gnu: Add guile-irc.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-irc): New variable.

doc: Fix typo in prosody configuration.

* doc/guix.texi (Messaging Services)[Prosody Service]: Switch 'cons' to
'cons*' in example prosody-service-type.

gnu: scintilla: Update to 4.3.2.

* gnu/packages/text-editors.scm (scintilla): Update to 4.3.2.

gnu: httrack: Fix Texinfo markup in description.

* gnu/packages/web.scm (httrack): Fix Texinfo markup in description.

gnu: simplescreenrecorder: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/video.scm (simplescreenrecorder)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: libmng: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/image.scm (libmng)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: libjaylink: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/embedded.scm (libjaylink)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: qdbm: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/databases.scm (qdbm)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: fritzing: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/engineering.scm (fritzing)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: glfw: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/gl.scm (glfw)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: wireless-tools: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/linux.scm (wireless-tools)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: openimageio: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/graphics.scm (openimageio)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: shogun: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/machine-learning.scm (shogun)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: perl-test-simple: Update to 1.302172.

* gnu/packages/perl-check.scm (perl-test-simple): Update to 1.302172.

gnu: five-or-more: Update to 3.32.1.

* gnu/packages/gnome.scm (five-or-more): Update to 3.32.1.
[source]: Hard-code NAME.

gnu: eigen: Update to 3.3.7.

* gnu/packages/algebra.scm (eigen): Update to 3.3.7.
[source]: Add a patch to fix a test failure.
* gnu/packages/patches/eigen-stabilise-sparseqr-test.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: doctest: Update to 2.3.7.

* gnu/packages/check.scm (doctest): Update to 2.3.7.

gnu: reaver: Update to 1.6.6.

* gnu/packages/networking.scm (reaver): Update to 1.6.6.
[source]: Hard-code NAME.

guix: import: opam: Use a default repository.

* guix/import/opam.scm (opam->guix-package): Use a default value for
`repository`.

gnu: gnome-shell-extension-appindicator: Update to 33.

* gnu/packages/gnome-xyz.scm (gnome-shell-extension-appindicator):
Update to 33.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add tla.

* gnu/packages/version-control.scm (tla): New variable.

services: nfs: Remove unnecessary "mount" invocation.

* gnu/services/nfs.scm (%nfs-activation): Remove unnecessary "mount"
invocation (/proc/fs/nfsd is automatically mounted, somehow).  Remove
unnecessary 'mkdir-p' call.

services: nfs: Move activation snippet out of line.

* gnu/services/nfs.scm (%nfs-activation): New variable.
(nfs-service-type)[extensions]: Refer to %NFS-ACTIVATION.

tests: nfs-server: Use marionette helper procedures.

* gnu/tests/nfs.scm (run-nfs-server-test)[test](wait-for-file): Remove.
("nscd is listening on its socket"): Use 'wait-for-unix-socket'.

gnu: rust-rand-0.4: Don't skip build.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-rand-0.4)[arguments]: Don't skip build.

gnu: rust-rand-0.3: Don't skip build.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-rand-0.3)[arguments]: Don't skip build.

gnu: rust-rand-xorshift-0.2: Don't skip build.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-rand-xorshift-0.2)[arguments]: Don't
skip build.

gnu: rust-rawpointer-0.1: Don't skip build.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-rawpointer-0.1)[arguments]: Don't
skip build.

gnu: rust-argon2rs-0.2: Don't skip build.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-argon2rs-0.2)[arguments]: Don't skip
build. Add phase to find all rust dependencies.

gnu: rust-cargon-0.0: Don't skip build.

* gnu/pacakges/crates-io.scm (rust-cargon-0.0)[arguments]: Don't skip
build. Move rust-gcc-0.3 from cargo-development-inputs to cargo-inputs.

gnu: linux-libre@4.19: Update to 4.19.110.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.110.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.

gnu: cook: Fix.

This follows up on commit 5adc59e6fe8abb701df8fc97d56a6e60258318a4.

* gnu/packages/cook.scm (cook)[home-page]: Better.

Reported-by: Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>

gnu: cogl: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/gnome.scm (cogl)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: agda: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/agda.scm (agda)[home-page]: Use HTTPS.

gnu: cook: Use archived home page.

* gnu/packages/cook.scm (cook)[home-page]: Use a Web Archived copy.

gnu: wxwidgets: Refer to xdg-open.

Fixes <https://debbugs.gnu.org/cgi/bugreport.cgi?bug=22704>.

* gnu/packages/wxwidgets.scm (wxwidgets)[inputs]: Add xdg-utils.
[arguments]: Add ‘refer-to-inputs’ phase to patch xdg-open calls.

gnu: python-tqdm: Update to 4.43.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-tqdm): Update to 4.43.0.
[arguments]: New field.
[native-inputs]: Remove PYTHON-FLAKE8 and PYTHON-COVERAGE.
[properties]: Remove.
(python2-tqdm): Use PACKAGE-WITH-PYTHON2.

gnu: python-zope-security: Update to 5.1.0.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-security): Update to 5.1.0.
[native-inputs]: Remove PYTHON-SIX.  Move PYTHON-ZOPE-COMPONENT and
PYTHON-ZOPE-LOCATION ...
[propagated-inputs]: ... here.  Add PYTHON-ZOPE-INTERFACE.
(python2-zope-security)[propagated-inputs]: Remove.

gnu: python-zope-location: Update to 4.2.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-location): Update to 4.2.
[native-inputs]: Add PYTHON-ZOPE-TESTRUNNER.
[propagated-inputs]: Add PYTHON-ZOPE-INTERFACE.

gnu: python-zope-proxy: Update to 4.3.4.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-proxy): Update to 4.3.4.
[native-inputs]: Add PYTHON-ZOPE-TESTRUNNER.

gnu: python-zope-configuration: Update to 4.3.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-configuration): Update to 4.3.1.
[native-inputs]: Add PYTHON-ZOPE-TESTING and PYTHON-ZOPE-TESTRUNNER.
[propagated-inputs]: Add PYTHON-ZOPE-INTERFACE.

gnu: python-zope-schema: Update to 5.0.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-schema): Update to 5.0.1.
[propagated-inputs]: Remove PYTHON-ZOPE-EXCEPTIONS.
[native-inputs]: Remove PYTHON-NOSE and PYTHON-COVERAGE.  Add
PYTHON-ZOPE-TESTRUNNER and PYTHON-ZOPE-I18NMESSAGEID.

gnu: python-zope-i18nmessageid: Update to 5.0.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-i18nmessageid): Update to 5.0.1.
[native-inputs]: Add PYTHON-COVERAGE and PYTHON-ZOPE-TESTRUNNER.
[propagated-inputs]: Add PYTHON-SIX.

gnu: python-zope-testrunner: Update to 5.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-testrunner): Update to 5.1.
[source](uri): Download tarball instead of zipball.
[native-inputs]: Remove UNZIP.  Move PYTHON-ZOPE-INTERFACE and
PYTHON-ZOPE-EXCEPTIONS ...
[propagated-inputs]: ... here.

gnu: python-zope-testing: Update to 4.7.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-testing): Update to 4.7.
[source](modules, snippet): Remove.

gnu: python-zope-exceptions: Update to 4.3.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-exceptions): Update to 4.3.

gnu: python-zope-interface: Update to 4.7.2.

* gnu/packages/python-web.scm (python-zope-interface): Update to 4.7.2.

gnu: python-gevent: Update to 1.4.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-gevent): Update to 1.4.0.
[arguments]: Adjust unbundling variables.  Future-proof the C_INCLUDE_PATH
override.  Add phases "pretend-to-be-CI" and "adjust-tests".  Run the tests
with "python -m gevent.tests", and respect PARALLEL-JOB-COUNT.
[native-inputs]: Add PYTHON-DNSPYTHON, PYTHON-PSUTIL, PYTHON-ZOPE-EVENT and
PYTHON-ZOPE-INTERFACE.
(python2-gevent)[native-inputs]: Fix input inheritance.

gnu: python-kivy: Remove unused input.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-kivy)[native-inputs]: Remove GIT.

gnu: Remove python2-gitdb.

Upstream no longer supports Python 2 and there are no users in Guix.

* gnu/packages/version-control.scm (python2-gitdb): Remove variable.

gnu: Remove python2-gitpython.

This package fails to build and has no users in Guix.

* gnu/packages/version-control.scm (python2-gitpython): Remove variable.

gnu: Remove python2-bandit.

This package fails to build and has no users in Guix.

* gnu/packages/openstack.scm (python2-bandit): Remove variable.

gnu: Remove python2-oslo.config.

This package fails to build and has no users in Guix.

* gnu/packages/openstack.scm (python2-oslo.config): Remove variable.

gnu: Remove python2-oslo.utils.

This package fails to build and has no users in Guix.

* gnu/packages/openstack.scm (python2-oslo.utils): Remove variable.

gnu: Remove python2-oslo.serialization.

* gnu/packages/openstack.scm (python2-oslo.serialization): Remove variable.
(python-oslo.serialization)[properties]: Remove.

gnu: Remove python2-oslo.log.

This package fails to build and has no users in Guix.

* gnu/packages/openstack.scm (python2-oslo.log): Remove variable.

gnu: Remove python2-tempest-lib.

This package fails to build and has no users in Guix.

* gnu/packages/openstack.scm (python2-tempest-lib): Remove variable.

gnu: Remove python2-swiftclient.

This package fails to build and has no reverse dependencies.

* gnu/packages/openstack.scm (python2-swiftclient): Remove variable.
(python-swiftclient)[properties]: Remove.

gnu: Remove python2-keystoneclient.

This package fails to build and has no reverse dependencies.

* gnu/packages/openstack.scm (python2-keystoneclient): Remove variable.

gnu: Remove git-annex-remote-hubic.

This package does not build and is officially unmaintained since 2017.

* gnu/packages/version-control.scm (git-annex-remote-hubic): Remove variable.

gnu: beets: Fix build with newer Werkzeug.

* gnu/packages/patches/beets-werkzeug-compat.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/music.scm (beets)[source](patches): New field.

gnu: Remove python2-flask-migrate.

Upstream no longer supports Python 2 and there are no dependencies on it in Guix.

* gnu/packages/python-web.scm (python2-flask-migrate): Remove variable.

gnu: python2-flake8: Add missing propagated dependency.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-flake8)[propagated-inputs]: Add
PYTHON-FUNCTOOLS32.

gnu: python-flask-migrate: Update to 2.5.3.

* gnu/packages/python-web.scm (python-flask-migrate): Update to 2.5.3.

gnu: python-flask-restful-swagger: Update to 0.20.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-flask-restful-swagger): Update to
0.20.1.
[arguments]: New field.  Explicitly disable tests.

gnu: python-stdnum: Update to 1.13.

* gnu/packages/finance.scm (python-stdnum): Update to 1.13.
[arguments]: New field.
[native-inputs]: Add PYTHON-NOSE.

gnu: python-flask-restful: Update to 0.3.8.

* gnu/packages/patches/python-flask-restful-werkzeug-compat.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/python-web.scm (python-flask-restful): Update to 0.3.8.
[source](patches): New field.
[native-inputs]: Remove PYTHON-SPHINX.

gnu: python-flask-wtf: Update to 0.14.3.

* gnu/packages/python-web.scm (python-flask-wtf): Update to 0.14.3.
[arguments]: Remove obsolete phase.  Override check phase.
[native-inputs]: Remove PYTHON-NOSE.  Add PYTHON-PYTEST.

gnu: python-flask-babel: Update to 1.0.0.

* gnu/packages/python-web.scm (python-flask-babel): Update to 1.0.0.
[arguments]: New field.

gnu: python-flask-login: Update to 0.5.0.

* gnu/packages/python-web.scm (python-flask-login): Update to 0.5.0.
[arguments]: Remove.
[native-inputs]: Remove PYTHON-NOSE and PYTHON-PEP8.  Add PYTHON-COVERAGE,
PYTHON-PYCODESTYLE. and PYTHON-PYTEST.

gnu: python-flask: Update to 1.1.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-flask): Update to 1.1.1.

gnu: python-werkzeug: Update to 1.0.0.

* gnu/packages/python-web.scm (python-werkzeug): Update to 1.0.0.
[source](uri): Capitalize PyPI project name.
[native-inputs]: Add PYTHON-PYTEST-TIMEOUT.

gnu: python-stem: Update to 1.8.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-stem): Update to 1.8.0.

gnu: Add libgccjit.

* gnu/packages/gcc.scm (libgccjit): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

tests: nfs: Ensure 'rpcinfo' can be found.

The test was failing since 8b9cad01e9619f53dc5a65892ca6a09ca5de3447.

* gnu/tests/nfs.scm (run-nfs-test)[test]("RPC service running"): Add
'setenv' call for PATH.

tests: opensmtpd: Check /var/spool/mail instead of /var/mail.

The test had been failing since the upgrade to 6.6.3p1 in commit
2dbfd8eec43b602d23cee3fdd2842cc333e36c24.

* gnu/services/mail.scm (opensmtpd-activation): Create /var/spool/mail.
* gnu/tests/mail.scm (run-opensmtpd-test): Check /var/spool/mail instead
of /var/mail.

tests: opensmtpd: Gracefully handle test failure.

Previously the 'wait' loop would run for ~1024 seconds, at which point
we'd reach the file descriptor limit due to the leak in 'queue-empty?'.

* gnu/tests/mail.scm (run-opensmtpd-test)[test]("mail arrived"): In
'queue-empty?', close PIPE to avoid file descriptor leak.  In 'wait'
loop, arrange to run at most 20 times.

services: dhcpd: Use 'invoke/quiet' when validating the config file.

This avoids the lengthy copyright/config message from dhcpd.

* gnu/services/networking.scm (dhcpd-activation): Use 'invoke/quiet'
instead of 'invoke'.

tests: dhcpd: Adjust network interface name.

This is a followup to 8e53fe2b91d2776bc1529e7b34967c8f1d9edc32.

* gnu/tests/networking.scm (dhcpd-v4-configuration)
(%dhcpd-os): Use "ens3" instead of "eth0".

tests: rsync: Set PATH.

This is a followup to 8b9cad01e9619f53dc5a65892ca6a09ca5de3447, which
would leave PATH unset.

* gnu/tests/rsync.scm (run-rsync-test)[test]("service running"): Add
call to 'setenv' for PATH.

gnu: star: Update to 2.7.3a.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (star): Update to 2.7.3a.

services/web: Export nginx-configuration-global-directives.

This is a follow-up to commit b420e6deb96e0760f12e3d941b76e690c4235e47.

* gnu/services/web.scm (nginx-configuration-global-directives): Export
procedure.

services: nginx: Fix broken default configuration.

* gnu/services/web.scm (nginx-configuration): Emit an empty events{}
block by default.
* doc/guix.texi (Web Services): Document it.

Revert "gnu: BlueZ: Update to 5.54."

This reverts commit f24aaa81de8c709adfda2e89271c562a5ca8d959.

This change caused too many rebuilds for the master branch.

gnu: java-snakeyaml: Update hash.

Compared to the the old tarfile available on ci.guix.gnu.org, only the file
'.hg_archival.txt' was removed.

* gnu/packages/java.scm (java-snakeyaml)[source]: Update hash.

gnu: java-xsdlib: Use archived home page URI, update source URI.

* gnu/packages/xml.scm (java-xsdlib)[home-page]: Use archived URI.
[source]: Update URI.

gnu: java-qdox: Move version 2.0-M2 side by side with version 1.12.1.

* gnu/packages/java.scm (java-qdox): Move package definition up,
such that it is side by side with version 1.12.1.

gnu: java-qdox: Update source and home-page URI.

* gnu/packages/java.scm (java-qdox)[source]: Update URI.
[home-page]: Update URI.

gnu: java-osgi-service-packageadmin: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-service-packageadmin)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-service-cm: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-service-cm)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-util-tracker: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-util-tracker)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-service-resolver: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-service-resolver)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-service-jdbc: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-service-jdbc)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-service-log: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-service-log)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-framework: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-framework)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-service-repository: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-service-repository)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-service-metatype-annotations: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-service-metatype-annotations)[source]:
Update URI.

gnu: java-osgi-util-promise: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-util-promise)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-util-function: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-util-function)[source]: Update URI.

gnu: java-osgi-namespace-service: Update source URI.

* gnu/packages/java.scm (java-osgi-namespace-service)[source]: Update URI.