gnu: icedove: Compute a self-contained source.

This refactoring work is to prepare for adding a icedove-l10n package, which
will reuse that source.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (comm-source->locales+changset): New procedure.
(thunderbird-source): Rename to...
(thunderbird-comm-source): ... here.
(icedove-source): New variable.
(icedove) [source]: Use it.
[phases]: Remove the prepare-thunderbird-sources and rename-to-icedove phases.

gnu: Add a 'update-mozilla-locales' helper for maintenance.

* gnu/packages/gnuzilla.scm (update-mozilla-locales): New procedure.

gnu: hplip-next: Simplify the fix-more-hard-coded-file-names phase.

* gnu/packages/cups.scm (hplip-next) [phases]: Only substitute python files in
the fix-more-hard-coded-file-names phase.  This greatly reduce the time taken
by the phase (from 21 s to 0.4 s) on my system, and is functionally
equivalent.

gnu: Add ddd.

* gnu/packages/debug.scm (ddd): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: emacs-vterm: Include etc directory in installed files.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-vterm)[arguments]<#:include>: Add
"^etc/.*" to the list of regexes for installed files.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: emacs-gnuplot: Update to 0.8.1.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-gnuplot): Update to 0.8.1.

gnu: emacs-goggles: Update to 0.3.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-goggles): Update to 0.3.
[description]: Use proper capitalization.

gnu: emacs-project: Update to 0.9.7.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-project): Update to 0.9.7.

gnu: php: Drop a failed test for riscv64.

* gnu/packages/php (php): Drop a failed test for riscv64.
[source, arguments, description]: Fix formatting.

guix: Show better progress bars.

Style provides information on the characters to use before and after the
progress bar content (`[` and `]` for the ascii style), as well as the
character for filled step (`#` for ascii style).  When supported, it
provides intermediate steps.  This is used for unicode style, to show
better precision.

* guix/progress.scm (<progress-bar-style>): New record type.
(ascii-bar-style, unicode-bar-style): New variables.
(progress-bar): Draw progress depending on style.  When supported, use
unicode style.  Fall back to ascii style.

gnu: Use unifont by default in TTYs.

It has even better language support than LatGrkCyr-8x16 and can show
fancy progress bars.

* gnu/services/base.scm (%default-console-font): Use unifont.

gnu: dino: Fix comment for pango-next.

Pango 1.5 is a rather old version ;)

* gnu/packages/messaging.scm (dino)[inputs]: Fix comment next to pango-next.

gnu: guile-filesystem: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/guile-xyz.scm (guile-filesystem): Update to 0.2.0.
[source]<url>: Use “https://gitlab.com/lilyp/guile-filesystem”.
[home-page]: Likewise.
(guile2.0-filesystem): Deleted variable.

gnu: hyfetch: Update to 1.4.6.

* gnu/packages/patches/hyfetch-fix-generator-script-quotation-escaping.patch:
New file.
* gnu/packages/patches/hyfetch-remove-old-catchy-os-py.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add them.
* gnu/packages/admin.scm (hyfetch)[source]: Update to 1.4.6.
Switch to git source and add patches.
[inputs]: Remove python-hypy-utils.
[arguments]<#:phases>: Remove set-HOME phase.

Signed-off-by: Liliana Marie Prikler <liliana.prikler@gmail.com>

gnu: Add emacs-pasp-mode.

* gnu/packages/patches/emacs-pasp-mode-quote-file-names.patch: New file.
* gnu/local.mk: Register it here.
* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-pasp-mode): New variable.

gnu: Add python-clorm.

* gnu/packages/maths.scm (python-clorm): New variable.

gnu: python-clingo: Install distribution information.

* gnu/packages/maths.scm (python-clingo)[#:phases]: Add ‘install-distinfo’.

gnu: racket: Update to 8.8.

* gnu/packages/patches/racket-backport-8.7-pkg-strip.patch: Remove file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Delete it.
* gnu/packages/racket.scm (%racket-origin)[patches]: Likewise.
(%racket-version): Update to 8.8.
(%zuo-version): Update to 1.6.
(racket)[inputs]<algol60, cext-lib, deinprogramm, draw, drracket>
<expeditor, gui, htdp, math, pict, r5rs, redex, sasl, scribble>
<typed-racket, string-constants, syntax-color>: Update checksums.
* gnu/packages/chez.scm (chez-scheme-for-racket): Update to
9.9.9-pre-release.14.

Signed-off-by: Liliana Marie Prikler <liliana.prikler@gmail.com>

gnu: dino: Update to 0.4.0.

* gnu/packages/messaging.scm (dino): Update to 0.4.0.
[inputs]: Replace gtk+ with gtk.
Replace pango with pango-next.
Add bash-minimal and libadwaita.

Signed-off-by: Liliana Marie Prikler <liliana.prikler@gmail.com>

gnu: hplip-next: Update to 3.22.10.

* gnu/packages/cups.scm (hplip-next): Update to 3.22.10.

gnu: Add hplip-next.

* gnu/packages/cups.scm (hplip-next): New variable.

gnu: Add r-longdat.

* gnu/packages/cran.scm (r-longdat): New variable.

gnu: Add r-bestnormalize.

* gnu/packages/cran.scm (r-bestnormalize): New variable.

gnu: Add r-butcher.

* gnu/packages/cran.scm (r-butcher): New variable.

gnu: Add r-lambertw.

* gnu/packages/cran.scm (r-lambertw): New variable.

gnu: Add r-lamw.

* gnu/packages/cran.scm (r-lamw): New variable.

gnu: Add r-effsize.

* gnu/packages/cran.scm (r-effsize): New variable.

gnu: Add r-filesstrings.

* gnu/packages/cran.scm (r-filesstrings): New variable.

gnu: Add r-strex.

* gnu/packages/cran.scm (r-strex): New variable.

gnu: libreoffice: Fix password encryption issue.

Fixes <https://issues.guix.gnu.org/59292>.

* gnu/packages/libreoffice.scm (libreoffice) [phases]: Add a
augment-LD_LIBRARY_PATH phase.

gnu: libreoffice: Enable logging system.

* gnu/packages/libreoffice.scm (libreoffice)
[configure-flags]: Add --enable-sal-log.

gnu: xmlsec: Update to 1.2.37.

* gnu/packages/xml.scm (xmlsec): Update to 1.2.37.

gnu: python-pygit2: Update to 1.11.1.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pygit2): Update to 1.11.1.
[build-system]: Use pyproject-build-system.
[arguments]: Delete field.
[propagated-inputs]: Remove python-cached-property.

gnu: audacity: Update to 3.2.4.

* gnu/packages/audio.scm (audacity): Update to 3.2.4.

gnu: r-naniar: Update to 1.0.0.

* gnu/packages/statistics.scm (r-naniar): Update to 1.0.0.
[propagated-inputs]: Add r-cli and r-vctrs.

gnu: r-forcats: Update to 1.0.0.

* gnu/packages/statistics.scm (r-forcats): Update to 1.0.0.
[propagated-inputs]: Remove r-ellipsis and r-withr.

gnu: r-lubridate: Update to 1.9.1.

* gnu/packages/statistics.scm (r-lubridate): Update to 1.9.1.

gnu: r-pbkrtest: Update to 0.5.2.

* gnu/packages/statistics.scm (r-pbkrtest): Update to 0.5.2.
[propagated-inputs]: Remove r-magrittr.

gnu: r-pbapply: Update to 1.7-0.

* gnu/packages/statistics.scm (r-pbapply): Update to 1.7-0.

gnu: r-sourcetools: Update to 0.1.7-1.

* gnu/packages/statistics.scm (r-sourcetools): Update to 0.1.7-1.

gnu: r-biased-urn: Update to 2.0.9.

* gnu/packages/statistics.scm (r-biased-urn): Update to 2.0.9.

gnu: r-purrr: Update to 1.0.1.

* gnu/packages/statistics.scm (r-purrr): Update to 1.0.1.

gnu: r-tidyr: Update to 1.3.0.

* gnu/packages/statistics.scm (r-tidyr): Update to 1.3.0.
[propagated-inputs]: Remove r-ellipsis; add r-cli and r-stringr.

gnu: r-e1071: Update to 1.7-13.

* gnu/packages/statistics.scm (r-e1071): Update to 1.7-13.

gnu: r-pkgmaker: Update to 0.32.7.

* gnu/packages/statistics.scm (r-pkgmaker): Update to 0.32.7.

gnu: r-rcurl: Update to 1.98-1.10.

* gnu/packages/statistics.scm (r-rcurl): Update to 1.98-1.10.

gnu: r-rmarkdown: Update to 2.20.

* gnu/packages/statistics.scm (r-rmarkdown): Update to 2.20.

gnu: r-rcpparmadillo: Update to 0.11.4.3.1.

* gnu/packages/statistics.scm (r-rcpparmadillo): Update to 0.11.4.3.1.

gnu: r-git2r: Update to 0.31.0.

* gnu/packages/statistics.scm (r-git2r): Update to 0.31.0.

gnu: r-ade4: Update to 1.7-22.

* gnu/packages/statistics.scm (r-ade4): Update to 1.7-22.
[propagated-inputs]: Add r-rcpp and r-rcpparmadillo.

gnu: r-chron: Update to 2.3-59.

* gnu/packages/statistics.scm (r-chron): Update to 2.3-59.

gnu: r-dbplyr: Update to 2.3.0.

* gnu/packages/statistics.scm (r-dbplyr): Update to 2.3.0.

gnu: r-dplyr: Update to 1.1.0.

* gnu/packages/statistics.scm (r-dplyr): Update to 1.1.0.
[propagated-inputs]: Add r-cli.

gnu: r-pryr: Update to 0.1.6.

* gnu/packages/statistics.scm (r-pryr): Update to 0.1.6.

gnu: r-knitr: Update to 1.42.

* gnu/packages/statistics.scm (r-knitr): Update to 1.42.
[propagated-inputs]: Remove r-stringr.

gnu: r-yaml: Update to 2.3.7.

* gnu/packages/statistics.scm (r-yaml): Update to 2.3.7.

gnu: r-markdown: Update to 1.5.

* gnu/packages/statistics.scm (r-markdown): Update to 1.5.
[propagated-inputs]: Remove r-mime.

gnu: r-formatr: Update to 1.14.

* gnu/packages/statistics.scm (r-formatr): Update to 1.14.

gnu: r-evaluate: Update to 0.20.

* gnu/packages/statistics.scm (r-evaluate): Update to 0.20.

gnu: r-bh: Update to 1.81.0-1.

* gnu/packages/statistics.scm (r-bh): Update to 1.81.0-1.

gnu: r-svglite: Update to 2.1.1.

* gnu/packages/statistics.scm (r-svglite): Update to 2.1.1.

gnu: r-gdtools: Update to 0.3.0.

* gnu/packages/statistics.scm (r-gdtools): Update to 0.3.0.
[propagated-inputs]: Add r-gfonts, r-htmltools, and r-memoise.

gnu: r-stringi: Update to 1.7.12.

* gnu/packages/statistics.scm (r-stringi): Update to 1.7.12.

gnu: r-spatial: Update to 7.3-16.

* gnu/packages/statistics.scm (r-spatial): Update to 7.3-16.

gnu: r-nlme: Update to 3.1-162.

* gnu/packages/statistics.scm (r-nlme): Update to 3.1-162.

gnu: r-codetools: Update to 0.2-19.

* gnu/packages/statistics.scm (r-codetools): Update to 0.2-19.

gnu: r-class: Update to 7.3-21.

* gnu/packages/statistics.scm (r-class): Update to 7.3-21.

gnu: r-mass: Update to 7.3-58.2.

* gnu/packages/statistics.scm (r-mass): Update to 7.3-58.2.

gnu: r-paws-compute: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-compute): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-storage: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-storage): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-networking: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-networking): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-management: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-management): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-machine-learning: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-machine-learning): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-analytics: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-analytics): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-security-identity: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-security-identity): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-application-integration: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-application-integration): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-end-user-computing: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-end-user-computing): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-developer-tools: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-developer-tools): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-cost-management: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-cost-management): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-customer-engagement: Update to 0.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-customer-engagement): Update to 0.2.0.

gnu: r-paws-common: Update to 0.5.5.

* gnu/packages/cran.scm (r-paws-common): Update to 0.5.5.

gnu: r-protolite: Update to 2.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-protolite): Update to 2.2.0.

gnu: r-vroom: Update to 1.6.1.

* gnu/packages/cran.scm (r-vroom): Update to 1.6.1.

gnu: r-rjsonio: Update to 1.3-1.8.

* gnu/packages/cran.scm (r-rjsonio): Update to 1.3-1.8.

gnu: r-delaporte: Update to 8.1.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-delaporte): Update to 8.1.0.

gnu: r-lwgeom: Update to 0.2-11.

* gnu/packages/cran.scm (r-lwgeom): Update to 0.2-11.

gnu: r-pdftools: Update to 3.3.3.

* gnu/packages/cran.scm (r-pdftools): Update to 3.3.3.

gnu: r-ragg: Update to 1.2.5.

* gnu/packages/cran.scm (r-ragg): Update to 1.2.5.

gnu: r-highlight: Update to 0.5.1.

* gnu/packages/cran.scm (r-highlight): Update to 0.5.1.

gnu: r-vdiffr: Update to 1.0.5.

* gnu/packages/cran.scm (r-vdiffr): Update to 1.0.5.

gnu: r-phangorn: Update to 2.11.1.

* gnu/packages/cran.scm (r-phangorn): Update to 2.11.1.

gnu: r-seqminer: Update to 8.6.

* gnu/packages/cran.scm (r-seqminer): Update to 8.6.

gnu: r-conflicted: Update to 1.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-conflicted): Update to 1.2.0.
[propagated-inputs]: Add r-cli.

gnu: r-modeldata: Update to 1.1.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-modeldata): Update to 1.1.0.

gnu: r-janitor: Update to 2.2.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-janitor): Update to 2.2.0.
[propagated-inputs]: Add r-hms.

gnu: r-tidypredict: Update to 0.5.

* gnu/packages/cran.scm (r-tidypredict): Update to 0.5.
[propagated-inputs]: Remove r-stringr.

gnu: r-flexsurv: Update to 2.2.2.

* gnu/packages/cran.scm (r-flexsurv): Update to 2.2.2.

gnu: r-visdat: Update to 0.6.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-visdat): Update to 0.6.0.
[propagated-inputs]: Add r-cli, r-forcats, and r-scales.

gnu: r-clusterr: Update to 1.3.0.

* gnu/packages/cran.scm (r-clusterr): Update to 1.3.0.
[propagated-inputs]: Remove r-gtools.

gnu: r-rcpptoml: Update to 0.2.2.

* gnu/packages/cran.scm (r-rcpptoml): Update to 0.2.2.