gnu: python-robotframework: Fully build the documentation.

* gnu/packages/patches/python-robotframework-ug2html.patch: New patch.
* gnu/local.mk: Register it.
* gnu/packages/python-xyz.scm (python-robotframework): Apply patch.
[modules]: New argument.
[phases]{build-and-install-doc}: Modify to build the full HTML documentation,
including the user guide.
[native-inputs]: Add python-pygments.

gnu: Add python-trio-websocket.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-trio-websocket): New variable.

gnu: python-jedi: Remove optional test dependency on python-django-2.2.

This avoids a dependency cycle between python-selenium (4.1.0) and
python-pytest-trio.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-jedi)[native-inputs]: Remove
python-django-2.2.

gnu: python-robotframework-sshlibrary: Patch for RobotFramework 5 compatibility.

* gnu/packages/patches/python-robotframework-sshlibrary-rf5-compat.patch: New
file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Register it.
* gnu/packages/python-xyz.scm (python-robotframework-sshlibrary): Apply it.

gnu: emacs-embark: Update to 0.16.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-embark): Update to 0.16.

gnu: bombadillo: Improve package style.

* gnu/packages/web-browsers.scm (bombadillo)[arguments]: Use G-expressions.
Remove trailing #T from phases.

gnu: bombadillo: Update to 2.4.0.

* gnu/packages/web-browsers.scm (bombadillo): Update to 2.4.0.

gnu: lagrange: Update to 1.11.1.

* gnu/packages/web-browsers.scm (lagrange): Update to 1.11.1.
[inputs]: Add FREETYPE.

gnu: asymptote: Update to 2.79.

* gnu/packages/plotutils.scm (asymptote): Update to 2.79.

gnu: bzflag: Improve package style.

* gnu/packages/games.scm (bzflag)[arguments]: Remove trailing #T from
phases. Use G-expressions.

gnu: bzflag: Update to 2.4.24.

* gnu/packages/games.scm (bzflag): Update to 2.4.24.

gnu: emacs-add-node-modules-path: Update to 1.3.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-add-node-modules-path): Update to 1.3.0.

gnu: emacs-geiser: Update to 0.23.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-geiser): Update to 0.23.

gnu: emacs-vertico: Update to 0.21.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-vertico): Update to 0.21.

gnu: emacs-corfu: Update to 0.20.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-corfu): Update to 0.20.

gnu: Add r-scopeloomr.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-scopeloomr): New variable.

gnu: python-robotframework-sshlibrary: Update to 3.8.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-robotframework-sshlibrary): Update to 3.8.0.

gnu: python-robotframework: Update to 4.1.3.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-robotframework): Update to 4.1.3.
[phases]{check}: Honor TESTS?.  Search tzdata in both native-inputs or inputs,
for cross-compilation.

gnu: emacs-tempel: Update to 0.3.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-tempel): Update to 0.3.

gnu: emacs-no-littering: Update to 1.2.6.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-no-littering): Update to 1.2.6.

gnu: emacs-marginalia: Update to 0.13.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-marginalia): Update to 0.13.

gnu: emacs-consult: Update to 0.16.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-consult): Update to 0.16.

gnu: emacs-clojure-mode: Update to 5.14.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-clojure-mode): Update to 5.14.0.

gnu: emacs-cider: Update to 1.3.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-cider): Update to 1.3.0.

gnu: emacs-cape: Update to 0.7.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-cape): Update to 0.7.

gnu: stex-bootstrap: Guard against unsupported systems.

The current implementation of nix-system->chez-machine et al. is rather
brittle and fails in unexpected ways.  In the meantime while a better
replacement is being built, prevent falsy return values from causing errors,
such as a failing “guix pull”.  See <https://issues.guix.gnu.org/54292>.

* gnu/packages/chez.scm (stex-bootstrap)[maybe-compile]: Use and=> to only
call chez-machine->threaded if nix-system->chez-machine returns a truthy
value.

gnu: gitg: Update to 41.

* gnu/packages/gnome.scm (gitg): Update to 41.
[arguments]: Drop ‘harden’ phase.
[inputs]: Replace gtkspell3 with gspell and gtksourceview-3 with gtksourceview.
[native-inputs]: Add python.

gnu: gitg: Use new package style.

* gnu/packages/gnome.scm (gitg)[arguments]: Use G-expressions.
[native-inputs]: Drop labels.

gnu: mumble: Enable tests.

* gnu/packages/telephony.scm (mumble)[#:tests?]: Drop argument.
[#:configure-flags]: Add “-Dtests=on”.

gnu: mumble: Update to 1.4.230.

* gnu/packages/telephony.scm (find-python-interpreter-cmake-modules):
New variable.
(mumble): Update to 1.4.230.
[source]: Adjust uri and snippet accordingly.
[arguments]: Change to a list of G-expressions.
<#:configure-flags>: New argument.
<#:phases>: Drop ‘configure’ (moved to configure-flags).
Add ‘unpack-submodules’, ‘fix-settings-crash’ and ‘hardcode-pulseaudio’.
[inputs]: Add glib and poco.

gnu: Add poco.

* gnu/packages/cpp.scm (poco): New variable.

gnu: opendht: Update to 2.3.4.

* gnu/packages/networking.scm (opendht): Update to 2.3.4.

gnu: icecat: Update to 91.7.0-guix0-preview1 [security fixes].

Includes fixes for CVE-2022-26381, CVE-2022-26383, CVE-2022-26384,
CVE-2022-26386, and CVE-2022-26387.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (%icecat-version, %icecat-build-id): Update.
(icecat-source): Update gnuzilla commit, base version, and hashes.

Revert "gnu: socat: Update to 1.7.4.3."

This reverts commit 3cd42883c4ad693ed1f79c6be35e1aa3e010e10a, which led
to ~13K rebuilds.

gnu: slurm <= 20.02: Build with '-fcommon'.

* gnu/packages/parallel.scm (slurm-20.02)[arguments]: New field.
(slurm-19.05, slumr-18.08): Inherit from it.

gnu: socat: Update to 1.7.4.3.

* gnu/packages/networking.scm (socat): Update to 1.7.4.3.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: blender: Enable boolean operations on meshes.

* gnu/packages/graphics.scm (blender)[inputs]: Add gmp.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Add cl-websocket-driver.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-websocket-driver, ecl-websocket-driver,
  sbcl-websocket-driver): New variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Add cl-sha1.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-sha1, ecl-sha1, sbcl-sha1): New variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Add cl-event-emitter.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-event-emitter, ecl-event-emitter,
  sbcl-event-emitter): New variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Add cl-fast-websocket.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-fast-websocket, ecl-fast-websocket,
  sbcl-fast-websocket): New variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: Add cl-template.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-template, ecl-template, sbcl-template): New
  variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: proot: Update to 5.3.0.

* gnu/packages/linux.scm (proot): Update to 5.3.0.
[arguments]: Adjust custom 'patch-sources phase to adjust skipped tests.

Revert "gnu: Add go-github-com-niemeyer-pretty."

This reverts commit 18b0527765301a3015afb9ba1209bd10f56426cb.

This package is not actually needed.

gnu: lvm2: Fix cross-compiling on some architectures.

* gnu/packages/linux.scm (lvm2)[native-inputs]: Add config.
[arguments]: Add phase to replace old versions of config.sub and
config.guess.

import: hackage: Use SRFI-71 instead of SRFI-11.

* guix/import/hackage.scm (read-cabal-and-hash)
(hackage-fetch-and-hash, hackage-fetch)
(hackage->guix-package): Use 'let' and 'let*' instead of 'let-values'
and 'let*-values'.

import: hackage: Avoid pointless use of 'compose'.

* guix/import/hackage.scm (hackage-module->sexp): Unroll pointless calls
to 'compose'.
(hackage->guix-package): Likewise.

scripts: import: gem: Fix recursive error handling.

Partly fixes <https://bugs.gnu.org/44115>.

* guix/scripts/import/gem.scm (guix-import-gem): Handle error.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

import: cran: Return multiple values for unknown packages.

Partly fixes <https://bugs.gnu.org/44115>.

* guix/import/pypi.scm (cran->guix-package): Return 'values'.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

import: elpa: Return multiple values for unknown packages.

Partly fixes <https://bugs.gnu.org/44115>.

* guix/import/elpa.scm (elpa->guix-package): Return values.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

import: hackage: Return multiple values for unknown packages.

Partly fixes <https://bugs.gnu.org/44115>.

* guix/import/hackage.scm (hackage->guix-package): Return 'values'.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

import: pypi: Return multiple values for unknown packages.

Partly fixes <https://bugs.gnu.org/44115>.

* guix/import/pypi.scm (pypi->guix-package): Return two values when
PROJECT is false.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

import: pypi: Gracefully handle missing project home page.

Fixes <https://issues.guix.gnu.org/54259>.
Reported by Ricardo Wurmus <rekado@elephly.net>.

* guix/import/pypi.scm (pypi->guix-package): Upon
'missing-source-error?', raise '&fix-hint' only if
'project-info-home-page' returns a non-empty string.

gnu: Add python-multipart.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-multipart): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add gnusim8085.

* gnu/packages/emulators.scm (gnusim8085): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

derivations: Coalesce inputs that have the same output path.

Fixes <https://issues.guix.gnu.org/54209>.

* guix/derivations.scm (coalesce-duplicate-inputs): Use the output paths
of DRV as a hash table key.
* tests/derivations.scm ("derivation with duplicate fixed-output
inputs"): Expect a single input for FINAL.
("derivation with equivalent fixed-output inputs"): New test.

gnu: scotch: Explicitly pass "-DINTSIZE" to CMake.

Previously, the 'scotch' and 'pt-scotch' packages would use the default
int size, which turned out to be 32 on x86_64-linux instead of 64 as it
used to be in Scotch 6.x.

* gnu/packages/maths.scm (scotch)[arguments]: Add "-DINTSIZE" to #:configure-flags.
(scotch32)[arguments]: Likewise.
(pt-scotch)[arguments]: Likewise.
(pt-scotch32)[arguments]: Likewise.

tests: Adjust to (guix import github) changes.

This is a followup to a8d3033da61958c53c44dd5db90672bfc4533ef9.

* tests/import-github.scm (call-with-releases): Mock
'open-connection-for-uri'.

system: Set kernel name for riscv64-linux.

* gnu/system.scm (system-linux-image-file-name): Add option for riscv64.

gnu: dtc: Use pkg-config-for-target.

* gnu/packages/bootloaders.scm (dtc)[arguments]: Adjust custom
'patch-pkg-config phase to use pkg-config-for-target.

gnu: dtc: Use different source tarball.

The xz compressed source failed to unpack on riscv64-linux.

* gnu/packages/bootloaders.scm (dtc)[source]: Use gzipped tarball.

build-system/meson: Add more cross-compilation targets.

* guix/build-system/meson.scm (make-machine-alist): Add riscv64-linux
option for cpu_family. Add riscv64-linux and powerpc-linux options for
endian.

gnu: squashfs-tools: Fix cross-compiling.

* gnu/packages/compression.scm (squashfs-tools)[arguments]: Adjust
make-flags to refer to the 'out' output specifically.

gnu: libcap: Fix cross-compiling.

* gnu/packages/linux.scm (libcap)[arguments]: Fix make-flags when
cross-compiling.

gnu: mtd-utils: Fix cross-compiling.

* gnu/packages/linux.scm (mtd-utils)[arguments]: Only add configure-flag
to enable unit-tests when not cross compiling.

gnu: libjpeg-turbo: Fix cross-compiling to riscv64-linux.

* gnu/packages/image.scm (libjpeg-turbo)[arguments]: When
cross-compiling to riscv64-linux correctly set CMAKE_SYSTEM_PROCESSOR.

gnu: libxrender: Fix cross compiling to riscv64-linux.

* gnu/packages/xorg.scm (libxrender)[arguments]: When cross compiling to
riscv64-linux replace config.sub and config.guess with newer versions.
[native-inputs]: When cross compiling to riscv64-linux add config.

gnu: libopenmpt: Update dependencies.

* gnu/packages/audio.scm (libopenmpt)[inputs]: Move libvorbis, mpg123,
zlib from here ...
[propagated-inputs]: ... to here. Add libogg.

gnu: icedove: Update to 91.6.2.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (icedove): Update to 91.6.2.

gnu: emacs-json-mode: Remove input for old versions.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-json-mode)[inputs]:
Remove emacs-json-reformat.

gnu: Add openriichi.

* gnu/packages/games.scm (openriichi): New variable.

gnu: Add siege.

* gnu/packages/web.scm (siege): New variable.

gnu: icecat: Update to 91.6.1-guix0-preview1 [security fixes].

Includes fixes for CVE-2022-26485 and CVE-2022-26486.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (%icecat-version, %icecat-build-id): Update.
(icecat-source): Update gnuzilla commit, base version, and hashes.

gnu: linux-libre 4.9: Update to 4.9.304.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9-version): Update to 4.9.304.
(linux-libre-4.9-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 4.14: Update to 4.14.269.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.269.
(linux-libre-4.14-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 4.19: Update to 4.19.232.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.232.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 5.4: Update to 5.4.182.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.182.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 5.10: Update to 5.10.103.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.10-version): Update to 5.10.103.
(linux-libre-5.10-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre: Update to 5.15.26.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.15-version): Update to 5.15.26.
(linux-libre-5.15-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 5.16: Update to 5.16.12.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.16-version): Update to 5.16.12.
(linux-libre-5.16-pristine-source): Update hash.

gnu: guile-ssh: Support cross-compilation.

Cross-compilation broke with the update to 0.15.1 in
eabc6af9b8b14bd629544e54bc9c9afa2d0dcd85.  'guile-snarf' would invoke
cpp instead of TRIPLET-cpp, which would thus fail to find libssh
headers.

* gnu/packages/ssh.scm (guile-ssh)[arguments]: Add
'support-cross-compilation' phase.

gnu: Add python-xmldiff.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-xmldiff): New variable.

Co-authored-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add jtdx.

* gnu/packages/radio.scm (jtdx-hamlib): New variable.
  (jtdx): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add python-stltools.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-stltools): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: gnome-shell-extension-gsconnect: Update to 48

* gnu/packages/gnome-xyz (gnome-shell-extension-gsconnect): Update to 48

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: cgdb: Reference gdb.

* gnu/packages/debug.scm (cgdb)[inputs]: Add gdb, bash-minimal
[arguments]: Add phase to fix hardcoded gdb and sh paths
Add configure flags for cross-compilation

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

import: github: Reuse HTTP connection for the /tags URL fallback.

* guix/import/github.scm (fetch-releases-or-tags): Call
'open-connection-for-uri' and reuse the same connection for the two
'http-fetch' calls.
* .dir-locals.el (scheme-mode): Add 'call-with-port'.

http-client: Correctly handle redirects when #:keep-alive? #t.

Previously PORT would be closed unconditionally, which broke redirects
when #:keep-alive? #t is given.

* guix/http-client.scm (http-fetch): Make 'port' a parameter of 'loop'.
Upon 3xx responses, do not close PORT is KEEP-ALIVE? is true, but consume
RESP's body.  Add second argument to 'loop'.

import: github: Gracefully handle rate limit exhaustion.

Previously, 'guix refresh' would literally crash when the rate limit was
reached due to the call to 'error'.  With this change, the updater
notices when the rate limit is reached and it turns itself into a no-op
until the rate limit has been reset.

When running "guix refresh" (with no arguments), the 'github' updater
gets used until the rate limit has been reached, after which "guix
refresh" automatically picks up the next valid updater, typically
'generic-git'.

* guix/import/github.scm (fetch-releases-or-tags): Use 'http-fetch'
directly instead of 'json-fetch' to let 'http-get-error?' exceptions
through.  Handle 403 errors with an 'X-RateLimit-Remaining' header.
(%rate-limit-reset-time): New variable.
(update-rate-limit-reset-time!, request-rate-limit-reached?): New
procedures.
(latest-released-version): Remove calls to 'error'.

http-client: Add response headers to '&http-get-error'.

* guix/http-client.scm (&http-get-error)[headers]: New field.
(http-fetch): Initialize the 'headers' field.

tests: Add (guix http-client) tests.

* tests/http-client.scm: New file.
* Makefile.am (SCM_TESTS): Add it.
* .dir-locals.el (scheme-mode): Add 'with-http-server'.

gnu: emacs-go-mode: Activate tests.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-go-mode)[arguments]: Activate tests.

gnu: emacs-go-mode: Update to 1.6.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-go-mode): Update to 1.6.0.
[arguments]: Remove unnecessary phase.

gnu: Add ncdu2.

* gnu/packages/ncdu.scm (ncdu2): New variable.

gnu: Add go-github-com-xdg-go-scram.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-xdg-go-scram): New variable.

gnu: Add go-github-com-xdg-go-pbkdf2.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-xdg-go-pbkdf2): New variable.

gnu: Add go-github-com-docker-go-units.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-docker-go-units): New variable.

gnu: Add go-github-com-niemeyer-pretty.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-niemeyer-pretty): New variable.

gnu: Add go-github-com-xdg-go-stringprep.

* gnu/packages/golang.scm (go-github-com-xdg-go-stringprep): New variable.

gnu: wob: Update to 0.13.

* gnu/packages/xdisorg.scm (wob): Update to 0.13.