gnu: libvirt: Update to 7.2.0.

* gnu/packages/virtualization.scm (libvirt): Update to 7.2.0.
[arguemnts]: Switch to meson, only build system supported by upstream.
[inputs]: Add libssh2 and readline.
[native-inputs]: Add bash-completion, gettext, python-docutils and
rpcsvc-proto.
* gnu/packages/patches/libvirt-add-install-prefix.patch: New file...
* gnu/local.mk: ...add it.
* gnu/packages/patches/libvirt-create-machine-cgroup.patch: Delete file,
merged by upstream.

Tested-by: Pierre Langlois <pierre.langlois@gmx.com>

gnu: libvirt: Enable disk and directory storage.

* gnu/packages/virtualization.scm (libvirt)[inputs]: Add parted.
[arguments]: Add configure flags to support disk and directory storage.

tests: libvirt: Catch issues with incorrect /var and /etc in package.

* gnu/tests/virtualization.scm (run-libvirt-test): Chdir to "/tmp" before
running test.  Add "connect" test.

gnu: crypto++: Update to 8.5.0.

* gnu/packages/crypto.scm (crypto++): Update to 8.5.0.
[origin]: Use git-fetch and git-reference.

gnu: chez-scheme: simplify packaging

Take advantage of patches that have been accepted upstream.
These changes lay a foundation for reusing more of Chez's
build process for Racket.

* gnu/packages/patches/chez-scheme-build-util-paths-backport.patch:
New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/chez.scm (chez-scheme)[source](patches): Use it.
[source](snippet): Remove bundled libraries here, not in configure phase.
[inputs]: Organize. Move "nanopass", "stex", and "xorg-rgb" to ...
[native-inputs]: ... this field.
[arguments]: Add (ice-9 ftw) to #:modules. Remove unneeded
'patch-processor-detection' phase. Add 'unpack-nanopass+stex' phase
(refactored from 'configure'). Simplify 'configure' phase by removing
patches that have been upstreamed. Add "--nogzip-man-pages" flag so we can
remove 'make-manpages-writable' phase. Stop ignoring #:configure-flags,
move "--threads" there, and remove unneeded workaround. Add 'prepare-stex'
phase (refactored from 'install-doc'). Use it to streamline 'install-doc'
phase, installing all of the right files into the right places.

Signed-off-by: Leo Prikler <leo.prikler@student.tugraz.at>

gnu: chez-scheme: Update stex.

Get a patch from upstream that will help us simplify the build process
for the Chez Scheme documentation.

* gnu/packages/chez.scm (chez-stex): Update to commit 5405149.

Signed-off-by: Leo Prikler <leo.prikler@student.tugraz.at>

gnu: chez-scheme: Update nanopass to 1.9.2.

* gnu/packages/chez.scm (nanopass): Update nanopass to 1.9.2.

Signed-off-by: Leo Prikler <leo.prikler@student.tugraz.at>

gnu: perl-net-cidr-lite: Update to 0.22 [security fixes].

* gnu/packages/networking.scm (perl-net-cidr-lite): Update to 0.22.

gnu: go-github-com-puerkitobio-goquery: Adjust inputs.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-puerkitobio-goquery)
[native-inputs]: Move all inputs ...
[propagated-inputs]: ... to here.

gnu: suitesparse: Update to 5.9.0.

* gnu/packages/maths.scm (suitesparse): Update to 5.9.0.
[arguments]: Use cc-for-target instead of hard-coding gcc.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: Add cl-umbra.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-umbra, cl-umbra, ecl-umbra): New variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Add cl-shadow.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-shadow, cl-shadow, ecl-shadow): New
  variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Add cl-cpus.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-cl-cpus, cl-cpus, ecl-cl-cpus): New
  variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: sbcl-golden-utils: Update to 0.0.0-2.62a5cb9.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-golden-utils): Update to 0.0.0-2.62a5cb9.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Fix copyright symbol.

* gnu/packages/crates-io.scm: Fix copyright line for Zheng Junjie.

Signed-off-by: Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>

doc: Use the shell dollar substitution.

See:
https://unix.stackexchange.com/questions/126927/have-backticks-i-e-cmd-in-sh-shells-been-deprecated

* doc/guix.texi: Replace the shell backquote deprecated substitution by the
dollar one.

doc: Reorder "Channels with Substitutes".

Ordering consistency introduced by 12871cc8db701a89f7f64303e1f16a8537a12561.

* doc/guix.texi (Channels): Move section "Channels with Substitutes".
Update the master menu.

gnu: sloccount: Update source URL.

* gnu/packages/code.scm (sloccount)[source, home-page]: Update.

gnu: libffi: Add 'release-monitoring-url'.

* gnu/packages/libffi.scm (libffi)[home-page]: Change to sourceware.org.
[properties]: New field.

gnu: mpg321: Update source URL.

* gnu/packages/mp3.scm (mpg321)[source]: Update URL to match what's on
SourceForge.  Add 'file-name'.

gnu-maintenance: Recognize more source tarball naming schemes.

* guix/gnu-maintenance.scm (%package-name-rx): Add ".src" and ".orig"
suffixes.
* tests/gnu-maintenance.scm ("release-file?"): Add mpg321 and bvi
examples.
("tarball->version"): New test.

utils: 'tarball-sans-extension' recognizes ".tgz".

* guix/utils.scm (tarball-sans-extension): Add ".tgz".

gnu-maintenance: Remove unused procedure.

* guix/gnu-maintenance.scm (savannah-package?): Remove.

gnu: file: Add 'release-monitoring-url' property.

* gnu/packages/file.scm (file)[properties]: New field.

gnu: ncftp: Add 'release-monitoring-url' property.

* gnu/packages/ftp.scm (ncftp)[properties]: New field.

gnu-maintenance: 'generic-html' updates packages with the right property.

* guix/gnu-maintenance.scm (html-updatable-package?): Return true for
packages with a 'release-monitoring-url' property.  This allows us to
cater for packages with source fetched over, say, FTP, but with an HTML
page to monitor.

gnu: go-github-com-sirupsen-logrus: Update to 1.8.1.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-sirupsen-logrus): Update to
1.8.1.
[propagated-inputs]: Add go-github-com-davecgh-go-spew,
go-github-com-pmezard-go-difflib. Sort alphabetically.
[arguments]: Enable test suite.

import: go: Replace underscores with hyphens in package names.

As per section '16.4.2 Package Naming' in the manual, use hypens instead
of underscores in package names.

* guix/import/go.scm (go-module->guix-package-name): Replace underscores
with hyphens.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

doc: Remind developers to build Guix.

The previous instructions were correct, but we got too many bug reports
with a root cause of "did not build Guix yet".

Other parts of the manual already instruct `make && make check`, so this
makes the treatment of building Guix more consistent, too.

* doc/contributing.texi (Building from Git): Instruct the user to run
`make` when building Guix.

gnu: drumstick: Use new HTTPS home page.

* gnu/packages/music.scm (drumstick)[home-page]: Update & use HTTPS.

gnu: perl-path-tiny: Update to 0.118.

* gnu/packages/perl.scm (perl-path-tiny): Update to 0.118.

gnu: vmpk: Update to 0.8.2.

* gnu/packages/music.scm (vmpk): Update to 0.8.2.

gnu: drumstick: Update to 2.1.1.

* gnu/packages/music.scm (drumstick): Update to 2.1.1.

gnu: drumstick: Remove unused ‘-DLIB_SUFFIX=’.

* gnu/packages/music.scm (drumstick)[arguments]:
Remove #:configure-flags.

gnu: ugrep: Update to 3.1.11.

* gnu/packages/search.scm (ugrep): Update to 3.1.11.

gnu: corkscrew: Update to 2.0-0.268b71e.

* gnu/packages/ssh.scm (corkscrew)[source]: Fetch from elsewhere.
[arguments]: Add #:configure-flags of ‘--enable-ssl’.
Add a new 'update-metadata phase.  Remove the custom 'configure phase.
[native-inputs]: Add autoconf, automake, and pkg-config.
[inputs]: Add openssl.
[description]: Update accordingly.

gnu: perl-pdf-api2: Update to 2.039.

* gnu/packages/perl.scm (perl-pdf-api2): Update to 2.039.

gnu: perl-moose: Update to 2.2015.

* gnu/packages/perl.scm (perl-moose): Update to 2.2015.

news: Add 'de' translation.

* etc/news.scm: Add German translation of user activation entry.

gnu: zabbix-agentd: Update to 5.2.6 [fixes CVE-2021-27927].

* gnu/packages/monitoring.scm (zabbix-agentd): Update to 5.2.6.

news: Clarify time window for account activation vulnerability.

* etc/news.scm: Tweak wording about skeleton files.

news: Recommend upgrade for account activation vulnerability.

* etc/news.scm: Recommend upgrade.

news: Add entry for user account activation vulnerability.

* etc/news.scm: Add entry.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

activation: Do not dereference symlinks during home directory creation.

Fixes <https://bugs.gnu.org/47584>.

* gnu/build/activation.scm (copy-account-skeletons): Do not chown the
home directory; leave this to 'activate-user-home'.
(activate-user-home): Only chown the home directory after the account
skeletons have been copied.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>.

daemon: Remove dead code.

Reported by Noisytoot on #guix.

* nix/nix-daemon/shared.hh (showManPage): Remove.
* nix/nix-daemon/nix-daemon.cc (printHelp, programId): Remove.

services: guix-publish: Add zstd compression by default.

That way, the default config with (advertises? #t) and without a cache
will offer zstd-compressed substitutes, which should lead to much higher
throughput than gzip.

* gnu/services/base.scm (default-compression): When
'guix-publish-configuration-cache' returns true, use higher level
compression ratios.  Add "zstd".
* doc/guix.texi (Base Services): Mention zstd.

gnu: knot-resolver: Update to 5.3.1.

* gnu/packages/dns.scm (knot-resolver): Update to 5.3.1.

gnu: terminator: Update to 2.1.1.

* gnu/packages/gnome.scm (terminator): Update to 2.1.1.

gnu: mousepad: Update to 0.5.4.

* gnu/packages/xfce.scm (mousepad): Update to 0.5.4.

gnu: perl-scalar-list-utils: Update to 1.56.

* gnu/packages/perl.scm (perl-scalar-list-utils): Update to 1.56.

gnu: perl-digest-hmac: Update to 1.04.

* gnu/packages/perl.scm (perl-digest-hmac): Update to 1.04.

gnu: perl-crypt-rijndael: Update to 1.16.

* gnu/packages/perl.scm (perl-crypt-rijndael): Update to 1.16.

gnu: vim: Update to 8.2.2689.

* gnu/packages/vim.scm (vim): Update to 8.2.2689.

gnu: diffoscope: Update to 172.

* gnu/packages/diffoscope.scm (diffoscope): Update to 172.

gnu: rust-rand-core: Update to 0.6.2.

Version 0.6.1 was yanked.

* gnu/packages/crates-io.scm(rust-rand-core): Update to 0.6.2.

gnu: tippecanoe: Update to 1.36.0.

* gnu/packages/geo.scm (tippecanoe): Update to 1.36.0.
  [arguments]: Use cc-for-target instead of hard-coding gcc.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: saga: Update to 7.9.0.

* gnu/packages/geo.scm (saga): Update to 7.9.0.
  [inputs]: Replace proj.4 with proj.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Add cl-opengl.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm: (sbcl-cl-opengl, cl-opengl, ecl-cl-opengl):
  New variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: nushell: Update to 0.29.0.

* gnu/packages/shells.scm (nushell): Update to 0.29.0.
(rust-nu-ansi-term-0.29):
(rust-nu-cli-0.29):
(rust-nu-command-0.29):
(rust-nu-data-0.29):
(rust-nu-engine-0.29):
(rust-nu-json-0.29):
(rust-nu-parser-0.29):
(rust-nu-plugin-0.29):
(rust-nu-plugin-binaryview-0.29):
(rust-nu-plugin-chart-0.29):
(rust-nu-plugin-fetch-0.29):
(rust-nu-plugin-from-bson-0.29):
(rust-nu-plugin-from-sqlite-0.29):
(rust-nu-plugin-inc-0.29):
(rust-nu-plugin-match-0.29):
(rust-nu-plugin-post-0.29):
(rust-nu-plugin-ps-0.29):
(rust-nu-plugin-s3-0.29):
(rust-nu-plugin-sys-0.29):
(rust-nu-plugin-textview-0.29):
(rust-nu-plugin-to-bson-0.29):
(rust-nu-plugin-to-sqlite-0.29):
(rust-nu-plugin-tree-0.29):
(rust-nu-plugin-xpath-0.29):
(rust-nu-protocol-0.29):
(rust-nu-source-0.29):
(rust-nu-stream-0.29):
(rust-nu-test-support-0.29):
(rust-nu-value-ext-0.29): Update to 0.29.

gnu: Add rust-hamcrest2-0.3.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-hamcrest2-0.3): New variable.

gnu: Add rust-rustyline-8.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-rustyline-8): New variable.

gnu: Add rust-nix-0.20.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-nix-0.20): New variable.
(rust-nix-0.19): Inherit from above.

gnu: Add rust-radix-trie-0.2.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-radix-trie-0.2): New variable.

gnu: Add rust-endian-type-0.1.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-endian-type-0.1): New variable.

gnu: Add rust-nibble-vec-0.1.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-nibble-vec-0.1): New variable.

gnu: rust-smallvec-1: Update to 1.6.1.

* gnu/packages/crates-io.scm (rust-smallvec-1): Update to 1.6.1.

gnu: emacs-org: Update to 9.4.5.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-org): Update to 9.4.5.
(emacs-org-contrib): Update to 20210329.

gnu: mgba: Update to 0.9.0.

* gnu/packages/emulators.scm (mgba): Update to 0.9.0.

gnu: emacs-tramp: Update to 2.5.0.3.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-tramp): Update to 2.5.0.3.

gnu: emacs-posframe: Update to 0.9.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-posframe): Update to 0.9.0.

gnu: emacs-ggtags: Update to 0.9.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-ggtags): Update to 0.9.0.
[source]: Update archive extension.

gnu: emacs-auctex: Update to 13.0.6.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-auctex): Update to 13.0.6.

gnu: runc: Update to 1.0.0-rc93.

* gnu/packages/virtualization.scm (runc): Update to 1.0.0-rc93.
[source]: Remove the patches field.
[phases]{unpack}: Remove override.
{build}: Add the man target.
{check}: Make conditional based on TESTS?.
{install}: Add the install-man target.
[native-inputs]: Add go-github-com-go-md2man.
[home-page]: Update.
* gnu/packages/patches/runc-CVE-2019-5736.patch: Delete file.
* gnu/local.mk: Un-register it.

gnu: containerd: Update to 1.4.4.

* gnu/packages/docker.scm (containerd): Update to 1.4.4.  Delete
trailing #t.
[arguments]: Set a MAKE-FLAGS binding.
[phases]{patch-paths}: Patch the reference to 'unpigz'.
{build, install}: Use the MAKE-FLAGS variable.
[inputs]: Add pigz.
* gnu/packages/patches/containerd-test-with-go1.13.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Un-register it.

gnu: pidgin: Update to 2.14.2.

* gnu/packages/messaging.scm (pidgin): Update to 2.14.2.
[source]: Remove pidgin-vv-gst.patch.
* gnu/packages/patches/pidgin-vv-gst.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Remove it.

gnu: lldpd: Update to 1.0.9.

* gnu/packages/networking.scm (lldpd): Update to 1.0.9.

gnu: ktouch: Remove unnecessary build phase.

* gnu/packages/education.scm (ktouch)[arguments]: Remove.

git: Remove unused variables.

This is a followup to 298f9d29d6c26e408a90d08d147d926aa6f81ab3, which
left those variables despite being unnecessary.

* guix/git.scm (clone*, update-cached-checkout): Remove unused
'auth-method' variable.

gnu: vtk: Add 'release-monitoring-url' property.

* gnu/packages/image-processing.scm (vtk)[properties]: New field.

gnu: vtk: Update to 9.0.1.

* gnu/packages/image-processing.scm (vtk): Update to 9.0.1.
[source](snippet): Remove bundled "ogg" directory as well.
[arguments]: Adjust #:configure-flags.  Add #:phases.
[inputs]: Add LIBOGG.
* gnu/packages/patches/vtk-fix-freetypetools-build-failure.patch: Update.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: curl: Update to 7.76.0 [security fixes].

Fixes CVE-2021-22876 and CVE-2021-22890.

* gnu/packages/curl.scm (curl/fixed): New variable.
(curl)[replacement]: New field.
* gnu/packages/patches/curl-7.76-use-ssl-cert-env.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: jami: Add debug outputs.

* gnu/packages/jami.scm (libring, libringclient, jami-gnome, jami-qt): Add a
"debug" output.

gnu: hostapd: Fix CVE-2021-30004.

* gnu/packages/admin.scm (hostapd)[patches]: Apply
'wpa-supplicant-CVE-2021-30004.patch'.

gnu: wpa-supplicant-minimal: Fix CVE-2021-30004.

* gnu/packages/patches/wpa-supplicant-CVE-2021-30004.patch: New patch.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register it.
* gnu/packages/admin.scm (wpa-supplicant-minimal): Apply patch.

gnu: python-pikepdf: Update to 2.10.0 [fixes CVE-2021-29421].

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pikepdf): Update to 2.10.0.

gnu: Add node-lts.

* gnu/packages/node.scm (node-lts): New variable.
* guix/build-system/node.scm (default-node): Use it.

gnu: Add llhttp-bootstrap.

* gnu/packages/patches/llhttp-bootstrap-CVE-2020-8287.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/node.scm (llhttp-bootstrap): New variable.

gnu: Add node-llparse-bootstrap.

* gnu/packages/node.scm (node-llparse-bootstrap): New variable.

gnu: Add node-llparse-frontend-bootstrap.

* gnu/packages/node.scm (node-llparse-frontend-bootstrap): New variable.

gnu: Add node-llparse-builder-bootstrap.

* gnu/packages/node.scm (node-llparse-builder-bootstrap): New variable.

gnu: Add node-debug-bootstrap.

* gnu/packages/node.scm (node-debug-bootstrap): New variable.

gnu: Add node-binary-search-bootstrap.

* gnu/packages/node.scm (node-binary-search-bootstrap): New variable.

gnu: Add node-ms-bootstrap.

* gnu/packages/node.scm (node-ms-bootstrap): New variable.

gnu: Add node-semver-bootstrap.

* gnu/packages/node.scm (node-semver-bootstrap): New variable.

gnu: Add node-bootstrap.

* gnu/packages/node (node-bootstrap): Add hidden alias for node.

gnu: node: Use license prefix.

* gnu/packages/node.scm (node)[license]: Use prefix for license.

gnu: Add libuv-for-node

* gnu/packages/libevent.scm (libuv-for-node): New variable.

build-system: Rewrite node build system.

* guix/build/node-build-system.scm: Rewrite it.
* guix/build-system/node.scm: Adjust accordingly.
* gnu/packages/node-xyz.scm (node-semver): Likewise.

Co-authored-by: Timothy Sample <samplet@ngyro.com>

gnu: libringclient: Disable the libwrap feature.

As it causes video calls to segfault.

* gnu/packages/jami.scm (libringclient): Set -DENABLE_LIBWRAP to false for the
time being.

gnu: Add jami-qt.

* gnu/packages/jami.scm (jami-qt): New variable.