnu: Add ruby-json.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-json): New variable.

gnu: Add ruby-tzinfo.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-tzinfo): New variable.

gnu: Add ruby-thread-safe.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-thread-safe): New variable.

gnu: Add ruby-pry.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-pry): New variable.

gnu: Add ruby-slop-3.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-slop-3): New variable.

gnu: Add ruby-coderay.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-coderay): New variable.

gnu: Add ruby-method-source.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-method-source): New variable.

gnu: sound-theme-freedesktop: Specify the applicable licenses.

* gnu/packages/libcanberra.scm (sound-theme-freedesktop)[license]:
  Specify the actual licenses that apply.

licenses: Add CC-BY-SA and CC-BY.

* guix/licenses.scm (cc-by-sa4.0, cc-by3.0): New variables.