Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updates
[jackhill/guix/guix.git] / gnu / packages / bioinformatics.scm
2017-12-31 Efraim FlashnerMerge remote-tracking branch 'origin/master' into core...
2017-12-27 Ben Woodcroftgnu: vsearch: Update to 2.6.2.
2017-12-24 Tobias Geerinckx... gnu, doc: Use HTTPS for cran.r-project.org home pages.
2017-12-22 Roel Janssengnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.2.
2017-12-21 Leo FamulariMerge branch 'master' into core-updates
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-biomart: Update to 2.34.1.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-gviz: Update to 1.22.2.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-gqtlstats: Update to 1.10.1.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.2.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-limma: Update to 3.34.4.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-edger: Update to 3.20.2.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-biocstyle: Update to 2.6.1.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-dexseq: Update to 1.24.2.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-vegan: Update to 2.4-5.
2017-12-19 Efraim Flashnergnu: Remove redundant cmake libdir configure flags.
2017-12-19 Marius BakkeMerge branch 'master' into core-updates
2017-12-18 Ricardo Wurmusgnu: r-seurat: Update to 2.1.0.
2017-12-18 Ricardo Wurmusgnu: r-seurat: Fix ModularityOptimizer.jar.
2017-12-15 Ben Woodcroftgnu: bedtools: Update to 2.27.1.
2017-12-14 Ben Woodcroftgnu: diamond: Update to 0.9.14.
2017-12-11 Christopher Bainesgnu: Switch to using the version-major procedure.
2017-12-09 Ricardo Wurmusgnu: bedtools-2.18: Fix build.
2017-12-07 Marius BakkeMerge branch 'master' into core-updates
2017-12-07 Ludovic CourtèsMerge branch 'version-0.14.0'
2017-12-06 Ricardo Wurmusgnu: bedtools: Update to 2.27.0.
2017-12-05 Marius BakkeMerge branch 'master' into core-updates
2017-12-03 Ricardo Wurmusgnu: Add kallisto.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: jellyfish: Update to 2.2.7.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-annotationhub: Update to 2.10.1.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-msnid: Update to 1.12.1.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-maldiquant: Update to 1.17.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicalignments: Update to 1.14.1.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-limma: Update to 3.34.2.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-variantannotation: Update to 1.24.2.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-getopt: Update to 1.20.1.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-gseabase: Update to 1.40.1.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-dexseq: Update to 1.24.1.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-deseq2: Update to 1.18.1.
2017-11-30 Ricardo Wurmusgnu: r-annotate: Update to 1.56.1.
2017-11-30 Arun Isaacgnu: metabat: Use scons-build-system.
2017-11-29 Roel Janssengnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.1.
2017-11-29 Roel Janssengnu: Add r-copynumber.
2017-11-27 Ricardo Wurmusgnu: Add java-picard-1.113.
2017-11-27 Ricardo Wurmusgnu: Add java-picard.
2017-11-27 Ricardo Wurmusgnu: java-htsjdk: Update to 2.3.0.
2017-11-27 Ricardo Wurmusgnu: r-rhdf5: Fix build phase.
2017-11-23 Ricardo Wurmusgnu: subread: Update to 1.6.0.
2017-11-21 Ricardo Wurmusgnu: idr: Update to 2.0.3.
2017-11-21 Ricardo Wurmusgnu: idr: Correct license.
2017-11-19 Marius BakkeMerge branch 'master' into core-updates
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-genomeinfodbdata: Update to 0.99.1.
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-go-db: Update to 3.5.0.
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-org-ce-eg-db: Update to 3.5.0.
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-org-dm-eg-db: Update to 3.5.0.
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-org-mm-eg-db: Update to 3.5.0.
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-genomationdata: Update to 1.10.0.
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: Remove duplicate from (gnu packages bioinformatics).
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-org-hs-eg-db: Clarify description.
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-org-hs-eg-db: Update to 3.5.0.
2017-11-18 Ricardo Wurmusgnu: r-org-hs-eg-db: Remove duplicate package definition.
2017-11-17 Ricardo Wurmusgnu: Move testing packages from python.scm to check...
2017-11-16 Ludovic Courtèsgnu: Move more packages from python to python-web.
2017-11-13 Ben Woodcroftgnu: diamond: Update to 0.9.13.
2017-11-13 Ricardo Wurmusgnu: Move test packages from perl to perl-check.
2017-11-13 Ricardo Wurmusgnu: cd-hit: Update source tarball hash.
2017-11-11 Tobias Geerinckx... gnu: methylkit: Use new home page.
2017-11-10 Ben Woodcroftgnu: vsearch: Update to 2.6.0.
2017-11-10 Ricardo Wurmusgnu: cutadapt: Update to 1.14.
2017-11-09 Ben Woodcroftgnu: roary: Update to 3.11.0.
2017-11-08 Ricardo Wurmusgnu: miso: Use pypi-uri.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-hitc.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-fithic.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-sushi.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-gwascat.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-gviz.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-gqtlstats.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-ldblock.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-erma.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-homo-sapiens.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-org-hs-eg-db.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-snpstats.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-gqtlbase.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-gprofiler.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-ggbio.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-biovizbase.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-organismdbi.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-ensembldb.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-annotationfilter.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-dirichletmultinomial.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-complexheatmap.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-genomicfiles.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-gage.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: Add r-keggrest.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: r-msnbase: Update to 2.4.0.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: r-mutationalpatterns: Update to 1.4.0.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: r-annotationhub: Update to 2.10.0.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: r-mzr: Remove bundled copy of boost.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: r-mzr: Update to 2.12.0.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: r-mzid: Update to 1.16.0.
2017-11-07 Ricardo Wurmusgnu: r-chipseq: Update to 1.28.0.
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