gnu: ghc-regex-posix: Propagate inputs.

* gnu/packages/haskell.scm (ghc-regex-posix): Propagate ghc-regex-base
  input.

gnu: Add ghc-test-framework-hunit.

* gnu/packages/haskell.scm (ghc-test-framework-hunit): New variable.

gnu: Add ghc-test-framework.

* gnu/packages/haskell.scm (ghc-test-framework): New variable.

gnu: Add ghc-libxml.

* gnu/packages/haskell.scm (ghc-libxml): New variable.

gnu: Add ghc-hostname.

* gnu/packages/haskell.scm (ghc-hostname): New variable.

gnu: tilda: Update to 1.3.0.

* gnu/packages/terminals.scm (tilda): Update to 1.3.0.
[inputs]: Switch vte from 0.36 to 0.40, remove zip.

gnu: youtube-dl: Update to 2015.11.18.

* gnu/packages/video.scm (youtube-dl): Update to 2015.11.18.

gnu: libsndfile: Add fixes for CVE-2014-9496 and CVE-2015-7805.

* gnu/packages/patches/libsndfile-CVE-2014-9496.patch,
  gnu/packages/patches/libsndfile-CVE-2015-7805.patch: New files.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add them.
* gnu/packages/pulseaudio.scm (libsndfile)[source]: Add patches.

gnu: libxslt: Add fix for CVE-2015-7995.

* gnu/packages/patches/libxslt-CVE-2015-7995.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/xml.scm (libxslt)[source]: Add patch.

gnu: libxml2: Add fixes for CVE-2015-{1819,7941,7942,8035} and other bugs.

* gnu/packages/patches/libxml2-CVE-2015-1819.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-CVE-2015-7941-pt1.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-CVE-2015-7941-pt2.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-CVE-2015-7942-pt1.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-CVE-2015-7942-pt2.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-CVE-2015-8035.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-737840.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-738805.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-746048.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-747437.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-751603.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-751631.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-754946.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-754947.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-bug-755857.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-fix-catalog-corruption.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-id-attrs-in-xmlSetTreeDoc.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-node-sort-order-pt1.patch,
  gnu/packages/patches/libxml2-node-sort-order-pt2.patch: New files.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add them.
* gnu/packages/xml.scm (libxml2)[source]: Add patches.

gnu: libpng: Update to 1.5.24 [fixes CVE-2015-8126].

* gnu/packages/image.scm (libpng): Update to 1.5.24.

Revert "gnu: libpng: Use 1.5.24 as a replacement [fixes CVE-2015-8126]."

This reverts commit 1b076e630f4a7245d14634b047e1d1a91ee2659e.

services: Export udev-configuration procedures.

* gnu/services/base.scm (udev-configuration, udev-configuration?,
  udev-configuration-rules): Export.

gnu: weechat: Fix patching of assignments to 'python2_bin'.

Fixes a regression introduced in a9346fa.

* gnu/packages/weechat.scm (weechat)[arguments]: Make sure PYTHON2_BIN
  can be freed with 'free'.

gnu: weechat: Encode as UTF-8.

* gnu/packages/weechat.scm: Reencode as UTF-8.

gnu: weechat: Record the absolute file name of 'python'.

Fixes <http://bugs.gnu.org/21879>.
Reported by Luis Felipe López Acevedo <felipe.lopez@openmailbox.org>.

* gnu/packages/weechat.scm (weechat)[arguments]: Add
  'set-python-file-name' phase.

gnu: weechat: Use 'modify-phases'.

* gnu/packages/weechat.scm (weechat)[arguments]: Use 'modify-phases'.
  Remove 'fix-file' phase.

gnu: python-tornado: Use the preferred home-page.

* gnu/packages/python.scm (python-tornado)[home-page]: Use the preferred
  one.

gnu: python-cryptography: Update to 1.0.2.

* gnu/packages/python.scm (python-cryptography): Update to 1.0.2.

gnu: python-cryptography-vectors: Update to 1.0.2.

* gnu/packages/python.scm (python-cryptography-vectors): Update to 1.0.2.

gnu: zynaddsubfx: Update to 2.5.2.

* gnu/packages/music.scm (zynaddsubfx): Update to 2.5.2.

gnu: Add python-pystache.

* gnu/packages/python.scm (python-pystache, python2-pystache): New
  variables.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

Revert "gnu: wget: Update to 1.17."

This reverts commit 4ca02340691624316330619fc6fec5a5e68e00b7.

gnu: Add network-manager-applet.

* gnu/packages/gnome.scm (network-manager-applet): New variable.

gnu: Add network-manager.

* gnu/packages/gnome.scm (%network-manager-glib-duplicate-test-patch)
(network-manager): New variables.

gnu: youtube-dl: Update to 2015.11.15.

* gnu/packages/video.scm (youtube-dl): Update to 2015.11.15.

Thank Chris.

ftp-client: Restrict to TCP/IP connections.

Fixes <http://bugs.gnu.org/21925>.
Regression introduced in 279ec1d.
Reported by Chris Marusich <cmmarusich@gmail.com>.

* guix/ftp-client.scm (ftp-open): Restrict sockets to
  SOCK_STREAM/IPPROTO_IP.

gnu: Add Scribus.

* gnu/packages/scribus.scm: New file
* gnu/packages/patches/scribus-qobject.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES, dist_patch_DATA): Add them.

gnu: Add GraphicsMagick.

* gnu/packages/imagemagick.scm (graphicsmagick): New variable.

gnu: Add prefix to license imports in (gnu packages imagemagick).

* gnu/packages/imagemagick.scm: Import (guix licenses) with prefix
  "license:".

gnu: Add ppp.

* gnu/packages/samba.scm (ppp): New variable.

gnu: wget: Update to 1.17.

* gnu/packages/wget.scm (wget): Update to 1.17.

gnu: dovecot: Update to 2.2.19.

* gnu/packages/mail.scm (dovecot): Update to 2.2.19.

gnu: eigen: Run 'ctest' in verbose mode.

* gnu/packages/algebra.scm (eigen)[arguments]: Add "-V" in
  'EIGEN_CTEST_ARGS'.

gnu: eigen: Use 'modify-phases'.

* gnu/packages/algebra.scm (eigen)[arguments]: Use 'modify-phases'
  instead of 'alist-cons-before'.

gnu: eigen: Fix 'Cflags' value in 'eigen3.pc'.

* gnu/packages/algebra.scm (eigen)[source]: Augment snippet to address
  <http://eigen.tuxfamily.org/bz/show_bug.cgi?id=1114>.

gnu: Add love.

* gnu/packages/game-development.scm (love): New variable.

gnu: Add devil.

* gnu/packages/image.scm (devil): New variable.
* gnu/packages/patches/devil-fix-libpng.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add it.

graft: Graft files in parallel.

* guix/build/graft.scm (rewrite-directory): Use 'n-par-for-each' instead
  of 'for-each'.

graft: Graft files in a deterministic order.

* guix/build/graft.scm (rewrite-directory)[rewrite-leaf]: Change to take
  a single parameter.  Add call to 'lstat'.  Factorize result of
  'destination'.
  Use 'find-files' instead of 'file-system-fold'.

gnu: Add tilda.

* gnu/packages/terminals.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: vte: Provide 0.36.5.

* gnu/packages/gnome.scm (vte): Add version 0.36.5.

gnu: mpv: Remove lua configure hack.

* gnu/packages/video.scm (mpv)[arguments]: Remove obsolete code that
  helped configure find lua.

gnu: mpv: Update to 0.13.0.

* gnu/packages/video.scm (mpv): Update to 0.13.0.

gnu: Add r-devtools.

* gnu/packages/statistics.scm (r-devtools): New variable.

gnu: Add r-rstudioapi.

* gnu/packages/statistics.scm (r-rstudioapi): New variable.

gnu: Add r-git2r.

* gnu/packages/statistics.scm (r-git2r): New variable.

gnu: Add r-httr.

* gnu/packages/statistics.scm (r-httr): New variable.

gnu: Add r-roxygen2.

* gnu/packages/statistics.scm (r-roxygen2): New variable.

gnu: Add r-brew.

* gnu/packages/statistics.scm (r-brew): New variable.

gnu: Add r-whisker.

* gnu/packages/statistics.scm (r-whisker): New variable.

gnu: Add r-rversions.

* gnu/packages/statistics.scm (r-rversions): New variable.

gnu: Add r-xml2.

* gnu/packages/statistics.scm (r-xml2): New variable.

gnu: Add r-curl.

* gnu/packages/web.scm (r-curl): New variable.

emacs: 'display-search-paths' now takes a list of profiles.

Fixes a regression introduced in fc2d233.

* emacs/guix-main.scm (process-package-actions): Make second argument to
  'display-search-paths' a list.

gnu: images: Add jpegoptim 1.4.3

* gnu/packages/images.scm (jpegoptim): New variable jpegoptim

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: libpng: Use 1.5.24 as a replacement [fixes CVE-2015-8126].

Reported by Leo Famulari <leo@famulari.name>.

* gnu/packages/image.scm (libpng-urls): New procedure.
  (libpng)[source]: Use it.
  [replacement]: New field.
  (libpng-1.5.24): New variable.

gnu: gnucash: Update to 2.6.9.

* gnu/packages/gnucash.scm (gnucash): Update to 2.6.9.
  [home-page]: Update.

gnu: pari-gp: Update to 2.7.5.

* gnu/packages/algebra.scm (pari-gp): Update to 2.7.5.

gnu: enlightenment: Update to 0.19.13.

* gnu/packages/enlightenment.scm (enlightenment): Update to 0.19.13.

gnu: evas-generic-loaders: Update to 1.16.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (evas-generic-loaders): Update to
  1.16.0.

gnu: emotion-generic-players: Update to 1.16.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (emotion-generic-players): Update to
  1.16.0.

gnu: elementary: Update to 1.16.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (elementary): Update to 1.16.0.

gnu: efl: Update to 1.16.0.

* gnu/packages/enlightenment.scm (efl): Update to 1.16.0.

gnu: youtube-dl: Update to 2015.11.13.

* gnu/packages/video.scm (youtube-dl): Update to 2015.11.13.

gnu: sudo: Build sequentially.

Possibly fixes <http://bugs.gnu.org/21918>.

* gnu/packages/admin.scm (sudo)[arguments]: Add #:parallel-build? #f.

gnu: Add guile-sly.

* gnu/packages/guile.scm (guile-sly): New variable.

gnu: calf: Update tarball URL.

* gnu/packages/audio.scm (calf)[source]: Use tarball from new project
  website instead of sourceforge.

gnu: eigen: Update to 3.2.7.

* gnu/packages/algebra.scm (eigen): Upgrade to 3.2.7.
  [source]: Add 'file-name' field.

gnu: mit-krb5: Add fixes for CVE-2015-{2695,2696,2697,2698}.

* gnu/packages/patches/mit-krb5-CVE-2015-2695-pt1.patch,
  gnu/packages/patches/mit-krb5-CVE-2015-2695-pt2.patch,
  gnu/packages/patches/mit-krb5-CVE-2015-2696.patch,
  gnu/packages/patches/mit-krb5-CVE-2015-2697.patch,
  gnu/packages/patches/mit-krb5-CVE-2015-2698-pt1.patch,
  gnu/packages/patches/mit-krb5-CVE-2015-2698-pt2.patch: New files.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add them.
* gnu/packages/mit-krb5.scm (mit-krb5)[native-inputs]: Add patches.

gnu: mit-krb5: Refactor build code; support multiple patches.

* gnu/packages/mit-krb5.scm (mit-krb5)[source]: Use version-major+minor.
  [arguments]: Use modify-phases.  Split and rewrite 'unpack' phase into
  'unpack', 'apply-patches', and 'enter-source-directory' phases.  Add a
  'pre-check' phase instead of replacing the 'check' phase.  Combine
  substitutions on the same file.  In the 'unpack' phase, find
  native-inputs with names starting with "patch/" and apply them all.
  Print a message for each patch applied.  Do not rely on the result of
  'chdir', which is unspecified.  Determine the names of the inner tar
  file and the directory in a more robust way.  Add (ice-9 ftw),
  (ice-9 match) and (srfi srfi-1) to #:modules.

gnu: mit-krb5: Update to 1.13.2.

* gnu/packages/mit-krb5.scm (mit-krb5): Update to 1.13.2.
  [native-inputs]: Remove "patch/init-fix".
* gnu/packages/patches/mit-krb5-init-fix.patch: Delete file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Remove it.

gnu: Adjust formatting as recommended by 'guix lint'.

* gnu/packages/aidc.scm (barcode, qrencode),
  gnu/packages/bash.scm (bash, bash-completion),
  gnu/packages/busybox.scm (busybox),
  gnu/packages/cdrom.scm (cdparanoia),
  gnu/packages/cmake.scm (cmake),
  gnu/packages/conkeror.scm (conkeror),
  gnu/packages/cook.scm (cook),
  gnu/packages/curl.scm (curl),
  gnu/packages/docbook.scm (docbook-xsl),
  gnu/packages/enlightenment.scm (enlightenment),
  gnu/packages/games.scm (abbaye),
  gnu/packages/geeqie.scm (exiv2),
  gnu/packages/gimp.scm (gegl),
  gnu/packages/gl.scm (glu, freeglut, ftgl),
  gnu/packages/glib.scm (glib),
  gnu/packages/gnome.scm (orbit2, gconf, geocode-glib),
  gnu/packages/gstreamer.scm (gstreamer, gst-plugins-base),
  gnu/packages/linux.scm (util-linux),
  gnu/packages/lisp.scm (gcl, ecl),
  gnu/packages/maths.scm (gnuplot, hdf5),
  gnu/packages/ssh.scm (dropbear),
  gnu/packages/web.scm (json-c): Remove tabulations and trailing
  white spaces or reformat to fit within 80 columns.
* gnu/packages/audio.scm (aubio),
  gnu/packages/emacs.scm (emacs-s),
  gnu/packages/engineering.scm (geda-gaf),
  gnu/packages/games.scm (dosbox),
  gnu/packages/gnome.scm (gusb),
  gnu/packages/gtk.scm (gtk+),
  gnu/packages/guile.scm (guile-wisp),
  gnu/packages/hurd.scm (hurd-headers),
  gnu/packages/wm.scm (i3-wm): Adjust synopsis or description.

gnu: upower: Update to 0.99.3.

* gnu/packages/gnome.scm (upower): Update to 0.99.3.

gnu: upower: Enable GObject introspection.

* gnu/packages/gnome.scm (upower)[native-inputs]: Add gobject-introspection.

gnu: gcr: Update to 3.18.0, enable introspection.

* gnu/packages/gnome.scm (gcr): Update to 3.18.0.
  [native-inputs]: Add gobject-introspection and libxslt.

gnu: nix: Don't propagate Perl libraries.

* gnu/packages/package-management.scm (nix): Move perl-www-curl,
  perl-dbi and perl-dbd-sqlite from 'propagated-inputs' to 'inputs'.
  [arguments]: Add #:configure-flags.

gnu: nix: Update to 1.10.

* gnu/packages/package-management.scm (nix): Update to 1.10.

lint: Have connections time out after 3 seconds.

* guix/scripts/lint.scm (probe-uri): Add #:timeout parameter.  Pass it
  to 'open-connection-for-uri' and 'ftp-open'.
  (validate-uri): Pass #:timeout 3 to 'probe-uri'.

download: Always use AI_ADDRCONFIG when resolving host names.

* guix/build/download.scm (open-socket-for-uri): Always pass
  AI_ADDRCONFIG to 'getaddrinfo' as recommended in the fine Guile
  manual.
* guix/ftp-client.scm (ftp-open): Ditto.

download: Add timeout parameter for connections.

* guix/build/download.scm (ensure-uri): New procedure.
(current-http-proxy): New variable.
(open-socket-for-uri): Copy from Guile commit aaea5b2, but add #:timeout
parameter and use 'connect*' instead of 'connect'.
(open-connection-for-uri): Add #:timeout parameter and pass it to
'open-socket-for-uri'.

ftp-client: Add timeout parameter to 'ftp-open'.

* guix/ftp-client.scm (catch-EINPROGRESS): New macro.
(connect*): New procedure.
(ftp-open): Add #:timeout parameter.  Use 'connect*' instead of
'connect' and pass it TIMEOUT.

ftp-client: Restrict to TCP connections.

* guix/ftp-client.scm (ftp-open): Force SOCK_STREAM as the socket type
  to avoid calling 'connect' on a datagram socket.

emacs: Adjust 'guix environment' popup.

* emacs/guix-command.el (guix-command-improve-environment-argument): Use
  "E" for '--expose' and "S" for '--share' to distinguish them from
  '--expression' and '--system' accordingly.  Make '--ad-hoc' an option
  taking packages instead of a simple switch.
  (guix-command-rest-argument): Complete shell command instead of
  packages for '--' argument.
  (guix-command-additional-arguments): Add fake 'packages' argument.
  New variable.
  (guix-command-additional-arguments): Use it.
  (guix-command-post-process-environment-packages,
  guix-command-post-process-environment-ad-hoc): New functions.
  (guix-command-post-processors): Add "environment" command with the new
  argument processors.

emacs: Adjust 'guix container' popup.

* emacs/guix-command.el (guix-command-improve-action-argument): Use "C"
  key for 'container' action to distinguish it from 'challenge'.
  (guix-command-rest-argument): Add positional arguments.

emacs: Improve post processing of popup arguments.

* emacs/guix-command.el (guix-command-switches,
  guix-command-rest-arg-regexp): New variables.
  (guix-command-post-processors,
  guix-command-post-process-matching-args,
  guix-command-post-process-rest-single,
  guix-command-post-process-rest-multiple,
  guix-command-post-process-rest-multiple-leave,
  guix-command-post-process-package-args): New functions.
  (guix-command-post-process-rest-multiple): Take 2 arguments.
  (guix-command-define-popup-action): Adjust accordingly.
* emacs/guix-utils.el (guix-modify): New function.

Revert "gnu: libvpx: Update to 1.5.0."

This reverts commit fb3f69394a139fca0d60efb49843599fcc2e6e28.

gnu: mupen64plus-core: Add comment.

* gnu/packages/games.scm (mupen64plus-core): Comment the reason for the
  supported-systems field.

gnu: mupen64plus-core: Specify supported-systems.

* gnu/packages/games.scm (mupen64plus-core): Specify supported-systems.

gnu: Add inklingreader.

* gnu/packages/inklingreader.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

Signed-off-by: Mathieu Lirzin <mthl@gnu.org>

gnu: gsl: Update to 2.1.

* gnu/packages/maths.scm (gsl): Update to 2.1.

gnu: Add c-ares.

* gnu/packages/aria2.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: Add owncloud-client.

* gnu/packages/owncloud.scm (owncloud-client): New variable.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: Add qtkeychain.

* gnu/packages/qt.scm (qtkeychain): New variable.

gnu: libvpx: Update to 1.5.0.

* gnu/packages/video.scm (libvpx): Update to 1.5.0.

gnu: mosaik: Build only on x86_64.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (mosaik)[supported-systems]: Add
  field.

gnu: sudo: Upgrade to 1.8.15 [fixes CVE-2015-5602].

* gnu/packages/admin.scm (sudo)[arguments]: Add CPPFLAGS to
  #:configure-flags.   In 'pre-configure' phase, modify
  'sudo_usage.h.in'.  Add pattern to remove '-o 0 -g 0' installation
  flag in 'Makefile.in', and remove pattern for '-O 0 -G 0'.  Remove
  modifications of 'configure'.

gnu: Add caribou.

* gnu/packages/gnome.scm (caribou): New variable.

gnu: Add evolution-data-server.

* gnu/packages/gnome.scm (evolution-data-server): New variable.