gnu: python-pycrypto: Fix build with Python 3.8.

* gnu/packages/patches/python-pycrypto-time-clock.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/python-crypto.scm (python-pycrypto)[source](patches): Add it.

gnu: gRPC@1.16: Fix build with glibc 2.30 and later.

* gnu/packages/rpc.scm (grpc-1.16.1)[arguments]: Add phase to rename custom
gettid() function.

gnu: python-gevent: Update to 1.5.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-gevent): Update to 1.5.0.
[arguments]: Split the unbundling and include path adjustments intwo two
phases.  Enable previously failing test; disable two others.  Use a format
string instead of DISPLAY when writing skipped_tests.txt.

gnu: spandsp: Add comment.

* gnu/packages/telephony.scm (spandsp)[native-inputs]: Note that the
LIBJPEG-TURBO dependency comes via LIBTIFF.

gnu: Add linphoneqt.

* gnu/packages/linphone.scm (linphoneqt): New variable.

Signed-off-by: Danny Milosavljevic <dannym@scratchpost.org>

gnu: spandsp: Fix build failure.

* gnu/packages/telephony.scm (spandsp)[native-inputs]: Add libjpeg-turbo.

gnu: liblinphone: Fix build failure.

* gnu/packages/linphone.scm (liblinphone)[arguments]<#:configure-flags]: Add
-DENABLE_STRICT=NO.

Signed-off-by: Danny Milosavljevic <dannym@scratchpost.org>

gnu: commencement: Memoize packages as a function of the system.

Previous, things like 'ld-wrapper-boot0' would be memoized with
(mlambda () …).  However, the definition of 'ld-wrapper-boot0' depends
on the result of (%boot0-inputs), which is itself a function
of (%current-system).  Thus, if one first calls:

  (parameterize ((%current-system "x86_64-linux"))
    (ld-wrapper-boot0))

then, in all subsequent calls to 'ld-wrapper-boot0', the value
of (%current-system) would be ignored because the result is already
memoized.  Concretely, 'ld-wrapper-boot0' would always have the
dependencies it has on x86_64-linux, even though they are different than
those on armhf-linux, say ("bash-mesboot" vs. "bootstrap-binaries").

Fixes <https://bugs.gnu.org/40482>.
Reported by Marius Bakke <mbakke@fastmail.com>.

* gnu/packages/commencement.scm (define/system-dependent): New macro.
(linux-libre-headers-boot0, hurd-core-headers-boot0, ld-wrapper-boot0)
(gcc-boot0-intermediate-wrapped, gcc-boot0-wrapped, ld-wrapper-boot3):
Define using 'define/system-dependent' instead of 'define' + 'mlambda'.
Adjust users so they no longer look like procedure calls.
* tests/guix-build.sh: Add test.

Merge branch 'master' into core-updates

gnu: boinc-client: Update to 7.16.6.

* gnu/packages/distributed.scm (boinc-client): Update to 7.16.6.

gnu: ephemeralpg: Update to 2.9.

* gnu/packages/databases.scm (ephemeralpg): Update to 2.9.
[arguments]: Remove obsolete work-arounds.
[native-inputs]: Add which.

gnu: ephemeralpg: Use HTTPS home page.

* gnu/packages/databases.scm (ephemeralpg)[source, home-page]: Use HTTPS.

gnu: crispy-doom: Update to 5.7.2.

* gnu/packages/games.scm (crispy-doom): Update to 5.7.2.

gnu: r-powerlaw: Update to 0.70.4.

* gnu/packages/cran.scm (r-powerlaw): Update to 0.70.4.

gnu: burp: Update to 2.3.24.

* gnu/packages/backup.scm (burp): Update to 2.3.24.

gnu: burp: Extend test time-outs.

* gnu/packages/backup.scm (burp)[arguments]: Add a new
‘extend-test-time-outs’ phase.

gnu: libzen: Update to 0.4.38.

* gnu/packages/cpp.scm (libzen): Update to 0.4.38.
[source]: Hard-code NAME.

gnu: celluloid: Update to 0.19.

* gnu/packages/video.scm (celluloid): Update to 0.19.

gnu: ghc-regex-tdfa: Update home page.

* gnu/packages/haskell-xyz.scm (ghc-regex-tdfa)[home-page]: Update.

gnu: btrfs-progs: Update to 5.6.

* gnu/packages/linux.scm (btrfs-progs): Update to 5.6.

tests: openvswitch: Use the absolute file name of ovs-vsctl.

This fixes a regression introduced in 8b9cad01e9619f53dc5a65892ca6a09ca5de3447
where ovs-vsctl would no longer be available in PATH.

* gnu/tests/networking.scm (run-openvswitch-test): Qualify "ovs-vsctl"
invocation by ungexping the OPENVSWITCH variable instead of assuming it's
available on PATH.

vm: Use virtio network driver.

This fixes a regression introduced in 8e53fe2b91d2776bc1529e7b34967c8f1d9edc32
where 'guix system vm' would no longer be using virtio.

* gnu/system/vm.scm (common-qemu-options): Add "-nic user,model=virtio-net-pci".

gnu: Add fulcrum.

* gnu/packages/finance.scm (fulcrum): New variable.

gnu: emacs-ace-window: Update to 0.10.0

[[PGP Signed Part:No public key for 7C7AFFBEFEF2CB25 created at 2020-04-05T22:27:27+0200 using RSA]]
* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-ace-window) Update to 0.10.0.

From c3dc065f9247c98ba90fbf3ec9c51abb06417269 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Michael Rohleder <mike@rohleder.de>
Date: Sun, 5 Apr 2020 22:15:50 +0200
Subject: [PATCH] gnu: emacs-ace-window: Update to 0.10.0

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-ace-window) Update to 0.10.0.

gnu: Add emacs-dired-git-info.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-dired-git-info): New variable.

gnu: Add emacs-diredfl.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-diredfl): New variable.

gnu: pianobar: Update to 2020.04.05.

* gnu/packages/music.scm (pianobar): Update to 2020.04.05.

gnu: mariadb: Fix build on armhf-linux.

* gnu/packages/databases.scm (mariadb)[arguments]: When building for
armhf-linux, add phase 'hide-default-gcc'.
[native-inputs]: Distinguish GCC-5.

gnu: aegisub: Fix build with Make 4.3.

* gnu/packages/patches/aegisub-make43.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/video.scm (aegisub)[source](patches): Add it.

tests: Run guided installation tests from an ISO image.

* gnu/tests/install.scm (guided-installation-test): Pass
 #:installation-disk-image-file-system-type to 'run-install'.

installer: tests: Don't install to a CD/DVD.

* gnu/installer/tests.scm (choose-partitioning): Use 'find' to select
the disk.

vm: 'system-disk-image' honors #:substitutable? for ISO9660 images.

This is a followup to a328f66a9e16d7bae765d8bc088e4a97037e6e2b.

* gnu/system/vm.scm (iso9660-image): Add #:substitutable? and pass it to
'expression->derivation-in-linux-vm'.
(system-disk-image): Pass #:substitutable? to 'iso9660-image'.

lint: 'check-patch-file-names' restricts to shorter file names.

* guix/lint.scm (check-patch-file-names): Increase MARGIN.

gnu: sdl-pango: Shorten file name of patch.

* gnu/packages/patches/sdl-pango-fix-explicit-SDLPango_CopyFTBitmapTo.patch:
Rename to...
* gnu/packages/patches/sdl-pango-header-guard.patch: ... this.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/sdl.scm (sdl-pango):
Likewise.

gnu: akonadi: Shorten file name of patch.

This ensures we stay below the POSIX tar file name length limit.

* gnu/packages/patches/akonadi-Revert-Make-installation-properly-relo.patch:
Rename to...
* gnu/packages/patches/akonadi-not-relocatable.patch: ... this.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/kde-pim.scm (akonadi): Likewise.

gnu: binutils: Shorten file names of MinGW patches.

This ensures we stay below the POSIX tar file name length limit.

* gnu/packages/patches/binutils-mingw-w64-reproducible-import-libraries.patch:
Rename to...
* gnu/packages/patches/binutils-mingw-w64-deterministic.patch: ... this.
* gnu/packages/patches/binutils-mingw-w64-specify-timestamp.patch:
Rename to...
* gnu/packages/patches/binutils-mingw-w64-timestamp.patch: ... this.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/cross-base.scm (cross-binutils): Likewise.

gnu: spice-gtk: Add an absolute reference for libjpeg in the .la files.

* gnu/packages/spice.scm (spice-gtk)[arguments]: Add phase 'patch-la-files.

gnu: installer: Fix issue with "Esperanto" locale.

According to glibc manual, locale are under the following form:
          language[_territory[.codeset]][@modifier]

The esperanto locale "epo" does not have a territory. Modify run-command to
take this into account.

Reported by Alex Sassmannshausen here:
https://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2020-04/msg00192.html.

* gnu/installer/utils.scm (run-command): Handle locale without territory such
as "epo".

gnu: gnuradio: Fix gnuradio-companion GUI not showing.

* gnu/packages/ham-radio.scm (gnuradio)[arguments]: Add 'wrap-glib-or-gtk' and
  'wrap-with-GI_TYPELIB_PATH' phases.

gnu: xorriso: Build gui frontend.

* gnu/packages/cdrom.scm (xorriso)[outputs]: Add gui.
[arguments]: Add custom phase to install gui files to separate output
and wrap the binary.
[inputs]: Add tk.

Add missing services/linux.scm to gnu/local.mk.

* gnu/local.mk (GNU_SYSTEM_MODULES): Add linux.scm.

gnu: emacs-orgalist: Update to 1.12.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-orgalist): Update to 1.12.
[description]: Fix wording.

gnu: xfce: Fix typo.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce)[inputs]: Re-spell ‘tumlber’.

services: gnome: Fix ‘gnome’ field name.

To match its own documentation & other similar services.

* gnu/services/desktop.scm (gnome-desktop-configuration)[gnome-package]:
Rename to…
[gnome]: …this.

vm: Transparently compress iso9660 images.

* gnu/build/vm.scm (make-iso9660-image): Use the ‘--zisofs’ xorriso
filter at the highest compression settings for supported directories.

lint: Check for inappropriate inputs in propagated-inputs too.

* guix/lint.scm (check-inputs-should-be-native): Also check the
propagated inputs of the package.

gnu: libssh: Update to 0.9.4 [fixes CVE-2020-1730].

* gnu/packages/ssh.scm (libssh): Update to 0.9.4.

gnu: python-titlecase: Nose is a native input.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-titlecase)[propagated-inputs]: Rename to ...
[native-inputs]: ... this.

gnu: Add gqrx.

* gnu/packages/ham-radio.scm (gqrx): New variable.

Co-authored-by: Danny Milosavljevic <dannym@scratchpost.org>

gnu: Add gnuradio-iqbalance.

* gnu/packages/ham-radio.scm (gnuradio-iqbalance): New variable.

gnu: Add libosmo-dsp.

* gnu/packages/ham-radio.scm (libosmo-dsp): New variable.

gnu: Add gnuradio-osmosdr.

* gnu/packages/ham-radio.scm (gnuradio-osmosdr): New variable.

gnu: Add gnuradio.

* gnu/packages/ham-radio.scm (gnuradio): New variable.

Co-authored-by: Danny Milosavljevic <dannym@scratchpost.org>
Co-authored-by: Charlie Ritter <chewzerita@posteo.net>

gnu: Add codec2.

* gnu/packages/audio.scm (codec2): New variable.

gnu: Add python-click-plugins.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-click-plugins): New variable.

gnu: Add python-titlecase.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-titlecase): New variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: Add xfe.

* gnu/packages/disk.scm (xfe): New variable.

gnu: Add fox.

* gnu/packages/graphics.scm (fox): New variable.

gnu: nano: Update to 4.9.2.

* gnu/packages/nano.scm (nano): Update to 4.9.2.

gnu: Remove python2-scikit-image.

Some of the packages that this depends upon no longer supports Python 2.

* gnu/packages/python-science.scm (python2-scikit-image): Remove variable.

gnu: python-serpent: Declare python2 variant.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-serpent)[properties]: New field.
(python2-serpent): New public variable.

gnu: python-dask: Update to 2.14.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-dask): Update to 2.14.0.

gnu: python-cloudpickle: Update to 1.3.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cloudpickle): Update to 1.3.0.
[arguments]: Remove #:tests?.  Add #:phases.
[native-inputs]: Add PYTHON-PSUTIL.  Remove PYTHON-MOCK.
[properties]: New field.
(python2-cloudpickle)[native-inputs]: New field.  Preserve PYTHON2-MOCK.
[propagated-inputs]: Add PYTHON2-FUTURES.

gnu: python-datrie: Update to 0.8.2

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-datrie): Update to 0.8.2.

gnu: minimap2: Fix cond expression for Guile 3 compatibility.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (minimap2)[arguments]: Make the last COND
test the symbol else instead of _.

gnu: shellcheck: Update homepage.

* gnu/packages/haskell-apps.scm (shellcheck)[homepage]: Update URL.

Signed-off-by: Tobias Geerinckx-Rice <me@tobias.gr>

gnu: mcomix: Update to 20200402.

* gnu/packages/image-viewers.scm (mcomix): Update to 20200402.

installer: Include empty variant in keyboard layout selection.

Previously for Azerbaijani, no Latin layout but only the Cyrillic variant
could be selected.

* gnu/installer/newt/keymap.scm (add-empty-variant): New procedure.
(run-keymap-page): Use it to insert an empty variant.

installer: Allow Alt+Shift toggle from non-Latin keyboard layouts.

Fixes <https://bugs.gnu.org/40493>.

* gnu/installer/newt/keymap.scm (%non-latin-layouts): New variable.
(%non-latin-variants): New variable.
(%latin-layout+variants): New variable.
(toggleable-latin-layout): New procedure to compute combined layouts.
(run-keymap-page): Use it.
(keyboard-layout->configuration): Apply it in config.scm.
(run-layout-page): Mention Alt+Shift.
* gnu/installer/keymap.scm (kmscon-update-keymap): Pass on XKB options.
* gnu/installer/record.scm (<installer>): Adjust code comments.
* gnu/installer.scm (apply-keymap): Pass on XKB options.
(installer-steps): Adjust code comments.
* gnu/packages/patches/kmscon-runtime-keymap-switch.patch: Apply XKB options.

services/web: Fix ordering of default-nginx-config.

Fixes an error message '"load_module" directive is specified too late'.

* gnu/services/web.scm (default-nginx-config): Emit load_module before
global directives.

gnu: cataclysm-dda: Update to 0.E.

* gnu/packages/games.scm (cataclysm-dda): Update to 0.E.

gnu: python-cython: The i686 python2 workaround is needed for 32-bit ARM too.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cython)[arguments]: In the check phase,
disable parallel test execution for all 32-bit systems.
* gnu/packages/python-xyz.scm (python2-cython)[arguments]: Remove similar i686 workaround.

gnu: qtwebengine: Fix build with Ninja >= 1.10.

* gnu/packages/qt.scm (qtwebengine)[arguments]: Add phase
'patch-ninja-version-check'.

gnu: linux-libre: Update to 5.4.31.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.31.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre@5.6: Update to 5.6.3.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.6-version): Update to 5.6.3.
(linux-libre-5.6-pristine-source): Update hash.

news: Add ‘de’ translation.

* etc/news.scm: Add a ‘de’ translation.

download: Use correct system and guile in 'url-fetch/tarbomb' and 'url-fetch/zipbomb'.

Fixes <https://bugs.gnu.org/40115>.

Previously the result of `guix build -s $system $package' would depend on the
system Guix was built for if $package or one of its dependencies used
'url-fetch/tarbomb' or 'url-fetch/zipbomb' as the origin method of its
source (e.g. `guix build -s i686-linux ffmpeg' on i686-linux would build a
different derivation than on x86_64-linux).

This patch fixes this by explicitly passing the correct system and guile to
'gexp->derivation'.

* guix/download.scm (url-fetch/tarbomb): Pass #:system system and
  #:guile-for-build guile to 'gexp->derivation', where guile is the derivation
  of guile for system.
  (url-fetch/zipbomb): Likewise.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: openntpd: Don't use NAME in source URI.

* gnu/packages/ntp.scm (openntpd)[source]: Hard-code NAME.

gnu: et: Update home page.

* gnu/packages/ssh.scm (et)[home-page]: Update.

gnu: mosh: Tweak description.

* gnu/packages/ssh.scm (mosh)[description]: Use full sentences and note
that only the client may roam.

gnu: Add chrony.

* gnu/packages/ntp.scm (chrony): New public variable.

gnu: python-pyjwt: Remove dependency on old version of 'pytest-runner'.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pyjwt)[arguments]: New field.
[native-inputs]: Remove PYTHON-PYTEST-RUNNER.

gnu: perl-gd: Do not rely on 'libgd-config'.

* gnu/packages/gd.scm (perl-gd)[native-inputs]: Add PERL-EXTUTILS-PKGCONFIG.

gnu: ecl: Fix build with LibFFI >= 3.3.

* gnu/packages/lisp.scm (ecl)[source](modules, snippet): New fields.

gnu: ruby-sqlite3: Remove obsolete workaround.

* gnu/packages/ruby.scm (ruby-sqlite3)[arguments]: Remove phase
'adjust-failing-test'.

maint: Adjust release manifest for Guile 3.0 switch.

* etc/release-manifest.scm (%packages-to-cross-build): Refer to
GUILE-3.0/FIXED instead of GUILE-2.2/FIXED.

Merge branch 'master' into core-updates

 Conflicts:
etc/news.scm
gnu/local.mk
gnu/packages/check.scm
gnu/packages/cross-base.scm
gnu/packages/gimp.scm
gnu/packages/java.scm
gnu/packages/mail.scm
gnu/packages/sdl.scm
gnu/packages/texinfo.scm
gnu/packages/tls.scm
gnu/packages/version-control.scm

doc: Mention HTTP/HTTPS proxy in the system installation instructions.

* doc/guix.texi (Keyboard Layout and Networking and Partitioning):
Mention 'herd set-http-proxy guix-daemon'.

tests: Mark VM images as non-substitutable.

* gnu/tests/install.scm (run-install): Pass #:substitutable? to
'system-disk-image' and to 'gexp->derivation'.

vm: Allow images to be marked as non-substitutable.

* gnu/system/vm.scm (expression->derivation-in-linux-vm): Add
 #:substitutable? parameter.  Pass it to 'gexp->derivation'.
(qemu-image): Add #:substitutable? and pass it to
'expression->derivation-in-linux-vm'.
(system-disk-image): Add #:substitutable? and pass it to 'qemu-image'.

gnu: cross-base: Remove unneeded 'let'.

This is a followup to 102d307520dee27a40feb1ca5a699763a2f3aefe.

* gnu/packages/cross-base.scm (cross-libc): Remove (let ((libc libc)) …).

(cherry picked from commit 524a4e357cd71566841aaf405e8548fa3600b11b)

gnu: genimage: Update to 11.

* gnu/packages/genimage.scm (genimage): Update to 11,
[arguments]: add a new test dump file to the patched ones
because of missing /etc/passwd in build environment.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <m.othacehe@gmail.com>

installer: Add proxy support.

* gnu/installer/proxy.scm: New file.
* gnu/local.mk (INSTALLER_MODULES): Add it.
* po/guix/POTFILES.in: Add it.
* gnu/installer/newt/parameters.scm (run-proxy-page): New procedure,
(run-parameters-page): add the previous procedure to the parameters menu.

installer: Turn help menu into parameters menu.

* gnu/local.mk (INSTALLER_MODULES): Rename help.scm into parameters.scm.
* po/guix/POTFILES.in: Ditto.
* gnu/installer/record.scm (<installer>): Rename help-menu into parameter-menu
and help-page into parameters-page.
* gnu/installer/newt/parameters.scm: Renamed from help.scm. Update information
messages.
* gnu/installer/newt.scm: Update accordingly.
* gnu/installer/newt/keymap.scm: Ditto.

gnu: higan: Update description.

* gnu/packages/emulators.scm (higan)[synopsis, description]: Update
description.

gnu: higan: Update to 110.

* gnu/packages/emulators.scm (higan): Update to 110.
[source]: Switch to new repository.
[inputs]: Add libxrandr, replace sdl with sdl2.
[home-page]: Use new URL.
[license]: Switch license.
* gnu/packages/patches/higan-remove-march-native-flag.patch: Delete file.
* gnu/local.mk: Reflect patch removal.

gnu: Syncthing: Update to 1.4.1.

* gnu/packages/syncthing.scm (syncthing): Update to 1.4.1.

gnu: Add go-github-com-calmh-murmur3.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-calmh-murmur3): New variable.
(go-github-com-willf-bloom)[propagated-inputs]: Replace
go-github-com-spaolacci-murmur3 with it.
[arguments]: Patch the murmur3 import path in a new 'patch-import-path' phase.

gnu: Go: Update to 1.13.9.

* gnu/packages/golang.scm (go-1.13): Update to 1.13.9.

maint: Cross-build GUILE-2.2/FIXED.

* etc/release-manifest.scm (%packages-to-cross-build): Replace
"guile@2.2" with GUILE-2.2/FIXED.