gnu: r-genomicalignments: Update to 1.20.0.
[jackhill/guix/guix.git] / gnu / packages / bioinformatics.scm
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicalignments: Update to 1.20.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.14.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-delayedarray: Update to 0.10.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-biostrings: Update to 2.52.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-biocparallel: Update to 1.18.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-biomart: Update to 2.40.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-annotationdbi: Update to 1.46.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-biobase: Update to 2.44.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicranges: Update to 1.36.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-xvector: Update to 0.24.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-limma: Update to 3.40.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-variantannotation: Update to 1.30.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-edger: Update to 3.26.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-genomeinfodb: Update to 1.20.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-iranges: Update to 2.18.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-s4vectors: Update to 0.22.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-bioccheck: Update to 1.20.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-biocstyle: Update to 2.12.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-biocviews: Update to 1.52.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-grohmm: Update to 1.18.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-shortread: Update to 1.42.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-gostats: Update to 2.50.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-category: Update to 2.50.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-gseabase: Update to 1.46.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-rbgl: Update to 1.60.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-annotationforge: Update to 1.26.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-dexseq: Update to 1.30.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-deseq2: Update to 1.24.0.
2019-05-05 Ricardo Wurmusgnu: r-genefilter: Update to 1.66.0.
2019-04-28 Ludovic CourtèsMerge branch 'staging'
2019-04-27 Ricardo Wurmusgnu: r-rhtslib: Fix build.
2019-04-27 Ricardo Wurmusgnu: r-ggbio: Fix build.
2019-04-26 Ricardo Wurmusgnu: Add umi-tools.
2019-04-23 Marius BakkeMerge branch 'master' into staging
2019-04-19 Ricardo Wurmusgnu: r-seurat: Update to 3.0.0.
2019-04-16 Marius BakkeMerge branch 'master' into staging
2019-04-11 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicfeatures: Update to 1.34.8.
2019-04-11 Ricardo Wurmusgnu: Add python2-checkm-genome.
2019-04-11 Ricardo Wurmusgnu: Add pplacer.
2019-04-07 Marius BakkeMerge branch 'master' into staging
2019-04-06 Ricardo Wurmusgnu: r-ldblock: Update to 1.12.1.
2019-04-06 Ricardo Wurmusgnu: r-ensembldb: Update to 2.6.8.
2019-04-03 Ricardo Wurmusgnu: r-rcas: Add upstream name.
2019-04-02 Ricardo Wurmusgnu: pigx-scrnaseq: Use older loompy.
2019-04-02 Ricardo Wurmusgnu: Add python-loompy-for-pigx-scrnaseq.
2019-04-02 Ricardo Wurmusgnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.40.
2019-04-02 Ricardo Wurmusgnu: python-scanpy: Add python-louvain to inputs.
2019-03-31 Marius BakkeMerge branch 'master' into staging
2019-03-31 Efraim Flashnergnu: Fix descriptions to not use quotes.
2019-03-29 Ricardo Wurmusgnu: Add python-bbknn.
2019-03-27 Ricardo Wurmusgnu: trim-galore: Add pigz.
2019-03-27 Ricardo Wurmusgnu: trim-galore: Fix test for Python.
2019-03-27 Ricardo Wurmusgnu: r-rhdf5lib: Update to 1.4.3.
2019-03-27 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicfeatures: Update to 1.34.7.
2019-03-26 Ricardo Wurmusgnu: python-scanpy: Update to 1.4.
2019-03-26 Ricardo Wurmusgnu: trim-galore: Update to 0.6.1.
2019-03-26 Ricardo Wurmusgnu: cutadapt: Update to 2.1.
2019-03-25 Ricardo Wurmusgnu: r-gkmsvm: Move to (gnu packages bioconductor).
2019-03-25 Ricardo Wurmusgnu: r-wgcna: Move to (gnu packages cran).
2019-03-25 Ricardo Wurmusgnu: r-optparse: Move to (gnu packages cran).
2019-03-25 Ricardo Wurmusgnu: r-bookdown: Move to (gnu packages cran).
2019-03-25 Ricardo Wurmusgnu: r-sparql: Move to (gnu packages cran).
2019-03-24 Ricardo Wurmusgnu: r-seqinr: Move to (gnu packages cran).
2019-03-24 Ricardo Wurmusgnu: r-acsnminer: Move to (gnu packages cran).
2019-03-24 Ricardo Wurmusgnu: r-phangorn: Update to 2.5.3.
2019-03-24 Ricardo Wurmusgnu: r-gqtlstats: Update to 1.14.1.
2019-03-24 Ricardo Wurmusgnu: r-rbgl: Update to 1.58.2.
2019-03-23 Marius BakkeMerge branch 'master' into staging
2019-03-22 Ricardo Wurmusgnu: Add starlong.
2019-03-21 Marius BakkeMerge branch 'master' into staging
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: r-diversitree: Update to 0.9-11.
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: r-maldiquant: Update to 1.19.2.
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: r-diversitree: Fix typo.
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: r-annotationhub: Update to 2.14.5.
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicfeatures: Update to 1.34.6.
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: r-variantannotation: Update to 1.28.13.
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: r-category: Update to 2.48.1.
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: r-dexseq: Update to 1.28.3.
2019-03-20 Ricardo Wurmusgnu: Add adapterremoval.
2019-03-19 Ricardo Wurmusgnu: nanopolish: Use python-wrapper.
2019-03-19 Ricardo Wurmusgnu: nanopolish: Remove bundled library sources.
2019-03-18 Ricardo Wurmusgnu: python-biom-format: Fix build.
2019-03-18 Ricardo Wurmusgnu: Add bbmap.
2019-03-18 Ricardo Wurmusgnu: blasr: Add home page.
2019-03-18 Ricardo Wurmusgnu: Add arriba.
2019-03-18 Ricardo Wurmusgnu: Add blasr.
2019-03-18 Ricardo Wurmusgnu: Add blasr-libcpp.
2019-03-18 Ricardo Wurmusgnu: Add pbbam.
2019-03-15 Ricardo Wurmusgnu: Add bwa-meth.
2019-03-14 Marius BakkeMerge branch 'master' into staging
2019-03-13 Ricardo Wurmusgnu: Add python-velocyto.
2019-03-13 Ricardo Wurmusgnu: python-loompy: Update to 2.0.17.
2019-03-13 Ricardo Wurmusgnu: Add tetoolkit.
2019-03-12 Ricardo Wurmusgnu: r-qvalue: Move to (gnu packages bioconductor).
2019-03-10 Marius BakkeMerge branch 'master' into staging
2019-03-08 Ricardo Wurmusgnu: blast+: Update to 2.7.1.
2019-03-08 Ricardo Wurmusgnu: r-mzr: Update to 2.16.2.
2019-03-08 Ricardo Wurmusgnu: r-gviz: Update to 1.26.5.
2019-03-08 Ricardo Wurmusgnu: r-ensembldb: Update to 2.6.7.
2019-03-08 Ricardo Wurmusgnu: r-annotationhub: Update to 2.14.4.
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