gnu: Add hikari.

* gnu/packages/wm.scm (hikari): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: cuirass: Update to 1.0.0-4.ff3f25d.

* gnu/packages/ci.scm (cuirass): Update to 1.0.0-4.ff3f25d.

gnu: eolie: Add missing inputs.

This fixes errors observed directly at launch of Eolie inside pure
environments.  (See <https://bugs.gnu.org/47097> for more information.)
It is still not possible to launch Eolie inside a container, however.
(See also <https://bugs.gnu.org/47106>.)

* gnu/packages/gnome.scm (eolie)[inputs]: Add libhandy and
gnome-settings-daemon.

gnu: guix-build-coordinator: Update to 0-21.6e7e63f.

* gnu/packages/package-management.scm (guix-build-coordinator): Update to
0-21.6e7e63f.

gnu: guix-data-service: Update to 0.0.1-26.410f58c.

* gnu/packages/web.scm (guix-data-service): Update to 0.0.1-26.410f58c.
[inputs]: Use newer PostgreSQL and guile-json packages, and switch to
non-deprecated variants of other packages.

gnu: Add r-samr.

* gnu/packages/cran.scm (r-samr): New variable.

Signed-off-by: Ricardo Wurmus <rekado@elephly.net>

gnu: Add r-gsa.

* gnu/packages/cran.scm (r-gsa): New variable.

Signed-off-by: Ricardo Wurmus <rekado@elephly.net>

gnu: r-suppdists: Update hash.

* gnu/packages/cran.scm (r-suppdists)[source]: Update hash.

gnu: SVT-HEVC: Update to 1.5.0.

* gnu/packages/video.scm (svt-hevc): Update to 1.5.0.
[license]: Specify the license.

gnu: SVT-AV1: Update URLs.

* gnu/packages/video.scm (svt-av1)[source, home-page]: Update URLs.

gnu: libaom: Update to 3.0.0.

* gnu/packages/video.scm (libaom): Update to 3.0.0.

gnu: guix: Update to 6e7ba45.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 6e7ba45.

gnu: sqlite: Update to 3.32.3 [security fixes].

Fixes CVE-2020-11655, CVE-2020-11656, CVE-2020-13434, CVE-2020-13435,
CVE-2020-13630, CVE-2020-13631, CVE-2020-13632, CVE-2020-15358 and
CVE-2020-9327.

* gnu/packages/sqlite.scm (sqlite/fixed): New variable.
(sqlite)[replacement]: Graft.

gnu: mariadb: Fix CVE-2021-27928.

* gnu/packages/patches/mariadb-CVE-2021-27928.patch: New patch.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register it.
* gnu/packages/databases.scm (mariadb/fixed): New variable. Apply patch.
(mariadb)[replacement]: Graft.

gnu: Remove QT 4.

For more information, see:

https://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2016-02/msg00596.html
https://bugs.gnu.org/45704

* gnu/packages/qt.scm (qt-4, python2-pyqt-4): Remove variables.
* gnu/packages/engineering.scm (qucs, qucs-s): Remove variables.
* gnu/packages/messaging.scm (pybitmessage): Remove variable.
* gnu/packages/password-utils.scm (keepassx): Remove variable.
* gnu/packages/pdf.scm (poppler-qt4): Remove variable.

doc: "Invoking guix refresh" links to '--with-latest'.

* doc/guix.texi (Invoking guix refresh): Reword intro and Link to
'--with-latest'.

doc: Explain how to pass 'guix refresh' the packages found in your profile.

Suggested by Xinglu Chen <public@yoctocell.xyz>.

* doc/guix.texi (Invoking guix refresh): Mention how to update packages
found in one's profile.

doc: Move 'guix refresh --list-updaters' reference to the right place.

* doc/guix.texi (Invoking guix refresh): Move '--list-updaters' right
after '--type'.

import: print: Improve origin method name guesswork.

Fixes <https://bugs.gnu.org/47375>.
Reported by Léo Le Bouter <lle-bout@zaclys.net>.

* guix/import/print.scm (package->code): For METHOD, use 'variable-name'
preferably, and call 'procedure-name' as a last resort.

lint: archival: Gracefully handle packages with a #f hash value.

Fixes <https://bugs.gnu.org/47293>.
Reported by Luis Felipe.

* guix/lint.scm (check-archival): Check whether 'content-hash-value'
returns true.

gnu: ircii: Update to 20210314 [security fixes].

See this message for more information about the security issues fixed in
ircii 20210314:

https://seclists.org/oss-sec/2021/q1/262

* gnu/packages/irc.scm (ircii): Update to 20210314.

gnu: linux-libre 5.10: Update to 5.10.26.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.10-version): Update to 5.10.26.
(linux-libre-5.10-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre: Update to 5.11.10.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.11-version): Update to 5.11.10.
(linux-libre-5.11-pristine-source): Update hash.

gnu: vips: Update to 8.10.6.

* gnu/packages/image-processing.scm (vips): Update to 8.10.6.

gnu: spdlog: Update to 1.8.3.

* gnu/packages/logging.scm (spdlog): Update to 1.8.3.

gnu: youtube-dl: Update to 2021.03.25.

* gnu/packages/video.scm (youtube-dl): Update to 2021.03.25.

gnu: wla-dx: Update to 9.12.

* gnu/packages/assembly.scm (wla-dx): Update to 9.12.

gnu: doctest: Update to 2.4.6.

* gnu/packages/check.scm (doctest): Update to 2.4.6.

gnu: libinstpatch: Update to 1.1.6.

* gnu/packages/audio.scm (libinstpatch): Update to 1.1.6.

gnu: emacs: Update to 27.2.

* gnu/packages/emacs.scm (emacs): Update to 27.2.

gnu: cuirass: Update to 1.0.0-3.f5a2eea.

* gnu/packages/ci.scm (cuirass): Update to 1.0.0-3.f5a2eea.

gnu: Add go-gitlab.com-shackra-goimapnotify.

* gnu/packages/mail.scm (go-gitlab.com-shackra-goimapnotify): New variable.

Signed-off-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>

gnu: synapse: Update to 1.29.0.

* gnu/packages/matrix.scm (synapse): Update to 1.29.0.

gnu: gcc: Fix comment about gfortran.

Added by: cb4805e34c9997edca14743516b9a0fde6303d1c
Fixes: 0681f05486d901c92637c098bb7afddef35068b0

* gnu/packages/gcc.scm (gcc): Fix comment about gfortran.

Signed-off-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>

gnu: openssl: Update to 1.1.1k [security fixes].

Fixes CVE-2021-3450 and CVE-2021-3449.

* gnu/packages/tls.scm (openssl/fixed): Update to 1.1.1k.

gnu: xfce4-netload-plugin: Update to 1.4.0.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-netload-plugin): Update to 1.4.0.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: exo: Update to 4.16.1.

* gnu/packages/xfce.scm (exo): Update to 4.16.1.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: thunar: Update to 4.16.6.

* gnu/packages/xfce.scm (thunar): Update to 4.16.6.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: xfce4-systemload-plugin: Update to 1.3.1.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-systemload-plugin): Update to 1.3.1.
[inputs]: Add libgtop.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: xfce4-battery-plugin: Update to 1.1.4.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-battery-plugin): Update to 1.1.4.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: Add quickproject.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-quickproject, ecl-quickproject,
sbcl-quickproject): New variables.

gnu: Add html-template.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-html-template, ecl-html-template,
sbcl-html-template): New variables.

Revert "gnu: guix: Update to 86dd54f."

A test failure (tests/print) was uncovered so revert until we fix it.

This reverts commit b0eb525ddba77420ff8c0930b9173b10f9ae342d.

gnu: linux-libre 4.4: Update to 4.4.263.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.4-version): Update to 4.4.263.
(linux-libre-4.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 4.9: Update to 4.9.263.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9-version): Update to 4.9.263.
(linux-libre-4.9-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 4.14: Update to 4.14.227.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.227.
(linux-libre-4.14-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 4.19: Update to 4.19.183.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.183.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 5.4: Update to 5.4.108.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.108.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre: Update to 5.11.9.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.11-version): Update to 5.11.9.
(linux-libre-5.11-pristine-source): Update hash.

gnu: guix: Update to 86dd54f.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 86dd54f.

doc: Fix typo in qemu-binfmt-service example.

* doc/guix.texi (Virtualization Services): Add missing parentheses.

gnu: Add gsequencer.

* gnu/packages/music.scm (gsequencer): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add drawing.

* gnu/packages/gnome.scm (drawing): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: emacs-git-gutter: Update to 0.91.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-git-gutter): Update to 0.91.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add emacs-vterm-toggle.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-vterm-toggle): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: r-textshape: Use HTTPS home page URI.

* gnu/packages/cran.scm (r-textshape)[home-page]: Use HTTPS URI.

gnu: ddrescue: Support cross compiling.

* gnu/packages/disk.scm (ddrescue)[arguments]: Add configure-flag to
fix cross compiling.

gnu: guile-mastodon-dev: Remove it.

* gnu/packages/ci.scm (guile-mastodon-dev): Remove it.
(cuirass): Update it.

gnu: guile-mastodon: Update to 0.0.1-1.74b75bc.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-mastodon): Update to 0.0.1-1.74b75bc.
[source]: Remove Guile-3.0 snippet since this new release brings Guile-3.0
support.

gnu: Add python-pylibacl.

* gnu/packages/acl.scm (python-pylibacl): New variable.

gnu: ccache: Update to 4.2.

* gnu/packages/ccache.scm (ccache): Update to 4.2.
[build-system]: Switch to cmake-build-system.
[inputs]: Add zstd:lib.
[arguments]: Move substitution before change of directory and add phase
to set HOME variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: gqrx: Add missing input.

* gnu/packages/radio.scm (gqrx)[inputs]: Add libsndfile.

gnu: gnuradio-osmosdr: Update to 0.2.3-0.a100eb0.

* gnu/packages/radio.scm (gnuradio-osmosdr): Update to 0.2.3-0.a100eb0.
  [native-inputs]: Replace swig by pybind11.
  [inputs]: Add libsndfile.

gnu: gnuradio-iqbalance: Update to 0.38.2-0.fbee239.

* gnu/packages/radio.scm (gnuradio-iqbalance): Update to 0.38.2-0.fbee239.
  [native-inputs]: Replace swig by pybind11.

gnu: gnuradio: Add missing inputs.

* gnu/packages/radio.scm (gnuradio)[native-inputs]: Add js-mathjax.
  [inputs]: Add libsndfile.
  [arguments]: Add 'configure-flags' to find mathjax.

gnu: gnuradio: Update to 3.9.0.0.

* gnu/packages/radio.scm (gnuradio): Update to 3.9.0.0.
  [source]: Remove snippet deleting the included copy of volk,
  as it is not included anymore.
  [native-inputs]: Replace swig with pybind11.
  [inputs]: Add sdl (for dtv).
  [arguments]: Remove 'configure-flags". Disable broken tests.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: sed: Make it build on SELinux-enabled kernels.

Fixes: <https://bugs.gnu.org/41498>.

* gnu/packages/base.scm (sed)[arguments]: New field.  This adds a
snippet, equivalent to the patch submitted upstream, which fixes an
issue that prevents sed from building on SELinux-enabled kernels.

Adjusted by Efraim Flashner to apply to master.

utils: Fix target-64bit? on powerpc64le-linux.

* guix/utils.scm (target-64bit?): Change the string from "ppc64" to
"powerpc64", which matches Guix system names like "powerpc64le-linux".

ci: %cross-targets: Add powerpc64le-linux-gnu.

* gnu/ci.scm (%cross-targets): Add an entry for powerpc64le-linux-gnu.

syscalls: Fix RNDADDTOENTCNT on powerpc64le-linux.

This fixes the failing test add-to-entropy-count in tests/syscalls.scm on
powerpc64le-linux.

* guix/build/syscalls.scm (RNDADDTOENTCNT): When %host-type starts with
"powerpc64le", set this to #x80045201.  Otherwise, set it to #x40045201 as
before.

syscalls: Fix clone on powerpc64le-linux.

This makes the clone procedure work correctly and fixes some test failures on
powerpc64le-linux, including tests/containers.scm.

* guix/build/syscalls.scm (clone): Add an entry for ppc64le.

Add powerpc64le-linux as a supported Guix architecture.

This makes powerpc64le-linux a supported architecture for Guix, but not for
Guix System.

* Makefile.am (SUPPORTED_SYSTEMS): Add an entry for powerpc64le-linux.
* etc/guix-install.sh (chk_sys_arch): Same.
* guix/packages.scm (%supported-systems): Same.
* m4/guix.m4 (GUIX_ASSERT_SUPPORTED_SYSTEM): Same.
* tests/guix-build.sh (all_systems): Same.

gnu: libelf: Fix compilation for powerpc64le-linux.

* gnu/packages/elf.scm (libelf)[arguments]: Modify replacement 'configure phase
to invoke "./configure" with "--host=powerpc64le-unknown-linux-gnu" on
powerpc64le-linux.

Signed-off-by: Chris Marusich <cmmarusich@gmail.com>

gnu: texlive-latex-base: Fix compilation on powerpc64le*.

* gnu/packages/tex.scm (texlive-latex-base)[arguments]: LuaJIT is not ported to
powerpc64le* yet. Update replacement 'build phase to add "luajittex" within the
"disabled-formats" list on powerpc64le*.

Signed-off-by: Chris Marusich <cmmarusich@gmail.com>

gnu: texlive-bin: Fix compilation on powerpc64le*.

* gnu/packages/tex.scm (texlive-bin)[arguments]: Append "--disable-luajittex"
and "--disable-mfluajit" to keyword argument "#:configure-flags" on
powerpc64le* because LuaJIT is not ported to powerpc64le* yet. Also set
"#:tests?" to "#f" on powerpc64le*.

Signed-off-by: Chris Marusich <cmmarusich@gmail.com>

gnu: guile-avahi: Fix compilation on powerpc64le-linux.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-avahi)[arguments]: Parallel builds fail on
powerpc64le-linux. Set "#:parallel-build?" to "#f".

Signed-off-by: Chris Marusich <cmmarusich@gmail.com>

gnu: bdb-4.8: Fix configure on powerpc64le-linux.

* gnu/packages/dbm.scm (bdb-4.8)[arguments]: Modify 'configure phase to append
"--build=powerpc64le-unknown-linux-gnu" to configure's flags when compiling for
powerpc64le-linux.

Signed-off-by: Chris Marusich <cmmarusich@gmail.com>

gnu: binutils-final: Support more Power architectures.

* gnu/packages/commencement.scm (binutils-final)[arguments]: When checking if
the system is a Power architecture, instead of hard-coding "powerpc-linux",
use the target-powerpc? procedure so it works on more Power architectures.
[inputs]: Likewise.

gnu: binutils-final: Provide bash for binary on powerpc-linux.

* gnu/packages/commencement.scm (binutils-final)[arguments]: On
powerpc-linux allow a reference to static-bash-for-glibc.
[inputs]: On powerpc-linux add static-bash-for-glibc.

gnu: gcc-boot0: Enable 128-bit long double for POWER9.

* gnu/packages/commencement.scm (gcc-boot0) [#:configure-flags]: Add
--with-long-double-128 when the boot triplet is "powerpc64le-guix-linux-gnu",
instead of "powerpc64le-linux-gnu", which is incorrect.  The actual triplet
used during bootstrapping is "powerpc64le-guix-linux-gnu".

gnu: glibc: Fix ldd path on powerpc*.

This should avoid some problems, such as "not a dynamic executable" errors.

* gnu/packages/patches/glibc-ldd-powerpc.patch: New patch.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register it.
* gnu/packages/base.scm: (glibc)[native-inputs]: Add it.
[arguments]: When building for powerpc* apply it.
* gnu/packages/commencement.scm (glibc-final-with-bootstrap-bash,
glibc-final)[native-inputs]: Add patch conditionally.

This patch has been adjusted to apply to master.

Signed-off-by: Chris Marusich <cmmarusich@gmail.com>
Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: gcc-4.7: On powerpc64le, fix /lib64 references.

Fixes: <https://bugs.gnu.org/46253>.

* gnu/packages/gcc.scm (gcc-4.7)[#:phases][pre-configure]: When the
gcc/config/rs6000 directory exists, replace "/lib64" with "/lib" in all files
within it.  Note that this fix will be picked up by any package that re-uses
the pre-configure phase from gcc-4.7 (e.g., all the usual gcc packages).
(make-libstdc++)[#:phases][fix-rs6000-libdir]: New phase, which does the same
as above.  It was necessary to duplicate the fix here because make-libstdc++
does not re-use the pre-configure phase from gcc-4.7.

utils: Add target-powerpc? procedure.

* guix/utils.scm (target-powerpc?): New exported procedure.

gnu: bootstrap: Add support for powerpc64le-linux.

The bootstrap tarballs used by these bootstrap packages were created via the
following steps:

- Create a new x86_64 VM using QEMU.
- Use
  https://ftp.gnu.org/gnu/guix/guix-system-install-1.2.0.x86_64-linux.iso.xz
  to install Guix System 1.2.0 in the VM.
- Run: guix pull --no-substitutes --commit=662e7e28d576ada91fc9dec7d27c100666114f03
- Run: guix build --no-substitutes --target=powerpc64le-linux-gnu bootstrap-tarballs

With the exception of gcc-static, all bootstrap binaries contained in these
tarballs can be built reproducibly.  Unfortunately, gcc-static is not always
reproducible when everything is built from source on separate machines.
Despite investigation efforts, the cause remains unclear, so we have decided
to move forward with these binaries to unblock further bootstrapping work.
For details, see <https://bugs.gnu.org/41669>.

* gnu/packages/bootstrap.scm (%bootstrap-executables)
(bootstrap-executable-file-name, bootstrap-guile-url-path)
(bootstrap-guile-hash, %bootstrap-coreutils&co, %bootstrap-binutils)
(%bootstrap-glibc, %bootstrap-gcc): Add entries for powerpc64le-linux.
(%bootstrap-executable-base-urls): Add an entry for alpha.gnu.org.

gnu: Add cbonsai.

* gnu/packages/toys.scm (cbonsai): New variable.

gnu: bcunit: Update to 3.0.2-0.74021cc and enable more features.

* gnu/packages/linphone.scm (bcunit)[source]: Switch to git repository.
[version]: Update to 3.0.2-0.74021cc.
[outputs]: Add a "doc" output.
[arguments]: Remove the tests? argument, enabling tests.
[configure-flags]: Enable curses, doc, examples, tests and memtrace.
[phases]{patch-source, move-doc}: New phases.
{check}: Override phase.
[inputs]: Add ncurses.
[description]: Fix typo.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: Add libdecaf.

* gnu/packages/crypto.scm (libdecaf): New variable.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-widgetsnbextension: Remove package.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-widgetsnbextension): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-utils: Remove package.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-utils): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-tables: Remove package.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-tables): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-stem: Remove package.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-stem): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-sh: Remove package.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-sh): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-mpd2: Remove package.

* gnu/packages/mpd.scm (python2-mpd2): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-rq: Remove package.

* gnu/packages/databases.scm (python2-rq): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-nbxmpp: Remove package.

* gnu/packages/messaging.scm (python2-nbxmpp): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-mutagen: Remove package.

* gnu/packages/music.scm (python2-mutagen): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-ipywidgets: Remove package.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-ipywidgets): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-graphql-core: Remove package.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-graphql-core): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-furl: Remove package.

* gnu/packages/python-web.scm (python2-furl): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: python2-flask: Remove package.

* gnu/packages/python-web.scm (python2-flask): Delete.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>