build-system/gnu: Add 'bootstrap' phase.
[jackhill/guix/guix.git] / gnu / packages / bioinformatics.scm
2018-03-11 Ludovic Courtèsbuild-system/gnu: Add 'bootstrap' phase.
2018-02-24 Marius BakkeMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-22 Ricardo Wurmusgnu: r-qtl: Update to 1.42-8.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-delayedmatrixstats: Update to 1.0.3.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-scater: Update to 1.6.3.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-gviz: Update to 1.22.3.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-gprofiler: Update to 0.6.4.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-ensembldb: Update to 2.2.2.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-seurat: Update to 2.2.1.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-qtl: Update to 1.42-7.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicranges: Update to 1.30.2.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-getopt: Update to 1.20.2.
2018-02-19 Ricardo Wurmusgnu: r-bookdown: Update to 0.7.
2018-02-17 Ricardo WurmusMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-17 Ben Woodcroftgnu: vsearch: Update to 2.7.1.
2018-02-16 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-15 Ben Woodcroftgnu: diamond: Update to 0.9.18.
2018-02-15 Ricardo Wurmusgnu: Add python-loompy.
2018-02-15 Ricardo Wurmusgnu: Add r-dropbead.
2018-02-15 Ricardo Wurmusgnu: Add r-delayedmatrixstats.
2018-02-14 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-13 Ben Woodcroftgnu: vsearch: Update to 2.7.0.
2018-02-13 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-gprofiler: Update to 0.6.3.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-ensembldb: Update to 2.2.1.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-gage: Update to 2.28.2.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-keggrest: Update to 1.18.1.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-seurat: Update to 2.2.0.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-msnbase: Update to 2.4.2.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-methylkit: Update to 1.4.1.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-gkmsvm: Update to 0.79.0.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-wgcna: Update to 1.62.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-genomation: Update to 1.11.3.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicfeatures: Update to 1.30.3.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.3.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.8.1.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-biomart: Update to 2.34.2.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-genomicranges: Update to 1.30.1.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-limma: Update to 3.34.8.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-variantannotation: Update to 1.24.5.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-edger: Update to 3.20.8.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-bookdown: Update to 0.6.
2018-02-13 Ricardo Wurmusgnu: r-vegan: Update to 2.4-6.
2018-02-12 Ricardo Wurmusgnu: Add r-scran.
2018-02-12 Ricardo Wurmusgnu: Add r-scater.
2018-02-12 Ricardo Wurmusgnu: Add r-singlecellexperiment.
2018-02-12 Ricardo Wurmusgnu: Add r-beachmat.
2018-02-12 Ricardo Wurmusgnu: Add r-rhdf5lib.
2018-02-11 Ricardo Wurmusgnu: Add r-hdf5array.
2018-02-11 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-09 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-07 Marius Bakkegnu: multiqc: Update to 1.4.
2018-02-04 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-04 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-02-02 Ben Woodcroftgnu: diamond: Update to 0.9.17.
2018-02-01 Marius BakkeMerge branch 'master' into core-updates
2018-01-27 Ben Woodcroftgnu: diamond: Update to 0.9.16.
2018-01-26 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-01-26 Ben Woodcroftgnu: diamond: Update to 0.9.15.
2018-01-25 Tobias Geerinckx... gnu: deeptools: Update URI.
2018-01-24 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-01-23 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-01-22 Ricardo Wurmusgnu: star: Make reproducible.
2018-01-22 Efraim Flashnergnu: khmer: Add aarch64-linux to supported systems.
2018-01-21 Ricardo Wurmusgnu: Add salmon.
2018-01-21 Ricardo Wurmusgnu: Add sailfish.
2018-01-21 Ricardo Wurmusgnu: Add libdivsufsort.
2018-01-21 Ricardo Wurmusgnu: Add libgff.
2018-01-20 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-01-11 Leo FamulariMerge branch 'master' into core-updates
2018-01-10 Ben Woodcroftgnu: seqmagick: Use 'pypi-uri'.
2018-01-10 Ben Woodcroftgnu: mafft: Update to 7.313.
2018-01-09 Ben Woodcroftgnu: seqmagick: Update to 0.7.0.
2018-01-05 Mark H WeaverMerge branch 'master' into core-updates
2018-01-03 Leo FamulariMerge branch 'master' into core-updates
2018-01-02 Tobias Geerinckx... gnu: htslib: Mark up description.
2018-01-02 Ricardo Wurmusgnu: ribotaper: Wrap executables.
2018-01-02 Tobias Geerinckx... gnu: python-pysam: Update to 0.13.0.
2018-01-02 Tobias Geerinckx... gnu: htslib: Update to 1.6.
2017-12-31 Efraim FlashnerMerge remote-tracking branch 'origin/master' into core...
2017-12-27 Ben Woodcroftgnu: vsearch: Update to 2.6.2.
2017-12-24 Tobias Geerinckx... gnu, doc: Use HTTPS for cran.r-project.org home pages.
2017-12-22 Roel Janssengnu: Update r-mutationalpatterns to 1.4.2.
2017-12-21 Leo FamulariMerge branch 'master' into core-updates
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-biomart: Update to 2.34.1.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-gviz: Update to 1.22.2.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-gqtlstats: Update to 1.10.1.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.2.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-limma: Update to 3.34.4.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-edger: Update to 3.20.2.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-biocstyle: Update to 2.6.1.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-dexseq: Update to 1.24.2.
2017-12-19 Ricardo Wurmusgnu: r-vegan: Update to 2.4-5.
2017-12-19 Efraim Flashnergnu: Remove redundant cmake libdir configure flags.
2017-12-19 Marius BakkeMerge branch 'master' into core-updates
2017-12-18 Ricardo Wurmusgnu: r-seurat: Update to 2.1.0.
2017-12-18 Ricardo Wurmusgnu: r-seurat: Fix ModularityOptimizer.jar.
2017-12-15 Ben Woodcroftgnu: bedtools: Update to 2.27.1.
2017-12-14 Ben Woodcroftgnu: diamond: Update to 0.9.14.
2017-12-11 Christopher Bainesgnu: Switch to using the version-major procedure.
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