gnu: Add libratbag.

* gnu/packages/gnome.scm (libratbag): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add python-evdev.

* gnu/packages/linux.scm (python-evdev): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add udevil.

* gnu/packages/disk.scm (udevil): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: emacs-4clojure: Fix typos in description.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-4clojure)[description]: Fix typos.

gnu: emacs-4clojure: Fix version.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-4clojure)[version]: Use `git-version' as
there is no proper release.

gnu: Add emacs-4clojure.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-4clojure): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: font-gnu-freefont: Add otf and woff font types.

* gnu/packages/fonts.scm (font-gnu-freefont): Add otf and woff font types.
* gnu/packages/genealogy.scm (gramps)[inputs]: Replace font-gnu-freefont-tff
with font-gnu-freefont.
* doc/guix.texi: Adjust a reference to the package.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: clipmenu: Fix hash.

* gnu/packages/xdisorg.scm (clipmenu):[origin] Update hash.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add emacs-xclip.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-xclip): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

system: Automatically adjust linux-module packages to use the
operating-system's kernel.

* gnu/system.scm (package-for-kernel): New procedure.
(operating-system-directory-base-entries): Use it.
* gnu/tests/linux-module.scm: Test it.

gnu: wget2: Add support for gnu updater.

* gnu/packages/wget.scm (wget2)[properties]: New field. Add
ftp-directory.

gnu: commoncpp: Add support for gnu updater.

* gnu/packages/telephony.scm (commoncpp)[properties]: New field. Add
ftp-directory, upstream-name.

gnu: osip: Update to 5.1.1.

* gnu/packages/telephony.scm (osip): Update to 5.1.1.

gnu: osip: Add support for gnu updater.

* gnu/packages/telephony.scm (osip)[properties]: New field. Add
upstream-name, ftp-directory.

gnu: gama: Update to 2.08.

* gnu/packages/gps.scm (gama): Update to 2.08.

gnu: parallel: Update to 20200422.

* gnu/packages/parallel.scm (parallel): Update to 20200422.

gnu: guile-8sync: Add support for gnu updater.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-8sync)[properties]: New field. Add
upstream-name.

doc: cookbook: Explain how to use bind mounts.

* doc/guix-cookbook.texi (Setting up a bind mount): Add example.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

doc: Adjust @var vs. @code.

* doc/guix.texi (Base Services): Adjust @var vs. @code.  Use 'cons'
instead of 'cons*' in example.

services: Add udev-rules-service helper.

* doc/guix.texi (Base services): Add documentation for
'udev-rules-service'. Replace examples of 'udev-service-type' extension
with 'udev-rules-service'.
* gnu/services/base.scm (udev-rules-service): New procedure.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: maths: dune-*: Update to version 2.7

* gnu/packages/maths.scm (dune-*): Update to version 2.7.
(dune-uggrid)[source] Download from Git, as no release tarball for
version 2.7 exists.
(dune-alugrid,dune-subgrid,dune-pdelab)[source] Use commit hashes as no
tags for version 2.7 exist (yet?).
(dune-istl)[source](patches) Add patch required to build version 2.7
without openmpi.
* gnu/packages/patches/dune-istl-2.7-fix-non-mpi-tests.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

system: Split %BASE-PACKAGES in smaller parts.

* gnu/system.scm: (%base-packages-interactive, %base-packages-linux,
%base-packages-networking, %base-packages-utils): New variables.
(%base-packages): Use those new variables.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add blueman.

* gnu/packages/networking.scm (blueman): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

profiles: Add #:name parameter to 'profile-derivation'.

* guix/profiles.scm (profile-derivation): Add #:name and pass it to
'gexp->derivation'.

system: 'operating-system-boot-parameters-file' uses 'scheme-file'.

* gnu/system.scm (operating-system-boot-parameters-file): Use
'scheme-file' instead of 'gexp->file'.
(operating-system-directory-base-entries): Adjust accordingly.

gexp: Add 'load-path?' field to <scheme-file>.

* guix/gexp.scm (<scheme-file>)[load-path?]: New field.
(scheme-file): Add #:set-load-path? and honor it.
(scheme-file-compiler): Pass #:set-load-path? to 'gexp->file'.
* doc/guix.texi (G-Expressions): Document it.

gnu: pari-gp: Update to 2.11.4.

* gnu/packages/algebra.scm (pari-gp): Update to 2.11.4.

gnu: ungoogled-chromium: Update to 81.0.4044.122-0.31d6e60 [security fixes].

This fixes CVE-2020-6459, CVE-2020-6460, and CVE-2020-6458.

* gnu/packages/chromium.scm (%chromium-version): Set to 81.0.4044.122.
(%ungoogled-revision): Set to 31d6e60c96481599b42072b4489e4468280198e3.
(%chromium-origin, %ungoogled-origin): Update hashes.

gnu: qt@4: Update source URI.

* gnu/packages/qt.scm (qt-4)[source](uri): Adjust to current.

gnu: Remove mumimu.

* gnu/packages/mail.scm (mumimu): Remove variable.

gnu: mumi: Update to 0.0.0-16.9175199.

* gnu/packages/mail.scm (mumi): Update to 0.0.0-16.9175199.
[inputs]: Add guile-xapian; remove mumimu.

gnu: Add w-scan.

* gnu/packages/video.scm (w-scan): New variable.

gnu: Add font-meera-inimai.

* gnu/packages/fonts.scm (font-meera-inimai): New variable.

gnu: Add python-google-brotli.

* gnu/packages/compression.scm (python-google-brotli): New variable.

gnu: linux-libre: Update to 5.4.34.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.34.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@5.6: Update to 5.6.6.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.6-version): Update to 5.6.6.
(linux-libre-5.6-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@4.19: Update to 4.19.117.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.117.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.

news: Add entry for the cookbook.

* etc/news.scm: Add entry for the cookbook.

self: Build and install 'guix-cookbook.info' and its translations.

* guix/self.scm (translate-texi-manuals)[build]: Translate and install
guix-cookbook.texi.
(info-manual)[build]: Handle "guix-cookbook*.texi".

self: translate-texi-manuals: Add 'available-translations'.

* guix/self.scm (translate-texi-manuals)[build](available-translations):
New procedure.
Use it rather than directly calling 'find-files' & co.

self: translate-texi-manuals: Don't hardcode "guix.texi".

* guix/self.scm (translate-texi-manuals)[build](translate-texi): Add
'prefix' and #:extras parameters and honor them.  Adjust callers.

doc: Include *.json files in the source.

This is a followup to c9f321e52a99dea93fcc099372ea0167150b9aac.

* doc/build.scm (texinfo-manual-source)[build]: Add *.json to #$output.

gnu: OpenSSL: Update to 1.1.1g [fixes CVE-2020-1967].

* gnu/packages/tls.scm (openssl)[replacement]: Replace with openssl-1.1.1g.
(openssl-1.1.1e): Replace variable with ...
(openssl-1.1.1g): ... this.

gnu: emacs-dired-toggle-sudo: Update to 1.0-0.13bbe52.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-dired-toggle-sudo): Update to 1.0-0.13bbe52.
* gnu/packages/patches/emacs-dired-toggle-sudo-emacs-26.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: shepherd: Add Guile 2.0 variant.

* gnu/packages/admin.scm (guile2.0-shepherd): New variable.

gnu: shepherd: Update to 0.8.0.

* gnu/packages/admin.scm (shepherd): Update to 0.8.0.
* gnu/services/shepherd.scm (shepherd-configuration-file): Use
'default-pid-file-timeout' instead of fiddling with '%pid-file-timeout'.

tests: web: Explicitly wait for the HTTP port.

* gnu/tests/web.scm (run-webserver-test)["HTTP port ready"]: New test.

tests: ssh: Explicitly wait for port 22.

Previously we could occasionally try to connect before the server is
actually listening, both for OpenSSH and Dropbear.

* gnu/tests/ssh.scm (run-ssh-test)["wait for port 22"]: New test.

gnu: guile-xapian: Update to 0.1.0.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-xapian): Update to 0.1.0.

gnu: Add python-rdflib-jsonld.

* gnu/packages/rdf.scm (python-rdflib-jsonld): New variable.

gnu: rdf.scm: Use license: prefix.

* gnu/packages/rdf.scm: Use a 'license:' prefix for package licenses
instead of only importing a select number of licenses.

gnu: Add u-boot-pinebook-pro-rk3399.

* gnu/packages/bootloaders (u-boot-pinebook-pro-rk3399): New variable.
* gnu/packages/patches/u-boot-DT-for-Pinebook-Pro.patch: New file.
* gnu/packages/patches/u-boot-add-boe-nv140fhmn49-display.patch: New file.
* gnu/packages/patches/u-boot-gpio-keys-binding-cons.patch: New file.
* gnu/packages/patches/u-boot-leds-common-binding-con.patch: New file.
* gnu/packages/patches/u-boot-support-Pinebook-Pro-laptop.patch: New file.
* gnu/packages/patches/u-boot-video-rockchip-fix-build.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add new patches.
* gnu/bootloader/u-boot.scm (install-pinebook-pro-rk3399-u-boot,
  u-boot-pinebook-pro-rk3399-bootloader): New variable.

Co-authored-by: Jan Nieuwenhuizen <janneke@gnu.org>

gnu: liblinphone: Fix icons.

* gnu/packages/linphone.scm (liblinphone): Fix icons.

Signed-off-by: Maxim Cournoyer <maxim.cournoyer@gmail.com>

gnu: obs: Update to 25.0.7.

* gnu/packages/video (obs): Update to 25.0.7.

packages: Recommend against the use of 'package-file'.

* guix/packages.scm (package-file): Recommend against its use in the
docstring.
* doc/guix.texi (The Store Monad): Likewise.

Revert "system: Don’t create a module database when no modules are available."

This reverts commit b2fff3b5de7d510fe4809e9a97089dddf2a39ffc.

Fixes <https://bugs.gnu.org/40713>.
Reported by pkill9 <pkill9@runbox.com>.

This commit is incorrect: its effect depends on whether KERNEL's build
output is already available in the store, it breaks with non-package
kernels as reported at <https://bugs.gnu.org/40713>, and the
LINUX-MODULE-DATABASE hook is required at all times since
5c79f238634c5adb6657f1b4b1bb4ddb8bb73ef1 removed the relevant bits from
the 'linux-libre' package.

services: etc: Detect and report duplicate entries.

Fixes <https://bugs.gnu.org/40729>.
Reported by Christopher Baines <mail@cbaines.net>.

* gnu/services.scm (files->etc-directory)[assert-no-duplicates]: New
procedure.
Use it.

services: dovecot: 'stop' method returns #f upon success.

* gnu/services/mail.scm (dovecot-shepherd-service)[stop]: Use 'invoke'
instead of 'make-forkexec-constructor'.  Previously, the 'stop' method
would return the PID of the "dovecot stop" process, which would be
interpreted as a failure to stop the service.

services: Don't use the deprecated 'make-forkexec-constructor' call.

Passing 'make-forkexec-constructor' a string or several string arguments
has been deprecated since dmd 0.1.

* gnu/services/base.scm (rngd-service-type): In 'start' method, pass a
list as the first argument to 'make-forkexec-constructor'.
* gnu/services/desktop.scm (bluetooth-shepherd-service): Likewise.
* gnu/services/spice.scm (spice-vdagent-shepherd-service): Likewise.

gnu: mcron: Remove now unneeded phase.

This is a followup to a52aa7fdef19f95fc1755ecd88e979ba07d8b392.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (mcron)[arguments]: Remove
'fix-finding-guile'.

gnu: cgit: Update Git source code to 2.25.4.

* gnu/packages/version-control.scm (cgit)[inputs]: Update git-source to 2.25.4.

gnu: Git: Update to 2.26.2 [fixes CVE-2020-11008].

* gnu/packages/version-control.scm (git): Update to 2.26.2.
[native-inputs]: Update git-manpages.

gnu: xfce.scm: Sort module imports.

* gnu/packages/xfce.scm: Sort module imports.

Signed-off-by: Danny Milosavljevic <dannym@scratchpost.org>

installer: Rename uvesafb shepherd service to maybe-uvesafb.

Because the installer's uvesafb service loads uvesafb only on some machines.

This is a follow-up to commit 0ad60b2a89d6d387236466e0bcdd61ac489fca37.

* gnu/system/install.scm (uvesafb-shepherd-service): Adjust provision and
description fields.

gnu: libqalculate: Fix libcurl gnutls CA cert bundle file.

* gnu/packages/patches/libqalculate-3.8.0-libcurl-ssl-fix.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/maths.scm (libqalculate)[source]: Use it.

Signed-off-by: Danny Milosavljevic <dannym@scratchpost.org>

gnu: Add midori.

* gnu/packages/web-browsers.scm (midori): New variable.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <m.othacehe@gmail.com>

syscalls: Fix Linux detection in 'readdir*'.

* guix/build/syscalls.scm (readdir*): Fix Linux detection for
`arm-unknown-linux-gnueabihf'.

gnu: Add r-bridgesampling.

* gnu/packages/cran.scm (r-bridgesampling): New variable.

Signed-off-by: Ricardo Wurmus <rekado@elephly.net>

tests: Update expected values for package->code.

Reported by janneke on IRC.

* tests/print.scm: Update expected package definitions produced by package->code.

gnu: java-bouncycastle: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/java.scm (java-bouncycastle)[source]: Download using
git-fetch. Use upstream's repo, not a mirror.

gnu: java-lz4: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/java.scm (java-lz4)[source]: Download using git-fetch.
[arguments]: Add phase to make files writable.

gnu: java-fest-assert: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/java.scm (java-fest-assert)[source]: Download using
git-fetch.

gnu: java-fest-test: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/java.scm (java-fest-test)[source]: Download using
git-fetch.

gnu: java-fest-util: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/java.scm (java-fest-util)[source]: Download using
git-fetch.

gnu: graphene: Update to 1.10.0.

* gnu/packages/gtk.scm (graphene): Update to 1.10.0.
[build-system]: Switch to meson-build-system.
[arguments]: Update configure-flags to not install tests.
[inputs]: Remove python2. Move gobject-introspection ...
[native-inputs]: ... to here. Remove autoconf, automake, libtool, which.

gnu: sparql-query: Sort inputs alphabetically.

* gnu/packages/databases.scm (sparql-query)[inputs]: Sort alphabetically.

gnu: sparql-query: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/databases.scm (sparql-query)[source]: Download using
git-fetch.

gnu: mu: Update to 1.4.

* gnu/packages/mail.scm (mu): Update to 1.4.
[arguments]: Remove 'fix-date-tests phase. Add 'patch-bin-sh-in-tests phase.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

services: Add 'simulated-wifi-service-type'.

* gnu/services/networking.scm (simulated-wifi-shepherd-services): New
procedure.
(simulated-wifi-service-type): New variable.
* doc/guix.texi (Networking Services): Document it.

services: Add 'hostapd-service-type'.

* gnu/services/networking.scm (<hostapd-configuration>): New record
type.
(hostapd-configuration-file, hostapd-shepherd-services): New
procedures.
(hostapd-service-type): New variable.
* doc/guix.texi (Networking Services): Document it.

gnu: php: Update to 7.4.5.

* gnu/packages/php.scm (php): Update to 7.4.5.

Revert "gnu: libxfce4util: Update to 4.15.0."

This reverts commit c0bff513a41a12b446565f3c0de06343acbb6e23.

gnu: emacs-org-superstar: Update to 1.2.1.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-org-superstar): Update to 1.2.1.

doc: Make install script more prominent.

Suggested by Steven vanZyl <rushsteve1@rushsteve1.us>.

* doc/guix.texi (Binary Installation): Add @example showing how to
download the script.  Use "systemctl enable --now".

gnu: Add notification-daemon.

* gnu/packages/gnome.scm (notification-daemon): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

tests: Invoke 'git' with a custom '.gitconfig' and ignore the system config.

Fixes <https://bugs.gnu.org/37679>.
Reported by Gábor Boskovits <boskovits@gmail.com>.

* guix/tests/git.scm (call-with-environment-variables): New procedure.
(with-environment-variables): New macro.
(populate-git-repository)[git]: Wrap (git-command) invocation in
'call-with-temporary-directory' and 'with-environment-variables'.

gnu: Add trezord-udev-rules.

* gnu/packages/finance.scm (trezord-udev-rules): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

status: Remove extra space before ellipsis.

Extra space was introduced in 8fa4ac5be4d5f8a1e62635842b16486832ff49f1.

* guix/status.scm (print-build-event): Remove extra space before
ellipsis.

installer: connman: Fix Wifi connection.

Issue reported by SergioBG here:
https://lists.gnu.org/archive/html/bug-guix/2020-04/msg00432.html.

Due to default buffering mode, the installer was reading from the pipe without
having actually written a command before.

* gnu/installer/connman.scm (connman-connect-with-auth): Set pipe buffering
mode to 'line.

services: sddm: Have sddm provision xorg-server.

* gnu/services/sddm.scm (sddm-shepherd-service)[shepherd-service]: Have
sddm provision 'xorg-server like the other display managers.

gnu: python-cython: Update to 0.29.16.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cython): Update to 0.29.16.

gnu: qrcodegen-cpp: Update to 1.6.0.

* gnu/packages/aidc.scm (qrcodegen-cpp): Update to 1.6.0.

gnu: vim-asyncrun: Update to 2.7.5.

* gnu/packages/vim.scm (vim-asyncrun): Update to 2.7.5.

gnu: libavif: Update to 0.7.1.

* gnu/packages/image.scm (libavif): Update to 0.7.1.
[arguments]: Run the test suite.

gnu: Add node-semver.

* gnu/packages/node-xyz.scm (node-semver): New variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: chess: Update to 6.2.6.

* gnu/packages/games.scm (chess): Update to 6.2.6.

gnu: chess: Set upstream name and ftp-directory.

* gnu/packages/games.scm (chess)[properties]: New field. Add
upstream-name and ftp-directory.

installer: Fix backtrace display.

The 'syslog' macro cannot be resolved in the pre-unwind-handler
context. Failed to resolve 'syslog' in this context resulted in the swallowing
of all installation errors.

Fixes 5c04b00cf463a543b8ffc9eb55991f6b4cc145dd.

* gnu/installer.scm (installer-program): Use (gnu installer utils) module.

gnupg: Accept revoked keys.

I (nckx) have revoked all RSA subkeys, in favour of my older and
freshly-refreshed ECDSA ones.  This was merely a precaution: to my
knowledge all my RSA private keys have been carefully destroyed and
were never compromised.  This commit keeps ‘make authenticate’ happy.

* guix/gnupg.scm (revkeysig-rx): New variable for revoked keys.
(gnupg-verify): Parse it.
(gnupg-status-good-signature?): Accept it as ‘good’ for our purposes.
* build-aux/git-authenticate.scm (%committers): Clarify nckx's subkeys.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Use the test-only time zone database where appropriate.

* gnu/packages/backup.scm (duplicity)[inputs]: Remove tzdata.
[native-inputs]: Add tzdata-for-tests.
* gnu/packages/finance.scm (ledger): Likewise.
* gnu/packages/compression.scm (lhasa)[native-inputs]: Use tzdata-for-tests.
* gnu/packages/cran.scm (r-rstan)[native-inputs]: Likewise.
* gnu/packages/databases.scm (mongodb)[native-inputs]: Likewise.
* gnu/packages/kde-frameworks.scm (kdelibs4support)[native-inputs]: Likewise.