utils: Add 'modify-phases'.

* guix/build/utils.scm (modify-phases): New macro.

build-system/gnu: Add support for zip archives.

Fixes <http://bugs.gnu.org/19866>.
Reported by Andreas Enge <andreas@enge.fr>.

* guix/build/gnu-build-system.scm (unpack): Use 'unzip' when SOURCE ends
  in '.zip'.

Merge branch 'master' into core-updates

services: slim: Add "F1 to change" in session message.

* gnu/services/xorg.scm (slim-service)[slim.cfg]: Add 'session_msg'.

services: slim: Preserve the order of session types.

That makes WindowMaker the default session, by default.

* gnu/services/xorg.scm (xsessions-directory)[builder]: Prepend a number
  in the file name to preserve the order of SESSIONS.
  (slim-service): Augment docstring.
* doc/guix.texi (X Window): Adjust accordingly.

gnu: openexr: Add synopsis.

* gnu/packages/graphics.scm (openexr)[synopsis]: Fill in.
  [description]: Improve.

gnu: grep: Apply fix for CVE-2015-1345.

* gnu/packages/patches/grep-CVE-2015-1345.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/base.scm (grep): Add patch.

gnu: samba: Update to 3.6.25.

* gnu/packages/samba.scm (samba): Update to 3.6.25.

gnu: e2fsprogs: Update to 1.42.12.

* gnu/packages/linux.scm (e2fsprogs): Update to 1.42.12.

doc: Remove reference to git submodules in HACKING.

* HACKING: Remove mention of git submodules.

gnu: icecat: Apply fixes for CVE-2015-{0822,0827,0831,0836}.

* gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0822.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0827-pt-1.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0827-pt-2.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0827-pt-3.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0831-pt-1.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0831-pt-2.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-01.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-02.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-03.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-04.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-05.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-06.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-07.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-08.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-09.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-10.patch,
  gnu/packages/patches/icecat-CVE-2015-0836-pt-11.patch: New files.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add them.
* gnu/packages/gnuzilla.scm (icecat)[source]: Add patches.

gnu: luajit: Fix patch file names in gnu-system.am.

* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Fix patch file names.

gnu: Fix luajit installation

* gnu/packages/lua.scm (luajit): Apply 2 patches.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Register 2 patches.
* gnu/packages/patches/luajit-no_ldconfig.patch: New file.
* gnu/packages/patches/luajit-symlinks.patch: New file.

gnu: Add avidemux.

* gnu/packages/video.scm (avidemux, avidemux-2.5): New variables.

build: Bump version number.

* configure.ac: Change to version 0.8.2.

ui: Add missing copyright line.

* guix/ui.scm: Add copyright line for Deck (aka. nebuli).

ui: Honor --no-* options passed via $GUIX_BUILD_OPTIONS.

Reported by Alex Kost <alezost@gmail.com>
at <http://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2015-02/msg00702.html>.

* guix/ui.scm (parse-command-line)[parse-options-from]: Add 'seeds'
  parameter.
  Thread the result of the first 'parse-options-from' call to the
  second.

ui: Factorize command-line + env. var. option parsing.

* guix/ui.scm (%default-argument-handler, parse-command-line): New
  procedures.
  (environment-build-options): Make private.
* guix/scripts/archive.scm (guix-archive)[parse-options,
  parse-options-from]: Remove.  Use 'parse-command-line' instead.
* guix/scripts/build.scm (guix-build): Likewise.
* guix/scripts/environment.scm (guix-environment): Likewise.
* guix/scripts/package.scm (guix-package): Likewise.
* guix/scripts/system.scm (guix-system): Likewise.
* tests/ui.scm (with-environment-variable): New macro.
  ("parse-command-line"): New test.

gnu: ffmpeg: Add soxr and twolame as inputs.

* gnu/packages/video.scm (ffmpeg): Add soxr and twolame as inputs.

gnu: nss-mdns: Use /var as the localstatedir.

Reported by Mark H Weaver <mhw@netris.org>
at <http://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2015-02/msg00686.html>.

* gnu/packages/avahi.scm (nss-mdns)[arguments]: Use
  --localstatedir=/var.

services: nscd: Make sure /var/db/nscd exists.

* gnu/services/base.scm (nscd-service)[activate]: Make /var/db/nscd.

gnu: Add CTL.

* gnu/packages/graphics.scm (ctl): New variable.

gnu: Add OpenEXR and IlmBase.

* gnu/packages/graphics.scm (ilmbase, openexr): New variables.
* gnu/packages/patches/openexr-missing-samples.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: Add portaudio.

* gnu/packages/audio.scm (portaudio): New variable.

gnu: Add twolame.

* gnu/packages/audio.scm (twolame): New variable.

gnu: Add soxr.

* gnu/packages/audio.scm (soxr): New variable.

gnu: Add soundtouch.

* gnu/packages/audio.scm (soundtouch): New variable.

gnu: Add libsbsms.

* gnu/packages/audio.scm (libsbsms): New variable.

gnu: Add cpufrequtils.

* gnu/packages/linux.scm (cpufrequtils): New variable.
* gnu/packages/patches/cpufrequtils-fix-aclocal.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Add it.

gnu: Add sysfsutils-1.

* gnu/packages/linux.scm (sysfsutils-1): New variable.

gnu: Add sysfsutils.

* gnu/packages/linux.scm (sysfsutils): New variable.

gnu: Add glibc-utf8-locales.

* gnu/packages/base.scm (glibc-utf8-locales): New variable.

gnu: python2-rdflib: Explicitly build with python-2.

* gnu/packages/rdf.scm (python2-rdflib): Add argument to build with python-2.

gnu: glibc: Change 'LOCPATH' specification to look for "lib/locale".

Suggested by Andreas Schwab <schwab@linux-m68k.org>
at <http://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2015-02/msg00652.html>.

* gnu/packages/base.scm (glibc)[native-search-paths]: Change
  "share/locale" to "lib/locale".

download: Cope with Guile 2.0.6 or earlier.

* guix/build/download.scm: Do not attempt to support relative URIs in
  "Location" headers if 'declare-relative-uri-header!' is not present.
  This is the case for Guile 2.0.6 or earlier.

gnu: Add python2-rdflib.

* gnu/packages/rdf.scm (python2-rdflib): New variable.
  (python-rdflib): Add patch.
* gnu/packages/patches/python2-rdflib-drop-sparqlwrapper.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Register patch.

gnu: python-html5lib: Add propagated input.

* gnu/packages/python.scm (python-html5lib): Add propagated input python-six.
  (python2-html5lib): Add propagated input python2-six.

gnu: Add python2-six.

* gnu/packages/python.scm (python2-six): New variable.

gnu: python-rdflib: Correct typo.

* gnu/packages/rdf.scm (python-rdflib): Correct typo in the name of an input.

gnu: glibc-locales: Install to lib/locales.

Suggested by Andreas Schwab <schwab@linux-m68k.org>
at <http://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2015-02/msg00652.html>.

* gnu/packages/base.scm (glibc-locales) <#:configure-flags>: Change
  "/share/locale" to "/lib/locale".

gnu: Add pumpa.

* gnu/packages/pumpio.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

guix system: Honor '--no-grub'.

Reported by Alex Kost <alezost@gmail.com>
at <http://lists.gnu.org/archive/html/guix-devel/2015-02/msg00564.html>.

* guix/scripts/system.scm (%options) <no-grub>: Use 'alist-cons' instead
  of 'alist-delete'.

artwork: Update to latest GRUB image.

* gnu/artwork.scm (%artwork-repository): Update to newer snapshot.

gnu: Sync GNU synopses and descriptions.

* gnu/packages/games.scm (gnugo): Adjust synopsis.
* gnu/packages/libffcall.scm (libffcall): Likewise.
* gnu/packages/lisp.scm (clisp): Adjust synopsis and description.

build: Reject or warn against file name length limit overruns.

* m4/guix.m4 (GUIX_TEST_ROOT_DIRECTORY, LINUX_HASH_BANG_LIMIT,
  SOCKET_FILE_NAME_LIMIT, GUIX_SOCKET_FILE_NAME_LENGTH,
  GUIX_TEST_SOCKET_FILE_NAME_LENGTH, GUIX_HASH_BANG_LENGTH,
  GUIX_CHECK_FILE_NAME_LIMITS): New macros.
* configure.ac: Use 'GUIX_CHECK_FILE_NAME_LIMITS'.
* config-daemon.ac: Use 'GUIX_TEST_ROOT_DIRECTORY'.
* test-env.in: Check socket name length and emit warning if it exceeds
  107.

build: Disable grafting in sanity checks.

* build-aux/check-available-binaries.scm: Wrap body in 'parameterize'
  form that clears '%graft?'.
* build-aux/check-final-inputs-self-contained.scm: Likewise.

gnu: Add TiMidity++.

* gnu/packages/audio.scm (timidity++): New variable.

gnu: Add Freepats.

* gnu/packages/audio.scm (freepats): New variable.

gnu: Add Stow.

* gnu/packages/package-management.scm (stow): New variable.

gnu: Add Test::Output.

* gnu/packages/perl.scm (perl-test-output): New variable.

gnu: Add Sub::Exporter.

* gnu/packages/perl.scm (perl-sub-exporter): New variable.

gnu: Add Data::OptList.

* gnu/packages/perl.scm (perl-data-optlist): New variable.

gnu: Add Capture::Tiny.

* gnu/packages/perl.scm (perl-capture-tiny): New variable.

gnu: Add Params::Util.

* gnu/packages/perl.scm (perl-params-util): New variable.

gnu: Add Sub::Install.

* gnu/packages/perl.scm (perl-sub-install): New variable.

gnu: Add Xournal.

* gnu/packages/pdf.scm (xournal): New variable.

licenses: Add IPA Font License.

* guix/licenses.scm (ipa): New variable.

Thank Daniel.

tests: Skip tests that would fail due to the shebang length.

Reported by Daniel Kochmański <dkochmanski@hellsgate.pl>.
Fixes <http://bugs.gnu.org/19888>.

* guix/tests.scm (shebang-too-long?): New procedure.
* tests/builders.scm ("gnu-build"): Conditionalize on
  not (shebang-too-long?).
* tests/packages.scm ("GNU Make, bootstrap"): Likewise.
* tests/guix-package.sh (shebang_not_too_long): New function.
  Use it to determine whether to build 'gnu-make-boot0'.

tests: Factorize the network reachability test.

* guix/tests.scm (network-reachable?): New procedure.
* tests/builders.scm (network-reachable?): Remove.
  Replace references to it with calls to the new 'network-reachable?'
  procedure.
* tests/derivations.scm (%coreutils): Use 'network-reachable?' instead
  of 'getaddrinfo'.
* tests/packages.scm: Likewise.
* tests/union.scm: Likewise.

gnu: ffmpeg-2.2: Update to 2.2.13

* gnu/packages/video.scm (ffmpeg-2.2): Update to version 2.2.13.

gnu: ffmpeg: Update to 2.5.4

* gnu/packages/video.scm (ffmpeg): Update to version 2.5.4.

gnu: Add CCL.

* gnu/packages/lisp.scm (ccl): New variable.

gnu: Add wxwidgets.

* gnu/packages/wxwidgets.scm: New file.
* gnu-system.am (GNU_SYSTEM_MODULES): Add it.

gnu: python2-oauthlib: Drop inherited fields.

* gnu/packages/python.scm (python2-oauthlib): Drop inherited fields.

gnu: i2c-tools: Add perl to inputs.

* gnu/packages/linux.scm (i2c-tools): Add perl to inputs.

gnu: Add i2c-tools.

* gnu/packages/linux.scm (i2c-tools): New variable.

gnu: Add libmspack.

* gnu/packages/compression.scm (libmspack): New variable.

gnu: vamp: Delete broken files from output.

See <https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/vamp-plugin-sdk/+bug/1253656>.

* gnu/packages/audio.scm (vamp): Delete "/lib/libvamp-sdk.la" and
  "/lib/libvamp-hostsdk.la" from the output directory after the install
  phase.

gnu: Add weex.

* gnu/packages/ftp.scm (weex): New variable.
* gnu/packages/patches/weex-vacopy.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Register patch.

gnu: isc-dhcp: Add inetutils to inputs.

* gnu/packages/admin.scm (isc-dhcp): Add inetutils to inputs, and
  add it to the PATH set by the wrapper around 'dhclient-script'.

gnu: chmlib: Patch for compilation on mips.

* gnu/packages/patches/chmlib-inttypes.patch: New file.
* gnu-system.am (dist_patch_DATA): Register patch.
* gnu/packages/ebook.scm (chmlib): Apply patch.

import: cpan: Update tests for dependency handling.

* tests/cpan.scm (test-json): Remove core module dependencies.
  [cpan->guix-package]: Add mock url handling for module api.
  Adjust expected native-inputs and license.

import: cpan: Change %corelist into a promise.

Fixes compilation failures in 'guix pull'.

* guix/import/cpan.scm (%corelist): Change it to a promise by wrapping it with
  'delay'.
  (cpan-module->sexp): Adapt uses of %corelist by wrapping with 'force'.

gnu: Add jalv.

* gnu/packages/audio.scm (jalv): New variable.

gnu: lilv: propagate inputs serd, sord and sratom.

* gnu/packages/audio.scm (lilv): move serd, sord and sratom to propagated
  inputs.

gnu: Add HTSeq.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (htseq): New variable.

gnu: Add libyaml.

* gnu/packages/web.scm (libyaml): New variable.

gnu: mpc: Update to 1.0.3.

* gnu/packages/multiprecision.scm (mpc): Update to 1.0.3.

gnu: pari-gp: Update to 2.7.3.

* gnu/packages/algebra.scm (pari-gp): Update to 2.7.3.

gnu: Add arpack-ng.

* gnu/packages/maths.scm (arpack-ng): New variable.

gnu: python-scipy: install UTF-8 locale.

* gnu/packages/python.scm (python-scipy): Install en_US.UTF-8 locale in
  install-doc phase to avoid encoding error.

gnu: matplotlib: install UTF-8 locale.

* gnu/packages/python.scm (python-matplotlib): Install en_US.UTF-8 locale in
  install-doc phase to avoid encoding error.

gnu: gnupg: Add version 2.1.2.

* gnu/packages/gnupg.scm (gnupg): Update to 2.1.2.
  (gnupg-2.0): Copy of previous package for version 2.0.26.

Add David Hashe to 'AUTHORS'.

gnu: Add exim.

* gnu/packages/mail.scm (exim): New variable.

gnu: Add gnugo.

* gnu/packages/games.scm (gnugo): New variable.

gnu: glibc: Disable parallel build.

* gnu/packages/base.scm (glibc)[arguments]: Disable parallel build.

gnu: Add npth.

* gnu/packages/gnupg.scm (npth): New variable.

gnu: Add Ant.

* gnu/packages/java.scm (ant): New variable.

gnu: Add RSeQC.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (rseqc): New variable.

gnu: libunistring: Update to 0.9.5.

* gnu/packages/libunistring.scm (libunistring): Update to 0.9.5.

download: Handle HTTP redirects to relative URI references.

Fixes <http://bugs.gnu.org/19840>.
Reported by Ricardo Wurmus <rekado@elephly.net>.

* guix/build/download.scm: On Guile 2.0.11 or earlier, redefine the http
  "Location" header to accept relative URIs.
  (resolve-uri-reference): New exported procedure.
  (http-fetch): Use 'resolve-uri-reference' to resolve redirections.
* guix/http-client.scm (http-fetch): Use 'resolve-uri-reference'

import: cpan: Use cpan mirror url.

* guix/import/cpan.scm (cpan-module->sexp)[source-url]: Substitute cpan mirror
  url.

import: cpan: Sort inputs.

* guix/import/cpan.scm (cpan-module->sexp)[convert-inputs]: Sort returned list
  of inputs.

import: cpan: Adjust licenses.

* guix/import/cpan.scm (string->license): Add artistic2.0.  Use
  '(package-license perl) for "perl_5" as is our convention.

import: cpan: Use corelist to filter dependencies.

* guix/import/cpan.scm (%corelist): New variable.
  (module->dist-name, core-module?): New procedures.
  (cpan-module->sexp)[convert-inputs]: Use them.  Include "test" dependencies
  in converted inputs.
* doc/guix.texi (Invoking guix import)[cpan]: Mention corelist filtering.

guix: licenses: Add Artistic 2.0 license.

* guix/licenses.scm (artistic2.0): New variable.

build-system/perl: Use Build.PL for builds if present.

* guix/build/perl-build-system.scm (configure): Use Build.PL if present.
  (build, check, install): New procedures.
  (%standard-phases): Replace build, check, and install phases.
* guix/build-system/perl (perl-build): Add make-maker? and module-build-flags
  arguments.
* doc/guix.texi (Build Systems)[perl-build-system]: Document behavior rsp.
  Build.PL and new arguments.

gnu: gnutls: Move which from 'propagated-inputs' to 'native-inputs'.

* gnu/packages/gnutls.scm (gnutls): Move which to 'native-inputs'.
  Comment on 'propagated-inputs'.