services: profile: Create manifest at monadic-bind time.

Fixes <https://bugs.gnu.org/44952>.
Reported by Mathieu Othacehe <othacehe@gnu.org>.

* gnu/services.scm (packages->profile-entry): Change 'with-monad' to
'mlet' with one binding.

daemon: Remove unneeded forward declaration.

This is a followup to ee9dff34f9317509cb2b833d07a0d5e01a36a4ae.

* nix/libstore/build.cc: Remove 'struct Agent' forward declaration.

gnu: emacs-relint: Update to 1.19.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-relint): Update to 1.19.

gnu: emacs-xr: Update to 1.20.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-xr): Update to 1.20.

gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.51.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (pigx-chipseq): Update to 0.0.51.
[inputs]: Add r-corrplot, r-deseq2, r-dt, r-ggrepel, r-gprofiler2, r-pheatmap,
and r-rsubread.

gnu: pigx-scrnaseq: Update to 1.1.7.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (pigx-scrnaseq): Update to 1.1.7.

gnu: alot: Don't use unstable tarball.

* gnu/packages/mail.scm (alot)[source]: Download using git-fetch.

gnu: Add fiano-fmap.

* gnu/packages/admin.scm (fiano-fmap): New variable.

gnu: Add fiano-utk.

* gnu/packages/admin.scm (fiano-utk): New variable.

gnu: Add fiano.

* gnu/packages/admin.scm (fiano): New variable.

gnu: Add go-github.com-ulikunitz-xz.

* gnu/packages/golang.scm (go-github.com-ulikunitz-xz): New variable.

gnu: poetry: Update to 1.1.4.

* gnu/packages/python-xyz.scm (poetry): Update to 1.1.4.
[arguments]: Loosen constraint on python-keyring only.
[propagated-inputs] Remove python-jsonschema, python-pyparsing and python-pyrsistent.
Add python-pip, python-packaging and python-poetry-core.
Use python-requests-toolbelt-0.9.1.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add python-poetry-core.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-poetry-core): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: python-tomlkit: Update to 0.7.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-tomlkit): Update to 0.7.0.
[native-inputs]: Add python-pyyaml.
[description]: Update description.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: python-pip: Update to 20.2.4.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pip): Update to 20.2.4.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: python-virtualenv: Update to 20.2.1.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-virtualenv): Update to 20.2.1.
[propagated-inputs] Use python-distlib/next instead of python-distlib.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add python-distlib/next.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-distlib/next): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: python-packaging: Update to 20.4.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-packaging): Update to 20.4.
[source]: Remove patch that has been merged upstream.
* gnu/packages/patches/python-packaging-test-arch.patch: Remove file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Apply removal.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: dfu-util: Update to 0.10.

* gnu/packages/flashing-tools.scm (dfu-util): Update to 0.10.

gnu: libreoffice: Build reproducibly.

* gnu/packages/libreoffice.scm (libreoffice)[native-inputs]: Add ziptime.
[arguments]: Add a 'reset-zip-timestamps phase that invokes it.

gnu: libfprint: Update to 1.90.4.

* gnu/packages/freedesktop.scm (libfprint): Update to 1.90.4.

gnu: sudo: Update to 1.9.4.

* gnu/packages/admin.scm (sudo): Update to 1.9.4.
[source]: Add patch.
* gnu/packages/patches/sudo-fix-build-without-sendmail.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: Add ziptime.

* gnu/packages/compression.scm (ziptime): New public variable.

gnu: photoflare: Update to 1.6.6.

* gnu/packages/photo.scm (photoflare): Update to 1.6.6.

gnu: mtools: Update to 4.0.26.

* gnu/packages/mtools.scm (mtools): Update to 4.0.26.

gnu: drbd-utils: Update to 9.15.1.

* gnu/packages/cluster.scm (drbd-utils): Update to 9.15.1.

gnu: sratom: Update to 0.6.6.

* gnu/packages/audio.scm (sratom): Update to 0.6.6.

gnu: suil: Update to 0.10.8.

* gnu/packages/audio.scm (suil): Update to 0.10.8.

gnu: nicotine: Update to 2.1.2.

* gnu/packages/nicotine.scm (nicotine+): Update to 2.1.2.
[inputs]: Remove python-mutagen and python-dbus. Add python-pytaglib.
[native-inputs]: Add gettext-minimal.
[arguments]: Apply the 'glib-or-gtk-wrap' and 'glib-or-gtk-compile-schemas'
phases from the glib-or-gtk-build-system.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: Add python-pytaglib.

* gnu/packages/mp3.scm (python-pytaglib): New variable.

Signed-off-by: Leo Famulari <leo@famulari.name>

gnu: Add sbcl-stumpwm-screenshot.

* gnu/packages/wm.scm (sbcl-stumpwm-screenshot): New variable.

gnu: Add sbcl-stumpwm-winner-mode.

* gnu/packages/wm.scm (sbcl-stumpwm-winner-mode): New variable.

gnu: Add sbcl-stumpwm-mem.

* gnu/packages/wm.scm (sbcl-stumpwm-mem): New variable.

gnu: Add sbcl-stumpwm-cpu.

* gnu/packages/wm.scm (sbcl-stumpwm-cpu): New variable.

gnu: Add sbcl-stumpwm-numpad-layouts.

* gnu/packages/wm.scm (sbcl-stumpwm-numpad-layouts): New variable.

gnu: stumpwm: Update to 20.11.

* gnu/packages/wm.scm (stumpwm): Update to 20.11.

gnu: sbcl: Update to 2.0.11.

* gnu/packages/lisp.scm (sbcl): Update to 2.0.11.

gnu: clisp: Enable ASDF module and parallel build, remove old patch.

* gnu/packages/lisp.scm (clisp)[source]: Remove patch that does not seem to be
needed anymore.
[arguments]: Remove (obsolete?) #:build keyword.  Enable ASDF and explicitly
enable ffcall, readline, sigsegv.  Enable parallel-build since they seem to
work now.

gnu: Add generic-cl.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-generic-cl, ecl-generic-cl, sbcl-generic-cl):
New variables.

gnu: cl-environments: Update to 20201110 and use SBCL build system.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-environments): Update to 20201110.
[build-system]: Use asdf-build-system/sbcl.
(ecl-cl-environments, sbcl-cl-environments): New variables.
(sbcl-static-dispatch): Comment which error we get when using
sbcl-cl-environments.

gnu: sbcl-alexandria: Update to 1.2.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (sbcl-alexandria): Update to 1.2.

gnu: Add gmni.

* gnu/packages/web-browsers.scm (gmni): New variable.

Signed-off-by: Christopher Baines <mail@cbaines.net>

doc: Document that source derivation builds can be checked.

It is a common mistake to modify an <origin> record that computes to a
fixed-output derivation, forgetting to update its hash field, only to find out
that a previously built source gets used instead.  While there doesn't seem to
be an obvious solution to this problem, we can at least document the fact that
sources can be checked the same as other builds.

* doc/guix.texi (Additional Build Options): Document that source derivation
builds can be verified using --check.

gnu: par2cmdline: Update to 0.8.1.

* gnu/packages/backup.scm (par2cmdline): Update to 0.8.1.

gnu: gpxsee: Update to 7.37.

* gnu/packages/gps.scm (gpxsee): Update to 7.37.

gnu: perl-gd: Update to 2.73.

* gnu/packages/gd.scm (perl-gd): Update to 2.73.

gnu: rsibreak: Update to 0.12.13.

* gnu/packages/kde-utils.scm (rsibreak): Update to 0.12.13.

gnu: signing-party: Update to 2.11.

* gnu/packages/gnupg.scm (signing-party): Update to 2.11.

processes: Add '--format' and the "normalized" format.

* guix/scripts/processes.scm (lock->recutils): New procedure.
(daemon-session->recutils): Use it.
(daemon-sessions->recutils, session-key->recutils)
(session-scalars->normalized-record)
(child-process->normalized-record)
(daemon-sessions->normalized-record): New procedures.
(session-rec-type, lock-rec-type, child-process-rec-type)
(%available-formats): New variables.
(list-formats): New procedure.
(%options, show-help): Add '--format'.
(%default-options): New variable.
(guix-processes): Use 'parse-command-line' instead of 'args-fold*'.
Honor the 'format' value in OPTIONS.
* doc/guix.texi (Invoking guix processes): Document '--format'.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

processes: Put ChildProcess and ChildPID on separate lines.

* guix/scripts/processes.scm (daemon-session->recutils): Put child
process information in separate fields.
* doc/guix.texi (Invoking guix processes): Document change in output of
'guix processes'.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

daemon: Remove pre-Guix hack.

* nix/libstore/build.cc (DerivationGoal::startBuilder): Remove
"NIX_OUTPUT_CHECKED" hack.

gnu: mcelog: Update to 173.

* gnu/packages/linux.scm (mcelog): Update to 173.

gnu: libmwaw: Update to 0.3.17.

* gnu/packages/libreoffice.scm (libmwaw): Update to 0.3.17.

gnu: libphidget: Update to 2.1.9.20190409.

* gnu/packages/libphidget.scm (libphidget): Update to 2.1.9.20190409.

gnu: unionfs-fuse: Update to 2.1.

* gnu/packages/linux.scm (unionfs-fuse): Update to 2.1.

gnu: altermime: Update to 0.3.11.

* gnu/packages/mail.scm (altermime): Update to 0.3.11.

gnu: libtermkey: Update to 0.22.

* gnu/packages/terminals.scm (libtermkey): Update to 0.22.
[arguments]: Add a 'patch-failing-test phase.

gnu: libtermkey: Prepare for cross-compilation.

* gnu/packages/terminals.scm (libtermkey)[arguments]: Use CC-FOR-TARGET.

ci: Temporarily disable image-jobs.

* gnu/ci.scm (hydra-jobs): Temporarily disable image-jobs.

gnu: emacs-dashboard: Update to 1.7.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-dashboard): Update to 1.7.0.

gnu: streamlink: Update to 1.7.0.

* gnu/packages/video.scm (streamlink): Update to 1.7.0.

gnu: cava: Update to 0.7.3.

* gnu/packages/audio.scm (cava): Update to 0.7.3.

gnu: xnotify: Update to 0.7.3.

* gnu/packages/wm.scm (xnotify): Update to 0.7.3.

gnu: emacs-dired-rsync: Update to 0.5.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-dired-rsync): Update to 0.5.

gnu: xmenu: Update to 4.4.1.

* gnu/packages/wm.scm (xmenu)[version]: Update to 4.4.1.
[inputs]: Add xinerama.

gnu: xclickroot: Update to 1.2.

* gnu/packages/wm.scm (xclickroot): Update to 1.2.

gnu: webssh: Update to 1.5.3.

* gnu/packages/ssh.scm (webssh): Update to 1.5.3.

gnu: emacs-tramp: Update to 2.4.4.4.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-tramp): Update to 2.4.4.4.

gnu: Add emacs-polymode-markdown.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-polymode-markdown): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: nudoku: Update source URI.

* gnu/packages/games.scm (nudoku)[source]: Remove trailing .git from URI.

gnu: nudoku: Add source file-name field.

* gnu/packages/games.scm (nudoku)[source]: Add file-name field.

gnu: Add python-pytelegrambotapi.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pytelegrambotapi): New variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: texmaker: Update to 5.0.4.

* gnu/packages/tex.scm (texmaker): Update to 5.0.4.

gnu: stgit: Update to 0.23.

* gnu/packages/version-control.scm (stgit): Update to 0.23.

gnu: stgit: Update home page.

* packages/version-control.scm (stgit)[home-page]: Follow HTML redirection.

gnu: vim: Update to 8.2.2067.

* gnu/packages/vim.scm (vim): Update to 8.2.2067.

gnu: prixovy: Enable Brotli inspection.

* gnu/packages/tor.scm (privoxy)[arguments]: Add "--with-brotli"
to the #:configure-flags.
[inputs]: Add brotl.

gnu: prixovy: Enable HTTPS inspection.

* gnu/packages/tor.scm (privoxy)[arguments]: Add "--with-openssl"
to the #:configure-flags.
[inputs]: Add openssl.

news: Add ‘de’ translation.

gnu: b4: Update to 0.5.3.

* gnu/packages/version-control.scm (b4): Update to 0.5.3.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: grokmirror: Update to 2.0.5.

* gnu/packages/version-control.scm (grokmirror): Update to 2.0.5.
[propagated-inputs]: Add python-packaging.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: esbuild: Update to 0.8.16.

* gnu/packages/web.scm (esbuild): Update to 0.8.16.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: Add cgoban.

* gnu/packages/games.scm (cgoban): New variable.

Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>

gnu: weasyprint: Update to 52.1.

Fixes <https://issues.guix.gnu.org/42409>.

* gnu/packages/patches/weasyprint-library-paths.patch: Delete.
* gnu/packages/pdf.scm (weasyprint): Update to 52.1
[phases]{patch-library-paths}: Adjust.
{check}: Remove.
{register-dejavu-font}: New phase.
[native-inputs]: Add font-dejavu.

gnu: python-pyphen: Update to 0.10.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pyphen): Update to 0.10.0.

gnu: python-tinycss2: Update to 1.1.0.

* gnu/packages/patches/python-tinycss2-flake8-compat.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): De-register it.
* gnu/packages/python-web.scm (python-tinycss2): Update to 1.1.0.
[source]: Remove patch.
[arguments]: Remove field, disabling tests.
[native-inputs]: Remove field.

gnu: python-flit: Update to 3.0.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-flit): Update to 3.0.0.

gnu: python-cssselect2: Update to 0.4.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-cssselect2): Update to 0.4.1.

gnu: python-cairosvg: Update to 2.5.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cairosvg): Update to 2.5.0.

gnu: python-mypy: Update to 0.790.

* gnu/packages/python-check.scm (python-mypy): Update to 0.790.
[origin]: Fetch sources from git.
[phases]{check}: Run the unit tests only, not the self test, which fails.
[native-inputs]: Remove python-py.  Use python-pytest-6.

gnu: python-pytest-xdist: Update to 2.1.0.

* gnu/packages/check.scm (python-pytest-xdist): Update to 2.1.0.

gnu: Add python-pytest-6.

* gnu/packages/check.scm (python-pytest-6): New variable.
(python-pytest-6-bootstrap): Likewise.

gnu: python-typing-extensions: Update to 3.7.4.3.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-typing-extensions): Update to 3.7.4.3.

gnu: Add python-py-next.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-py-next): New variable.

gnu: Add python-iniconfig.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-iniconfig): New variable.

gnu: python-cairocffi: Update to 1.2.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cairocffi): Update to 1.2.0.
[source]: Fetch from Git.
[patches]: Remove field.
[inputs]: Remove pango.
[native-inputs]: Remove pkg-config and python-docutils.  Add python-numpy and
python-sphinx-rtd-theme.
[phases]{patch-paths}: Adjust.  Fix the patching of gdk-3.
{disable-linters}: New phase.
{install-doc}: Adjust.  The license file is now installed by a build phase.
* gnu/packages/patches/python-cairocffi-dlopen-path.patch: Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): De-register it.

gnu: python-cairocffi: Fix indentation.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-cairocffi): Fix indentation.

gnu: python-html5lib: Update to 1.1.

* gnu/packages/python-web.scm (python-html5lib): Update to 1.1.

gnu: guix: Update to 1.2.0-3.35a32fe.

* gnu/packages/package-management.scm (guix): Update to 1.2.0-3.35a32fe.

Make "guile-avahi" dependency optional.

* configure.ac (HAVE_GUILE_AVAHI): New conditional.
* Makefile.am (MODULES): Add "guix/avahi.scm" and "guix/scripts/discover.scm"
if HAVE_GUILE_AVAHI is set.
* guix/scripts/publish.scm: Autoload (guix avahi).
* guix/scripts/substitute.scm: Autoload (guix scripts discovery).