packages: The 'patch-guile' field of <origin> is now a package.

* guix/packages.scm (default-guile): Return a package instead of a
  derivation.
  (package-source-derivation): Adjust accordingly.

gnu: tar: Update to 1.17.

* gnu/packages/base.scm (tar): Update to 1.17.  Remove 'arguments' and
  'inputs'.
* gnu/packages/patches/tar-gets-undeclared.patch: Remove.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Remove 'tar-gets-undeclared.patch'.

gnu: linux-libre-headers: Support cross-compilation.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-headers):
  When (%current-target-system) is true, pass it as the argument to
  'build-phase'.  This fixes cross-compilation.
  Reported by Mark H. Weaver <mhw@netris.org>.

daemon: Set the umask to 022 when starting.

* nix/nix-daemon/guix-daemon.cc (main): Add 'umask' call.
* test-env.in: Remove use of 'umask'.

gnu: Add pavucontrol.

* gnu/packages/pulseaudio.scm (pavucontrol): New variable.

gnu: qt: Propagate input mesa.

* gnu/packages/qt.scm (qt): Propagate input mesa.

gnu: qt: Do not use special SSE etc. instructions.

* gnu/packages/qt.scm (qt): Add configure flags to disable machine specific
    instructions.

gnu: qt: Add input pulseaudio.

* gnu/packages/qt.scm (qt): Add input pulseaudio.

gnu: Add Pangomm, ATKmm, and GTKmm.

* gnu/packages/gtk.scm (atk)[synopsis]: Fix typo.
  (pangomm, atkmm, gtkmm): New variables.

list-packages: Show a list of patches for each package.

* build-aux/list-packages.scm (list-join): New procedure.
  (package->sxml)[patch-url]: New procedure.
  Use it.

snix: Prefer descriptions from the Womb rather than from Nixpkgs.

* guix/snix.scm (snix-derivation->guix-package): Use
  'gnu-package-doc-description' as the description for GNU packages.

Synchronize package descriptions with the Womb.

* gnu/packages/algebra.scm,
  gnu/packages/aspell.scm,
  gnu/packages/autotools.scm,
  gnu/packages/base.scm,
  gnu/packages/bash.scm,
  gnu/packages/bison.scm,
  gnu/packages/cdrom.scm,
  gnu/packages/cflow.scm,
  gnu/packages/compression.scm,
  gnu/packages/cpio.scm,
  gnu/packages/cppi.scm,
  gnu/packages/ddrescue.scm,
  gnu/packages/dejagnu.scm,
  gnu/packages/ed.scm,
  gnu/packages/emacs.scm,
  gnu/packages/fdisk.scm,
  gnu/packages/freeipmi.scm,
  gnu/packages/gawk.scm,
  gnu/packages/gcal.scm,
  gnu/packages/gcc.scm,
  gnu/packages/gdb.scm,
  gnu/packages/gdbm.scm,
  gnu/packages/gettext.scm,
  gnu/packages/ghostscript.scm,
  gnu/packages/global.scm,
  gnu/packages/gnunet.scm,
  gnu/packages/gnupg.scm,
  gnu/packages/gnutls.scm,
  gnu/packages/gperf.scm,
  gnu/packages/gprolog.scm,
  gnu/packages/groff.scm,
  gnu/packages/grub.scm,
  gnu/packages/gsasl.scm,
  gnu/packages/guile.scm,
  gnu/packages/gv.scm,
  gnu/packages/help2man.scm,
  gnu/packages/idutils.scm,
  gnu/packages/indent.scm,
  gnu/packages/less.scm,
  gnu/packages/libidn.scm,
  gnu/packages/libsigsegv.scm,
  gnu/packages/libunistring.scm,
  gnu/packages/lightning.scm,
  gnu/packages/linux.scm,
  gnu/packages/lsh.scm,
  gnu/packages/m4.scm,
  gnu/packages/mail.scm,
  gnu/packages/maths.scm,
  gnu/packages/multiprecision.scm,
  gnu/packages/nano.scm,
  gnu/packages/ncurses.scm,
  gnu/packages/nettle.scm,
  gnu/packages/ocrad.scm,
  gnu/packages/oggvorbis.scm,
  gnu/packages/parted.scm,
  gnu/packages/plotutils.scm,
  gnu/packages/pth.scm,
  gnu/packages/readline.scm,
  gnu/packages/recutils.scm,
  gnu/packages/rush.scm,
  gnu/packages/scheme.scm,
  gnu/packages/screen.scm,
  gnu/packages/shishi.scm,
  gnu/packages/smalltalk.scm,
  gnu/packages/system.scm,
  gnu/packages/texinfo.scm,
  gnu/packages/time.scm,
  gnu/packages/unrtf.scm,
  gnu/packages/version-control.scm,
  gnu/packages/wdiff.scm,
  gnu/packages/wget.scm,
  gnu/packages/which.scm,
  gnu/packages/xnee.scm,
  gnu/packages/zile.scm: Change value of the 'description' field to that
  of the Womb.

build: 'sync-descriptions' now compares GNU package descriptions.

* build-aux/sync-synopses.scm: Rename to...
* build-aux/sync-descriptions.scm: ... this.  Compare the value of
  'gnu-package-doc-description' and 'package-description' and report any
  mismatch.
* Makefile.am (EXTRA_DIST): Adjust accordingly.
  (sync-synopses): Rename to...
  (sync-descriptions): ... this.

gnu-maintenance: Get descriptions from 'gnumaint/pkgdescr.txt'.

* guix/gnu-maintenance.scm (%gnumaint-base-url): New variable.
  (%package-list-url): Use it.
  (%gsrc-package-list-url): Remove.
  (%package-description-url): New variable.
  (official-gnu-packages): Change to use %PACKAGE-DESCRIPTION-URL
  instead of %GSRC-PACKAGE-LIST-URL.  Adjust recutils field names
  accordingly.

Update 'TODO'.

gnu: Use the 'patches' field of <origin>.

* gnu/packages/apr.scm,
  gnu/packages/autotools.scm,
  gnu/packages/avahi.scm,
  gnu/packages/cdrom.scm,
  gnu/packages/cmake.scm,
  gnu/packages/cpio.scm,
  gnu/packages/cross-base.scm,
  gnu/packages/emacs.scm,
  gnu/packages/flex.scm,
  gnu/packages/fontutils.scm,
  gnu/packages/glib.scm,
  gnu/packages/grub.scm,
  gnu/packages/guile.scm,
  gnu/packages/idutils.scm,
  gnu/packages/libevent.scm,
  gnu/packages/linux.scm,
  gnu/packages/mail.scm,
  gnu/packages/make-bootstrap.scm,
  gnu/packages/mp3.scm,
  gnu/packages/oggvorbis.scm,
  gnu/packages/pdf.scm,
  gnu/packages/plotutils.scm,
  gnu/packages/qemu.scm,
  gnu/packages/recutils.scm,
  gnu/packages/rush.scm,
  gnu/packages/scheme.scm,
  gnu/packages/system.scm,
  gnu/packages/tcsh.scm,
  gnu/packages/valgrind.scm,
  gnu/packages/vpn.scm,
  gnu/packages/w3m: Use the 'patches' field of <origin> instead of
  adding a patch as input plus using #:patches.

packages: Add 'patches' and related fields to <origin>.

See <https://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2013-09/msg00137.html>
for the rationale.

* guix/packages.scm (<origin>)[patches, patch-flags, patch-inputs,
  patch-guile]: New fields.
  (%standard-patch-inputs, default-guile, patch-and-repack): New
  procedures.
  (package-source-derivation): When 'patches' is non-empty, call
  'patch-and-repack'.
* guix/utils.scm (file-sans-extension): New procedure.

gnu: Add Qt 5.1.1.

* gnu/packages/qt.scm (qt): New variable.

gnu: Add Cairomm.

* gnu/packages/gtk.scm (cairomm): New variable.

Update 'AUTHORS'.

* AUTHORS: Add Alex, Joshua, and Aljosha.

Augment 'TODO'.

gnu: Add alsa-utils.

* gnu/packages/linux.scm (alsa-utils): New variable.

gnu: xmlto: Keep references to libxml2, libxslt, and util-linux programs.

* gnu/packages/xml.scm (xmlto): Add 'arguments' field.
  [inputs]: Add libxml2 and libxslt.

gnu: Gracefully handle circular dependencies between 'base' and 'linux'.

* gnu/packages/base.scm (linux-libre-headers-boot0): Turn into a thunk.
  User updated.

gnu: pari-gp: Update to 2.5.5.

* gnu/packages/algebra.scm (pari-gp): Update to 2.5.5.

gnu: mutt: Add input gpgme.

* gnu/packages/mail.scm (mutt): Add input gpgme.

gnu: Add gpgme.

* gnu/packages/gnupg.scm (gpgme): New variable.

gnu: icu4c: Patch RUNPATH of libraries.

* gnu/packages/icu4c.scm (icu4c): Elf-patch RUNPATH of libraries, for instance
    of libicuuc.so.

gnu: cdparanoia: Fix links of internal libraries into binary.

* gnu/packages/cdrom.scm (cdparanoia): Use patchelf to link internal libraries
    into binary.

gnu: Add libsigc++ and glibmm.

* gnu/packages/glib.scm (libsigc++, glibmm): New variable.

gnu: gobject-introspection: Export via #:export.

* gnu/packages/glib.scm: Export 'gobject-instrospection' via the
  #:export clause.

gnu: Add freeglut, glu, and FTGL.

* gnu/packages/gl.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: ao: Build PulseAudio back-end.

* gnu/packages/oggvorbis.scm (ao): Add PulseAudio as an input.

gnu: oggvorbis: Use #:export clause.

* gnu/packages/oggvorbis.scm: Use #:export clause instead of
  'define-public'.

gnu: pulseaudio: Add dependency on libcap.

* gnu/packages/pulseaudio.scm (pulseaudio): Add dependency on libcap.

gnu: Add libcap.

* gnu/packages/linux.scm (libcap): New variable.

download: Add Debian mirrors.

* guix/download.scm (%mirrors)[debian]: New set of mirrors.

gnu: gnupg: Upgrade to 2.0.22.

* gnu/packages/gnupg.scm (gnupg): Update to 2.0.22. This release fixes
  security issue CVE-2013-4402 in the OpenPGP packet parser.

gnu: Add PulseAudio and related libraries.

* gnu/packages/pulseaudio.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: Add FFTW.

* gnu/packages/algebra.scm (fftw): New variable.

gnu: Add libxkbcommon.

* gnu/packages/qt.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: xorg: Add xcb-util-renderutil.

* gnu/packages/xorg.scm (xcb-util-renderutil): New variable.

gnu: xorg: Add xcb-util-keysyms.

* gnu/packages/xorg.scm (xcb-util-keysyms): New variable.

gnu: xorg: Add xcb-util-image.

* gnu/packages/xorg.scm (xcb-util-image): New variable.

gnu: xorg: Add xcb-util.

* gnu/packages/xorg.scm (xcb-util): New variable.
* gnu/packages/xorg.scm (xcb-util-wm): Expand the description.

gnu: xorg: Add xcb-util-wm.

* gnu/packages/xorg.scm (xcb-util-wm): New variable.

gnu: Add Netcat.

* gnu/packages/system.scm (netcat): New variable.

monads: Allow resolution of a monad's bind/return at expansion time.

* guix/monads.scm (<monad>): Turn in a raw SRFI-9 record type.
  (define-monad): New macro.
  (with-monad): Add a case for when MONAD is a macro.
  (identity-return, identity-bind, store-return, store-bind): Inline.
  (%identity-monad, %store-monad): Use 'define-monad'.
* tests/monads.scm ("monad?"): New test.

gnu: vm: Rewrite helper functions as monadic functions.

* gnu/system/dmd.scm (host-name-service, nscd-service, mingetty-service,
  syslog-service, guix-service, static-networking-service): Rewrite as
  monadic functions.
  (dmd-configuration-file): Use 'text-file' instead of
  'add-text-to-store'.
* gnu/system/grub.scm (grub-configuration-file): Rewrite as a monadic
  function.
* gnu/system/linux.scm (pam-services->directory): Likewise.
* gnu/system/shadow.scm (group-file, passwd-file, guix-build-accounts):
  Likewise.
* gnu/system/vm.scm (expression->derivation-in-linux-vm, qemu-image,
  union, system-qemu-image): Likewise.

Add (guix monads).

* guix/monads.scm: New file.
* tests/monads.scm: New file.
* Makefile.am (MODULES): Add guix/monads.scm.
  (SCM_TESTS): Add tests/monads.scm.
* doc/guix.texi (The Store Monad): New node.
  (The Store): Reference it.

gnu: libxcb: Enable xcb-xkb.

* gnu/packages/xorg.scm (libxcb): Add configure flag "--enable-xkb".

gnu: gnome: Add brasero.

* gnu/packages/gnome.scm (brasero): New variable; not totally usable due to
    lacking inputs.

gnu: Add hicolor-icon-theme.

* gnu/packages/gnome.scm (hicolor-icon-theme): New variable.

gnu: gnome: Add gnome-icon-theme.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-icon-theme): New variable.

gnu: Add icon-naming-utils.

* gnu/packages/gnome.scm (icon-naming-utils): New variable.

gnu: Add perl-xml-simple.

* gnu/packages/xml.scm (perl-xml-simple): New variable.

gnu: gnome: Add gsettings-desktop-schemas.

* gnu/packages/gnome.scm (gsettings-desktop-schemas): New variable.

gnu: xnee: Drop input gtk+.

* gnu/packages/xnee.scm (xnee): Drop unused input gtk+.

gnu: itstool: Really push the modification announced in 9000d556.

* gnu/packages/glib.scm (itstool): Do as announced in 9000d556.

gnu: itstool: Add propagated inputs python-2 and libxml2.

* gnu/packages/glib.scm (itstool): Add propagated input python-2; it is needed
    to rewrite the shebang in the output python script and must be propagated
    so that PYTHONPATH gets set when using itstool; and libxml2, imported as a
    module by the script.

gnu: Add libcanberra.

* gnu/packages/libcanberra.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: libvorbis: Propagate input libogg.

* gnu/packages/oggvorbis.scm (libvorbis): Propagate input libogg, as
    stipulated by the pkg-config files.

gnu: gnome: Add libnotify.

* gnu/packages/gnome.scm (libnotify): New variable.

gnu: racket: Revert input from gtk+-3 to gtk+-2.

* gnu/packages/scheme.scm (racket): Revert input from gtk+-3 to gtk+-2.

gnu: gtk+: Propagate inputs.

* gnu/packages/gtk.scm (gtk+): Propagate inputs at-spi2-atk, libxi and
    libxinerama.

gnu: Revert inputs from gtk+-3 to gtk+-2.

* gnu/packages/cdrom.scm (dvdisaster): Replace input gtk+ by gtk+-2.
* gnu/packages/emacs.scm (emacs): Replace input gtk+ by gtk+-2.
* gnu/packages/geeqie.scm (geeqie): Replace input gtk+ by gtk+-2.
* gnu/packages/gkrellm.scm (gkrellm): Replace input gtk+ by gtk+-2.
* gnu/packages/mp3.scm (ripperx): Replace input gtk+ by gtk+-2.
* gnu/packages/scheme.scm: Drop duplicate inclusion of module gtk.

gnu: gtk+-2: Update to 2.24.21.

* gnu/packages/gtk.scm (gtk+-2): Update to 2.24.21, add inputs perl and
    python.

gnu: Add Gtk+ 3.

* gnu/packages/gtk.scm (gtk+): Switch to version 3.10.0.
* gnu/packages/gtk.scm (gtk+-2): New name for version 2.24.20.

gnu: Drop gtk+-3, erroneously pushed in the previous commit.

* gnu/packages/gtk.scm (gtk+-3): Delete variable.

gnu: Add at-spi2-atk.

* gnu/packages/gtk.scm (at-spi2-atk): New variable.

gnu: atk: Update to 2.10.0.

* gnu/packages/gtk.scm (atk): Update to 2.10.0.

gnu: Add at-spi2-core.

* gnu/packages/gtk.scm (at-spi2-core): New variable.

gnu: libxi: Propagate inputs inputproto and libx11.

* gnu/packages/xorg.scm (libxi): Propagate inputs inputproto and libx11,
    as stipulated by xi.pc.

gnu: glib: Update to 2.38.0.

* gnu/packages/glib.scm (glib): Update to 2.38.0 and drop rewriting of GTESTER.
* gnu/packages/patches/glib-tests-homedir.patch: Update patch for 2.38.0.
* gnu/packages/patches/glib-tests-desktop.patch: Update patch for 2.38.0 and
    drop test dbus-appinfo.

gnu: Add gobject-introspection.

* gnu/packages/glib.scm (gobject-introspection): New variable.

gnu: git: Add graphical tools to the "gui" output.

* gnu/packages/version-control.scm (git): Add "gui" output.  Add Tcl/Tk
  as inputs.  Add #:configure-flags.  Augment 'split' phase to handle
  graphical user interfaces.

gnu: git: Do not retain reference from "out" to Subversion.

* gnu/packages/version-control.scm (git): Wrap 'git-svn', not 'git', for
  PERL5LIB and LD_LIBRARY_PATH.

Add httpd

* gnu/packages/web.scm (httpd): New variable
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: bzip2: Allow cross-compilation.

Reported by Nikita Karetnikov <nikita@karetnikov.org>.

* gnu/packages/compression.scm (bzip2): Add 'set-cross-environment'
  phase for cross-compilation.

gnu: git: Add "svn" output for 'git-svn'.

* gnu/packages/version-control.scm (git): Add SUBVERSION as an input.
  Add 'split' phase.

gnu: subversion: Install Perl bindings.

* gnu/packages/version-control.scm (subversion): Add
  'install-perl-bindings' phase.

gnu: Add SWIG.

* gnu/packages/swig.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: libmicrohttpd: Update to 0.9.30.

* gnu/packages/gnunet.scm (libmicrohttpd): Update to 0.9.30.

gnu: flex: Use Bison 2.7 for tests.

* gnu/packages/bison.scm (bison): Move FLEX to 'inputs', and remove the
  hack that turned off its test suite.
* gnu/packages/flex.scm (flex): Add 'bison-for-tests' in 'inputs', and
  use that to run the tests.

Update 'pt_BR.po'.

gnu: Add Skribilo.

* gnu/packages/skribilo.scm (skribilo): New variable.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: Add Guile-Cairo.

* gnu/packages/gtk.scm (guile-cairo): New variable.

gnu: xorriso: Update to 1.3.2.

* gnu/packages/cdrom.scm (xorriso): Update to 1.3.2.

gnu: lightning: Update to 2.0.1.

* gnu/packages/lightning.scm (lightning): Update to 2.0.1.

gnu: freeipmi: Update to 1.3.2.

* gnu/packages/freeipmi.scm (freeipmi): Update to 1.3.2.

gnu: gdb: Update to 7.6.1.

* gnu/packages/gdb.scm (gdb): Update to 7.6.1.

gnu: bison: Update to 3.0.

* gnu/packages/bison.scm (bison): Update to 3.0.  Make Perl a native
  input.  Add a variant of Flex as a native input.  Use #:export instead
  of 'define-public'.
* gnu/packages/flex.scm (flex): Use #:export instead of 'define-public'.

gnu: units: Update to 2.02.

* gnu/packages/maths.scm (units): Update to 2.02.

gnu: texinfo: Update to 5.2.

* gnu/packages/texinfo.scm (texinfo): Update to 5.2.

gnu: global: Update to 6.2.9.

* gnu/packages/global.scm (global): Update to 6.2.9.

build: Bump version to 0.5.

* configure.ac: Switch to 0.5.

gnu: guix: Update to 0.4.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 0.4.
  (guix-0.4): Remove.
* gnu/system/vm.scm (qemu-image, system-qemu-image): Use GUIX instead of
  GUIX-0.4.

gnu: vm: Remove erroneous store reference.

* gnu/system/vm.scm (system-qemu-image): Remove reference from BOOT to
  MINGETTY since MINGETTY may not be valid yet.

Update '.po' files.

gnu: vm: Add more packages to the profile.

* gnu/system/vm.scm (system-qemu-image): Add grep, sed, and Findutils to
  the profile.