system: Add helper file-system-mount-point-predicate.

* gnu/system/file-systems.scm (file-system-mount-point-predicate): Add
it.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gexp: 'computed-file' always uses a native Guile.

Fixes a regression whereby, when cross-compiling, 'computed-file' would
use a cross-compiled Guile as its builder, which would fail to run.

Regression introduced in af57d1bf6c46f47d82dbc234dde1e16fa8634e9d (the
problem had always been there but was hidden before behind the (not guile)
condition.)

* guix/gexp.scm (computed-file-compiler): For 'guile', pass #:target #f.
* tests/gexp.scm ("lower-object, computed-file, #:target"): New test.

gnu: welle-io: Update to 2.4.

* gnu/packages/radio.scm (welle-io): Update to 2.4.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: python-gffutils: Update to 0.10.1.

* gnu/packages/bioinformatics.scm (python-gffutils): Update to 0.10.1.
[arguments]: Remove obsolete phase.  Respect TESTS? in check phase while at
it.

gnu: python-argh: Fix test failure.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-argh)[arguments]: Add patch-tests phase
and override check phase.

gnu: python-pyelftools: Update to 0.28.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-pyelftools): Update to 0.28.
[source]: Change to GIT-FETCH.
[source](snippet): New field.
[arguments]: Override check phase.

gnu: python-warcio: Fix test failure.

* gnu/packages/python-web.scm (python-warcio)[arguments]: Invoke pytest
directly instead of going through setup.py.  Skip three more tests.

gnu: python-drmaa: Remove unused input.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-drmaa)[native-inputs]: Remove.

gnu: python-drmaa: Fix build failure.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-drmaa)[arguments]: Disable sanity
checks.

gnu: python-psutil: Update to 5.9.0.

* gnu/packages/python-xyz.scm (python-psutil): Update to 5.9.0.

gnu: emacs-which-key: Update to 3.6.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-which-key): Update to 3.6.0.

profiles: texlive-font-maps: Create ls-R file.

* guix/profiles.scm (texlive-font-maps): Run mktexlsr on resulting tree to
provide ls-R file.

gnu: Add nitrokey-app.

* gnu/packages/crates-io.scm (nitrokey-app): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add cppcodec.

* gnu/packages/crates-io.scm (cppcodec): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: Add libnitrokey.

* gnu/packages/security-token.scm (libnitrokey): New variable.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: fcitx5-gtk: Split IM module output for different version of GTK.

* gnu/packages/fcitx5.scm (fcitx5-gtk)[arguments]: Use G-Expression.

<phases>: Split input method module into different outputs for GTK2, GTK3 and GTK4.

Now default output only provides GLib client of Fcitx5.

[inputs]: Use label-less style inputs.
[outputs]: Add new "gtk3" output.

[synopsis]: Fix typo.
[description]: Describe the functionality of each output.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: fcitx5-gtk: Add GTK 4 support.

* gnu/packages/fcitx5.scm (fcitx5-gtk)[arguments]:
<configure-flags>: Enable GTK 4 IM module.
<phases>: In 'patch-install-prefix', patch the install prefix of GTK 4 IM
module.
[inputs]: Add GTK 4.
[outputs]: Add 'gtk4'.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: elixir: Fix regex for ERTS_BIN substitution.

* gnu/packages/elixir.scm (elixir)[arguments]: In 'replace-paths' phase,
change "ERTS_BIN" regexp.

Signed-off-by: Ludovic Courtès <ludo@gnu.org>

gnu: elixir: Fix file name argument to 'search-input-file'.

Reported by John Hamelink <me@johnhame.link>
and Cees de Groot <cg@evrl.com>.

Regression introduced in 3da297997dad5b3525277fcecdca84f01d45b104.

* gnu/packages/elixir.scm (elixir)[arguments]: In 'replace-paths' phase,
search for "/bin/sh", not "sh".

pull: '--list-generations' pipes its output to the pager.

* guix/scripts/pull.scm (process-query): For 'list-generations queries,
use 'with-paginated-output-port'.
(display-news-entry-title): Pass second argument to 'highlight'.
(display-news-entry): Pass second argument to 'dim'.

ui: 'display-generation' uses color when talking to a pager.

This makes sure that, say, 'guix pull -l' benefits from colors when its
output is piped to a pager, as long as the underlying terminal supports
it.

* guix/ui.scm (display-generation): Add second argument to 'highlight'.

ui: 'with-paginated-output-port' gives access to the wrapped port.

* guix/ui.scm (pager-port-mapping): New variable.
(pager-wrapped-port): New procedure.
(call-with-paginated-output-port): Parameterize 'pager-port-mapping'.

pull: '--list-generations' lists packages only with '--details'.

* guix/scripts/pull.scm (show-help, %options): Add "--details".
(process-query): Honor it.
* doc/guix.texi (Invoking guix pull): Document it.

gnu: Remove glibc@2.2.5 and gcc-2.95-wrapper.

This reverts commits a95924c9ac3f238cde243c96d552ff59ad77ca16 and
defa85b26537a3cc20624fb9dbcae906226361d5, which were used to build
nhc98@1.22 but are no longer needed.

* gnu/packages/base.scm (glibc-2.2.5): Remove.
* gnu/packages/commencement.scm (gcc-2.95-wrapper): Remove.
(glibc-mesboot0, gcc-mesboot0, binutils-mesboot): Keep private.

gnu: ghc@4: Build without referring to packages in commencement.scm.

* gnu/packages/haskell.scm (ghc-4)[arguments]: Remove #:implicit-inputs?.
In 'bootstrap' phase, pass '-optc-D_GNU_SOURCE=1'.  Use
'search-input-file' to locate lib{bfd,iberty}.a, and 'which' for cpp.
Patch 'mk/config.mk.in'.  In 'configure' phase, emit "config.cache".
In 'make-boot' phase, replace "CLK_TCK" in 'nHandle.c'.
[native-inputs]: Remove now-implicit inputs; remove GLIBC-2.2.5,
GCC-MESBOOT0, and BINUTILS-MESBOOT.  Add GCC-2.95 and BINUTILS-2.33.
Remove input labels.

gnu: ghc@4: Use 'search-patches'.

* gnu/packages/haskell.scm (ghc-4)[source]: Use 'search-patches'.

gnu: gcc: Add 2.95.

* gnu/packages/gcc.scm (gcc-2.95): New variable.

gnu: nhc98: Build with the current tool chain.

* gnu/packages/patches/nhc98-c-update.patch: New file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Add it.
* gnu/packages/haskell.scm (nhc98)[source]: Use it.
[arguments]: Remove #:implicit-inputs?.
[native-inputs]: Remove.

gnu: xournalpp: Use G-expressions.

* gnu/packages/pdf.scm (xournalpp)[arguments]: Use G-expressions.
<#:phases>: Replace WHICH with SEARCH-INPUT-FILES.

gnu: xournalpp: Remove input labels.

* gnu/packages/pdf.scm (xournalpp)[native-inputs]: Remove labels.

gnu: xournalpp: Update to 1.1.1.

* gnu/packages/pdf.scm (xournalpp): Update to 1.1.1.
[arguments]<#:phases>: Remove unnecessary phase.

publish: Do not sign the URL/Compression/FileSize narinfo fields.

This will allow mirror operators to alter these non-normative bits of a
narinfo without having to resign narinfos.

* guix/scripts/publish.scm (narinfo-string): Remove
URL/Compression/FileSize from BASE-INFO.  Move them after "Signature".
* tests/publish.scm ("/*.narinfo")
("/*.narinfo with properly encoded '+' sign")
("/*.narinfo with lzip + gzip")
("with cache, lzip + gzip"): Adjust accordingly.
* tests/substitute.scm ("query narinfo with signature over relevant subset"):
New test.

git-authenticate: Ensure the target is a descendant of the introductory commit.

Fixes a bug whereby authentication of a commit *not* descending from the
introductory commit could succeed, provided the commit verifies the
authorization invariant.

In the example below, A is a common ancestor of the introductory commit
I and of commit X.  Authentication of X would succeed, even though it is
not a descendant of I, as long as X is authorized according to the
'.guix-authorizations' in A:

   X     I
    \   /
      A

This is because, 'authenticate-repository' would not check whether X
descends from I, and the call (commit-difference X I) would return X.

In practice that only affects forks because it means that ancestors of
the introductory commit already contain a '.guix-authorizations' file.

* guix/git-authenticate.scm (authenticate-repository): Add call to
'commit-descendant?'.
* tests/channels.scm ("authenticate-channel, not a descendant of introductory commit"):
New test.
* tests/git-authenticate.scm ("authenticate-repository, target not a descendant of intro"):
New test.
* tests/guix-git-authenticate.sh: Expect earlier test to fail since
9549f0283a78fe36f2d4ff2a04ef8ad6b0c02604 is not a descendant of
$intro_commit.  Add new test targeting an ancestor of the introductory
commit, and another test targeting the v1.2.0 commit.
* doc/guix.texi (Specifying Channel Authorizations): Add a sentence.

git: Add 'commit-descendant?'.

* guix/git.scm (commit-descendant?): New procedure.
* tests/git.scm ("commit-descendant?"): New test.

git-authenticate: Test introductory commit signature verification.

These tests mimic similar tests already in 'tests/channels.scm', but
without using the higher-level 'authenticate-channel'.

* tests/git-authenticate.scm ("introductory commit, valid signature")
("introductory commit, missing signature")
("introductory commit, wrong signature"): New tests.

tests: Set a hard build timeout.

* guix/tests.scm (open-connection-for-tests): Pass #:timeout to
'set-build-options'.
(call-with-external-store): Add call to 'set-build-options'.

gnu: emacs-howm: Update to 1.4.8.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-howm): Update to 1.4.8.

gnu: emacs-package-lint: Update to 0.16.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-package-lint): Update to 0.16.

gnu: tiled: Update to 1.8.1.

* gnu/packages/game-development.scm (tiled): Update to 1.8.1.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: neon: Update to 0.32.2.

* gnu/packages/version-control.scm (neon): Update to 0.32.2.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: srain: Update to 1.3.2.

* gnu/packages/irc.scm (srain): Update to 1.3.2.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: hexchat: Update to 2.16.1.

* gnu/packages/messaging.scm (hexchat): Update to 2.16.1.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add rtss.

* gnu/packages/rust-apps.scm (rtss): New variable.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: feh: Update to 3.8.

* gnu/packages/image-viewers.scm (feh): Update to 3.8.
[inputs]: Sort lexically.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: udpcast: Update to 20211207.

* gnu/packages/admin.scm (udpcast): Update to 20211207.
[source]: Remove buildroot.net uri.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: alfis: Fix build.

* gnu/packages/rust-apps: (alfis): [arguments]<#:phases>:
Relax the rust-zeroize requirements for rust-chacha20poly1305
and rust-chacha20 in the 'relax-requirements' phase.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: rust-chacha20poly1305: Fix build.

* gnu/packages/crates-io: (rust-chacha20poly1305):
[arguments]<#:phases>: Add a new 'relax-requirements' phase.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: xfce4-notifyd: Update to 0.6.3.

* gnu/packages/xfce.scm (xfce4-notifyd): Update to 0.6.3.

Signed-off-by: Nicolas Goaziou <mail@nicolasgoaziou.fr>

gnu: Add cl-wordnet.

* gnu/packages/lisp-xyz.scm (cl-wordnet, ecl-wordnet, sbcl-wordnet): New
  variables.

Signed-off-by: Guillaume Le Vaillant <glv@posteo.net>

gnu: freecad: Update to 0.19.3-0.09a05a9.

* gnu/packages/engineering.scm (freecad): Update to 0.19.3-0.09a05a9.
  [source]: Remove patches.
  [arguments]: Remove unneeded variables for pyside2 and shiboken2 from
  'configure-flags'.
* gnu/packages/patches/freecad-boost-serialization.patch: Remove file.
* gnu/packages/patches/freecad-vtk9.patch: Remove file.
* gnu/locak.mk (dist_patch_DATA): Remove "freecad-boost-serialization.patch"
  and "freecad-vtk9.patch".

gnu: WebKitGTK: Update to 2.34.5 [security fixes].

Fixes CVE-2022-22589, CVE-2022-22590, CVE-2022-22592:

https://webkitgtk.org/security/WSA-2022-0002.html

* gnu/packages/webkit.scm (webkitgtk): Update to 2.34.5.

gnu: non-sequencer: Build with libsigc++ 2.

This fixes the build:

------
Configuring sequencer
Checking for 'sigc++-2.0' >= 2.0.0                   : not found
The configuration failed
------

* gnu/packages/music.scm (non-sequencer)[inputs]: Replace libsigc++ with
libsigc++-2.

gnu: qview: Update to 5.0.

* gnu/packages/image-viewers.scm (qview): Update to 5.0.
[build-system]: Use QT-BUILD-SYSTEM.
[arguments]<#:phases>: Use G-expressions.  Remove trailing #T.  Add a new phase
for tests.
[native-inputs]: Add QTTOOLS.
[inputs]: Re-order alphabetically.

gnu: Mutt: Update to 2.2.0.

* gnu/packages/mail.scm (mutt): Update to 2.2.0.

gnu: libngspice: Update to 36.

* gnu/packages/engineering.scm (libngspice, ngspice): Update to 36.
(libngspice)[inputs]: Remove labels.

gnu: cozy: Update to 1.2.0.

* gnu/packages/ebook.scm (cozy): Update to 1.2.0.
[native-inputs]: Remove labels.
[inputs]: Add bash-minimal to please 'guix lint'.

gnu: gnome-commander: Update to 1.14.0.

* gnu/packages/gnome.scm (gnome-commander): Update to 1.14.0.
[native-inputs]: Add flex.
[inputs]: Remove deprecated gnome-vfs. Add glib.

gnu: python-astropy: Update to 5.0.1.

* gnu/packages/astronomy.scm (python-astropy): Update to 5.0.1.

gnu: libredwg: Update to 0.12.5.

* gnu/packages/engineering.scm (libredwg): Update to 0.12.5.
[native-inputs]: Remove labels.

gnu: openxr: Update to 1.0.22.

* gnu/packages/graphics.scm (openxr): Update to 1.0.22.

gnu: linux-libre 4.14.266: Fix source code hash.

This is a followup to commit 54ac2ec4e95a3ef7f95dcbc03089fbffc47e609b.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.14-pristine-source): Fix hash.

gnu: linux-libre 4.9: Update to 4.9.301.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.9-version): Update to 4.9.301.
(linux-libre-4.9-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 4.14: Update to 4.14.266.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.14-version): Update to 4.14.266.
(linux-libre-4.14-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 4.19: Update to 4.19.229.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-4.19-version): Update to 4.19.229.
(linux-libre-4.19-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 5.4: Update to 5.4.179.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.4-version): Update to 5.4.179.
(linux-libre-5.4-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 5.10: Update to 5.10.100.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.10-version): Update to 5.10.100.
(linux-libre-5.10-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre: Update to 5.15.23.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.15-version): Update to 5.15.23.
(linux-libre-5.15-pristine-source): Update hash.

gnu: linux-libre 5.16: Update to 5.16.9.

* gnu/packages/linux.scm (linux-libre-5.16-version): Update to 5.16.9.
(linux-libre-5.16-pristine-source): Update hash.

gnu: cpu: Add detection for AMD CPUs.

* guix/cpu.scm <cpu>: Add vendor field.
(current-cpu): Also fill in the 'vendor' field.
(cpu->gcc-architecture): Add detection logic for AMD CPUs.

guix: cpu: Rewrite based on feature flags.

* guix/cpu.scm (cpu->gcc-architecture): Rewrite detection based on
detected feature flags.

gnu: gcc: Add compiler-cpu-architectures for armhf.

* gnu/packages/gcc.scm (%gcc-7.5-armhf-micro-architectures,
%gcc-10-armhf-micro-architectures): New variables.
(gcc-7, gcc-10)[properties]: Add armhf compiler-cpu-architectures.

gnu: gcc: Add compiler-cpu-architectures for aarch64.

* gnu/packages/gcc.scm (%gcc-7.5-aarch64-micro-architectures,
%gcc-10-aarch64-micro-architectures): New variables.
(gcc-7, gcc-10)[properties]: Add aarch64 compiler-cpu-architectures.

gnu: monado: Remove input labels.

* gnu/packages/graphics.scm (monado)[inputs]: Remove labels.

gnu: monado: Provide missing input.

* gnu/packages/graphics.scm (monado)[inputs]: Add PYTHON.

gnu: fping: Update to 5.1.

* gnu/packages/networking.scm (fping): Update to 5.1.

doc: Zabbix: Improvide description.

* doc/guix.texi (Monitoring Services): Document the various 'zabbix-*' service
types, and expand description of all Zabbix services.  Use less marketing terms.
(Web Services): Add subsubheading for PHP-FPM, and anchors for
cross-referencing.
* gnu/services/monitoring.scm (zabbix-front-end-configuration): Use @ref
instead of @pxref for cross-referencing.

gnu: Zabbix: Update to 5.4.10.

* gnu/packages/monitoring.scm (zabbix-agentd): Update to 5.4.10.
[source](snippet): Simplify fping substitution.

gnu: zabbix-agentd: Use the correct license.

* gnu/packages/monitoring.scm (zabbix-agentd)[license]: Change from GPL2 to GPL2+.

gnu: zabbix-agentd: Add release-monitoring-url.

* gnu/packages/monitoring.scm (zabbix-agentd)[properties]: New field.

gnu: qt5ct: Update to 1.5.

* gnu/packages/qt.scm (qt5ct): Update to 1.5.
[arguments]: Remove trailing #t.

gnu: enlightenment: Update to 0.25.3.

* gnu/packages/enlightenment.scm (enlightenment): Update to 0.25.3.

gnu: Add julia-optim.

* gnu/packages/julia-xyz.scm (julia-optim): New variable.

gnu: Add julia-linesearches.

* gnu/packages/julia-xyz.scm (julia-linesearches): New variable.

gnu: dino: Update to 0.3.0.

* gnu/packages/messaging.scm (dino): Update to 0.3.0.
[arguments]: Add 'wrap phase.
[inputs]: Add gstreamer, gst-plugins-base, gst-plugins-good, libcanberra,
libsrtp, and webrtc-audio-processing.

gnu: Add texlive-stmaryrd/fixed.

* gnu/packages/tex.scm (texlive-stmaryrd/fixed): New variable.

gnu: Add texlive-psnfss/fixed.

* gnu/packages/tex.scm (texlive-psnfss/fixed): New variable.

gnu: Add texlive-babel/fixed.

* gnu/packages/tex.scm (texlive-babel/fixed): New variable.

gnu: Add texlive-amsmath.

This is a corrected variant of texlive-latex-amsmath, which should be removed.

* gnu/packages/tex.scm (texlive-amsmath): New variable.

gnu: emacs-corfu: Update to 0.19.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-corfu): Update to 0.19.

gnu: Add emacs-multi-vterm.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-multi-vterm): New variable.

gnu: protonvpn-cli: Remove sanity-check phase.

* gnu/packages/vpn.scm (protonvpn-cli)[arguments]: Remove sanity-check
phase.

gnu: protonvpn-cli: Do not try to wrap the wrapper.

* gnu/packages/vpn.scm (protonvpn-cli)[arguments]: Try to wrap the
original program, and not the wrapper, as wrap-program handles that
properly.

gnu: emacs-with-editor: Update to 3.2.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-with-editor): Update to 3.2.0.
[arguments]<#:phases>: Use G-expressions.

gnu: emacs-no-littering: Update to 1.2.5.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-no-littering): Update to 1.2.5.

gnu: emacs-moody: Update to 0.7.1.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-moody): Update to 0.7.1.

gnu: emacs-keycast: Update to 1.2.0.

* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-keycast): Update to 1.2.0.

gnu: uBlock Origin: Update to 1.41.2.

* gnu/packages/browser-extensions.scm (ublock-origin): Update to 1.41.2.

gnu: ungoogled-chromium: Update to 98.0.4758.80-1.

* gnu/packages/patches/ungoogled-chromium-accelerated-video-decode.patch:
Delete file.
* gnu/local.mk (dist_patch_DATA): Adjust accordingly.
* gnu/packages/chromium.scm (%chromium-version): Set to 98.0.4758.80.
(arch-patch, %arch-patches): Remove variables.
(%guix-patches): Remove accelerated video decode patch which no longer works.
(%ungoogled-origin): Update hash.
(ungoogled-chromium-snippet): Don't apply %ARCH-PATCHES.
(ungoogled-chromium)[source]: Update hash.
[arguments]: Remove obsolete #:configure-flags.  Adjust substitutions.

gnu: wxsvg: Update to 1.5.23.

* gnu/packages/wxwidgets.scm (wxsvg): Update to 1.5.23.

gnu: re2: Use G-expressions.

* gnu/packages/regex.scm (re2)[arguments]: Rewrite with gexps.  Simplify
cross-compilation fix by using CXX-FOR-TARGET.